MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_003911	CCG	2	6	745338	745343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695618
15003	NC_003911	CAT	2	6	745381	745386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695618
15004	NC_003911	CG	4	8	745408	745415	0 %	0 %	50 %	50 %	56695618
15005	NC_003911	CGGATG	2	12	745446	745457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695618
15006	NC_003911	GTG	2	6	745552	745557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15007	NC_003911	CGG	2	6	745586	745591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695619
15008	NC_003911	CCG	2	6	745606	745611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695619
15009	NC_003911	CCG	2	6	745626	745631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695619
15010	NC_003911	GAC	2	6	745657	745662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695619
15011	NC_003911	GC	3	6	745784	745789	0 %	0 %	50 %	50 %	56695619
15012	NC_003911	CTG	2	6	745810	745815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695619
15013	NC_003911	GCCG	2	8	745818	745825	0 %	0 %	50 %	50 %	56695619
15014	NC_003911	AAGG	2	8	745846	745853	50 %	0 %	50 %	0 %	56695619
15015	NC_003911	GTG	2	6	745861	745866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15016	NC_003911	GCATG	2	10	745881	745890	20 %	20 %	40 %	20 %	56695619
15017	NC_003911	GGC	2	6	745980	745985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695619
15018	NC_003911	GTG	2	6	746089	746094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15019	NC_003911	GTG	2	6	746113	746118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15020	NC_003911	TGG	2	6	746134	746139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15021	NC_003911	GCC	2	6	746142	746147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695619
15022	NC_003911	GAT	2	6	746181	746186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695619
15023	NC_003911	CCG	2	6	746187	746192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695619
15024	NC_003911	GTG	2	6	746206	746211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695619
15025	NC_003911	CG	3	6	746237	746242	0 %	0 %	50 %	50 %	56695619
15026	NC_003911	CTG	3	9	746287	746295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695619
15027	NC_003911	CG	3	6	746387	746392	0 %	0 %	50 %	50 %	56695619
15028	NC_003911	GGC	2	6	746431	746436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695619
15029	NC_003911	CGC	2	6	746554	746559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695620
15030	NC_003911	CAGC	2	8	746594	746601	25 %	0 %	25 %	50 %	56695620
15031	NC_003911	CAGG	2	8	746684	746691	25 %	0 %	50 %	25 %	56695620
15032	NC_003911	GGT	2	6	746734	746739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695620
15033	NC_003911	TCG	2	6	746760	746765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695620
15034	NC_003911	ATC	2	6	746817	746822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695620
15035	NC_003911	GGC	2	6	746870	746875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695620
15036	NC_003911	ACC	2	6	746895	746900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695620
15037	NC_003911	GGC	2	6	746909	746914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695620
15038	NC_003911	TCG	2	6	746925	746930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695620
15039	NC_003911	CCA	2	6	746953	746958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695620
15040	NC_003911	CACCGG	2	12	746966	746977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695620
15041	NC_003911	CGGT	2	8	747012	747019	0 %	25 %	50 %	25 %	56695620
15042	NC_003911	GATCGA	2	12	747038	747049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56695620
15043	NC_003911	GCA	2	6	747079	747084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695620
15044	NC_003911	GGC	2	6	747137	747142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695620
15045	NC_003911	GCCAGC	2	12	747174	747185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695620
15046	NC_003911	CGC	2	6	747281	747286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695620
15047	NC_003911	CTG	2	6	747296	747301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695620
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15049	NC_003911	TGG	2	6	747564	747569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695621
15050	NC_003911	GCA	2	6	747696	747701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695621
15051	NC_003911	GGC	2	6	747844	747849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695621
15052	NC_003911	TGC	2	6	747861	747866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695621
15053	NC_003911	CGC	2	6	747917	747922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695621
15054	NC_003911	GGC	2	6	747955	747960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695621
15055	NC_003911	CAA	2	6	747997	748002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695621
15056	NC_003911	CTG	2	6	748007	748012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695621
15057	NC_003911	GCA	2	6	748066	748071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695621
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15059	NC_003911	CGA	2	6	748159	748164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695621
15060	NC_003911	TGG	2	6	748212	748217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695621
15061	NC_003911	GC	3	6	748237	748242	0 %	0 %	50 %	50 %	56695621
15062	NC_003911	CGA	2	6	748279	748284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695621
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15065	NC_003911	TTG	2	6	748559	748564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695622
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15069	NC_003911	CCGA	2	8	748889	748896	25 %	0 %	25 %	50 %	56695622
15070	NC_003911	GCG	2	6	748931	748936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695622
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15080	NC_003911	GTCAC	2	10	749297	749306	20 %	20 %	20 %	40 %	56695622
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15085	NC_003911	CAC	2	6	749445	749450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695623
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15087	NC_003911	CTT	3	9	749550	749558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695623
15088	NC_003911	ATG	2	6	749566	749571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695623
15089	NC_003911	TGA	2	6	749618	749623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695623
15090	NC_003911	GCC	2	6	749655	749660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695623
15091	NC_003911	CCAGC	2	10	749730	749739	20 %	0 %	20 %	60 %	56695623
