MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_005296	TGC	2	6	607445	607450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
14002	NC_005296	GTG	2	6	607453	607458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933621
14003	NC_005296	GGC	2	6	607501	607506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933621
14004	NC_005296	GCT	2	6	607545	607550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
14005	NC_005296	CCG	2	6	607559	607564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933621
14006	NC_005296	CAG	2	6	607579	607584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933621
14007	NC_005296	CAC	2	6	607596	607601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933621
14008	NC_005296	TGG	2	6	607652	607657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933621
14009	NC_005296	GGT	2	6	607662	607667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933621
14010	NC_005296	GTG	3	9	607675	607683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933621
14011	NC_005296	GCT	2	6	607689	607694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
14012	NC_005296	CGC	2	6	607756	607761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933622
14013	NC_005296	GCT	2	6	607781	607786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933622
14014	NC_005296	GCG	2	6	607794	607799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933622
14015	NC_005296	CCT	2	6	607897	607902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933622
14016	NC_005296	GCG	2	6	607918	607923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933622
14017	NC_005296	TGG	2	6	608032	608037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933622
14018	NC_005296	GGT	2	6	608063	608068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933622
14019	NC_005296	CTGG	2	8	608069	608076	0 %	25 %	50 %	25 %	39933622
14020	NC_005296	GTG	2	6	608103	608108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933622
14021	NC_005296	TCG	2	6	608227	608232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933622
14022	NC_005296	CGC	2	6	608236	608241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933622
14023	NC_005296	TGA	2	6	608242	608247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933622
14024	NC_005296	GC	3	6	608274	608279	0 %	0 %	50 %	50 %	39933622
14025	NC_005296	GCCTC	2	10	608293	608302	0 %	20 %	20 %	60 %	39933622
14026	NC_005296	CG	3	6	608318	608323	0 %	0 %	50 %	50 %	39933622
14027	NC_005296	CTG	2	6	608421	608426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933622
14028	NC_005296	CCG	2	6	608552	608557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933623
14029	NC_005296	TGC	2	6	608562	608567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933623
14030	NC_005296	CCG	2	6	608572	608577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933623
14031	NC_005296	CGG	2	6	608630	608635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933623
14032	NC_005296	TGC	2	6	608708	608713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933623
14033	NC_005296	GGCG	2	8	608721	608728	0 %	0 %	75 %	25 %	39933623
14034	NC_005296	GTG	2	6	608764	608769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933623
14035	NC_005296	GGC	2	6	608771	608776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933623
14036	NC_005296	CTG	2	6	608815	608820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933623
14037	NC_005296	GCA	2	6	608839	608844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933623
14038	NC_005296	GGC	2	6	608899	608904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933623
14039	NC_005296	GCT	4	12	608910	608921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933623
14040	NC_005296	CA	3	6	608965	608970	50 %	0 %	0 %	50 %	39933623
14041	NC_005296	CGC	2	6	609001	609006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933624
14042	NC_005296	AG	3	6	609027	609032	50 %	0 %	50 %	0 %	39933624
14043	NC_005296	CG	3	6	609045	609050	0 %	0 %	50 %	50 %	39933624
14044	NC_005296	GCCG	2	8	609097	609104	0 %	0 %	50 %	50 %	39933624
14045	NC_005296	GGC	2	6	609159	609164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933624
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14047	NC_005296	GCC	2	6	609304	609309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933624
14048	NC_005296	CAG	3	9	609325	609333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933624
14049	NC_005296	GATC	2	8	609342	609349	25 %	25 %	25 %	25 %	39933624
14050	NC_005296	TCG	2	6	609368	609373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933624
14051	NC_005296	CCA	2	6	609447	609452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933624
14052	NC_005296	CGC	2	6	609459	609464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933624
14053	NC_005296	CAGC	2	8	609481	609488	25 %	0 %	25 %	50 %	39933624
14054	NC_005296	GCCG	2	8	609501	609508	0 %	0 %	50 %	50 %	39933624
14055	NC_005296	GCC	2	6	609517	609522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933624
14056	NC_005296	CGC	2	6	609627	609632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933624
14057	NC_005296	CTG	2	6	609679	609684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933624
14058	NC_005296	GAA	2	6	609700	609705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933624
14059	NC_005296	CGG	2	6	609715	609720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933624
14060	NC_005296	AGCG	2	8	609730	609737	25 %	0 %	50 %	25 %	39933624
14061	NC_005296	CG	3	6	609817	609822	0 %	0 %	50 %	50 %	39933624
14062	NC_005296	CGG	2	6	609855	609860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933624
14063	NC_005296	TCG	2	6	609935	609940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933624
14064	NC_005296	CGG	2	6	609976	609981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933624
14065	NC_005296	GC	3	6	609991	609996	0 %	0 %	50 %	50 %	39933624
14066	NC_005296	GCA	2	6	610023	610028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933624
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14068	NC_005296	GCA	2	6	610035	610040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933624
14069	NC_005296	GTC	2	6	610051	610056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933624
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14075	NC_005296	CGC	2	6	610381	610386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933625
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14092	NC_005296	GC	3	6	610960	610965	0 %	0 %	50 %	50 %	39933625
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14107	NC_005296	CGTC	2	8	611539	611546	0 %	25 %	25 %	50 %	39933626
14108	NC_005296	CGC	2	6	611562	611567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933626
