MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_005027	CGCGAT	2	12	630801	630812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	32471309
12002	NC_005027	TTTTCC	2	12	630859	630870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471309
12003	NC_005027	GCC	2	6	630906	630911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471309
12004	NC_005027	TTC	2	6	630927	630932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471309
12005	NC_005027	TCG	2	6	630968	630973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471309
12006	NC_005027	CGT	2	6	630986	630991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471309
12007	NC_005027	ACC	2	6	631002	631007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471309
12008	NC_005027	GCC	2	6	631029	631034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471309
12009	NC_005027	T	6	6	631059	631064	0 %	100 %	0 %	0 %	32471309
12010	NC_005027	TCC	2	6	631069	631074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32471309
12011	NC_005027	GCC	2	6	631075	631080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471309
12012	NC_005027	GGTGG	2	10	631201	631210	0 %	20 %	80 %	0 %	32471310
12013	NC_005027	CGC	2	6	631232	631237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471310
12014	NC_005027	GAA	2	6	631254	631259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471310
12015	NC_005027	GGCGG	2	10	631307	631316	0 %	0 %	80 %	20 %	32471310
12016	NC_005027	TGGG	2	8	631364	631371	0 %	25 %	75 %	0 %	32471310
12017	NC_005027	G	6	6	631377	631382	0 %	0 %	100 %	0 %	32471310
12018	NC_005027	ACTT	2	8	631533	631540	25 %	50 %	0 %	25 %	32471311
12019	NC_005027	CCCT	2	8	631543	631550	0 %	25 %	0 %	75 %	32471311
12020	NC_005027	AGGG	2	8	631552	631559	25 %	0 %	75 %	0 %	32471311
12021	NC_005027	GT	3	6	631600	631605	0 %	50 %	50 %	0 %	32471311
12022	NC_005027	CCCTC	2	10	631608	631617	0 %	20 %	0 %	80 %	32471311
12023	NC_005027	GAGG	2	8	631875	631882	25 %	0 %	75 %	0 %	32471311
12024	NC_005027	CGT	2	6	632068	632073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471312
12025	NC_005027	TGC	2	6	632095	632100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471312
12026	NC_005027	GGCACA	2	12	632134	632145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471312
12027	NC_005027	ACG	2	6	632235	632240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471312
12028	NC_005027	GGT	2	6	632360	632365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471312
12029	NC_005027	GCG	2	6	632440	632445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471312
12030	NC_005027	ATC	2	6	632469	632474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471312
12031	NC_005027	CCG	2	6	632479	632484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471312
12032	NC_005027	CGG	2	6	632500	632505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471312
12033	NC_005027	GCT	2	6	632557	632562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471313
12034	NC_005027	CTTG	2	8	632611	632618	0 %	50 %	25 %	25 %	32471313
12035	NC_005027	CTT	2	6	632620	632625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471313
12036	NC_005027	GGC	2	6	632647	632652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471313
12037	NC_005027	GCC	2	6	632736	632741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12038	NC_005027	TCG	2	6	632772	632777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471313
12039	NC_005027	TGG	2	6	632787	632792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471313
12040	NC_005027	CCG	2	6	632793	632798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12041	NC_005027	TCG	2	6	632847	632852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471313
12042	NC_005027	CGCT	2	8	632865	632872	0 %	25 %	25 %	50 %	32471313
12043	NC_005027	CGCC	2	8	632896	632903	0 %	0 %	25 %	75 %	32471313
12044	NC_005027	TTC	2	6	632904	632909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471313
12045	NC_005027	GCC	2	6	632913	632918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12046	NC_005027	GGTT	2	8	632930	632937	0 %	50 %	50 %	0 %	32471313
12047	NC_005027	TTC	2	6	633033	633038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471313
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12050	NC_005027	CGG	2	6	633226	633231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471313
12051	NC_005027	T	6	6	633232	633237	0 %	100 %	0 %	0 %	32471313
12052	NC_005027	CGG	2	6	633314	633319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471313
12053	NC_005027	GAC	2	6	633362	633367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471313
12054	NC_005027	CGG	2	6	633373	633378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471313
12055	NC_005027	GCG	2	6	633392	633397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471313
12056	NC_005027	CGC	2	6	633437	633442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12057	NC_005027	GAC	2	6	633443	633448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471313
12058	NC_005027	TCT	2	6	633486	633491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471313
12059	NC_005027	TGA	2	6	633589	633594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471313
12060	NC_005027	CCGT	2	8	633615	633622	0 %	25 %	25 %	50 %	32471313
12061	NC_005027	ATC	2	6	633656	633661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471313
12062	NC_005027	GT	3	6	633721	633726	0 %	50 %	50 %	0 %	32471313
12063	NC_005027	TGG	2	6	633793	633798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471313
12064	NC_005027	CGC	2	6	633819	633824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12065	NC_005027	CTGC	2	8	633926	633933	0 %	25 %	25 %	50 %	32471313
12066	NC_005027	TCG	2	6	633978	633983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471313
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12068	NC_005027	CCG	2	6	634038	634043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471313
12069	NC_005027	TCA	2	6	634158	634163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471314
12070	NC_005027	CGT	2	6	634196	634201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471314
12071	NC_005027	TCG	2	6	634225	634230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471314
12072	NC_005027	A	7	7	634232	634238	100 %	0 %	0 %	0 %	32471314
12073	NC_005027	GCC	2	6	634289	634294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471314
12074	NC_005027	CGT	2	6	634304	634309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471314
