MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003911	TGA	2	6	123227	123232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695043
2502	NC_003911	GCG	2	6	123237	123242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695043
2503	NC_003911	GC	3	6	123248	123253	0 %	0 %	50 %	50 %	56695043
2504	NC_003911	CGT	2	6	123264	123269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695043
2505	NC_003911	GCT	2	6	123318	123323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695043
2506	NC_003911	CAA	2	6	123363	123368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695043
2507	NC_003911	CGA	2	6	123390	123395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695043
2508	NC_003911	GCG	2	6	123436	123441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695043
2509	NC_003911	GGC	2	6	123451	123456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695043
2510	NC_003911	GA	3	6	123509	123514	50 %	0 %	50 %	0 %	56695043
2511	NC_003911	CTCGC	2	10	123597	123606	0 %	20 %	20 %	60 %	56695043
2512	NC_003911	TCT	2	6	123622	123627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695043
2513	NC_003911	CCGA	2	8	123646	123653	25 %	0 %	25 %	50 %	56695043
2514	NC_003911	GAA	2	6	123655	123660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695043
2515	NC_003911	ACGA	2	8	123679	123686	50 %	0 %	25 %	25 %	56695043
2516	NC_003911	CG	3	6	126266	126271	0 %	0 %	50 %	50 %	56695044
2517	NC_003911	TCG	2	6	126276	126281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695044
2518	NC_003911	CTG	2	6	126333	126338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695044
2519	NC_003911	CGC	2	6	126365	126370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695044
2520	NC_003911	ATCG	2	8	126377	126384	25 %	25 %	25 %	25 %	56695044
2521	NC_003911	GCC	2	6	126429	126434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695044
2522	NC_003911	AGA	2	6	126528	126533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695044
2523	NC_003911	CCG	2	6	126577	126582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695044
2524	NC_003911	TAAAA	2	10	126671	126680	80 %	20 %	0 %	0 %	56695044
2525	NC_003911	GGTC	2	8	126683	126690	0 %	25 %	50 %	25 %	56695044
2526	NC_003911	GAG	2	6	126714	126719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695044
2527	NC_003911	TTG	2	6	126748	126753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695044
2528	NC_003911	ACA	2	6	126760	126765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695044
2529	NC_003911	GCA	2	6	126772	126777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695044
2530	NC_003911	TGG	2	6	126841	126846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695044
2531	NC_003911	GCG	2	6	126867	126872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695044
2532	NC_003911	GGA	2	6	126896	126901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695044
2533	NC_003911	AGA	2	6	127025	127030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695044
2534	NC_003911	TCG	2	6	127054	127059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695044
2535	NC_003911	TCA	2	6	127096	127101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695044
2536	NC_003911	TTC	2	6	127108	127113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695044
2537	NC_003911	GCC	2	6	127166	127171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695044
2538	NC_003911	TCA	2	6	127201	127206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695044
2539	NC_003911	T	6	6	127255	127260	0 %	100 %	0 %	0 %	56695044
2540	NC_003911	CTG	2	6	127296	127301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695044
2541	NC_003911	TCG	2	6	127744	127749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695045
2542	NC_003911	CG	3	6	127812	127817	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
2543	NC_003911	AC	3	6	127837	127842	50 %	0 %	0 %	50 %	56695045
2544	NC_003911	GGGC	2	8	127911	127918	0 %	0 %	75 %	25 %	56695045
2545	NC_003911	CG	3	6	127950	127955	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
2546	NC_003911	GC	3	6	127964	127969	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
2547	NC_003911	TGA	2	6	127981	127986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695045
2548	NC_003911	CGC	2	6	128004	128009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695045
2549	NC_003911	AG	3	6	128033	128038	50 %	0 %	50 %	0 %	56695045
2550	NC_003911	CGG	2	6	128046	128051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695045
2551	NC_003911	CG	3	6	128060	128065	0 %	0 %	50 %	50 %	56695045
2552	NC_003911	CGC	2	6	128102	128107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695045
2553	NC_003911	CTTT	2	8	128127	128134	0 %	75 %	0 %	25 %	56695045
