MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_005296	CGT	2	6	651400	651405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15002	NC_005296	CGA	2	6	651424	651429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15003	NC_005296	AGC	2	6	651441	651446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15004	NC_005296	GCA	2	6	651448	651453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15005	NC_005296	GCC	3	9	651461	651469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933662
15006	NC_005296	GC	3	6	651478	651483	0 %	0 %	50 %	50 %	39933662
15007	NC_005296	CGC	2	6	651506	651511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933662
15008	NC_005296	CGA	2	6	651518	651523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15009	NC_005296	GAG	2	6	651539	651544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933662
15010	NC_005296	CAC	2	6	651563	651568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933662
15011	NC_005296	GCG	2	6	651582	651587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933662
15012	NC_005296	CCGA	2	8	651591	651598	25 %	0 %	25 %	50 %	39933662
15013	NC_005296	CG	4	8	651607	651614	0 %	0 %	50 %	50 %	39933662
15014	NC_005296	TGC	2	6	651630	651635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15015	NC_005296	CAC	2	6	651651	651656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933662
15016	NC_005296	CCG	2	6	651672	651677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933662
15017	NC_005296	GAG	2	6	651716	651721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933662
15018	NC_005296	GCC	3	9	651732	651740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933662
15019	NC_005296	GC	3	6	651753	651758	0 %	0 %	50 %	50 %	39933662
15020	NC_005296	CGA	2	6	651805	651810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15021	NC_005296	GCA	2	6	651838	651843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15022	NC_005296	GGC	2	6	651932	651937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933662
15023	NC_005296	GC	3	6	651940	651945	0 %	0 %	50 %	50 %	39933662
15024	NC_005296	GCT	2	6	651989	651994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15025	NC_005296	CGA	2	6	652024	652029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15026	NC_005296	CCAG	2	8	652051	652058	25 %	0 %	25 %	50 %	39933662
15027	NC_005296	TCG	2	6	652077	652082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933662
15028	NC_005296	CCG	2	6	652110	652115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933662
15029	NC_005296	GAA	2	6	652136	652141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933662
15030	NC_005296	GCC	2	6	652217	652222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15031	NC_005296	GCC	2	6	652281	652286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15032	NC_005296	GTA	2	6	652342	652347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933663
15033	NC_005296	GCC	2	6	652432	652437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15034	NC_005296	GCC	2	6	652483	652488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15035	NC_005296	CGC	2	6	652533	652538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15036	NC_005296	GC	3	6	652552	652557	0 %	0 %	50 %	50 %	39933663
15037	NC_005296	TCA	2	6	652608	652613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933663
15038	NC_005296	GTC	2	6	652642	652647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933663
15039	NC_005296	ATCG	2	8	652651	652658	25 %	25 %	25 %	25 %	39933663
15040	NC_005296	GC	3	6	652698	652703	0 %	0 %	50 %	50 %	39933663
15041	NC_005296	AGC	2	6	652721	652726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933663
15042	NC_005296	TGAT	2	8	652754	652761	25 %	50 %	25 %	0 %	39933663
15043	NC_005296	GC	3	6	652769	652774	0 %	0 %	50 %	50 %	39933663
15044	NC_005296	GCC	2	6	652794	652799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15045	NC_005296	GTT	2	6	652822	652827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933663
15046	NC_005296	GC	5	10	652852	652861	0 %	0 %	50 %	50 %	39933663
15047	NC_005296	GATT	2	8	652882	652889	25 %	50 %	25 %	0 %	39933663
15048	NC_005296	CGA	2	6	652908	652913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933663
15049	NC_005296	GGC	2	6	652939	652944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933663
15050	NC_005296	CGC	2	6	652968	652973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15051	NC_005296	CG	3	6	652983	652988	0 %	0 %	50 %	50 %	39933663
15052	NC_005296	CCA	2	6	652989	652994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933663
15053	NC_005296	CCG	2	6	653013	653018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933663
15054	NC_005296	TGA	2	6	653155	653160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933664
15055	NC_005296	GCCA	2	8	653194	653201	25 %	0 %	25 %	50 %	39933664
15056	NC_005296	ACGAT	2	10	653252	653261	40 %	20 %	20 %	20 %	39933664
15057	NC_005296	GCCG	2	8	653265	653272	0 %	0 %	50 %	50 %	39933664
15058	NC_005296	CCAG	2	8	653279	653286	25 %	0 %	25 %	50 %	39933664
15059	NC_005296	TGC	2	6	653311	653316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15060	NC_005296	ACC	2	6	653356	653361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933664
15061	NC_005296	GCGAAC	2	12	653362	653373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15062	NC_005296	GCA	2	6	653414	653419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15063	NC_005296	CGA	2	6	653435	653440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15064	NC_005296	TGG	2	6	653456	653461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933664
