MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_005027	ACA	2	6	109178	109183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470783
2002	NC_005027	CCG	2	6	109224	109229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470783
2003	NC_005027	TCA	2	6	109245	109250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470783
2004	NC_005027	TCT	2	6	109473	109478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470784
2005	NC_005027	CAA	2	6	109499	109504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470784
2006	NC_005027	TGT	2	6	109521	109526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470784
2007	NC_005027	TCA	2	6	109572	109577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470784
2008	NC_005027	GCA	2	6	109584	109589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2009	NC_005027	CTTTG	2	10	109592	109601	0 %	60 %	20 %	20 %	32470784
2010	NC_005027	TGGC	2	8	109614	109621	0 %	25 %	50 %	25 %	32470784
2011	NC_005027	GGC	2	6	109634	109639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470784
2012	NC_005027	TGAT	2	8	109742	109749	25 %	50 %	25 %	0 %	32470784
2013	NC_005027	CGC	2	6	109760	109765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470784
2014	NC_005027	GTTT	2	8	109815	109822	0 %	75 %	25 %	0 %	32470784
2015	NC_005027	GCT	2	6	109856	109861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2016	NC_005027	CGA	2	6	109992	109997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2017	NC_005027	CAA	2	6	110066	110071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470784
2018	NC_005027	ATC	2	6	110163	110168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470784
2019	NC_005027	CAC	2	6	110209	110214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470784
2020	NC_005027	ACG	2	6	110238	110243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2021	NC_005027	T	6	6	110337	110342	0 %	100 %	0 %	0 %	32470784
2022	NC_005027	GCTT	2	8	110391	110398	0 %	50 %	25 %	25 %	32470784
2023	NC_005027	TTGCG	2	10	110452	110461	0 %	40 %	40 %	20 %	32470784
2024	NC_005027	GCTG	2	8	110549	110556	0 %	25 %	50 %	25 %	32470784
2025	NC_005027	TTG	2	6	110597	110602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470784
2026	NC_005027	ACG	2	6	110630	110635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2027	NC_005027	CGA	2	6	110714	110719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2028	NC_005027	ATC	2	6	110733	110738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470784
2029	NC_005027	TTC	2	6	110771	110776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470784
2030	NC_005027	TGC	2	6	110824	110829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2031	NC_005027	TCA	2	6	110922	110927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470784
2032	NC_005027	CGAAT	2	10	110948	110957	40 %	20 %	20 %	20 %	32470784
2033	NC_005027	CAG	2	6	111074	111079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2034	NC_005027	TGC	2	6	111136	111141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470784
2035	NC_005027	GTC	2	6	111208	111213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470785
2036	NC_005027	TGTTT	2	10	111324	111333	0 %	80 %	20 %	0 %	32470785
2037	NC_005027	GGA	2	6	111334	111339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470785
2038	NC_005027	TCGC	2	8	111344	111351	0 %	25 %	25 %	50 %	32470785
2039	NC_005027	CGA	2	6	111508	111513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470785
2040	NC_005027	TG	3	6	111564	111569	0 %	50 %	50 %	0 %	32470785
2041	NC_005027	CGA	2	6	111576	111581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470785
2042	NC_005027	CAA	2	6	111627	111632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470785
2043	NC_005027	ATC	2	6	111646	111651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470785
2044	NC_005027	ACG	2	6	111749	111754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470785
2045	NC_005027	GTT	2	6	111757	111762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470785
2046	NC_005027	TTG	2	6	111823	111828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470785
2047	NC_005027	TCC	2	6	112038	112043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470785
2048	NC_005027	CTG	2	6	112064	112069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470785
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2050	NC_005027	GATG	2	8	112120	112127	25 %	25 %	50 %	0 %	32470785
2051	NC_005027	AAC	2	6	112129	112134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470785
2052	NC_005027	TCA	2	6	112146	112151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470785
2053	NC_005027	T	6	6	112445	112450	0 %	100 %	0 %	0 %	32470786
2054	NC_005027	GAC	2	6	112457	112462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470786
2055	NC_005027	GTTT	2	8	112464	112471	0 %	75 %	25 %	0 %	32470786
2056	NC_005027	CGA	2	6	112511	112516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470786
2057	NC_005027	TCAA	2	8	112531	112538	50 %	25 %	0 %	25 %	32470786
2058	NC_005027	CG	3	6	112688	112693	0 %	0 %	50 %	50 %	32470786
2059	NC_005027	CCG	2	6	112728	112733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470786