12075	NC_005027	TCA	3	9	634329	634337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471314
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12077	NC_005027	TTC	2	6	634468	634473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471314
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12079	NC_005027	CGG	2	6	634516	634521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471314
12080	NC_005027	ACG	2	6	634524	634529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471314
12081	NC_005027	GCT	2	6	634611	634616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471315
12082	NC_005027	TGG	2	6	634651	634656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471315
12083	NC_005027	ATG	2	6	634758	634763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471315
12084	NC_005027	ATCGC	2	10	634768	634777	20 %	20 %	20 %	40 %	32471315
12085	NC_005027	GTC	3	9	634783	634791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471315
12086	NC_005027	GATCG	2	10	634896	634905	20 %	20 %	40 %	20 %	32471315
12087	NC_005027	GGT	2	6	634910	634915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471315
12088	NC_005027	GTC	2	6	634931	634936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471315
12089	NC_005027	AAC	2	6	634978	634983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471315
12090	NC_005027	CTG	2	6	635004	635009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471315
12091	NC_005027	GCAC	2	8	635125	635132	25 %	0 %	25 %	50 %	32471315
12092	NC_005027	AAG	2	6	635140	635145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471315
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12094	NC_005027	ACG	2	6	635197	635202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471315
12095	NC_005027	ACC	2	6	635223	635228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471315
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12097	NC_005027	CTT	2	6	635464	635469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471316
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12099	NC_005027	ACC	2	6	635525	635530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471316
12100	NC_005027	CAA	2	6	635539	635544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471316
12101	NC_005027	CAAG	2	8	635632	635639	50 %	0 %	25 %	25 %	32471316
12102	NC_005027	TGA	2	6	635652	635657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471316
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12104	NC_005027	GAA	2	6	635855	635860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471316
12105	NC_005027	CGA	2	6	635875	635880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471316
12106	NC_005027	GTT	2	6	635881	635886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471316
12107	NC_005027	GTT	3	9	635962	635970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471316
12108	NC_005027	CAC	2	6	635989	635994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471316
12109	NC_005027	TCG	2	6	636063	636068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471316
12110	NC_005027	GAT	2	6	636076	636081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471316
12111	NC_005027	CTC	2	6	636156	636161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32471316
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12113	NC_005027	TGA	2	6	636247	636252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471316
12114	NC_005027	TTC	2	6	636274	636279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471316
12115	NC_005027	ACTGG	2	10	636351	636360	20 %	20 %	40 %	20 %	32471316
12116	NC_005027	TCGC	2	8	636396	636403	0 %	25 %	25 %	50 %	32471316
12117	NC_005027	GCGTTG	2	12	636404	636415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	32471316
12118	NC_005027	TGT	2	6	636441	636446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471316
12119	NC_005027	GCA	2	6	636450	636455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471316
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12121	NC_005027	CGA	3	9	636535	636543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471316
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12361	NC_005027	ACG	2	6	649180	649185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471328
12362	NC_005027	CGA	2	6	649193	649198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471328
12363	NC_005027	GTC	2	6	649324	649329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471328
12364	NC_005027	ACG	2	6	649360	649365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471328
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12374	NC_005027	CGT	2	6	649857	649862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471330
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12388	NC_005027	TGC	2	6	651211	651216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471331
12389	NC_005027	TC	3	6	651230	651235	0 %	50 %	0 %	50 %	32471331
12390	NC_005027	CGA	2	6	651266	651271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471331
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12393	NC_005027	TC	3	6	651340	651345	0 %	50 %	0 %	50 %	32471331
12394	NC_005027	GAC	2	6	651423	651428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471331
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12433	NC_005027	TGTT	2	8	653349	653356	0 %	75 %	25 %	0 %	32471335
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12463	NC_005027	CTT	2	6	655039	655044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471338
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12470	NC_005027	TGCT	2	8	655463	655470	0 %	50 %	25 %	25 %	32471338
12471	NC_005027	TCG	2	6	655618	655623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471338
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12474	NC_005027	GGGA	2	8	656081	656088	25 %	0 %	75 %	0 %	32471339
12475	NC_005027	CGG	2	6	656125	656130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471339
12476	NC_005027	CGAC	2	8	656253	656260	25 %	0 %	25 %	50 %	32471340
12477	NC_005027	TTCGG	2	10	656278	656287	0 %	40 %	40 %	20 %	32471340
12478	NC_005027	CGA	2	6	656297	656302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471340
12479	NC_005027	ATTG	2	8	656312	656319	25 %	50 %	25 %	0 %	32471340
12480	NC_005027	CATT	2	8	656404	656411	25 %	50 %	0 %	25 %	32471340
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12482	NC_005027	AT	3	6	656546	656551	50 %	50 %	0 %	0 %	32471340
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