15065	NC_005296	GGGT	2	8	653485	653492	0 %	25 %	75 %	0 %	39933664
15066	NC_005296	GGC	3	9	653493	653501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15067	NC_005296	GCA	2	6	653537	653542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15068	NC_005296	GAC	2	6	653592	653597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15069	NC_005296	CAGC	2	8	653619	653626	25 %	0 %	25 %	50 %	39933664
15070	NC_005296	CGG	2	6	653633	653638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15071	NC_005296	GATCG	2	10	653655	653664	20 %	20 %	40 %	20 %	39933664
15072	NC_005296	GCG	2	6	653797	653802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15073	NC_005296	GAA	2	6	653832	653837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933664
15074	NC_005296	CAC	2	6	653838	653843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933664
15075	NC_005296	GCA	2	6	653855	653860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15076	NC_005296	GCC	2	6	653923	653928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933664
15077	NC_005296	GCG	2	6	653959	653964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15078	NC_005296	CGA	2	6	654002	654007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15079	NC_005296	GTT	2	6	654012	654017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933664
15080	NC_005296	CAG	2	6	654048	654053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15081	NC_005296	CGA	3	9	654065	654073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15082	NC_005296	GGT	2	6	654105	654110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933664
15083	NC_005296	GCG	2	6	654127	654132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15084	NC_005296	GTG	2	6	654151	654156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933664
15085	NC_005296	GCG	2	6	654161	654166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15086	NC_005296	GAT	2	6	654270	654275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933664
15087	NC_005296	CCA	2	6	654281	654286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933664
15088	NC_005296	TCG	2	6	654296	654301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15089	NC_005296	CCG	2	6	654413	654418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933664
15090	NC_005296	GGC	4	12	654429	654440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933664
15091	NC_005296	GAT	2	6	654471	654476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933664
15092	NC_005296	GCC	2	6	654477	654482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933664
15093	NC_005296	TCGCCG	2	12	654538	654549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933664
15094	NC_005296	GCT	2	6	654579	654584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933664
15095	NC_005296	GCG	2	6	654661	654666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933665
15096	NC_005296	GCC	2	6	654670	654675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933665
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15099	NC_005296	TGG	2	6	654749	654754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933665
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15101	NC_005296	CGC	2	6	654838	654843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933665
15102	NC_005296	CGG	3	9	654846	654854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933665
15103	NC_005296	CGGC	2	8	654857	654864	0 %	0 %	50 %	50 %	39933665
15104	NC_005296	GCTC	2	8	654942	654949	0 %	25 %	25 %	50 %	39933665
15105	NC_005296	TGC	2	6	654971	654976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933665
15106	NC_005296	CGC	2	6	655024	655029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933665
15107	NC_005296	GCG	4	12	655069	655080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933665
15108	NC_005296	CAG	3	9	655087	655095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933665
15109	NC_005296	CCA	2	6	655182	655187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933665
15110	NC_005296	TCG	2	6	655226	655231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933665
15111	NC_005296	CG	3	6	655321	655326	0 %	0 %	50 %	50 %	39933665
15112	NC_005296	CGC	2	6	655438	655443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933666
15113	NC_005296	CG	3	6	655551	655556	0 %	0 %	50 %	50 %	39933666
15114	NC_005296	GCC	2	6	655571	655576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933666
15115	NC_005296	GC	3	6	655632	655637	0 %	0 %	50 %	50 %	39933666
15116	NC_005296	GCC	2	6	655683	655688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933666
15117	NC_005296	TCGA	2	8	655739	655746	25 %	25 %	25 %	25 %	39933666
15118	NC_005296	GC	3	6	655788	655793	0 %	0 %	50 %	50 %	39933666
15119	NC_005296	CGCGC	2	10	655802	655811	0 %	0 %	40 %	60 %	39933666
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15121	NC_005296	CGG	2	6	655872	655877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933666
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15484	NC_005296	CGG	2	6	670526	670531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933681
15485	NC_005296	CGTC	2	8	670534	670541	0 %	25 %	25 %	50 %	39933681
15486	NC_005296	CG	3	6	670568	670573	0 %	0 %	50 %	50 %	39933681
15487	NC_005296	GTG	3	9	670614	670622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933681
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