MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_005027	GAT	2	6	345480	345485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471013
6502	NC_005027	TGG	2	6	345486	345491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471013
6503	NC_005027	AGA	2	6	345545	345550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471013
6504	NC_005027	AG	3	6	345553	345558	50 %	0 %	50 %	0 %	32471013
6505	NC_005027	TCG	2	6	345941	345946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471014
6506	NC_005027	AAG	2	6	345973	345978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471014
6507	NC_005027	CGC	2	6	346119	346124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471014
6508	NC_005027	TGA	2	6	346157	346162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471014
6509	NC_005027	AC	3	6	346204	346209	50 %	0 %	0 %	50 %	32471014
6510	NC_005027	AAG	2	6	346402	346407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471014
6511	NC_005027	TTGA	2	8	346443	346450	25 %	50 %	25 %	0 %	32471015
6512	NC_005027	ACT	2	6	346467	346472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471015
6513	NC_005027	TCT	2	6	346475	346480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32471015
6514	NC_005027	AATC	2	8	346543	346550	50 %	25 %	0 %	25 %	32471015
6515	NC_005027	CCG	2	6	346583	346588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471015
6516	NC_005027	ATC	2	6	346705	346710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471015
6517	NC_005027	GTGCT	2	10	346753	346762	0 %	40 %	40 %	20 %	32471015
6518	NC_005027	CTG	2	6	346793	346798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471015
6519	NC_005027	GA	3	6	346883	346888	50 %	0 %	50 %	0 %	32471015
6520	NC_005027	CGT	2	6	346984	346989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471015
6521	NC_005027	CAGC	2	8	347000	347007	25 %	0 %	25 %	50 %	32471015
6522	NC_005027	GAA	2	6	347047	347052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471015
6523	NC_005027	CAT	2	6	347061	347066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471015
6524	NC_005027	CAA	2	6	347150	347155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471015
6525	NC_005027	CCG	2	6	347156	347161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471015
6526	NC_005027	CG	3	6	347320	347325	0 %	0 %	50 %	50 %	32471015
6527	NC_005027	TGA	3	9	347355	347363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471015
6528	NC_005027	CGA	2	6	347451	347456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471015
6529	NC_005027	GCGG	2	8	347531	347538	0 %	0 %	75 %	25 %	32471015
6530	NC_005027	TCG	2	6	347589	347594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471015
6531	NC_005027	TGA	2	6	347661	347666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471015
6532	NC_005027	CCG	2	6	347687	347692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471015
6533	NC_005027	ATCA	2	8	347723	347730	50 %	25 %	0 %	25 %	32471015
6534	NC_005027	GAC	2	6	347749	347754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471015
6535	NC_005027	TCG	2	6	347901	347906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6536	NC_005027	AAC	2	6	347918	347923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471016
6537	NC_005027	GGC	2	6	347931	347936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471016
6538	NC_005027	GAT	2	6	347953	347958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471016
6539	NC_005027	GGA	2	6	347959	347964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32471016
6540	NC_005027	GATC	2	8	347966	347973	25 %	25 %	25 %	25 %	32471016
6541	NC_005027	ACG	2	6	348004	348009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6542	NC_005027	GGC	2	6	348062	348067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471016
6543	NC_005027	CAA	2	6	348080	348085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471016
6544	NC_005027	CGT	2	6	348109	348114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6545	NC_005027	ACT	2	6	348151	348156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471016
6546	NC_005027	AGCC	2	8	348217	348224	25 %	0 %	25 %	50 %	32471016
6547	NC_005027	CGAT	2	8	348225	348232	25 %	25 %	25 %	25 %	32471016
6548	NC_005027	GCA	2	6	348244	348249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6549	NC_005027	ACGAAC	2	12	348294	348305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32471016
6550	NC_005027	CGA	2	6	348332	348337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6551	NC_005027	TGC	2	6	348366	348371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6552	NC_005027	CTG	2	6	348401	348406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6553	NC_005027	GACAC	2	10	348791	348800	40 %	0 %	20 %	40 %	32471016
6554	NC_005027	CA	3	6	348838	348843	50 %	0 %	0 %	50 %	32471016
6555	NC_005027	CGG	2	6	348852	348857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471016
6556	NC_005027	CAT	2	6	349000	349005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471016
6557	NC_005027	GAAC	2	8	349138	349145	50 %	0 %	25 %	25 %	32471016
6558	NC_005027	CACT	2	8	349158	349165	25 %	25 %	0 %	50 %	32471016