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14122	NC_005296	GCG	2	6	612104	612109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933627
14123	NC_005296	ACA	2	6	612210	612215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933627
14124	NC_005296	TCT	2	6	612225	612230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933627
14125	NC_005296	GCT	2	6	612267	612272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933627
14126	NC_005296	GCC	2	6	612291	612296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933627
14127	NC_005296	CTC	3	9	612307	612315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933627
14128	NC_005296	GC	3	6	612391	612396	0 %	0 %	50 %	50 %	39933627
14129	NC_005296	CGAGGC	2	12	612415	612426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933627
14130	NC_005296	CCGCG	2	10	612512	612521	0 %	0 %	40 %	60 %	39933627
14131	NC_005296	GGCGC	2	10	612537	612546	0 %	0 %	60 %	40 %	39933627
14132	NC_005296	CGC	2	6	612571	612576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933627
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14134	NC_005296	GGGC	2	8	612628	612635	0 %	0 %	75 %	25 %	39933627
14135	NC_005296	GTT	2	6	613346	613351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933628
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14137	NC_005296	GTC	2	6	613359	613364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933628
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14140	NC_005296	CTG	2	6	613471	613476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933628
14141	NC_005296	CG	3	6	613522	613527	0 %	0 %	50 %	50 %	39933628
14142	NC_005296	AGCC	2	8	613534	613541	25 %	0 %	25 %	50 %	39933628
14143	NC_005296	CGCCA	2	10	613686	613695	20 %	0 %	20 %	60 %	39933628
14144	NC_005296	GCG	2	6	613720	613725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933628
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14146	NC_005296	CGG	2	6	613900	613905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933628
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14149	NC_005296	GTC	2	6	614016	614021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933628
14150	NC_005296	CTGA	2	8	614069	614076	25 %	25 %	25 %	25 %	39933628
14151	NC_005296	CGG	2	6	614104	614109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933628
14152	NC_005296	CG	3	6	614130	614135	0 %	0 %	50 %	50 %	39933628
14153	NC_005296	CGG	2	6	614137	614142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933628
14154	NC_005296	GGT	2	6	614308	614313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933629
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14159	NC_005296	GAC	2	6	614524	614529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933629
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14216	NC_005296	CG	3	6	616468	616473	0 %	0 %	50 %	50 %	39933631
14217	NC_005296	TCG	2	6	616479	616484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933631
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14220	NC_005296	GC	4	8	616620	616627	0 %	0 %	50 %	50 %	39933631
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14222	NC_005296	CGC	2	6	616729	616734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933631
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14224	NC_005296	GC	3	6	616779	616784	0 %	0 %	50 %	50 %	39933631
14225	NC_005296	TCA	2	6	616794	616799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933631
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14228	NC_005296	CGA	2	6	616930	616935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933631
14229	NC_005296	CGCAG	2	10	617062	617071	20 %	0 %	40 %	40 %	39933632
14230	NC_005296	CGG	3	9	617109	617117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933632
14231	NC_005296	CAG	2	6	617153	617158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933632
14232	NC_005296	GCC	2	6	617162	617167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933632
14233	NC_005296	GCA	2	6	617173	617178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933632
14234	NC_005296	CCATCA	2	12	617230	617241	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	39933632
14235	NC_005296	ACG	2	6	617265	617270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933632
14236	NC_005296	GC	4	8	617505	617512	0 %	0 %	50 %	50 %	39933632
14237	NC_005296	CCA	2	6	617530	617535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933632
14238	NC_005296	GGCAA	2	10	617554	617563	40 %	0 %	40 %	20 %	39933632
14239	NC_005296	CGG	2	6	617606	617611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933632
14240	NC_005296	CGG	2	6	617818	617823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933633
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14242	NC_005296	ACG	2	6	617948	617953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933633
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14477	NC_005296	GATC	2	8	628308	628315	25 %	25 %	25 %	25 %	39933642
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14482	NC_005296	CGC	2	6	628478	628483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933642
14483	NC_005296	ACC	2	6	628519	628524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933642
14484	NC_005296	CGC	2	6	628754	628759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933642
14485	NC_005296	CGGCGC	2	12	628761	628772	0 %	0 %	50 %	50 %	39933642
14486	NC_005296	CGA	2	6	628776	628781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933642
14487	NC_005296	TCG	2	6	628825	628830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933642
14488	NC_005296	CGGC	2	8	628909	628916	0 %	0 %	50 %	50 %	39933642
14489	NC_005296	ATG	2	6	628919	628924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933642
14490	NC_005296	CCG	2	6	628970	628975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933642
14491	NC_005296	GCG	2	6	628999	629004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933642
14492	NC_005296	CCG	2	6	629005	629010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933642
14493	NC_005296	CGGTG	2	10	629034	629043	0 %	20 %	60 %	20 %	39933642
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14495	NC_005296	GGC	2	6	629082	629087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933642
14496	NC_005296	TCG	2	6	629239	629244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933643
14497	NC_005296	CGC	2	6	629255	629260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933643
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14500	NC_005296	GTC	2	6	629349	629354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933643

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