MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120501	NC_005296	CGA	2	6	5240885	5240890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937711
120502	NC_005296	GGCGAC	2	12	5240933	5240944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39937711
120503	NC_005296	TGC	2	6	5240977	5240982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937711
120504	NC_005296	CGC	2	6	5241001	5241006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937711
120505	NC_005296	CGA	2	6	5241008	5241013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937711
120506	NC_005296	GCT	2	6	5241085	5241090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937711
120507	NC_005296	CA	3	6	5241094	5241099	50 %	0 %	0 %	50 %	39937711
120508	NC_005296	CCTG	2	8	5241100	5241107	0 %	25 %	25 %	50 %	39937711
120509	NC_005296	GC	3	6	5241110	5241115	0 %	0 %	50 %	50 %	39937711
120510	NC_005296	CA	3	6	5241121	5241126	50 %	0 %	0 %	50 %	39937711
120511	NC_005296	CGA	2	6	5241149	5241154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937711
120512	NC_005296	GAC	2	6	5241262	5241267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937712
120513	NC_005296	CGA	2	6	5241345	5241350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937712
120514	NC_005296	CTT	2	6	5241360	5241365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937712
120515	NC_005296	ACG	2	6	5241374	5241379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937712
120516	NC_005296	GAT	2	6	5241423	5241428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937712
120517	NC_005296	CCA	2	6	5241437	5241442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937712
120518	NC_005296	GCT	2	6	5241513	5241518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937712
120519	NC_005296	GC	3	6	5241570	5241575	0 %	0 %	50 %	50 %	39937712
120520	NC_005296	GAA	2	6	5241664	5241669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937712
120521	NC_005296	CGC	2	6	5241693	5241698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937712
120522	NC_005296	CTT	2	6	5241699	5241704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937712
120523	NC_005296	ACG	2	6	5241749	5241754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937712
120524	NC_005296	CAT	2	6	5241900	5241905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937713
120525	NC_005296	TGCC	2	8	5241909	5241916	0 %	25 %	25 %	50 %	39937713
120526	NC_005296	ATC	2	6	5242177	5242182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937713
120527	NC_005296	CG	3	6	5242195	5242200	0 %	0 %	50 %	50 %	39937713
120528	NC_005296	CGG	2	6	5242226	5242231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937713
120529	NC_005296	GCG	2	6	5242232	5242237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937713
120530	NC_005296	GC	3	6	5242253	5242258	0 %	0 %	50 %	50 %	39937713
120531	NC_005296	TGCGC	2	10	5242305	5242314	0 %	20 %	40 %	40 %	39937713
120532	NC_005296	CGC	2	6	5242318	5242323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937713
120533	NC_005296	GCCT	2	8	5242324	5242331	0 %	25 %	25 %	50 %	39937713
120534	NC_005296	TGGC	2	8	5242384	5242391	0 %	25 %	50 %	25 %	39937713
120535	NC_005296	CTGC	2	8	5242428	5242435	0 %	25 %	25 %	50 %	39937713
120536	NC_005296	CCG	2	6	5242447	5242452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937713
120537	NC_005296	CTG	2	6	5242453	5242458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937713
120538	NC_005296	CGA	3	9	5242461	5242469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937713
120539	NC_005296	ACG	2	6	5242589	5242594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937714
120540	NC_005296	CGGC	2	8	5242652	5242659	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
120541	NC_005296	GGC	3	9	5242657	5242665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937714
120542	NC_005296	CGG	2	6	5242706	5242711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937714
120543	NC_005296	GGT	2	6	5242719	5242724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937714
120544	NC_005296	CGA	2	6	5242776	5242781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937714
120545	NC_005296	GC	3	6	5242853	5242858	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
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120548	NC_005296	CG	4	8	5242914	5242921	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
120549	NC_005296	GC	3	6	5242930	5242935	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
120550	NC_005296	GCA	2	6	5242973	5242978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937714
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120552	NC_005296	GCT	2	6	5243007	5243012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937714
120553	NC_005296	CTG	2	6	5243041	5243046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937714
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120555	NC_005296	GC	3	6	5243095	5243100	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
120556	NC_005296	CGCTGC	2	12	5243108	5243119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39937714
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120558	NC_005296	CGA	2	6	5243163	5243168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937714
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120561	NC_005296	CG	3	6	5243282	5243287	0 %	0 %	50 %	50 %	39937714
120562	NC_005296	CGTG	2	8	5243325	5243332	0 %	25 %	50 %	25 %	39937714
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120597	NC_005296	CG	3	6	5244720	5244725	0 %	0 %	50 %	50 %	39937716
120598	NC_005296	GGCGAT	2	12	5244729	5244740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39937716
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120600	NC_005296	CCGG	2	8	5244902	5244909	0 %	0 %	50 %	50 %	39937716
120601	NC_005296	AG	3	6	5244918	5244923	50 %	0 %	50 %	0 %	39937716
120602	NC_005296	GCC	2	6	5244943	5244948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937716
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120605	NC_005296	CGA	2	6	5245034	5245039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937716
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120607	NC_005296	CGG	2	6	5245101	5245106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937716
120608	NC_005296	CGT	2	6	5245118	5245123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937716
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