MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_005296	CGG	2	6	5000060	5000065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937491
115002	NC_005296	GAC	2	6	5000100	5000105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115003	NC_005296	GCG	2	6	5000106	5000111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937491
115004	NC_005296	ACG	2	6	5000122	5000127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115005	NC_005296	GAA	2	6	5000144	5000149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937491
115006	NC_005296	CGC	2	6	5000205	5000210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937491
115007	NC_005296	GGC	2	6	5000322	5000327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937491
115008	NC_005296	GCCAGG	2	12	5000428	5000439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39937491
115009	NC_005296	TCG	2	6	5000449	5000454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115010	NC_005296	GC	3	6	5000476	5000481	0 %	0 %	50 %	50 %	39937491
115011	NC_005296	TCG	2	6	5000515	5000520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115012	NC_005296	GCGT	2	8	5000530	5000537	0 %	25 %	50 %	25 %	39937491
115013	NC_005296	CG	3	6	5000542	5000547	0 %	0 %	50 %	50 %	39937491
115014	NC_005296	CGCT	2	8	5000550	5000557	0 %	25 %	25 %	50 %	39937491
115015	NC_005296	GCT	2	6	5000567	5000572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115016	NC_005296	ATG	2	6	5000610	5000615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937491
115017	NC_005296	CGT	2	6	5000674	5000679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937491
115018	NC_005296	GGCGC	2	10	5000690	5000699	0 %	0 %	60 %	40 %	39937491
115019	NC_005296	CTG	2	6	5000895	5000900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115020	NC_005296	CGC	2	6	5001050	5001055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937492
115021	NC_005296	CGA	2	6	5001098	5001103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115022	NC_005296	CATCGC	2	12	5001104	5001115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	39937492
115023	NC_005296	GC	3	6	5001165	5001170	0 %	0 %	50 %	50 %	39937492
115024	NC_005296	AAG	2	6	5001189	5001194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937492
115025	NC_005296	GCC	2	6	5001311	5001316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937492
115026	NC_005296	TGGG	2	8	5001337	5001344	0 %	25 %	75 %	0 %	39937492
115027	NC_005296	CGA	2	6	5001368	5001373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115028	NC_005296	CGT	2	6	5001443	5001448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115029	NC_005296	GCG	2	6	5001474	5001479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937492
115030	NC_005296	GATC	2	8	5001539	5001546	25 %	25 %	25 %	25 %	39937492
115031	NC_005296	ATC	2	6	5001696	5001701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39937492
115032	NC_005296	CGG	2	6	5001719	5001724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937492
115033	NC_005296	CGT	2	6	5001731	5001736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115034	NC_005296	CGG	2	6	5001743	5001748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937492
115035	NC_005296	GCG	2	6	5001805	5001810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937492
115036	NC_005296	CAC	2	6	5001845	5001850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39937492
115037	NC_005296	CGA	2	6	5001884	5001889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115038	NC_005296	TGC	2	6	5001961	5001966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115039	NC_005296	ACG	2	6	5001985	5001990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115040	NC_005296	GCT	2	6	5002013	5002018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115041	NC_005296	GATC	2	8	5002178	5002185	25 %	25 %	25 %	25 %	39937492
115042	NC_005296	GTC	2	6	5002206	5002211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
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115044	NC_005296	TCG	2	6	5002267	5002272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115045	NC_005296	GGTCGA	2	12	5002295	5002306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	39937492
115046	NC_005296	TCG	2	6	5002357	5002362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
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115048	NC_005296	GGC	2	6	5002416	5002421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937492
115049	NC_005296	GTC	2	6	5002433	5002438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937492
115050	NC_005296	GAA	2	6	5002469	5002474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39937492
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115052	NC_005296	CGG	2	6	5002803	5002808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937493
115053	NC_005296	GCG	2	6	5002812	5002817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39937493
115054	NC_005296	CGC	2	6	5002839	5002844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39937493
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115057	NC_005296	GCA	2	6	5003000	5003005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937493
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115060	NC_005296	CGA	2	6	5003067	5003072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937493
115061	NC_005296	GAT	2	6	5003110	5003115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39937493
115062	NC_005296	TCG	2	6	5003117	5003122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937493
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115083	NC_005296	TCGAG	2	10	5004147	5004156	20 %	20 %	40 %	20 %	39937493
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115097	NC_005296	CAG	2	6	5004676	5004681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39937493
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115116	NC_005296	CTG	2	6	5005312	5005317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39937493
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