MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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118002	NC_005296	ACG	2	6	5133786	5133791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937611
118003	NC_005296	CCG	2	6	5133820	5133825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937611
118004	NC_005296	CG	3	6	5133860	5133865	0 %	0 %	50 %	50 %	39937611
118005	NC_005296	CAT	2	6	5133866	5133871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937611
118006	NC_005296	CGC	2	6	5133875	5133880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937611
118007	NC_005296	CCA	2	6	5133903	5133908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937611
118008	NC_005296	AGCC	2	8	5133933	5133940	25 %	0 %	25 %	50 %	39937611
118009	NC_005296	GCC	2	6	5133977	5133982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937611
118010	NC_005296	CTT	2	6	5133992	5133997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39937611
118011	NC_005296	CGT	2	6	5134009	5134014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937611
118012	NC_005296	CTG	2	6	5134058	5134063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937611
118013	NC_005296	GAT	2	6	5134168	5134173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937612
118014	NC_005296	CCA	2	6	5134185	5134190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937612
118015	NC_005296	GCGATC	2	12	5134196	5134207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118016	NC_005296	GC	3	6	5134270	5134275	0 %	0 %	50 %	50 %	39937612
118017	NC_005296	CGG	2	6	5134300	5134305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937612
118018	NC_005296	CGG	2	6	5134323	5134328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937612
118019	NC_005296	CGAGC	2	10	5134435	5134444	20 %	0 %	40 %	40 %	39937612
118020	NC_005296	TGA	2	6	5134470	5134475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937612
118021	NC_005296	CGA	2	6	5134512	5134517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118022	NC_005296	GAA	2	6	5134543	5134548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937612
118023	NC_005296	GC	3	6	5134671	5134676	0 %	0 %	50 %	50 %	39937612
118024	NC_005296	TCGG	2	8	5134700	5134707	0 %	25 %	50 %	25 %	39937612
118025	NC_005296	GATA	2	8	5134722	5134729	50 %	25 %	25 %	0 %	39937612
118026	NC_005296	CAG	2	6	5134777	5134782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118027	NC_005296	TCG	2	6	5134857	5134862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118028	NC_005296	ATG	2	6	5134865	5134870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937612
118029	NC_005296	CAGCG	2	10	5134882	5134891	20 %	0 %	40 %	40 %	39937612
118030	NC_005296	CAG	2	6	5134909	5134914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118031	NC_005296	CCA	2	6	5135001	5135006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937612
118032	NC_005296	GCCG	2	8	5135008	5135015	0 %	0 %	50 %	50 %	39937612
118033	NC_005296	ATC	2	6	5135042	5135047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937612
118034	NC_005296	GAG	2	6	5135063	5135068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39937612
118035	NC_005296	CGC	2	6	5135074	5135079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937612
118036	NC_005296	GCCGGC	2	12	5135113	5135124	0 %	0 %	50 %	50 %	39937612
118037	NC_005296	GCC	2	6	5135146	5135151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937612
118038	NC_005296	ACA	2	6	5135208	5135213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937612
118039	NC_005296	CAG	2	6	5135230	5135235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118040	NC_005296	GAC	2	6	5135264	5135269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118041	NC_005296	GCG	2	6	5135280	5135285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937612
118042	NC_005296	AAC	2	6	5135303	5135308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39937612
118043	NC_005296	GTGCCG	2	12	5135309	5135320	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39937612
118044	NC_005296	CAG	2	6	5135329	5135334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118045	NC_005296	CCGA	2	8	5135336	5135343	25 %	0 %	25 %	50 %	39937612
118046	NC_005296	CAG	2	6	5135398	5135403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937612
118047	NC_005296	GGT	2	6	5135419	5135424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39937612
118048	NC_005296	CCGACC	2	12	5135461	5135472	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	39937613
118049	NC_005296	GGC	2	6	5135476	5135481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937613
118050	NC_005296	CAG	3	9	5135535	5135543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937613
118051	NC_005296	GCA	2	6	5135546	5135551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937613
118052	NC_005296	CGC	2	6	5135558	5135563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937613
118053	NC_005296	CGC	2	6	5135580	5135585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937613
118054	NC_005296	CTG	2	6	5135631	5135636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937613
118055	NC_005296	GC	3	6	5135648	5135653	0 %	0 %	50 %	50 %	39937613
118056	NC_005296	CAG	2	6	5135673	5135678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937613
118057	NC_005296	CACGAA	2	12	5135679	5135690	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	39937613
118058	NC_005296	TGA	2	6	5135708	5135713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937613
118059	NC_005296	GGCGA	2	10	5135718	5135727	20 %	0 %	60 %	20 %	39937613
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118083	NC_005296	CTTG	2	8	5136653	5136660	0 %	50 %	25 %	25 %	39937614
118084	NC_005296	CG	4	8	5136674	5136681	0 %	0 %	50 %	50 %	39937614
118085	NC_005296	TCG	2	6	5136713	5136718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937614
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118087	NC_005296	GGTC	2	8	5136827	5136834	0 %	25 %	50 %	25 %	39937614
118088	NC_005296	CTG	2	6	5136846	5136851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937614
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118102	NC_005296	TCG	2	6	5137761	5137766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937615
118103	NC_005296	GC	3	6	5137794	5137799	0 %	0 %	50 %	50 %	39937615
118104	NC_005296	CAG	2	6	5137808	5137813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937615
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