15092	NC_003911	TTC	2	6	749817	749822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695623
15093	NC_003911	CGA	2	6	749825	749830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695623
15094	NC_003911	CAT	2	6	749879	749884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695623
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15098	NC_003911	CTTC	2	8	749999	750006	0 %	50 %	0 %	50 %	56695623
15099	NC_003911	TCCG	2	8	750084	750091	0 %	25 %	25 %	50 %	56695623
15100	NC_003911	GA	3	6	750346	750351	50 %	0 %	50 %	0 %	56695624
15101	NC_003911	CTT	2	6	750377	750382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695624
15102	NC_003911	CAG	2	6	750423	750428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695624
15103	NC_003911	ATT	2	6	750457	750462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56695624
15104	NC_003911	GCT	2	6	750469	750474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695624
15105	NC_003911	GCA	2	6	750476	750481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695624
15106	NC_003911	GAT	2	6	750587	750592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695624
15107	NC_003911	GC	3	6	750602	750607	0 %	0 %	50 %	50 %	56695624
15108	NC_003911	GACC	2	8	750671	750678	25 %	0 %	25 %	50 %	56695624
15109	NC_003911	CGT	2	6	750912	750917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695625
15110	NC_003911	GCC	2	6	750922	750927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695625
15111	NC_003911	GTT	2	6	750928	750933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695625
15112	NC_003911	GCGG	2	8	750940	750947	0 %	0 %	75 %	25 %	56695625
15113	NC_003911	CGA	2	6	750948	750953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695625
15114	NC_003911	CAGC	2	8	751026	751033	25 %	0 %	25 %	50 %	56695625
15115	NC_003911	GC	3	6	751040	751045	0 %	0 %	50 %	50 %	56695625
15116	NC_003911	GCC	2	6	751076	751081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695625
15117	NC_003911	GCC	2	6	751090	751095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695625
15118	NC_003911	GCG	2	6	751188	751193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695625
15119	NC_003911	GGC	2	6	751227	751232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695625
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15243	NC_003911	GAC	2	6	756713	756718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695631
15244	NC_003911	GC	3	6	756778	756783	0 %	0 %	50 %	50 %	56695631
15245	NC_003911	GC	3	6	756795	756800	0 %	0 %	50 %	50 %	56695631
15246	NC_003911	GAA	2	6	756890	756895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695631
15247	NC_003911	CGGCG	2	10	756905	756914	0 %	0 %	60 %	40 %	56695631
15248	NC_003911	CGC	2	6	756944	756949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695631
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15250	NC_003911	CTG	2	6	757059	757064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695631
15251	NC_003911	TGG	2	6	757069	757074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695631
15252	NC_003911	GCT	2	6	757091	757096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695631
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15255	NC_003911	GGC	2	6	757208	757213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695631
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15259	NC_003911	TCG	2	6	757363	757368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695631
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15264	NC_003911	TGC	2	6	757462	757467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695631
15265	NC_003911	ATCG	2	8	757473	757480	25 %	25 %	25 %	25 %	56695631
15266	NC_003911	CGAAGC	2	12	757544	757555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695631
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15277	NC_003911	CGG	2	6	758360	758365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695632
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15282	NC_003911	GAAA	2	8	758543	758550	75 %	0 %	25 %	0 %	56695632
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15347	NC_003911	GCA	2	6	761665	761670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695635
15348	NC_003911	CGCAG	2	10	761695	761704	20 %	0 %	40 %	40 %	56695635
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15350	NC_003911	TGGG	2	8	761733	761740	0 %	25 %	75 %	0 %	56695635
15351	NC_003911	CAG	2	6	761741	761746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695635
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15354	NC_003911	GC	3	6	761884	761889	0 %	0 %	50 %	50 %	56695635
15355	NC_003911	CG	3	6	761894	761899	0 %	0 %	50 %	50 %	56695635
15356	NC_003911	CT	3	6	761939	761944	0 %	50 %	0 %	50 %	56695635
15357	NC_003911	TGC	2	6	761952	761957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695635
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15359	NC_003911	CGCCC	2	10	762137	762146	0 %	0 %	20 %	80 %	56695635
15360	NC_003911	CCA	2	6	762157	762162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695635
15361	NC_003911	ATC	2	6	762204	762209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695635
15362	NC_003911	GCG	2	6	762237	762242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695635
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15364	NC_003911	TGA	2	6	762291	762296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695635
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15486	NC_003911	CTG	2	6	767888	767893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695640
15487	NC_003911	ATG	2	6	767931	767936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695640
15488	NC_003911	GCC	2	6	767960	767965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695640
15489	NC_003911	CAC	2	6	768032	768037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695640
15490	NC_003911	CGG	2	6	768043	768048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695640
15491	NC_003911	CGC	2	6	768124	768129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695640
15492	NC_003911	CCG	2	6	768135	768140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695640
15493	NC_003911	CGC	2	6	768241	768246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695640
15494	NC_003911	TCG	2	6	768252	768257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695640
15495	NC_003911	GC	3	6	768282	768287	0 %	0 %	50 %	50 %	56695640
15496	NC_003911	TGG	2	6	768346	768351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695640
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15500	NC_003911	CGG	2	6	768460	768465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695640

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