MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003911	GCAG	2	8	650754	650761	25 %	0 %	50 %	25 %	56695535
13002	NC_003911	CGG	2	6	650776	650781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695535
13003	NC_003911	CGC	2	6	650810	650815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695535
13004	NC_003911	TCA	2	6	650875	650880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695535
13005	NC_003911	A	6	6	650896	650901	100 %	0 %	0 %	0 %	56695535
13006	NC_003911	GAT	3	9	650923	650931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695535
13007	NC_003911	TCG	2	6	652378	652383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695536
13008	NC_003911	GCC	2	6	652428	652433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695536
13009	NC_003911	TG	3	6	652456	652461	0 %	50 %	50 %	0 %	56695536
13010	NC_003911	GGGC	2	8	652525	652532	0 %	0 %	75 %	25 %	56695536
13011	NC_003911	CAT	2	6	652542	652547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695536
13012	NC_003911	CCA	2	6	652556	652561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695536
13013	NC_003911	GCC	2	6	652602	652607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695536
13014	NC_003911	CGG	2	6	652649	652654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695536
13015	NC_003911	CGC	2	6	652675	652680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695536
13016	NC_003911	CGATG	2	10	652694	652703	20 %	20 %	40 %	20 %	56695536
13017	NC_003911	GCCGC	2	10	652716	652725	0 %	0 %	40 %	60 %	56695536
13018	NC_003911	CCT	2	6	652796	652801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695536
13019	NC_003911	CGC	3	9	652848	652856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695536
13020	NC_003911	GGT	2	6	653074	653079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
13021	NC_003911	GAC	2	6	653123	653128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695537
13022	NC_003911	CG	3	6	653139	653144	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
13023	NC_003911	CTG	2	6	653216	653221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695537
13024	NC_003911	GGCG	2	8	653227	653234	0 %	0 %	75 %	25 %	56695537
13025	NC_003911	CGGGG	2	10	653260	653269	0 %	0 %	80 %	20 %	56695537
13026	NC_003911	GC	3	6	653294	653299	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
13027	NC_003911	CGA	2	6	653341	653346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695537
13028	NC_003911	CCG	2	6	653349	653354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695537
13029	NC_003911	CGC	2	6	653387	653392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695537
13030	NC_003911	GGGC	2	8	653458	653465	0 %	0 %	75 %	25 %	56695537
13031	NC_003911	CGG	2	6	653470	653475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695537
13032	NC_003911	GC	3	6	653527	653532	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
13033	NC_003911	CCG	3	9	653566	653574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695537
13034	NC_003911	TGG	2	6	653612	653617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
13035	NC_003911	GAT	2	6	653632	653637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
13036	NC_003911	CG	3	6	653638	653643	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
13037	NC_003911	TGA	2	6	653694	653699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
13038	NC_003911	CG	3	6	653701	653706	0 %	0 %	50 %	50 %	56695537
13039	NC_003911	TGA	2	6	653718	653723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695537
13040	NC_003911	GTG	2	6	653754	653759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
13041	NC_003911	CGA	2	6	653767	653772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695537
13042	NC_003911	GGGGC	2	10	653813	653822	0 %	0 %	80 %	20 %	56695537
13043	NC_003911	TGC	3	9	653883	653891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695537
13044	NC_003911	ATC	2	6	653945	653950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695537
13045	NC_003911	GGT	2	6	653992	653997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695537
13046	NC_003911	GTCTTT	2	12	654271	654282	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56695538
13047	NC_003911	GCC	2	6	654399	654404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13048	NC_003911	AGG	2	6	654406	654411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695538
13049	NC_003911	CGC	3	9	654446	654454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13050	NC_003911	TGC	2	6	654487	654492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695538
13051	NC_003911	CCG	3	9	654505	654513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13052	NC_003911	CGG	3	9	654572	654580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13053	NC_003911	CTGGT	2	10	654588	654597	0 %	40 %	40 %	20 %	56695538
13054	NC_003911	CG	3	6	654649	654654	0 %	0 %	50 %	50 %	56695538
13055	NC_003911	CGG	2	6	654719	654724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13056	NC_003911	TCGG	2	8	654729	654736	0 %	25 %	50 %	25 %	56695538
13057	NC_003911	CGCC	2	8	654748	654755	0 %	0 %	25 %	75 %	56695538
13058	NC_003911	CTG	2	6	654756	654761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695538
13059	NC_003911	CGC	2	6	654774	654779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13060	NC_003911	GCGAT	2	10	654811	654820	20 %	20 %	40 %	20 %	56695538
13061	NC_003911	CGG	2	6	654910	654915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13062	NC_003911	GCC	2	6	654936	654941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13063	NC_003911	GAA	2	6	654962	654967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695538
13064	NC_003911	GCC	2	6	654978	654983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13065	NC_003911	GCC	2	6	654999	655004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13066	NC_003911	CGG	2	6	655025	655030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13067	NC_003911	CGC	2	6	655037	655042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13068	NC_003911	TCG	2	6	655185	655190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695538
13069	NC_003911	GC	3	6	655192	655197	0 %	0 %	50 %	50 %	56695538
13070	NC_003911	GGC	2	6	655241	655246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13071	NC_003911	CGCCT	2	10	655296	655305	0 %	20 %	20 %	60 %	56695538
13072	NC_003911	TGCCGA	2	12	655345	655356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56695538
13073	NC_003911	GAT	2	6	655476	655481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695538
13074	NC_003911	ACC	2	6	655554	655559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695538
13075	NC_003911	TGA	2	6	655585	655590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695538
13076	NC_003911	CAA	2	6	655607	655612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695538
13077	NC_003911	CCA	2	6	655708	655713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695538
13078	NC_003911	CGG	2	6	655757	655762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695538
13079	NC_003911	CAT	2	6	655769	655774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695538
