MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_005296	TCG	2	6	584592	584597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933600
13503	NC_005296	CGA	2	6	584639	584644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13504	NC_005296	GCGG	2	8	584646	584653	0 %	0 %	75 %	25 %	39933601
13505	NC_005296	GC	3	6	584656	584661	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13506	NC_005296	CGC	2	6	584669	584674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
13507	NC_005296	CG	3	6	584707	584712	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13508	NC_005296	GCT	2	6	584729	584734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13509	NC_005296	GGT	2	6	584766	584771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933601
13510	NC_005296	GCCG	2	8	584793	584800	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13511	NC_005296	GTC	2	6	584841	584846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13512	NC_005296	TCG	2	6	584884	584889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13513	NC_005296	GC	3	6	584891	584896	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13514	NC_005296	CTG	2	6	584973	584978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13515	NC_005296	CG	3	6	584983	584988	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13516	NC_005296	GCC	2	6	585045	585050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
13517	NC_005296	GCC	2	6	585057	585062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
13518	NC_005296	GC	3	6	585075	585080	0 %	0 %	50 %	50 %	39933601
13519	NC_005296	CAG	3	9	585093	585101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13520	NC_005296	TCG	2	6	585127	585132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13521	NC_005296	CAG	2	6	585159	585164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13522	NC_005296	CGT	2	6	585191	585196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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13524	NC_005296	GTC	2	6	585258	585263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
13525	NC_005296	GCG	2	6	585298	585303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933601
13526	NC_005296	GCG	2	6	585316	585321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933601
13527	NC_005296	CGAT	2	8	585325	585332	25 %	25 %	25 %	25 %	39933601
13528	NC_005296	GCG	2	6	585343	585348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933601
13529	NC_005296	GCC	3	9	585381	585389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933601
13530	NC_005296	TCG	2	6	585439	585444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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13534	NC_005296	AGC	2	6	585475	585480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933601
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13537	NC_005296	GCT	2	6	585721	585726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933602
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13543	NC_005296	GGCCG	2	10	586017	586026	0 %	0 %	60 %	40 %	39933602
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13553	NC_005296	GAA	3	9	586686	586694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933603
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13557	NC_005296	TGC	5	15	587113	587127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933604
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13560	NC_005296	CCGGC	2	10	587147	587156	0 %	0 %	40 %	60 %	39933604
13561	NC_005296	GCT	2	6	587186	587191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933604
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13564	NC_005296	CTG	2	6	587256	587261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933604
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13599	NC_005296	GC	3	6	588802	588807	0 %	0 %	50 %	50 %	39933606
13600	NC_005296	TCGG	2	8	588819	588826	0 %	25 %	50 %	25 %	39933606
13601	NC_005296	CAA	2	6	588835	588840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933606
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13604	NC_005296	CGC	2	6	588904	588909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933606
13605	NC_005296	CGGTG	2	10	588967	588976	0 %	20 %	60 %	20 %	39933606
13606	NC_005296	GC	3	6	588978	588983	0 %	0 %	50 %	50 %	39933606
13607	NC_005296	CCG	2	6	588999	589004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933606
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13982	NC_005296	CTG	2	6	606685	606690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933620
13983	NC_005296	CGG	3	9	606692	606700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933620
13984	NC_005296	GCT	2	6	606702	606707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933620
13985	NC_005296	AGTGC	2	10	606752	606761	20 %	20 %	40 %	20 %	39933620
13986	NC_005296	GGC	2	6	606861	606866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933620
13987	NC_005296	AAGCC	2	10	606869	606878	40 %	0 %	20 %	40 %	39933620
13988	NC_005296	AAGCC	2	10	606920	606929	40 %	0 %	20 %	40 %	39933620
13989	NC_005296	CGC	2	6	606969	606974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933620
13990	NC_005296	GC	3	6	607070	607075	0 %	0 %	50 %	50 %	39933620
13991	NC_005296	GCC	2	6	607096	607101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933620
13992	NC_005296	GGC	2	6	607111	607116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933620
13993	NC_005296	GCG	2	6	607136	607141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933620
13994	NC_005296	CAA	2	6	607158	607163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933620
13995	NC_005296	TGA	2	6	607331	607336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933621
13996	NC_005296	CTG	2	6	607357	607362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
13997	NC_005296	TCG	2	6	607370	607375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
13998	NC_005296	TCGC	2	8	607385	607392	0 %	25 %	25 %	50 %	39933621
13999	NC_005296	GTTGCC	2	12	607401	607412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933621
14000	NC_005296	GTT	5	15	607428	607442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933621

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