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2061	NC_005027	ATG	2	6	112885	112890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470786
2062	NC_005027	CGA	2	6	112977	112982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470786
2063	NC_005027	GCC	2	6	113006	113011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470786
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2069	NC_005027	GGC	2	6	113141	113146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470786
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2082	NC_005027	A	6	6	113832	113837	100 %	0 %	0 %	0 %	32470786
2083	NC_005027	CTG	2	6	113910	113915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470786
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2088	NC_005027	GAA	2	6	114027	114032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470786
2089	NC_005027	GTTTCA	2	12	114054	114065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32470786
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2091	NC_005027	CGAC	2	8	114148	114155	25 %	0 %	25 %	50 %	32470786
2092	NC_005027	CG	3	6	114165	114170	0 %	0 %	50 %	50 %	32470786
2093	NC_005027	GATC	2	8	114197	114204	25 %	25 %	25 %	25 %	32470786
2094	NC_005027	GAAG	2	8	114266	114273	50 %	0 %	50 %	0 %	32470786
2095	NC_005027	GTCA	2	8	114274	114281	25 %	25 %	25 %	25 %	32470786
2096	NC_005027	GTC	2	6	114332	114337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470786
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2098	NC_005027	TTG	2	6	114420	114425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470786
2099	NC_005027	GAT	2	6	114431	114436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470786
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2105	NC_005027	CAG	2	6	114936	114941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470786
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2107	NC_005027	CGT	2	6	115011	115016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470786
2108	NC_005027	CTA	2	6	115115	115120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470786
2109	NC_005027	CAAT	2	8	115169	115176	50 %	25 %	0 %	25 %	32470786
2110	NC_005027	AGC	2	6	115334	115339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470786
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2112	NC_005027	CGCC	2	8	115561	115568	0 %	0 %	25 %	75 %	32470786
2113	NC_005027	GCC	2	6	115584	115589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470786
2114	NC_005027	CTA	2	6	115640	115645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470786
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2118	NC_005027	AGCCA	2	10	115861	115870	40 %	0 %	20 %	40 %	32470787
2119	NC_005027	GGCG	2	8	115935	115942	0 %	0 %	75 %	25 %	32470787
2120	NC_005027	ATCGG	2	10	116137	116146	20 %	20 %	40 %	20 %	32470787
2121	NC_005027	CGA	2	6	116151	116156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470787
2122	NC_005027	CAT	2	6	116163	116168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470787
2123	NC_005027	CGAT	2	8	116170	116177	25 %	25 %	25 %	25 %	32470787
2124	NC_005027	ATCA	2	8	116191	116198	50 %	25 %	0 %	25 %	32470787
2125	NC_005027	GATC	2	8	116228	116235	25 %	25 %	25 %	25 %	32470787
2126	NC_005027	GTC	2	6	116243	116248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470787
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2130	NC_005027	CGG	2	6	116695	116700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470787
2131	NC_005027	CGTG	2	8	116740	116747	0 %	25 %	50 %	25 %	32470787
2132	NC_005027	CAC	2	6	116752	116757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470787
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2240	NC_005027	CAAAA	2	10	123049	123058	80 %	0 %	0 %	20 %	32470795
2241	NC_005027	CCA	2	6	123118	123123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470795
2242	NC_005027	TCG	2	6	123133	123138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470795
2243	NC_005027	CACT	2	8	123144	123151	25 %	25 %	0 %	50 %	32470795
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2489	NC_005027	TGG	2	6	137206	137211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470816
2490	NC_005027	CAAT	2	8	137239	137246	50 %	25 %	0 %	25 %	32470816
2491	NC_005027	CGA	2	6	137300	137305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470816
2492	NC_005027	GTTC	2	8	137379	137386	0 %	50 %	25 %	25 %	32470816
2493	NC_005027	GCA	2	6	137426	137431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470816
2494	NC_005027	CAGT	2	8	137434	137441	25 %	25 %	25 %	25 %	32470816
2495	NC_005027	CGG	2	6	137447	137452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470816
2496	NC_005027	TGT	2	6	137476	137481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470816
2497	NC_005027	TCG	2	6	137529	137534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470816
2498	NC_005027	TTGG	2	8	137624	137631	0 %	50 %	50 %	0 %	32470816
2499	NC_005027	TGG	2	6	137650	137655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470816
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