MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_006142	GTAAT	2	10	516658	516667	40 %	40 %	20 %	0 %	51473607
10502	NC_006142	CTA	2	6	516724	516729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473607
10503	NC_006142	A	6	6	516751	516756	100 %	0 %	0 %	0 %	51473607
10504	NC_006142	AATTT	2	10	516898	516907	40 %	60 %	0 %	0 %	51473607
10505	NC_006142	TTTAC	2	10	516909	516918	20 %	60 %	0 %	20 %	51473607
10506	NC_006142	AAT	2	6	516995	517000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473607
10507	NC_006142	CAA	2	6	517006	517011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473607
10508	NC_006142	TATT	2	8	517055	517062	25 %	75 %	0 %	0 %	51473607
10509	NC_006142	T	6	6	517083	517088	0 %	100 %	0 %	0 %	51473607
10510	NC_006142	GCA	2	6	517089	517094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473607
10511	NC_006142	GAA	2	6	517137	517142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473607
10512	NC_006142	A	6	6	517141	517146	100 %	0 %	0 %	0 %	51473607
10513	NC_006142	A	6	6	517174	517179	100 %	0 %	0 %	0 %	51473607
10514	NC_006142	AGA	2	6	517184	517189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473607
10515	NC_006142	AGT	2	6	517248	517253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473607
10516	NC_006142	AAATT	2	10	517258	517267	60 %	40 %	0 %	0 %	51473607
10517	NC_006142	AGC	2	6	517347	517352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473607
10518	NC_006142	ATA	2	6	517410	517415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473607
10519	NC_006142	ATTATC	2	12	517442	517453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51473607
10520	NC_006142	ATT	2	6	517509	517514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473607
10521	NC_006142	AAAG	2	8	517530	517537	75 %	0 %	25 %	0 %	51473607
10522	NC_006142	TGA	2	6	517556	517561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473607
10523	NC_006142	AGA	2	6	517595	517600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473607
10524	NC_006142	TAG	2	6	517627	517632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473607
10525	NC_006142	TTCAGC	2	12	517652	517663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	51473607
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10527	NC_006142	A	7	7	518079	518085	100 %	0 %	0 %	0 %	51473608
10528	NC_006142	ATT	2	6	518093	518098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473608
10529	NC_006142	CTT	2	6	518109	518114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473608
10530	NC_006142	TAA	2	6	518116	518121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473608
10531	NC_006142	AGAACA	2	12	518156	518167	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51473608
10532	NC_006142	AGGT	2	8	518179	518186	25 %	25 %	50 %	0 %	51473608
10533	NC_006142	A	6	6	518231	518236	100 %	0 %	0 %	0 %	51473608
10534	NC_006142	CTA	2	6	518242	518247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473608
10535	NC_006142	AGG	2	6	518255	518260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51473608
10536	NC_006142	TAA	2	6	518267	518272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473608
10537	NC_006142	AGC	2	6	518285	518290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473608
10538	NC_006142	GGT	2	6	518337	518342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473608
10539	NC_006142	ATT	2	6	518346	518351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473608
10540	NC_006142	GAT	2	6	518415	518420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473608
10541	NC_006142	TAA	2	6	518422	518427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473608
10542	NC_006142	GAA	2	6	518457	518462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473608
10543	NC_006142	A	6	6	518468	518473	100 %	0 %	0 %	0 %	51473608
10544	NC_006142	TA	4	8	518552	518559	50 %	50 %	0 %	0 %	51473608
10545	NC_006142	AGA	2	6	518679	518684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473609
10546	NC_006142	TAG	2	6	518709	518714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10548	NC_006142	GTGAT	2	10	518798	518807	20 %	40 %	40 %	0 %	51473609
10549	NC_006142	TGC	2	6	518886	518891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473609
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10552	NC_006142	AG	3	6	518989	518994	50 %	0 %	50 %	0 %	51473609
10553	NC_006142	TAT	2	6	519016	519021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473609
10554	NC_006142	T	8	8	519037	519044	0 %	100 %	0 %	0 %	51473609
10555	NC_006142	ATA	2	6	519107	519112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473609
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10557	NC_006142	GAA	2	6	519220	519225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473609
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10559	NC_006142	AGCT	2	8	519390	519397	25 %	25 %	25 %	25 %	51473609
10560	NC_006142	ATC	2	6	519416	519421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473609
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10562	NC_006142	AATT	2	8	519434	519441	50 %	50 %	0 %	0 %	51473609
10563	NC_006142	AT	3	6	519483	519488	50 %	50 %	0 %	0 %	51473609
10564	NC_006142	AGT	2	6	519496	519501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10570	NC_006142	TAG	2	6	519765	519770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10572	NC_006142	TAGGTA	2	12	519809	519820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
10573	NC_006142	TCCTAT	2	12	519882	519893	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51473609
10574	NC_006142	AGTACC	2	12	519918	519929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	51473609
10575	NC_006142	TGA	2	6	519957	519962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10589	NC_006142	AGT	2	6	520401	520406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10591	NC_006142	TAT	2	6	520505	520510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473609
10592	NC_006142	ATA	2	6	520589	520594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473609
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10598	NC_006142	AAGAT	2	10	520772	520781	60 %	20 %	20 %	0 %	51473609
10599	NC_006142	AGA	2	6	520854	520859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473609
10600	NC_006142	TA	3	6	520892	520897	50 %	50 %	0 %	0 %	51473609
10601	NC_006142	TGA	2	6	520917	520922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473609
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10603	NC_006142	TAA	2	6	521079	521084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473609
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10605	NC_006142	ATT	3	9	521116	521124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473609
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10608	NC_006142	T	6	6	521497	521502	0 %	100 %	0 %	0 %	51473610
10609	NC_006142	TGC	2	6	521543	521548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473610
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10611	NC_006142	CTAA	2	8	521673	521680	50 %	25 %	0 %	25 %	51473610
10612	NC_006142	T	7	7	521732	521738	0 %	100 %	0 %	0 %	51473610
10613	NC_006142	AAATC	2	10	521748	521757	60 %	20 %	0 %	20 %	51473610
10614	NC_006142	ACCGTT	2	12	521858	521869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	51473610
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10616	NC_006142	CTAC	2	8	522129	522136	25 %	25 %	0 %	50 %	51473611
10617	NC_006142	AGC	2	6	522181	522186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473611
10618	NC_006142	T	8	8	522198	522205	0 %	100 %	0 %	0 %	51473611
10619	NC_006142	TTC	2	6	522211	522216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473611
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10621	NC_006142	TCA	2	6	522302	522307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473611
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10623	NC_006142	AT	3	6	522364	522369	50 %	50 %	0 %	0 %	51473611
10624	NC_006142	AAAAT	2	10	522377	522386	80 %	20 %	0 %	0 %	51473611
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