MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_003911	TGG	2	6	617894	617899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695511
12502	NC_003911	CTC	2	6	617907	617912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695511
12503	NC_003911	CTG	2	6	617958	617963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695511
12504	NC_003911	GC	4	8	618115	618122	0 %	0 %	50 %	50 %	56695511
12505	NC_003911	C	6	6	618160	618165	0 %	0 %	0 %	100 %	56695511
12506	NC_003911	CG	3	6	618186	618191	0 %	0 %	50 %	50 %	56695511
12507	NC_003911	GGC	2	6	618195	618200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695511
12508	NC_003911	GCG	2	6	618257	618262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695511
12509	NC_003911	GC	3	6	618281	618286	0 %	0 %	50 %	50 %	56695511
12510	NC_003911	GAT	2	6	618333	618338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695511
12511	NC_003911	CCGC	2	8	618349	618356	0 %	0 %	25 %	75 %	56695511
12512	NC_003911	ATG	2	6	618400	618405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695511
12513	NC_003911	CGG	2	6	618431	618436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695511
12514	NC_003911	TGG	2	6	618547	618552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695512
12515	NC_003911	AAT	2	6	618592	618597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56695512
12516	NC_003911	AGG	2	6	618682	618687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695512
12517	NC_003911	GCC	2	6	618689	618694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695512
12518	NC_003911	GGGCG	2	10	618733	618742	0 %	0 %	80 %	20 %	56695512
12519	NC_003911	CGA	2	6	618838	618843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695512
12520	NC_003911	GC	4	8	618902	618909	0 %	0 %	50 %	50 %	56695512
12521	NC_003911	GTGAT	2	10	618960	618969	20 %	40 %	40 %	0 %	56695512
12522	NC_003911	CCG	3	9	618972	618980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695512
12523	NC_003911	CCG	2	6	619030	619035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695512
12524	NC_003911	GCA	2	6	619045	619050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695512
12525	NC_003911	GC	3	6	619156	619161	0 %	0 %	50 %	50 %	56695512
12526	NC_003911	GACC	2	8	619213	619220	25 %	0 %	25 %	50 %	56695512
12527	NC_003911	CGCC	2	8	619225	619232	0 %	0 %	25 %	75 %	56695512
12528	NC_003911	GAT	2	6	619280	619285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695512
12529	NC_003911	TCG	2	6	619308	619313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695512
12530	NC_003911	CCA	2	6	619410	619415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695512
12531	NC_003911	CCA	2	6	619543	619548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695512
12532	NC_003911	CCTG	2	8	619605	619612	0 %	25 %	25 %	50 %	56695512
12533	NC_003911	TTG	2	6	619790	619795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695513
12534	NC_003911	GTC	2	6	619810	619815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695513
12535	NC_003911	GGT	2	6	619903	619908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695513
12536	NC_003911	TCT	2	6	619980	619985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695513
12537	NC_003911	TTC	2	6	620047	620052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695513
12538	NC_003911	GCA	2	6	620073	620078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695513
12539	NC_003911	GAT	2	6	620101	620106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695513
12540	NC_003911	CATG	2	8	620118	620125	25 %	25 %	25 %	25 %	56695513
12541	NC_003911	ATG	2	6	620174	620179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695513
12542	NC_003911	GC	3	6	620210	620215	0 %	0 %	50 %	50 %	56695513
12543	NC_003911	TGG	2	6	620406	620411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695513
12544	NC_003911	GCC	2	6	620431	620436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695513
12545	NC_003911	TGG	2	6	620466	620471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695513
12546	NC_003911	CCGAG	2	10	620529	620538	20 %	0 %	40 %	40 %	56695513
12547	NC_003911	GCCT	2	8	620551	620558	0 %	25 %	25 %	50 %	56695513
12548	NC_003911	AGGC	2	8	620660	620667	25 %	0 %	50 %	25 %	56695513
12549	NC_003911	AGGGC	2	10	620691	620700	20 %	0 %	60 %	20 %	56695513
12550	NC_003911	GGC	2	6	620749	620754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695513
12551	NC_003911	GCG	2	6	620774	620779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695513
12552	NC_003911	GGC	2	6	620815	620820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695513
12553	NC_003911	CGG	2	6	620901	620906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695513
12554	NC_003911	GAT	2	6	621020	621025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695514
12555	NC_003911	GGC	2	6	621089	621094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695514
