MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_005027	ACG	2	6	531804	531809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10002	NC_005027	TTG	2	6	531810	531815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10003	NC_005027	GCT	3	9	531848	531856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10004	NC_005027	GTT	2	6	531893	531898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10005	NC_005027	GTT	2	6	531908	531913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10006	NC_005027	CTT	2	6	531923	531928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10007	NC_005027	TGGAT	2	10	531954	531963	20 %	40 %	40 %	0 %	32471197
10008	NC_005027	TGC	2	6	531983	531988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10009	NC_005027	GTC	2	6	532017	532022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10010	NC_005027	CGA	2	6	532024	532029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10011	NC_005027	CGC	2	6	532052	532057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471197
10012	NC_005027	TTC	2	6	532060	532065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10013	NC_005027	GCGA	2	8	532082	532089	25 %	0 %	50 %	25 %	32471197
10014	NC_005027	GTC	2	6	532107	532112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10015	NC_005027	TCG	2	6	532114	532119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10016	NC_005027	TCG	2	6	532159	532164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10017	NC_005027	TCG	2	6	532195	532200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10018	NC_005027	GCGA	2	8	532273	532280	25 %	0 %	50 %	25 %	32471197
10019	NC_005027	TCC	2	6	532309	532314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32471197
10020	NC_005027	GTC	2	6	532396	532401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10021	NC_005027	TCGA	2	8	532413	532420	25 %	25 %	25 %	25 %	32471197
10022	NC_005027	CGA	2	6	532438	532443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10023	NC_005027	GCT	2	6	532507	532512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10024	NC_005027	TCA	2	6	532540	532545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471197
10025	NC_005027	AGC	2	6	532555	532560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10026	NC_005027	GCT	2	6	532596	532601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10027	NC_005027	TCT	2	6	532624	532629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10028	NC_005027	GTA	2	6	532734	532739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471197
10029	NC_005027	CAA	2	6	532743	532748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471197
10030	NC_005027	ATG	2	6	532765	532770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471197
10031	NC_005027	GTTGG	2	10	532786	532795	0 %	40 %	60 %	0 %	32471197
10032	NC_005027	AGC	2	6	532846	532851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10033	NC_005027	GCC	2	6	532854	532859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471197
10034	NC_005027	CGAT	2	8	532891	532898	25 %	25 %	25 %	25 %	32471197
10035	NC_005027	TCG	2	6	532909	532914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10036	NC_005027	TGG	2	6	532951	532956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471197
10037	NC_005027	TTG	2	6	533037	533042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10038	NC_005027	CGT	2	6	533225	533230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10039	NC_005027	TCT	2	6	533257	533262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10040	NC_005027	GCATCG	2	12	533281	533292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10041	NC_005027	CGAT	2	8	533329	533336	25 %	25 %	25 %	25 %	32471197
10042	NC_005027	TTC	2	6	533340	533345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10043	NC_005027	TTG	2	6	533367	533372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10044	NC_005027	TTG	2	6	533413	533418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32471197
10045	NC_005027	TTC	2	6	533469	533474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10046	NC_005027	TGC	2	6	533480	533485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10047	NC_005027	TCGA	2	8	533557	533564	25 %	25 %	25 %	25 %	32471197
10048	NC_005027	CGG	2	6	533725	533730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471197
10049	NC_005027	TGC	2	6	533732	533737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10050	NC_005027	TCA	2	6	533755	533760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471197
10051	NC_005027	TCA	2	6	533780	533785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471197
10052	NC_005027	TCG	2	6	533818	533823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10053	NC_005027	CGA	2	6	533843	533848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10054	NC_005027	GCA	2	6	533876	533881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10055	NC_005027	CTG	2	6	533911	533916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10056	NC_005027	GTC	2	6	533946	533951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10057	NC_005027	TCCG	2	8	534063	534070	0 %	25 %	25 %	50 %	32471197
10058	NC_005027	CGGTCA	2	12	534074	534085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	32471197
10059	NC_005027	CGG	2	6	534124	534129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471197
10060	NC_005027	CCGGT	2	10	534146	534155	0 %	20 %	40 %	40 %	32471197
10061	NC_005027	GGC	2	6	534193	534198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471197
10062	NC_005027	GGC	2	6	534209	534214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471197
10063	NC_005027	TTC	2	6	534216	534221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471197
10064	NC_005027	TCGC	2	8	534239	534246	0 %	25 %	25 %	50 %	32471197
10065	NC_005027	TTCG	2	8	534276	534283	0 %	50 %	25 %	25 %	32471197
10066	NC_005027	CGAC	2	8	534320	534327	25 %	0 %	25 %	50 %	32471197
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10082	NC_005027	GT	3	6	534972	534977	0 %	50 %	50 %	0 %	32471199
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10086	NC_005027	CGG	2	6	535063	535068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471199
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10099	NC_005027	ATGA	2	8	535634	535641	50 %	25 %	25 %	0 %	32471199
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10102	NC_005027	CGA	2	6	535891	535896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471200
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10104	NC_005027	TCCA	2	8	535961	535968	25 %	25 %	0 %	50 %	32471200
10105	NC_005027	CGC	3	9	535987	535995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471200
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10111	NC_005027	CATC	2	8	536395	536402	25 %	25 %	0 %	50 %	32471200
10112	NC_005027	GATTG	2	10	536452	536461	20 %	40 %	40 %	0 %	32471200
10113	NC_005027	CGC	2	6	536552	536557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471200
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10116	NC_005027	ACA	2	6	536677	536682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471200
10117	NC_005027	T	6	6	536961	536966	0 %	100 %	0 %	0 %	32471201
10118	NC_005027	TGGC	2	8	537001	537008	0 %	25 %	50 %	25 %	32471201
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10120	NC_005027	CGG	2	6	537027	537032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471201
10121	NC_005027	TGG	2	6	537053	537058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471201
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10228	NC_005027	GTCGAC	2	12	541592	541603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161579037
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10231	NC_005027	ACG	2	6	541710	541715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161579037
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10237	NC_005027	CGC	2	6	542017	542022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161579037
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10480	NC_005027	TCG	2	6	556559	556564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471220
10481	NC_005027	TGG	2	6	556601	556606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471220
10482	NC_005027	CGCGTC	2	12	556615	556626	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	32471220
10483	NC_005027	GATC	2	8	556632	556639	25 %	25 %	25 %	25 %	32471220
10484	NC_005027	TCG	2	6	556715	556720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471220
10485	NC_005027	ACA	2	6	556728	556733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471220
10486	NC_005027	GA	3	6	556759	556764	50 %	0 %	50 %	0 %	32471220
10487	NC_005027	GAT	2	6	556766	556771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471220
10488	NC_005027	CGTC	2	8	556782	556789	0 %	25 %	25 %	50 %	32471220
10489	NC_005027	CAT	2	6	556815	556820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471220
10490	NC_005027	CAA	2	6	556951	556956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471220
10491	NC_005027	TCG	3	9	556961	556969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471220
10492	NC_005027	TG	3	6	556988	556993	0 %	50 %	50 %	0 %	32471220
10493	NC_005027	GGA	2	6	557017	557022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32471220
10494	NC_005027	CACGGA	2	12	557044	557055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471220
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10497	NC_005027	GGGA	2	8	557107	557114	25 %	0 %	75 %	0 %	32471220
10498	NC_005027	CGA	2	6	557136	557141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471220
10499	NC_005027	TGG	2	6	557157	557162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471220
10500	NC_005027	GTC	2	6	557188	557193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471220

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