MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_005027	CAG	2	6	581211	581216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11002	NC_005027	GGC	2	6	581247	581252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471244
11003	NC_005027	CGA	2	6	581273	581278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11004	NC_005027	ATCCAA	2	12	581307	581318	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32471244
11005	NC_005027	GGT	3	9	581334	581342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471244
11006	NC_005027	GCG	2	6	581353	581358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471244
11007	NC_005027	CGG	2	6	581372	581377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471244
11008	NC_005027	CAC	2	6	581480	581485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471244
11009	NC_005027	AATCC	2	10	581486	581495	40 %	20 %	0 %	40 %	32471244
11010	NC_005027	GGC	2	6	581496	581501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471244
11011	NC_005027	GTT	2	6	581508	581513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471244
11012	NC_005027	GTC	2	6	581559	581564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11013	NC_005027	GAG	2	6	581583	581588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32471244
11014	NC_005027	GTG	2	6	581654	581659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471244
11015	NC_005027	CGT	2	6	581669	581674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11016	NC_005027	TGGA	2	8	581681	581688	25 %	25 %	50 %	0 %	32471244
11017	NC_005027	TCA	2	6	581723	581728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471244
11018	NC_005027	AGC	2	6	581783	581788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11019	NC_005027	CGG	2	6	581792	581797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471244
11020	NC_005027	CTT	2	6	581820	581825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471244
11021	NC_005027	GAT	2	6	581896	581901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471244
11022	NC_005027	ACA	2	6	581927	581932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471244
11023	NC_005027	TCGGA	2	10	582061	582070	20 %	20 %	40 %	20 %	32471244
11024	NC_005027	TGG	2	6	582104	582109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471244
11025	NC_005027	GTTG	2	8	582114	582121	0 %	50 %	50 %	0 %	32471244
11026	NC_005027	TTC	2	6	582123	582128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471244
11027	NC_005027	TCA	2	6	582136	582141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471244
11028	NC_005027	GGTC	2	8	582149	582156	0 %	25 %	50 %	25 %	32471244
11029	NC_005027	GTC	2	6	582189	582194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11030	NC_005027	TCGC	2	8	582212	582219	0 %	25 %	25 %	50 %	32471244
11031	NC_005027	TGA	2	6	582277	582282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471244
11032	NC_005027	CGA	2	6	582291	582296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11033	NC_005027	CGT	2	6	582335	582340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11034	NC_005027	GCGA	2	8	582343	582350	25 %	0 %	50 %	25 %	32471244
11035	NC_005027	TCA	2	6	582373	582378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471244
11036	NC_005027	TG	3	6	582540	582545	0 %	50 %	50 %	0 %	32471244
11037	NC_005027	TCA	2	6	582553	582558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471244
11038	NC_005027	TCGA	2	8	582600	582607	25 %	25 %	25 %	25 %	32471244
11039	NC_005027	TCG	2	6	582679	582684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11040	NC_005027	GTCCA	2	10	582730	582739	20 %	20 %	20 %	40 %	32471244
11041	NC_005027	CGA	2	6	582789	582794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11042	NC_005027	TCT	2	6	582869	582874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471244
11043	NC_005027	GA	3	6	582877	582882	50 %	0 %	50 %	0 %	32471244
11044	NC_005027	CAG	2	6	582903	582908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11045	NC_005027	GCT	2	6	582910	582915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11046	NC_005027	GA	3	6	583091	583096	50 %	0 %	50 %	0 %	32471244
11047	NC_005027	AGC	2	6	583158	583163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471244
11048	NC_005027	TCT	2	6	583205	583210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471244
11049	NC_005027	GAGC	2	8	583217	583224	25 %	0 %	50 %	25 %	32471244
11050	NC_005027	TGGA	2	8	583244	583251	25 %	25 %	50 %	0 %	32471244
11051	NC_005027	TTG	2	6	583261	583266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471244
11052	NC_005027	AAGA	2	8	583270	583277	75 %	0 %	25 %	0 %	32471244
11053	NC_005027	CGT	2	6	583302	583307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471245
11054	NC_005027	ACTT	2	8	583436	583443	25 %	50 %	0 %	25 %	32471246
11055	NC_005027	CCCT	2	8	583446	583453	0 %	25 %	0 %	75 %	32471246
11056	NC_005027	GT	3	6	583503	583508	0 %	50 %	50 %	0 %	32471246
11057	NC_005027	CCCTC	2	10	583511	583520	0 %	20 %	0 %	80 %	32471246
11058	NC_005027	AAGT	2	8	583559	583566	50 %	25 %	25 %	0 %	32471246
11059	NC_005027	AGCC	2	8	583788	583795	25 %	0 %	25 %	50 %	32471247
11060	NC_005027	ACG	2	6	583811	583816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11061	NC_005027	GTT	2	6	583819	583824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471247
11062	NC_005027	GTTGGC	2	12	583826	583837	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	32471247
11063	NC_005027	CGG	2	6	583854	583859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471247
11064	NC_005027	TGCAC	2	10	583923	583932	20 %	20 %	20 %	40 %	32471247
11065	NC_005027	CCGGA	2	10	583949	583958	20 %	0 %	40 %	40 %	32471247
11066	NC_005027	CCG	2	6	584000	584005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471247
11067	NC_005027	CCG	2	6	584015	584020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471247
11068	NC_005027	ACGC	2	8	584072	584079	25 %	0 %	25 %	50 %	32471247