2554	NC_003911	CTT	2	6	128162	128167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695045
2555	NC_003911	CATA	2	8	128188	128195	50 %	25 %	0 %	25 %	56695045
2556	NC_003911	TCC	2	6	128310	128315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695046
2557	NC_003911	GTT	3	9	128373	128381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695046
2558	NC_003911	GGT	2	6	128385	128390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695046
2559	NC_003911	GCC	2	6	128428	128433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695046
2560	NC_003911	TCT	3	9	128496	128504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695046
2561	NC_003911	TGG	2	6	128514	128519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695046
2562	NC_003911	TGA	2	6	128531	128536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695046
2563	NC_003911	TC	3	6	128573	128578	0 %	50 %	0 %	50 %	56695046
2564	NC_003911	CGC	2	6	128583	128588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695046
2565	NC_003911	CAT	2	6	128667	128672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695046
2566	NC_003911	CAT	2	6	128790	128795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695046
2567	NC_003911	TGCTGG	2	12	128927	128938	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695046
2568	NC_003911	GCTC	2	8	129033	129040	0 %	25 %	25 %	50 %	56695046
2569	NC_003911	ATC	2	6	129061	129066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695046
2570	NC_003911	GTC	2	6	129073	129078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695046
2571	NC_003911	GCG	3	9	129172	129180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695046
2572	NC_003911	CGT	2	6	129194	129199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695046
2573	NC_003911	GTT	2	6	130179	130184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695047
2574	NC_003911	CAG	2	6	130215	130220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695047
2575	NC_003911	CAC	2	6	130221	130226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695047
2576	NC_003911	GCCC	2	8	130244	130251	0 %	0 %	25 %	75 %	56695047
2577	NC_003911	CGG	2	6	130254	130259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695047
2578	NC_003911	CGG	2	6	130267	130272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695047
2579	NC_003911	CCA	2	6	130325	130330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695047
2580	NC_003911	GCT	2	6	130331	130336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695047
2581	NC_003911	CAGC	2	8	130365	130372	25 %	0 %	25 %	50 %	56695047
2582	NC_003911	GAA	2	6	130395	130400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695047
2583	NC_003911	GC	3	6	130617	130622	0 %	0 %	50 %	50 %	56695048
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2585	NC_003911	GCCA	2	8	130656	130663	25 %	0 %	25 %	50 %	56695048
2586	NC_003911	GGC	2	6	130718	130723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
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2588	NC_003911	GGT	2	6	130778	130783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695048
2589	NC_003911	ATC	2	6	130815	130820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695048
2590	NC_003911	ATGT	2	8	130899	130906	25 %	50 %	25 %	0 %	56695048
2591	NC_003911	TGG	2	6	130943	130948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695048
2592	NC_003911	TGG	2	6	130956	130961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695048
2593	NC_003911	ATG	2	6	130962	130967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695048
2594	NC_003911	TCA	2	6	131014	131019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695048
2595	NC_003911	AGG	3	9	131047	131055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695048
2596	NC_003911	CGG	2	6	131096	131101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2597	NC_003911	GGT	2	6	131102	131107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695048
2598	NC_003911	TCA	2	6	131116	131121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695048
2599	NC_003911	TGC	3	9	131122	131130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695048
2600	NC_003911	CCG	2	6	131287	131292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695048
2601	NC_003911	TGG	2	6	131332	131337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695048
2602	NC_003911	CGT	2	6	131389	131394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695048
2603	NC_003911	GCTGG	2	10	131459	131468	0 %	20 %	60 %	20 %	56695048
2604	NC_003911	GAT	2	6	131477	131482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695048
2605	NC_003911	CAT	2	6	131495	131500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695048
