MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_003911	GGC	2	6	949510	949515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695794
19503	NC_003911	CGT	2	6	949536	949541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695794
19504	NC_003911	GGT	2	6	949552	949557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695794
19505	NC_003911	CGG	2	6	949578	949583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695794
19506	NC_003911	CG	3	6	949628	949633	0 %	0 %	50 %	50 %	56695794
19507	NC_003911	GCC	2	6	949663	949668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695794
19508	NC_003911	CTCA	2	8	949705	949712	25 %	25 %	0 %	50 %	56695794
19509	NC_003911	CTC	2	6	949721	949726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695795
19510	NC_003911	CG	3	6	949748	949753	0 %	0 %	50 %	50 %	56695795
19511	NC_003911	GCCG	2	8	949802	949809	0 %	0 %	50 %	50 %	56695795
19512	NC_003911	GGC	2	6	949826	949831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695795
19513	NC_003911	CGC	2	6	949835	949840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695795
19514	NC_003911	CAT	2	6	949967	949972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695795
19515	NC_003911	CCG	2	6	949992	949997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695795
19516	NC_003911	GAT	2	6	950006	950011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695795
19517	NC_003911	CGG	2	6	950032	950037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695795
19518	NC_003911	ATG	2	6	950166	950171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695795
19519	NC_003911	GAT	2	6	950290	950295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695796
19520	NC_003911	GAT	2	6	950326	950331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695796
19521	NC_003911	GCTTCT	2	12	950346	950357	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56695796
19522	NC_003911	CGG	2	6	950382	950387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695796
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19524	NC_003911	GCG	2	6	950405	950410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695796
19525	NC_003911	TCA	2	6	950471	950476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695796
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19527	NC_003911	GCT	2	6	950736	950741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695797
19528	NC_003911	TCC	2	6	950775	950780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695797
19529	NC_003911	CGA	2	6	950904	950909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695797
19530	NC_003911	CGC	2	6	950943	950948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695797
19531	NC_003911	GC	3	6	950947	950952	0 %	0 %	50 %	50 %	56695797
19532	NC_003911	CG	3	6	951040	951045	0 %	0 %	50 %	50 %	56695797
19533	NC_003911	GGT	2	6	951057	951062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695797
19534	NC_003911	CGA	2	6	951171	951176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695798
19535	NC_003911	GGCG	3	12	951189	951200	0 %	0 %	75 %	25 %	56695798
19536	NC_003911	CGC	2	6	951225	951230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695798
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19539	NC_003911	GC	3	6	951280	951285	0 %	0 %	50 %	50 %	56695798
19540	NC_003911	ACCG	2	8	951450	951457	25 %	0 %	25 %	50 %	56695799
19541	NC_003911	GGC	2	6	951465	951470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695799
19542	NC_003911	GTG	2	6	951483	951488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695799
19543	NC_003911	TGG	2	6	951491	951496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695799
19544	NC_003911	CCA	2	6	951640	951645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695799
19545	NC_003911	CGC	2	6	951656	951661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695799
19546	NC_003911	GC	4	8	951667	951674	0 %	0 %	50 %	50 %	56695799
19547	NC_003911	CGAGAT	2	12	951746	951757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56695799
19548	NC_003911	GC	3	6	951781	951786	0 %	0 %	50 %	50 %	56695799
19549	NC_003911	TGCC	2	8	951790	951797	0 %	25 %	25 %	50 %	56695799
19550	NC_003911	CCGA	2	8	951825	951832	25 %	0 %	25 %	50 %	56695799
19551	NC_003911	CGC	3	9	951844	951852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695799
19552	NC_003911	TGC	2	6	951889	951894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695799
19553	NC_003911	CCGCG	2	10	951899	951908	0 %	0 %	40 %	60 %	56695799
19554	NC_003911	CG	3	6	951917	951922	0 %	0 %	50 %	50 %	56695799
19555	NC_003911	GCC	2	6	951933	951938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695799
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19557	NC_003911	GGCG	2	8	952022	952029	0 %	0 %	75 %	25 %	56695799
19558	NC_003911	GCT	3	9	952043	952051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695799
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19560	NC_003911	GCCC	2	8	952063	952070	0 %	0 %	25 %	75 %	56695799
19561	NC_003911	GCC	2	6	952107	952112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695799
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19564	NC_003911	GCC	2	6	952211	952216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695799
19565	NC_003911	CGATG	2	10	952217	952226	20 %	20 %	40 %	20 %	56695799
19566	NC_003911	GGGCA	2	10	952245	952254	20 %	0 %	60 %	20 %	56695799
19567	NC_003911	TGG	2	6	952408	952413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695800
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19574	NC_003911	GGGGC	2	10	952808	952817	0 %	0 %	80 %	20 %	56695800
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19593	NC_003911	CTG	2	6	953613	953618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695801
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19598	NC_003911	GGC	2	6	954107	954112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695801
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19600	NC_003911	GGTC	2	8	954154	954161	0 %	25 %	50 %	25 %	56695801
19601	NC_003911	CGC	2	6	954194	954199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695801
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19617	NC_003911	CAG	2	6	954881	954886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695802
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19988	NC_003911	CGC	2	6	973338	973343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695822
19989	NC_003911	GGC	2	6	973349	973354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695822
19990	NC_003911	GGC	2	6	973367	973372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695822
19991	NC_003911	GC	3	6	973386	973391	0 %	0 %	50 %	50 %	56695822
19992	NC_003911	GC	3	6	973448	973453	0 %	0 %	50 %	50 %	56695822
19993	NC_003911	CGC	2	6	973588	973593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695822
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20000	NC_003911	CG	3	6	973924	973929	0 %	0 %	50 %	50 %	56695823

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