11069	NC_005027	TCGC	2	8	584129	584136	0 %	25 %	25 %	50 %	32471247
11070	NC_005027	AGTG	2	8	584201	584208	25 %	25 %	50 %	0 %	32471247
11071	NC_005027	CGA	2	6	584211	584216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11072	NC_005027	GCA	2	6	584256	584261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11073	NC_005027	CTT	2	6	584302	584307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471247
11074	NC_005027	TCA	3	9	584322	584330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471247
11075	NC_005027	CGG	2	6	584331	584336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471247
11076	NC_005027	GAT	2	6	584362	584367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471247
11077	NC_005027	GGTT	2	8	584382	584389	0 %	50 %	50 %	0 %	32471247
11078	NC_005027	ATC	2	6	584546	584551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471247
11079	NC_005027	CAG	2	6	584662	584667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11080	NC_005027	AGCA	2	8	584677	584684	50 %	0 %	25 %	25 %	32471247
11081	NC_005027	GTT	2	6	584745	584750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471247
11082	NC_005027	CAA	2	6	584764	584769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471247
11083	NC_005027	ACC	2	6	584831	584836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471247
11084	NC_005027	TAG	2	6	584876	584881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471247
11085	NC_005027	CCAA	2	8	584935	584942	50 %	0 %	0 %	50 %	32471247
11086	NC_005027	AGC	2	6	584957	584962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11087	NC_005027	AGC	2	6	584984	584989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11088	NC_005027	AAG	2	6	585037	585042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471247
11089	NC_005027	TCCG	2	8	585043	585050	0 %	25 %	25 %	50 %	32471247
11090	NC_005027	CAC	2	6	585071	585076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471247
11091	NC_005027	CCG	2	6	585136	585141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471247
11092	NC_005027	CGG	2	6	585158	585163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471247
11093	NC_005027	CGA	2	6	585192	585197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471247
11094	NC_005027	GTC	2	6	585316	585321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471248
11095	NC_005027	TTTG	2	8	585343	585350	0 %	75 %	25 %	0 %	32471248
11096	NC_005027	TCC	2	6	585365	585370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32471248
11097	NC_005027	ACG	2	6	585374	585379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471248
11098	NC_005027	A	8	8	585437	585444	100 %	0 %	0 %	0 %	32471248
11099	NC_005027	GAG	2	6	585487	585492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32471248
11100	NC_005027	GCTCA	2	10	585495	585504	20 %	20 %	20 %	40 %	32471249
11101	NC_005027	GAA	2	6	585560	585565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471249
11102	NC_005027	AGTC	2	8	585566	585573	25 %	25 %	25 %	25 %	32471249
11103	NC_005027	CGG	2	6	585619	585624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471249
11104	NC_005027	CCG	2	6	585634	585639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471249
11105	NC_005027	GTC	2	6	585647	585652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471249
11106	NC_005027	AGA	2	6	585671	585676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471249
11107	NC_005027	CGT	2	6	585678	585683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471249
11108	NC_005027	ACCA	2	8	585708	585715	50 %	0 %	0 %	50 %	32471249
11109	NC_005027	TGC	2	6	585757	585762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471249
11110	NC_005027	GAA	3	9	585825	585833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471249
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11112	NC_005027	TCA	2	6	585946	585951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471249
11113	NC_005027	GACGAT	2	12	586058	586069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32471250
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11115	NC_005027	CTG	2	6	586297	586302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471250
11116	NC_005027	TGT	2	6	586319	586324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471250
11117	NC_005027	TGA	2	6	586344	586349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471250
11118	NC_005027	GAA	2	6	586375	586380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471250
11119	NC_005027	TCGCA	2	10	586396	586405	20 %	20 %	20 %	40 %	32471250
11120	NC_005027	GA	3	6	586407	586412	50 %	0 %	50 %	0 %	32471250
11121	NC_005027	GAT	2	6	586441	586446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471250
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11124	NC_005027	TGT	2	6	586585	586590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471250
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11483	NC_005027	CGT	2	6	603138	603143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471269
11484	NC_005027	AAG	2	6	603185	603190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471269
11485	NC_005027	TTC	2	6	603199	603204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471269
11486	NC_005027	TGC	2	6	603205	603210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471269
11487	NC_005027	CAAAC	2	10	603280	603289	60 %	0 %	0 %	40 %	32471269
11488	NC_005027	GGC	2	6	603319	603324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471269
11489	NC_005027	CTG	2	6	603375	603380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471269
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11491	NC_005027	AAG	2	6	603418	603423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471269
11492	NC_005027	AAAG	2	8	603471	603478	75 %	0 %	25 %	0 %	32471269
11493	NC_005027	T	6	6	603551	603556	0 %	100 %	0 %	0 %	32471270
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