2606	NC_003911	CGG	3	9	131512	131520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2607	NC_003911	GCTG	2	8	131527	131534	0 %	25 %	50 %	25 %	56695048
2608	NC_003911	TCG	2	6	131575	131580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695048
2609	NC_003911	CCA	2	6	131611	131616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695048
2610	NC_003911	GGACC	2	10	131627	131636	20 %	0 %	40 %	40 %	56695048
2611	NC_003911	TCT	4	12	131686	131697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695048
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2613	NC_003911	CGG	2	6	131711	131716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2614	NC_003911	CGG	2	6	131720	131725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2615	NC_003911	GGC	2	6	131735	131740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2616	NC_003911	CCGG	2	8	131812	131819	0 %	0 %	50 %	50 %	56695048
2617	NC_003911	GCG	2	6	131862	131867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695048
2618	NC_003911	GC	3	6	131877	131882	0 %	0 %	50 %	50 %	56695048
2619	NC_003911	GTC	2	6	131898	131903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695048
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2622	NC_003911	GC	3	6	132063	132068	0 %	0 %	50 %	50 %	56695049
2623	NC_003911	CGC	2	6	132094	132099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695049
2624	NC_003911	GCC	2	6	132125	132130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695049
2625	NC_003911	CCGCAA	2	12	132184	132195	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56695049
2626	NC_003911	GCC	2	6	132245	132250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695049
2627	NC_003911	CAGC	2	8	132289	132296	25 %	0 %	25 %	50 %	56695049
2628	NC_003911	CCA	2	6	132331	132336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695049
2629	NC_003911	TGC	2	6	132363	132368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695049
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2649	NC_003911	CG	3	6	133023	133028	0 %	0 %	50 %	50 %	56695050
2650	NC_003911	GCG	2	6	133032	133037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695050
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2654	NC_003911	GGC	2	6	133304	133309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695050
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2726	NC_003911	TGACC	2	10	136841	136850	20 %	20 %	20 %	40 %	56695054
2727	NC_003911	ATCT	2	8	136902	136909	25 %	50 %	0 %	25 %	56695054
2728	NC_003911	GC	3	6	136911	136916	0 %	0 %	50 %	50 %	56695054
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2730	NC_003911	CTG	2	6	136940	136945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695054
2731	NC_003911	CGC	3	9	137095	137103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695055
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2735	NC_003911	CGT	2	6	137257	137262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695055
2736	NC_003911	GGGCC	2	10	137263	137272	0 %	0 %	60 %	40 %	56695055
2737	NC_003911	TGC	2	6	137314	137319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695055
2738	NC_003911	GTCTG	2	10	137331	137340	0 %	40 %	40 %	20 %	56695055
2739	NC_003911	AG	3	6	137347	137352	50 %	0 %	50 %	0 %	56695055
2740	NC_003911	CGG	2	6	137409	137414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695055
2741	NC_003911	CGC	2	6	137482	137487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695055
2742	NC_003911	CGA	2	6	137694	137699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695056
2743	NC_003911	CTG	2	6	137847	137852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695056
2744	NC_003911	TGCGG	2	10	137889	137898	0 %	20 %	60 %	20 %	56695056
2745	NC_003911	GAG	2	6	137908	137913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695056
2746	NC_003911	ACCGGC	2	12	137942	137953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695056
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2748	NC_003911	GGT	2	6	138039	138044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695056
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2995	NC_003911	GC	3	6	149440	149445	0 %	0 %	50 %	50 %	56695061
2996	NC_003911	CGG	2	6	149484	149489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695061
2997	NC_003911	CGC	2	6	149506	149511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695061
2998	NC_003911	GCC	2	6	149524	149529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695061
2999	NC_003911	AGAT	2	8	149558	149565	50 %	25 %	25 %	0 %	56695061
3000	NC_003911	GCCGC	2	10	149578	149587	0 %	0 %	40 %	60 %	56695061

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