6559	NC_005027	AACCG	2	10	349252	349261	40 %	0 %	20 %	40 %	32471016
6560	NC_005027	ACT	2	6	349281	349286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32471016
6561	NC_005027	CGA	2	6	349294	349299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6562	NC_005027	GAAA	2	8	349478	349485	75 %	0 %	25 %	0 %	32471016
6563	NC_005027	GAA	2	6	349652	349657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471016
6564	NC_005027	GCC	2	6	349675	349680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471016
6565	NC_005027	CA	3	6	349715	349720	50 %	0 %	0 %	50 %	32471016
6566	NC_005027	CAA	2	6	349874	349879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471016
6567	NC_005027	ACA	2	6	349929	349934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32471016
6568	NC_005027	CTG	2	6	349954	349959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6569	NC_005027	CAAC	2	8	349984	349991	50 %	0 %	0 %	50 %	32471016
6570	NC_005027	GGTTGG	2	12	350033	350044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471016
6571	NC_005027	TCGA	2	8	350070	350077	25 %	25 %	25 %	25 %	32471016
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6573	NC_005027	GAA	2	6	350198	350203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471016
6574	NC_005027	GGT	2	6	350217	350222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471016
6575	NC_005027	GCA	2	6	350260	350265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
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6577	NC_005027	TCG	2	6	350284	350289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6578	NC_005027	TCCGA	2	10	350341	350350	20 %	20 %	20 %	40 %	32471016
6579	NC_005027	TGGAT	2	10	350353	350362	20 %	40 %	40 %	0 %	32471016
6580	NC_005027	GAT	2	6	350378	350383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471016
6581	NC_005027	CGT	2	6	350431	350436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471016
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6584	NC_005027	CGA	2	6	350667	350672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6585	NC_005027	GAA	2	6	350716	350721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471016
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6587	NC_005027	TCC	2	6	350775	350780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32471016
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6591	NC_005027	GCCTC	2	10	350954	350963	0 %	20 %	20 %	60 %	32471016
6592	NC_005027	AGC	2	6	351118	351123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32471016
6593	NC_005027	CGC	2	6	351202	351207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471016
6594	NC_005027	TGG	2	6	351246	351251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471016
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6597	NC_005027	CGG	2	6	351394	351399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471016
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6601	NC_005027	GTA	2	6	351797	351802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471017
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6605	NC_005027	GGC	2	6	351944	351949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471017
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6607	NC_005027	CTGA	2	8	351990	351997	25 %	25 %	25 %	25 %	32471017
6608	NC_005027	CGC	2	6	352057	352062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471017
6609	NC_005027	TCG	2	6	352109	352114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471017
6610	NC_005027	GCGAC	2	10	352147	352156	20 %	0 %	40 %	40 %	32471017
6611	NC_005027	TTCG	2	8	352258	352265	0 %	50 %	25 %	25 %	32471017
6612	NC_005027	TCG	2	6	352273	352278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471017
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6618	NC_005027	GT	3	6	352364	352369	0 %	50 %	50 %	0 %	32471017
6619	NC_005027	CGC	2	6	352426	352431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32471017
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6621	NC_005027	TCG	2	6	352533	352538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32471017
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6623	NC_005027	ACC	2	6	352629	352634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471017
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6992	NC_005027	AGT	2	6	372507	372512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471039
6993	NC_005027	GAA	2	6	372517	372522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32471039
6994	NC_005027	TG	3	6	372532	372537	0 %	50 %	50 %	0 %	32471039
6995	NC_005027	GTA	2	6	372787	372792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32471039
6996	NC_005027	CGG	2	6	372841	372846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32471039
6997	NC_005027	ACC	2	6	372875	372880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32471039
6998	NC_005027	TGCCG	2	10	372909	372918	0 %	20 %	40 %	40 %	32471039
6999	NC_005027	CTCG	2	8	372944	372951	0 %	25 %	25 %	50 %	32471039
7000	NC_005027	TGG	2	6	373044	373049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32471039

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