MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_003911	CGG	2	6	550094	550099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11003	NC_003911	GGC	2	6	550107	550112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11004	NC_003911	GCGCC	2	10	550135	550144	0 %	0 %	40 %	60 %	56695467
11005	NC_003911	GCG	2	6	550192	550197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11006	NC_003911	CGC	4	12	550202	550213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695467
11007	NC_003911	GGC	2	6	550243	550248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11008	NC_003911	CTT	2	6	550284	550289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695467
11009	NC_003911	CCA	2	6	550292	550297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695467
11010	NC_003911	GCC	2	6	550298	550303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695467
11011	NC_003911	CGC	2	6	550332	550337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695467
11012	NC_003911	GC	3	6	550336	550341	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11013	NC_003911	GC	3	6	550347	550352	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11014	NC_003911	CCCGG	2	10	550403	550412	0 %	0 %	40 %	60 %	56695467
11015	NC_003911	ATC	2	6	550413	550418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695467
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11017	NC_003911	GC	3	6	550587	550592	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11018	NC_003911	CGG	2	6	550652	550657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11019	NC_003911	CGG	2	6	550681	550686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695467
11020	NC_003911	TTC	2	6	550693	550698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695467
11021	NC_003911	GC	3	6	550720	550725	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11022	NC_003911	GC	6	12	550771	550782	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11023	NC_003911	GC	3	6	550834	550839	0 %	0 %	50 %	50 %	56695467
11024	NC_003911	CCT	2	6	550913	550918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695467
11025	NC_003911	CCA	2	6	550925	550930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695467
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11028	NC_003911	CG	3	6	551042	551047	0 %	0 %	50 %	50 %	56695468
11029	NC_003911	CGG	2	6	551052	551057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695468
11030	NC_003911	CAG	2	6	551078	551083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695468
11031	NC_003911	CTGG	2	8	551099	551106	0 %	25 %	50 %	25 %	56695468
11032	NC_003911	TCC	2	6	551175	551180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695468
11033	NC_003911	CG	3	6	551264	551269	0 %	0 %	50 %	50 %	56695468
11034	NC_003911	CA	3	6	551316	551321	50 %	0 %	0 %	50 %	56695468
11035	NC_003911	CGG	2	6	551326	551331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695468
11036	NC_003911	CCCG	2	8	551380	551387	0 %	0 %	25 %	75 %	56695468
11037	NC_003911	GCC	2	6	551394	551399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695468
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11039	NC_003911	GGGTC	2	10	551473	551482	0 %	20 %	60 %	20 %	56695468
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11041	NC_003911	CGCCAC	2	12	551527	551538	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56695468
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11044	NC_003911	GC	3	6	551621	551626	0 %	0 %	50 %	50 %	56695468
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11052	NC_003911	CGA	2	6	551872	551877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695468
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11055	NC_003911	TCG	2	6	551943	551948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695468
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11058	NC_003911	CAGG	2	8	552004	552011	25 %	0 %	50 %	25 %	56695468
11059	NC_003911	GCCGAG	2	12	552078	552089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56695468
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11065	NC_003911	CAT	2	6	552367	552372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695469
11066	NC_003911	GCCCG	2	10	552564	552573	0 %	0 %	40 %	60 %	56695469
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11088	NC_003911	CCGC	2	8	553983	553990	0 %	0 %	25 %	75 %	56695470
11089	NC_003911	TGA	2	6	554019	554024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695470
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11091	NC_003911	TGC	3	9	554178	554186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695470
11092	NC_003911	TCGA	2	8	554204	554211	25 %	25 %	25 %	25 %	56695470
11093	NC_003911	CGCA	2	8	554230	554237	25 %	0 %	25 %	50 %	56695470
11094	NC_003911	CG	3	6	554268	554273	0 %	0 %	50 %	50 %	56695470
11095	NC_003911	TGGGGG	2	12	554316	554327	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	56695470
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11101	NC_003911	GTCG	2	8	554767	554774	0 %	25 %	50 %	25 %	56695470
11102	NC_003911	GGT	2	6	554785	554790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695470
11103	NC_003911	GGCT	2	8	554810	554817	0 %	25 %	50 %	25 %	56695470
11104	NC_003911	TGGC	2	8	554868	554875	0 %	25 %	50 %	25 %	56695470
11105	NC_003911	GTCG	2	8	554893	554900	0 %	25 %	50 %	25 %	56695470
11106	NC_003911	CGC	2	6	554974	554979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695470
11107	NC_003911	GGC	2	6	554995	555000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695470
11108	NC_003911	GC	3	6	555027	555032	0 %	0 %	50 %	50 %	56695470
11109	NC_003911	CCG	2	6	555067	555072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695470
11110	NC_003911	TGT	2	6	555094	555099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695470
11111	NC_003911	TGGAC	2	10	555138	555147	20 %	20 %	40 %	20 %	56695470
11112	NC_003911	ATC	2	6	555188	555193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695470
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11117	NC_003911	GCT	2	6	555325	555330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695470
11118	NC_003911	TGG	2	6	555363	555368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695470
11119	NC_003911	TGCCGG	2	12	555424	555435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56695470
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11121	NC_003911	TTCT	2	8	555500	555507	0 %	75 %	0 %	25 %	56695470
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11366	NC_003911	GTC	2	6	569400	569405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695479
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11372	NC_003911	GTCAGG	2	12	569944	569955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695480
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11384	NC_003911	CGG	2	6	570521	570526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695480
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11479	NC_003911	GCG	2	6	574790	574795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695482
11480	NC_003911	GCT	2	6	574836	574841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695482
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11482	NC_003911	ACC	2	6	574894	574899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695482
11483	NC_003911	ACGAC	2	10	574928	574937	40 %	0 %	20 %	40 %	56695482
11484	NC_003911	GC	3	6	574942	574947	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
11485	NC_003911	AGGGCG	2	12	575012	575023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	56695482
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11491	NC_003911	GC	3	6	575254	575259	0 %	0 %	50 %	50 %	56695482
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