13080	NC_003911	ATC	2	6	655794	655799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695538
13081	NC_003911	ACA	2	6	655826	655831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695538
13082	NC_003911	TGC	2	6	656000	656005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695538
13083	NC_003911	CGC	2	6	656013	656018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695538
13084	NC_003911	AGC	2	6	656255	656260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695539
13085	NC_003911	ACC	3	9	656269	656277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695539
13086	NC_003911	GGT	2	6	656304	656309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695539
13087	NC_003911	CCG	2	6	656324	656329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695539
13088	NC_003911	CGGCAC	2	12	656385	656396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695539
13089	NC_003911	CTCG	2	8	656397	656404	0 %	25 %	25 %	50 %	56695539
13090	NC_003911	CGCC	2	8	656420	656427	0 %	0 %	25 %	75 %	56695539
13091	NC_003911	TTC	2	6	656557	656562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695539
13092	NC_003911	GTG	2	6	656674	656679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695539
13093	NC_003911	AAG	2	6	656719	656724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695539
13094	NC_003911	TGACC	2	10	656739	656748	20 %	20 %	20 %	40 %	56695539
13095	NC_003911	TGA	2	6	656753	656758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695539
13096	NC_003911	CAT	2	6	656781	656786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695539
13097	NC_003911	GC	3	6	656836	656841	0 %	0 %	50 %	50 %	56695539
13098	NC_003911	GCC	2	6	656863	656868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695539
13099	NC_003911	TGA	2	6	656879	656884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695539
13100	NC_003911	CTG	2	6	656923	656928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695539
13101	NC_003911	CGC	2	6	656984	656989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695539
13102	NC_003911	TGC	2	6	656993	656998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695539
13103	NC_003911	GCA	2	6	657050	657055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695539
13104	NC_003911	GAA	2	6	657061	657066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695539
13105	NC_003911	ACC	2	6	657091	657096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695539
13106	NC_003911	GAG	2	6	657103	657108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695539
13107	NC_003911	GCT	2	6	657170	657175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695539
13108	NC_003911	GCC	2	6	657232	657237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695539
13109	NC_003911	GAG	2	6	657250	657255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695539
13110	NC_003911	CTGG	2	8	657369	657376	0 %	25 %	50 %	25 %	56695539
13111	NC_003911	ATGG	2	8	657394	657401	25 %	25 %	50 %	0 %	56695539
13112	NC_003911	GC	3	6	657438	657443	0 %	0 %	50 %	50 %	56695539
13113	NC_003911	GGC	2	6	657483	657488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695539
13114	NC_003911	CAT	2	6	657516	657521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695539
13115	NC_003911	GTC	2	6	657778	657783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
13116	NC_003911	GGC	2	6	657784	657789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695540
13117	NC_003911	CGG	2	6	657893	657898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695540
13118	NC_003911	CTG	2	6	657901	657906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695540
13119	NC_003911	ACC	2	6	657931	657936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695540
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13121	NC_003911	CCG	2	6	658076	658081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695540
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13223	NC_003911	CGA	2	6	662484	662489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695544
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13225	NC_003911	GGC	2	6	662548	662553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695544
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13229	NC_003911	GC	3	6	662838	662843	0 %	0 %	50 %	50 %	56695546
13230	NC_003911	GCGG	2	8	662851	662858	0 %	0 %	75 %	25 %	56695546
13231	NC_003911	CG	3	6	662893	662898	0 %	0 %	50 %	50 %	56695546
13232	NC_003911	GTT	2	6	663030	663035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695545
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13235	NC_003911	TCG	2	6	663157	663162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695545
13236	NC_003911	CGCC	2	8	663179	663186	0 %	0 %	25 %	75 %	56695545
13237	NC_003911	GCC	2	6	663212	663217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695545
13238	NC_003911	GCG	2	6	663235	663240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695545
13239	NC_003911	GGA	2	6	663284	663289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695545
13240	NC_003911	ACC	2	6	663301	663306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695545
13241	NC_003911	GCG	2	6	663411	663416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695545
13242	NC_003911	TCGG	2	8	663430	663437	0 %	25 %	50 %	25 %	56695545
13243	NC_003911	CG	3	6	663460	663465	0 %	0 %	50 %	50 %	56695545
13244	NC_003911	GC	3	6	663509	663514	0 %	0 %	50 %	50 %	56695545
13245	NC_003911	CCG	2	6	663572	663577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695545
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13345	NC_003911	GGCG	2	8	667902	667909	0 %	0 %	75 %	25 %	56695552
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13354	NC_003911	GC	3	6	668192	668197	0 %	0 %	50 %	50 %	56695552
13355	NC_003911	CGG	2	6	668440	668445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695553
13356	NC_003911	GCCA	2	8	668457	668464	25 %	0 %	25 %	50 %	56695553
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13358	NC_003911	CAGCGC	2	12	668534	668545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56695553
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13360	NC_003911	CCAT	2	8	668643	668650	25 %	25 %	0 %	50 %	56695553
13361	NC_003911	GAT	2	6	668693	668698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695553
13362	NC_003911	CG	3	6	668707	668712	0 %	0 %	50 %	50 %	56695553
13363	NC_003911	GCG	2	6	668778	668783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695553
13364	NC_003911	GCG	2	6	668788	668793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695553
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13366	NC_003911	GGC	2	6	668849	668854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695553
13367	NC_003911	TCG	2	6	669148	669153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695553
13368	NC_003911	GGT	2	6	669173	669178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695553
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13386	NC_003911	CG	3	6	669925	669930	0 %	0 %	50 %	50 %	56695554
13387	NC_003911	CACC	2	8	669943	669950	25 %	0 %	0 %	75 %	56695554
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