12556	NC_003911	AG	3	6	621125	621130	50 %	0 %	50 %	0 %	56695514
12557	NC_003911	CCT	2	6	621151	621156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695514
12558	NC_003911	GCA	2	6	621163	621168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695514
12559	NC_003911	GC	3	6	621186	621191	0 %	0 %	50 %	50 %	56695514
12560	NC_003911	GAC	2	6	621203	621208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695514
12561	NC_003911	CGA	2	6	621262	621267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695514
12562	NC_003911	AGA	2	6	621268	621273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695514
12563	NC_003911	CG	3	6	621395	621400	0 %	0 %	50 %	50 %	56695514
12564	NC_003911	GATA	2	8	621502	621509	50 %	25 %	25 %	0 %	56695514
12565	NC_003911	CCA	2	6	621562	621567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695514
12566	NC_003911	AGAT	2	8	621594	621601	50 %	25 %	25 %	0 %	56695514
12567	NC_003911	CG	3	6	621705	621710	0 %	0 %	50 %	50 %	56695514
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12569	NC_003911	CGT	2	6	621790	621795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695514
12570	NC_003911	CCA	2	6	621841	621846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695514
12571	NC_003911	CG	3	6	621848	621853	0 %	0 %	50 %	50 %	56695514
12572	NC_003911	GGT	2	6	621877	621882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695514
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12575	NC_003911	GCC	3	9	622004	622012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695514
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12577	NC_003911	CGT	2	6	622093	622098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695514
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12581	NC_003911	CGA	2	6	622528	622533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695514
12582	NC_003911	CTG	2	6	622553	622558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695514
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12589	NC_003911	ACC	2	6	623100	623105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695515
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12592	NC_003911	TG	3	6	623337	623342	0 %	50 %	50 %	0 %	56695515
12593	NC_003911	ATG	2	6	623346	623351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695515
12594	NC_003911	CAGC	2	8	623411	623418	25 %	0 %	25 %	50 %	56695516
12595	NC_003911	AGA	2	6	623426	623431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695516
12596	NC_003911	CAGG	2	8	623469	623476	25 %	0 %	50 %	25 %	56695516
12597	NC_003911	CAC	2	6	623490	623495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695516
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12601	NC_003911	TGC	2	6	623614	623619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695516
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12604	NC_003911	TTGT	2	8	623743	623750	0 %	75 %	25 %	0 %	56695516
12605	NC_003911	TGAG	2	8	623772	623779	25 %	25 %	50 %	0 %	56695517
12606	NC_003911	GTTG	2	8	623791	623798	0 %	50 %	50 %	0 %	56695517
12607	NC_003911	GCCG	2	8	623822	623829	0 %	0 %	50 %	50 %	56695517
12608	NC_003911	GCC	2	6	623896	623901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695517
12609	NC_003911	GGCC	2	8	623965	623972	0 %	0 %	50 %	50 %	56695517
12610	NC_003911	ACG	2	6	623991	623996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695517
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12612	NC_003911	GCTG	2	8	624145	624152	0 %	25 %	50 %	25 %	56695517
12613	NC_003911	AG	3	6	624157	624162	50 %	0 %	50 %	0 %	56695517
12614	NC_003911	TGGGG	2	10	624550	624559	0 %	20 %	80 %	0 %	56695518
12615	NC_003911	CAC	2	6	624592	624597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695518
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12623	NC_003911	CCGG	2	8	624780	624787	0 %	0 %	50 %	50 %	56695518
12624	NC_003911	TGC	2	6	624794	624799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695518
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12733	NC_003911	GGA	2	6	629818	629823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695521
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12744	NC_003911	GCT	2	6	630422	630427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695522
12745	NC_003911	CAT	2	6	630431	630436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695522
12746	NC_003911	CTG	2	6	630444	630449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695522
12747	NC_003911	GCC	2	6	630500	630505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695522
12748	NC_003911	ACA	2	6	630700	630705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695522
12749	NC_003911	AGA	2	6	630709	630714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695522
