MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005296	GCG	2	6	125621	125626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933189
3002	NC_005296	TTG	2	6	125923	125928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933189
3003	NC_005296	CG	4	8	125954	125961	0 %	0 %	50 %	50 %	39933189
3004	NC_005296	CCA	2	6	126008	126013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933189
3005	NC_005296	GA	3	6	126085	126090	50 %	0 %	50 %	0 %	39933189
3006	NC_005296	CG	3	6	126109	126114	0 %	0 %	50 %	50 %	39933189
3007	NC_005296	GGC	2	6	126120	126125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933189
3008	NC_005296	GGC	2	6	126129	126134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933189
3009	NC_005296	TGC	3	9	126147	126155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933189
3010	NC_005296	GAC	2	6	126159	126164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933189
3011	NC_005296	AGA	2	6	126426	126431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933190
3012	NC_005296	GC	5	10	126441	126450	0 %	0 %	50 %	50 %	39933190
3013	NC_005296	CGG	2	6	126471	126476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933190
3014	NC_005296	GCC	2	6	126497	126502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933190
3015	NC_005296	AAGC	2	8	126548	126555	50 %	0 %	25 %	25 %	39933190
3016	NC_005296	TGC	2	6	126558	126563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933190
3017	NC_005296	CG	3	6	126599	126604	0 %	0 %	50 %	50 %	39933190
3018	NC_005296	GC	3	6	126732	126737	0 %	0 %	50 %	50 %	39933190
3019	NC_005296	CGC	2	6	126756	126761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933190
3020	NC_005296	CGT	2	6	126779	126784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933190
3021	NC_005296	TCG	2	6	126825	126830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933190
3022	NC_005296	GAG	2	6	126833	126838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933190
3023	NC_005296	TCC	2	6	126980	126985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933190
3024	NC_005296	CAG	2	6	127137	127142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933191
3025	NC_005296	CGC	2	6	127148	127153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933191
3026	NC_005296	CGG	2	6	127198	127203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933191
3027	NC_005296	CAT	2	6	127233	127238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933191
3028	NC_005296	GCCA	2	8	127258	127265	25 %	0 %	25 %	50 %	39933191
3029	NC_005296	GAA	2	6	127332	127337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933191
3030	NC_005296	GC	3	6	127351	127356	0 %	0 %	50 %	50 %	39933191
3031	NC_005296	ACCGCG	2	12	127357	127368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933191
3032	NC_005296	GTA	2	6	127386	127391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933191
3033	NC_005296	CGG	2	6	127401	127406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933191
3034	NC_005296	CCG	2	6	127454	127459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933191
3035	NC_005296	TCT	2	6	127481	127486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933191
3036	NC_005296	ACC	2	6	127513	127518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933191
3037	NC_005296	CCGGCG	2	12	127556	127567	0 %	0 %	50 %	50 %	39933191
3038	NC_005296	CGA	2	6	127613	127618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933191
3039	NC_005296	CAGC	2	8	127620	127627	25 %	0 %	25 %	50 %	39933191
3040	NC_005296	GCG	2	6	127659	127664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933191
3041	NC_005296	GCC	2	6	127677	127682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933191
3042	NC_005296	GCA	3	9	127691	127699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933191
3043	NC_005296	CGG	2	6	127722	127727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933191
3044	NC_005296	AGCG	2	8	127755	127762	25 %	0 %	50 %	25 %	39933191
3045	NC_005296	GCA	2	6	127787	127792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933191
3046	NC_005296	GGC	2	6	127794	127799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933191
3047	NC_005296	CGT	2	6	127896	127901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3048	NC_005296	GAC	2	6	127916	127921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3049	NC_005296	TCT	3	9	127924	127932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933192
3050	NC_005296	GCC	2	6	127994	127999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3051	NC_005296	GC	3	6	128077	128082	0 %	0 %	50 %	50 %	39933192
3052	NC_005296	GC	4	8	128136	128143	0 %	0 %	50 %	50 %	39933192
3053	NC_005296	TCG	2	6	128157	128162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3054	NC_005296	ACC	2	6	128181	128186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933192
3055	NC_005296	GCG	2	6	128212	128217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933192
3056	NC_005296	TCC	2	6	128220	128225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933192
3057	NC_005296	TGA	2	6	128236	128241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933192
3058	NC_005296	GCGCC	2	10	128275	128284	0 %	0 %	40 %	60 %	39933192
3059	NC_005296	CGG	2	6	128317	128322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933192
3060	NC_005296	GCC	2	6	128448	128453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3061	NC_005296	GTG	2	6	128472	128477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933192
3062	NC_005296	CGC	2	6	128495	128500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3063	NC_005296	CGA	2	6	128551	128556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3064	NC_005296	ATC	2	6	128586	128591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933192
3065	NC_005296	CCA	2	6	128601	128606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933192
3066	NC_005296	TCT	2	6	128629	128634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933192
3067	NC_005296	CGC	2	6	128636	128641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3068	NC_005296	CCG	2	6	128698	128703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3069	NC_005296	CCGCA	2	10	128719	128728	20 %	0 %	20 %	60 %	39933192
3070	NC_005296	GCA	2	6	128770	128775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3071	NC_005296	CAC	3	9	128834	128842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933192
