MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_003911	TGCGGA	2	12	2148305	2148316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56696890
44502	NC_003911	CCCGG	2	10	2148326	2148335	0 %	0 %	40 %	60 %	56696890
44503	NC_003911	CAT	2	6	2148393	2148398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696890
44504	NC_003911	GCA	2	6	2148447	2148452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696890
44505	NC_003911	GC	3	6	2148511	2148516	0 %	0 %	50 %	50 %	56696890
44506	NC_003911	TGGT	2	8	2148581	2148588	0 %	50 %	50 %	0 %	56696890
44507	NC_003911	CAC	2	6	2148638	2148643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696891
44508	NC_003911	CAC	2	6	2148683	2148688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696891
44509	NC_003911	CGA	2	6	2148814	2148819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696891
44510	NC_003911	CAC	2	6	2148848	2148853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696891
44511	NC_003911	TCGCC	2	10	2148868	2148877	0 %	20 %	20 %	60 %	56696891
44512	NC_003911	CAC	2	6	2148878	2148883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696891
44513	NC_003911	CGG	2	6	2148906	2148911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696891
44514	NC_003911	GTG	2	6	2148927	2148932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56696891
44515	NC_003911	GTCAG	2	10	2148965	2148974	20 %	20 %	40 %	20 %	56696892
44516	NC_003911	CGGG	2	8	2149012	2149019	0 %	0 %	75 %	25 %	56696892
44517	NC_003911	GGC	2	6	2149043	2149048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696892
44518	NC_003911	ATC	2	6	2149059	2149064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696892
44519	NC_003911	GCG	2	6	2149066	2149071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696892
44520	NC_003911	GCTG	2	8	2149108	2149115	0 %	25 %	50 %	25 %	56696892
44521	NC_003911	CAG	2	6	2149127	2149132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696892
44522	NC_003911	CAC	2	6	2149202	2149207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696892
44523	NC_003911	CGG	2	6	2149348	2149353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696892
44524	NC_003911	GGC	2	6	2149361	2149366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696892
44525	NC_003911	TCA	2	6	2149378	2149383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696892
44526	NC_003911	GCC	2	6	2149457	2149462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696892
44527	NC_003911	GCCTCT	2	12	2149512	2149523	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56696892
44528	NC_003911	CGC	2	6	2149558	2149563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696892
44529	NC_003911	GTC	2	6	2149568	2149573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696892
44530	NC_003911	CCA	2	6	2149644	2149649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696893
44531	NC_003911	GCT	2	6	2149650	2149655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44532	NC_003911	GCA	2	6	2149689	2149694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44533	NC_003911	CAC	2	6	2149714	2149719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696893
44534	NC_003911	CG	3	6	2149749	2149754	0 %	0 %	50 %	50 %	56696893
44535	NC_003911	CGA	2	6	2149816	2149821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44536	NC_003911	GTT	2	6	2149822	2149827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56696893
44537	NC_003911	CAG	2	6	2149876	2149881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44538	NC_003911	GC	3	6	2149956	2149961	0 %	0 %	50 %	50 %	56696893
44539	NC_003911	ATC	2	6	2150018	2150023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696893
44540	NC_003911	CTG	2	6	2150041	2150046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44541	NC_003911	TGT	2	6	2150049	2150054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56696893
44542	NC_003911	TGGCGA	2	12	2150055	2150066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56696893
44543	NC_003911	CGC	2	6	2150094	2150099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696893
44544	NC_003911	AGG	2	6	2150109	2150114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56696893
44545	NC_003911	GC	3	6	2150189	2150194	0 %	0 %	50 %	50 %	56696893
44546	NC_003911	GCC	2	6	2150215	2150220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696893
44547	NC_003911	TCG	2	6	2150231	2150236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44548	NC_003911	GAT	3	9	2150287	2150295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56696893
44549	NC_003911	CGG	2	6	2150304	2150309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696893
44550	NC_003911	GGC	2	6	2150468	2150473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696893
44551	NC_003911	ACC	2	6	2150543	2150548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696893
44552	NC_003911	AGA	2	6	2150607	2150612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56696893
44553	NC_003911	GGT	2	6	2150644	2150649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56696893
44554	NC_003911	CGG	2	6	2150700	2150705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696893
44555	NC_003911	ATC	2	6	2150738	2150743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696893
44556	NC_003911	CAG	2	6	2150782	2150787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696893
44557	NC_003911	GGGC	2	8	2150837	2150844	0 %	0 %	75 %	25 %	56696893
44558	NC_003911	GCTC	2	8	2150901	2150908	0 %	25 %	25 %	50 %	56696893
44559	NC_003911	GGC	2	6	2150929	2150934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696893
44560	NC_003911	GCC	2	6	2150937	2150942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696893
44561	NC_003911	ATCTCG	2	12	2151026	2151037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56696893
44562	NC_003911	CTT	2	6	2151102	2151107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56696893
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44567	NC_003911	GC	3	6	2152440	2152445	0 %	0 %	50 %	50 %	56696894
44568	NC_003911	GAG	2	6	2152454	2152459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56696894
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44570	NC_003911	CGG	2	6	2152509	2152514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696894
44571	NC_003911	ACC	2	6	2152526	2152531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696894
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44573	NC_003911	CGC	2	6	2152604	2152609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696894
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44577	NC_003911	GCC	2	6	2152972	2152977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696895
44578	NC_003911	ACC	2	6	2152990	2152995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56696895
44579	NC_003911	TGC	2	6	2153029	2153034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696895
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44582	NC_003911	GTC	2	6	2153073	2153078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696895
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44586	NC_003911	GCC	2	6	2153299	2153304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696895
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44589	NC_003911	ATC	2	6	2153391	2153396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56696895
44590	NC_003911	GCC	2	6	2153420	2153425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696895
44591	NC_003911	CGCT	2	8	2153436	2153443	0 %	25 %	25 %	50 %	56696895
44592	NC_003911	CAA	2	6	2153447	2153452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56696895
44593	NC_003911	CATCAC	2	12	2153471	2153482	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56696895
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44599	NC_003911	GCC	2	6	2153702	2153707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696896
44600	NC_003911	GC	3	6	2153786	2153791	0 %	0 %	50 %	50 %	56696896
44601	NC_003911	GC	3	6	2153834	2153839	0 %	0 %	50 %	50 %	56696897
44602	NC_003911	TGC	2	6	2153906	2153911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696897
44603	NC_003911	CCG	2	6	2153936	2153941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696897
44604	NC_003911	GGATGT	2	12	2153997	2154008	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56696897
44605	NC_003911	TGC	2	6	2154032	2154037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696897
44606	NC_003911	GCG	3	9	2154118	2154126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696897
44607	NC_003911	C	6	6	2154148	2154153	0 %	0 %	0 %	100 %	56696897
44608	NC_003911	GGC	2	6	2154159	2154164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696897
44609	NC_003911	CCG	2	6	2154206	2154211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56696897
44610	NC_003911	GGT	2	6	2154297	2154302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56696897
44611	NC_003911	AGC	2	6	2154316	2154321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56696897
44612	NC_003911	GC	3	6	2154324	2154329	0 %	0 %	50 %	50 %	56696897
44613	NC_003911	GCT	2	6	2154378	2154383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56696897
44614	NC_003911	CCCG	2	8	2154393	2154400	0 %	0 %	25 %	75 %	56696897
44615	NC_003911	GC	3	6	2154465	2154470	0 %	0 %	50 %	50 %	56696897
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44973	NC_003911	GTG	2	6	2172559	2172564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56696910
44974	NC_003911	CGG	2	6	2172665	2172670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56696910
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