MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_005296	TCG	2	6	477582	477587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933509
11002	NC_005296	TCG	2	6	477609	477614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933509
11003	NC_005296	TGA	2	6	477616	477621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933509
11004	NC_005296	GCG	2	6	477633	477638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933509
11005	NC_005296	GGC	2	6	477686	477691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933509
11006	NC_005296	CGGA	2	8	477785	477792	25 %	0 %	50 %	25 %	39933509
11007	NC_005296	TCGG	2	8	477831	477838	0 %	25 %	50 %	25 %	39933509
11008	NC_005296	GCC	2	6	477860	477865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933509
11009	NC_005296	CGGC	2	8	477873	477880	0 %	0 %	50 %	50 %	39933509
11010	NC_005296	GGA	2	6	477916	477921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933509
11011	NC_005296	GGC	2	6	477947	477952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933509
11012	NC_005296	CAC	2	6	477953	477958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933509
11013	NC_005296	ACG	2	6	477969	477974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933509
11014	NC_005296	CGA	2	6	477991	477996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933509
11015	NC_005296	GGCG	2	8	478012	478019	0 %	0 %	75 %	25 %	39933509
11016	NC_005296	TGT	2	6	478437	478442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933510
11017	NC_005296	AGC	2	6	478451	478456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933510
11018	NC_005296	GC	3	6	478465	478470	0 %	0 %	50 %	50 %	39933510
11019	NC_005296	CTT	3	9	478477	478485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933510
11020	NC_005296	CGG	2	6	478535	478540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933510
11021	NC_005296	TGG	2	6	478644	478649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933510
11022	NC_005296	TGA	2	6	478659	478664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933510
11023	NC_005296	CAA	2	6	478860	478865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933511
11024	NC_005296	GTC	2	6	478926	478931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933511
11025	NC_005296	CGC	2	6	478983	478988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933511
11026	NC_005296	TTC	2	6	479010	479015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933511
11027	NC_005296	TCG	2	6	479035	479040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933511
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11030	NC_005296	GC	3	6	479066	479071	0 %	0 %	50 %	50 %	39933511
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11032	NC_005296	AGC	2	6	479092	479097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933511
11033	NC_005296	GC	3	6	479260	479265	0 %	0 %	50 %	50 %	39933511
11034	NC_005296	GCG	2	6	479294	479299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933511
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11038	NC_005296	GTC	2	6	479397	479402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933511
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11052	NC_005296	GCA	2	6	479848	479853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933512
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11054	NC_005296	TCG	2	6	479886	479891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933512
11055	NC_005296	TCG	2	6	479994	479999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933512
11056	NC_005296	CGC	2	6	480103	480108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933512
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11058	NC_005296	GCC	2	6	480173	480178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933512
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11089	NC_005296	TGAT	2	8	481607	481614	25 %	50 %	25 %	0 %	39933513
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11093	NC_005296	GC	3	6	481694	481699	0 %	0 %	50 %	50 %	39933513
11094	NC_005296	TCT	2	6	481743	481748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933513
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11103	NC_005296	GCG	2	6	482197	482202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933513
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11110	NC_005296	GCC	2	6	482335	482340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933513
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11115	NC_005296	CGGC	2	8	482405	482412	0 %	0 %	50 %	50 %	39933513
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11121	NC_005296	CTT	2	6	482521	482526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933513
11122	NC_005296	GCG	2	6	482590	482595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933513
11123	NC_005296	CGG	2	6	482601	482606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933513
11124	NC_005296	CGGCG	2	10	482640	482649	0 %	0 %	60 %	40 %	39933513
11125	NC_005296	CAGC	2	8	482703	482710	25 %	0 %	25 %	50 %	39933513
11126	NC_005296	GCGG	2	8	482719	482726	0 %	0 %	75 %	25 %	39933513
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11132	NC_005296	CTT	2	6	482833	482838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933513
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11135	NC_005296	TCG	2	6	482870	482875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933513
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11242	NC_005296	CGA	2	6	487852	487857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933518
11243	NC_005296	TTCG	2	8	487963	487970	0 %	50 %	25 %	25 %	39933518
11244	NC_005296	CAA	2	6	487993	487998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933518
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11361	NC_005296	CG	3	6	492853	492858	0 %	0 %	50 %	50 %	39933522
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11364	NC_005296	TCG	2	6	493090	493095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933523
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11481	NC_005296	GGC	2	6	498238	498243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933529
11482	NC_005296	CG	3	6	498258	498263	0 %	0 %	50 %	50 %	39933529
11483	NC_005296	AGC	2	6	498371	498376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933529
11484	NC_005296	AGC	2	6	498428	498433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933529
11485	NC_005296	GCT	2	6	498458	498463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933529
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