12750	NC_003911	GTG	2	6	630753	630758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695522
12751	NC_003911	CGA	2	6	630764	630769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695522
12752	NC_003911	GC	3	6	630842	630847	0 %	0 %	50 %	50 %	56695522
12753	NC_003911	GGT	3	9	630902	630910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695522
12754	NC_003911	GGT	2	6	630926	630931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695522
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12756	NC_003911	GGGTG	2	10	631034	631043	0 %	20 %	80 %	0 %	56695522
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12758	NC_003911	GCCT	2	8	631153	631160	0 %	25 %	25 %	50 %	56695522
12759	NC_003911	GGC	2	6	631189	631194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695522
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12761	NC_003911	CCG	2	6	631289	631294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695522
12762	NC_003911	TGGC	3	12	631319	631330	0 %	25 %	50 %	25 %	56695522
12763	NC_003911	TGC	2	6	631389	631394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695523
12764	NC_003911	GGTGCT	2	12	631396	631407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695523
12765	NC_003911	GAT	2	6	631432	631437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695523
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12767	NC_003911	TTC	2	6	631484	631489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695523
12768	NC_003911	GGT	2	6	631503	631508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695523
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12771	NC_003911	TCCTGA	2	12	631572	631583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56695523
12772	NC_003911	CTG	2	6	631739	631744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695523
12773	NC_003911	ATGAC	2	10	631779	631788	40 %	20 %	20 %	20 %	56695523
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12776	NC_003911	TGC	2	6	631857	631862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695523
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12782	NC_003911	TGC	2	6	632276	632281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695524
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12801	NC_003911	ACC	3	9	633159	633167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695525
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12849	NC_003911	GGCCC	2	10	635070	635079	0 %	0 %	40 %	60 %	56695527
12850	NC_003911	GC	4	8	635147	635154	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
12851	NC_003911	CCG	2	6	635325	635330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695527
12852	NC_003911	TGCCGC	2	12	635340	635351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56695527
12853	NC_003911	GCG	2	6	635402	635407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
12854	NC_003911	TGC	2	6	635542	635547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695527
12855	NC_003911	GC	3	6	635557	635562	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
12856	NC_003911	GGC	2	6	635620	635625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
12857	NC_003911	TGC	2	6	635754	635759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695527
12858	NC_003911	GGC	2	6	635836	635841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695527
12859	NC_003911	GC	3	6	635874	635879	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
12860	NC_003911	CGC	5	15	635914	635928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695527
12861	NC_003911	GC	4	8	635949	635956	0 %	0 %	50 %	50 %	56695527
12862	NC_003911	TC	3	6	636379	636384	0 %	50 %	0 %	50 %	56695528
12863	NC_003911	CGC	2	6	636485	636490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695528
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12988	NC_003911	CGA	2	6	648951	648956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695534
12989	NC_003911	GC	3	6	648961	648966	0 %	0 %	50 %	50 %	56695534
12990	NC_003911	CGC	2	6	650058	650063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695535
12991	NC_003911	CGC	2	6	650093	650098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695535
12992	NC_003911	CG	3	6	650106	650111	0 %	0 %	50 %	50 %	56695535
12993	NC_003911	TGGT	2	8	650212	650219	0 %	50 %	50 %	0 %	56695535
12994	NC_003911	GTG	2	6	650220	650225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695535
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12996	NC_003911	CGCC	2	8	650425	650432	0 %	0 %	25 %	75 %	56695535
12997	NC_003911	GCT	2	6	650435	650440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695535
12998	NC_003911	GCA	2	6	650537	650542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695535
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13000	NC_003911	GT	3	6	650708	650713	0 %	50 %	50 %	0 %	56695535

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