MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_005027	TGGG	2	8	1322560	1322567	0 %	25 %	75 %	0 %	32472019
25003	NC_005027	TCG	2	6	1322639	1322644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472019
25004	NC_005027	TCG	2	6	1322652	1322657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472019
25005	NC_005027	AGCG	2	8	1322664	1322671	25 %	0 %	50 %	25 %	32472019
25006	NC_005027	TGG	2	6	1322688	1322693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472019
25007	NC_005027	ATC	2	6	1322804	1322809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472019
25008	NC_005027	GTT	2	6	1322841	1322846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472019
25009	NC_005027	GGT	2	6	1322917	1322922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472019
25010	NC_005027	CGG	2	6	1322949	1322954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472019
25011	NC_005027	GTT	2	6	1322967	1322972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472019
25012	NC_005027	GGA	2	6	1323021	1323026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32472019
25013	NC_005027	GTG	2	6	1323040	1323045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472019
25014	NC_005027	GGA	2	6	1323054	1323059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32472019
25015	NC_005027	CGC	2	6	1323066	1323071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472019
25016	NC_005027	TTC	2	6	1323082	1323087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32472019
25017	NC_005027	CGG	2	6	1323109	1323114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472019
25018	NC_005027	CGC	2	6	1323224	1323229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472019
25019	NC_005027	CAG	2	6	1323250	1323255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472019
25020	NC_005027	GCA	2	6	1323289	1323294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472019
25021	NC_005027	TTG	2	6	1323298	1323303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472019
25022	NC_005027	TGCG	2	8	1323400	1323407	0 %	25 %	50 %	25 %	32472020
25023	NC_005027	CAAG	2	8	1323491	1323498	50 %	0 %	25 %	25 %	32472020
25024	NC_005027	TGT	2	6	1323586	1323591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472020
25025	NC_005027	CGA	2	6	1323599	1323604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472020
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25027	NC_005027	GTT	2	6	1323632	1323637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472020
25028	NC_005027	CGAT	2	8	1323638	1323645	25 %	25 %	25 %	25 %	32472020
25029	NC_005027	CGC	2	6	1323682	1323687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472020
25030	NC_005027	TCGA	2	8	1323711	1323718	25 %	25 %	25 %	25 %	32472020
25031	NC_005027	GCG	2	6	1323752	1323757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472020
25032	NC_005027	TTG	2	6	1323759	1323764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472020
25033	NC_005027	AGTC	2	8	1323822	1323829	25 %	25 %	25 %	25 %	32472020
25034	NC_005027	GCG	2	6	1323870	1323875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472020
25035	NC_005027	GTG	2	6	1323916	1323921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472020
25036	NC_005027	ATTTG	2	10	1323922	1323931	20 %	60 %	20 %	0 %	32472020
25037	NC_005027	GTTCG	2	10	1323938	1323947	0 %	40 %	40 %	20 %	32472020
25038	NC_005027	GTCA	2	8	1324023	1324030	25 %	25 %	25 %	25 %	32472020
25039	NC_005027	AG	3	6	1324034	1324039	50 %	0 %	50 %	0 %	32472020
25040	NC_005027	TC	3	6	1324131	1324136	0 %	50 %	0 %	50 %	32472020
25041	NC_005027	GTTTG	2	10	1324202	1324211	0 %	60 %	40 %	0 %	32472020
25042	NC_005027	CGG	2	6	1324222	1324227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472020
25043	NC_005027	TGA	2	6	1324261	1324266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32472020
25044	NC_005027	GTT	2	6	1324313	1324318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472020
25045	NC_005027	GCT	2	6	1324328	1324333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472020
25046	NC_005027	CAT	2	6	1324404	1324409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472020
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25048	NC_005027	CTT	2	6	1324492	1324497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32472020
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25051	NC_005027	CGG	2	6	1324549	1324554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472020
25052	NC_005027	GCC	2	6	1324562	1324567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472020
25053	NC_005027	CAT	2	6	1324591	1324596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472020
25054	NC_005027	GAT	2	6	1324793	1324798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32472020
25055	NC_005027	GTT	2	6	1324814	1324819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472020
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25057	NC_005027	GGT	2	6	1324965	1324970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472021
25058	NC_005027	TTGGGT	2	12	1324983	1324994	0 %	50 %	50 %	0 %	32472021
25059	NC_005027	TTG	2	6	1324998	1325003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472021
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25070	NC_005027	GAT	2	6	1325474	1325479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32472022
25071	NC_005027	TCA	2	6	1325484	1325489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472022
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25077	NC_005027	AATC	2	8	1325756	1325763	50 %	25 %	0 %	25 %	32472022
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25082	NC_005027	TTGG	2	8	1325969	1325976	0 %	50 %	50 %	0 %	32472022
25083	NC_005027	GATTCT	2	12	1326188	1326199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32472022
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25088	NC_005027	CGG	2	6	1326375	1326380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472023
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25101	NC_005027	CAC	2	6	1326885	1326890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32472024
25102	NC_005027	CGAT	2	8	1326930	1326937	25 %	25 %	25 %	25 %	32472024
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25117	NC_005027	ATC	2	6	1327327	1327332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472024
25118	NC_005027	GAT	2	6	1327344	1327349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32472024
25119	NC_005027	TCG	2	6	1327415	1327420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472024
25120	NC_005027	CCTG	2	8	1327440	1327447	0 %	25 %	25 %	50 %	32472024
25121	NC_005027	CGT	2	6	1327465	1327470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472024
25122	NC_005027	CGA	2	6	1327527	1327532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472024
25123	NC_005027	TCG	2	6	1327536	1327541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472024
25124	NC_005027	TCA	2	6	1327550	1327555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472024
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25127	NC_005027	TCG	2	6	1327673	1327678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472024
25128	NC_005027	CGG	2	6	1327683	1327688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472024