3072	NC_005296	CCA	2	6	128854	128859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933192
3073	NC_005296	CAT	2	6	128879	128884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933192
3074	NC_005296	CGA	2	6	128920	128925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3075	NC_005296	GTG	2	6	129018	129023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933192
3076	NC_005296	CGC	2	6	129046	129051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3077	NC_005296	CGC	2	6	129131	129136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3078	NC_005296	TGC	2	6	129191	129196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3079	NC_005296	CGC	2	6	129200	129205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3080	NC_005296	CG	3	6	129212	129217	0 %	0 %	50 %	50 %	39933192
3081	NC_005296	TCG	2	6	129225	129230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933192
3082	NC_005296	CGGC	2	8	129238	129245	0 %	0 %	50 %	50 %	39933192
3083	NC_005296	CCG	2	6	129297	129302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933192
3084	NC_005296	ACGG	2	8	129303	129310	25 %	0 %	50 %	25 %	39933192
3085	NC_005296	CGG	2	6	129367	129372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933192
3086	NC_005296	ATC	2	6	129408	129413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933192
3087	NC_005296	CGC	2	6	130050	130055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3088	NC_005296	CGC	2	6	130057	130062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3089	NC_005296	GAC	2	6	130163	130168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3090	NC_005296	CGATGT	2	12	130189	130200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	39933193
3091	NC_005296	TCG	2	6	130206	130211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3092	NC_005296	GCA	2	6	130308	130313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3093	NC_005296	GGC	2	6	130322	130327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3094	NC_005296	GCC	2	6	130340	130345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3095	NC_005296	GCG	2	6	130482	130487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3096	NC_005296	CGC	2	6	130531	130536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3097	NC_005296	CCA	2	6	130572	130577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933193
3098	NC_005296	CCG	2	6	130587	130592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3099	NC_005296	CGAGGC	2	12	130618	130629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933193
3100	NC_005296	CG	3	6	130650	130655	0 %	0 %	50 %	50 %	39933193
3101	NC_005296	CAG	2	6	130694	130699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3102	NC_005296	GATCGA	2	12	130744	130755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	39933193
3103	NC_005296	CGG	2	6	130762	130767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3104	NC_005296	GGC	2	6	130790	130795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3105	NC_005296	GC	4	8	130805	130812	0 %	0 %	50 %	50 %	39933193
3106	NC_005296	CTA	3	9	130984	130992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933193
3107	NC_005296	GCT	2	6	130996	131001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3108	NC_005296	ATT	2	6	131133	131138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933193
3109	NC_005296	GTG	2	6	131140	131145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933193
3110	NC_005296	ATG	2	6	131171	131176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933193
3111	NC_005296	GGC	2	6	131231	131236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3112	NC_005296	GGCC	2	8	131260	131267	0 %	0 %	50 %	50 %	39933193
3113	NC_005296	GAT	2	6	131281	131286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933193
3114	NC_005296	CGC	2	6	131331	131336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3115	NC_005296	CCG	2	6	131362	131367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933193
3116	NC_005296	CGA	2	6	131407	131412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933193
3117	NC_005296	GCG	2	6	131414	131419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933193
3118	NC_005296	CTT	2	6	131555	131560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933194
3119	NC_005296	GCG	2	6	131588	131593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933194
3120	NC_005296	GCT	2	6	131608	131613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933194
3121	NC_005296	GC	3	6	131616	131621	0 %	0 %	50 %	50 %	39933194
3122	NC_005296	CAC	2	6	131648	131653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933194
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3245	NC_005296	GGC	2	6	138528	138533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933199
3246	NC_005296	AGC	2	6	138539	138544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933199
3247	NC_005296	CG	3	6	138596	138601	0 %	0 %	50 %	50 %	39933199
3248	NC_005296	GCCG	2	8	138631	138638	0 %	0 %	50 %	50 %	39933199
3249	NC_005296	GGCAC	2	10	138648	138657	20 %	0 %	40 %	40 %	39933199
3250	NC_005296	CGC	3	9	138766	138774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933199
3251	NC_005296	CTA	2	6	138776	138781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933199
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3253	NC_005296	CGG	2	6	138923	138928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933199
3254	NC_005296	CGA	2	6	138989	138994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933199
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3490	NC_005296	ATC	2	6	148937	148942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933209
3491	NC_005296	CAG	3	9	149023	149031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933209
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3493	NC_005296	CGC	2	6	149087	149092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933210
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3495	NC_005296	CGA	2	6	149110	149115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
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3500	NC_005296	GGC	2	6	149309	149314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210

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