25129	NC_005027	TTG	2	6	1327699	1327704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472024
25130	NC_005027	CATGG	2	10	1327716	1327725	20 %	20 %	40 %	20 %	32472024
25131	NC_005027	TCGA	2	8	1327756	1327763	25 %	25 %	25 %	25 %	32472024
25132	NC_005027	A	6	6	1327808	1327813	100 %	0 %	0 %	0 %	32472024
25133	NC_005027	GTC	2	6	1327900	1327905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472024
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25138	NC_005027	CGA	2	6	1328316	1328321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472024
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25140	NC_005027	GAA	2	6	1328527	1328532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32472024
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25142	NC_005027	CGA	2	6	1328583	1328588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472024
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25145	NC_005027	GCC	2	6	1328662	1328667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472024
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25151	NC_005027	CG	3	6	1329223	1329228	0 %	0 %	50 %	50 %	32472026
25152	NC_005027	GGT	2	6	1329265	1329270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472026
25153	NC_005027	CGAT	2	8	1329377	1329384	25 %	25 %	25 %	25 %	32472026
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25155	NC_005027	ACCG	2	8	1329522	1329529	25 %	0 %	25 %	50 %	32472026
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25219	NC_005027	AACC	2	8	1333811	1333818	50 %	0 %	0 %	50 %	32472030
25220	NC_005027	GTG	2	6	1333897	1333902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32472030
25221	NC_005027	GGCTG	2	10	1333946	1333955	0 %	20 %	60 %	20 %	32472030
25222	NC_005027	ACTTG	2	10	1334008	1334017	20 %	40 %	20 %	20 %	32472031
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25225	NC_005027	CATC	2	8	1334177	1334184	25 %	25 %	0 %	50 %	32472031
25226	NC_005027	CGA	2	6	1334224	1334229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472031
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25230	NC_005027	GTT	2	6	1334479	1334484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32472031
25231	NC_005027	ACA	2	6	1334502	1334507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32472031
25232	NC_005027	CGA	2	6	1334530	1334535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472031
25233	NC_005027	GAC	2	6	1334600	1334605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472031
25234	NC_005027	CGGA	2	8	1334697	1334704	25 %	0 %	50 %	25 %	32472031
25235	NC_005027	TCG	2	6	1334742	1334747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472031
25236	NC_005027	ATC	2	6	1334775	1334780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472031
25237	NC_005027	TGA	2	6	1334793	1334798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32472031
25238	NC_005027	ATGA	2	8	1334813	1334820	50 %	25 %	25 %	0 %	32472031
25239	NC_005027	TGC	2	6	1334835	1334840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472031
25240	NC_005027	TGC	2	6	1335120	1335125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472031
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25245	NC_005027	GTGG	2	8	1335816	1335823	0 %	25 %	75 %	0 %	32472033
25246	NC_005027	CGA	2	6	1335827	1335832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472033
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25253	NC_005027	AGC	2	6	1336167	1336172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472034
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25302	NC_005027	ACC	2	6	1339341	1339346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32472038
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25309	NC_005027	CGC	2	6	1339592	1339597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472038
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25314	NC_005027	ACC	2	6	1339967	1339972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32472038
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25322	NC_005027	AGCCG	2	10	1340368	1340377	20 %	0 %	40 %	40 %	32472039
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25330	NC_005027	GACTTC	2	12	1340782	1340793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32472039
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25333	NC_005027	CAA	2	6	1340908	1340913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32472039
25334	NC_005027	GCT	2	6	1340920	1340925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472039
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25336	NC_005027	TTTG	2	8	1340946	1340953	0 %	75 %	25 %	0 %	32472039
25337	NC_005027	ATC	2	6	1340966	1340971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472039
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25340	NC_005027	CGT	2	6	1341060	1341065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472039
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25343	NC_005027	GCG	2	6	1341310	1341315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472040
25344	NC_005027	CTG	2	6	1341355	1341360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32472040
25345	NC_005027	CGA	2	6	1341377	1341382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472040
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25347	NC_005027	TCA	2	6	1341530	1341535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472040
25348	NC_005027	CCT	2	6	1341541	1341546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32472041
25349	NC_005027	GCTGA	2	10	1341563	1341572	20 %	20 %	40 %	20 %	32472041
25350	NC_005027	CAACG	2	10	1341596	1341605	40 %	0 %	20 %	40 %	32472041
25351	NC_005027	CGC	2	6	1341787	1341792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472041
25352	NC_005027	GGA	2	6	1341833	1341838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32472041
25353	NC_005027	TGAA	2	8	1341855	1341862	50 %	25 %	25 %	0 %	32472041
25354	NC_005027	GCG	2	6	1341897	1341902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472041
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25454	NC_005027	CGA	2	6	1346962	1346967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32472049
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25458	NC_005027	CCAA	2	8	1347125	1347132	50 %	0 %	0 %	50 %	32472049
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25460	NC_005027	GA	3	6	1347245	1347250	50 %	0 %	50 %	0 %	32472050
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25464	NC_005027	CGG	2	6	1347414	1347419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32472050
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25467	NC_005027	CCA	2	6	1347582	1347587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32472050
25468	NC_005027	CAT	2	6	1347589	1347594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32472050
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25490	NC_005027	CGC	2	6	1348795	1348800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472052
25491	NC_005027	CCG	2	6	1348805	1348810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32472052
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