MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_003911	GC	3	6	2406481	2406486	0 %	0 %	50 %	50 %	56697127
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50004	NC_003911	TCGG	2	8	2406533	2406540	0 %	25 %	50 %	25 %	56697127
50005	NC_003911	CAG	2	6	2406571	2406576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697127
50006	NC_003911	CAG	2	6	2406583	2406588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697127
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50008	NC_003911	GCA	2	6	2406654	2406659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697127
50009	NC_003911	CGCC	2	8	2406672	2406679	0 %	0 %	25 %	75 %	56697127
50010	NC_003911	GCG	2	6	2406820	2406825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56697127
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50014	NC_003911	GC	3	6	2406959	2406964	0 %	0 %	50 %	50 %	56697127
50015	NC_003911	CGCC	2	8	2407001	2407008	0 %	0 %	25 %	75 %	56697127
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50072	NC_003911	CTGC	2	8	2410355	2410362	0 %	25 %	25 %	50 %	56697131
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50119	NC_003911	GCC	2	6	2412901	2412906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697134
50120	NC_003911	ATC	2	6	2412980	2412985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56697134
50121	NC_003911	CCA	2	6	2412987	2412992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697134
50122	NC_003911	GCC	2	6	2413028	2413033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697134
50123	NC_003911	GCT	2	6	2413129	2413134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697134
50124	NC_003911	CCA	2	6	2413155	2413160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697134
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50126	NC_003911	GCC	2	6	2413270	2413275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697134
50127	NC_003911	CAC	2	6	2413285	2413290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697134
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50135	NC_003911	TCT	2	6	2413705	2413710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697135
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50140	NC_003911	GTG	2	6	2414157	2414162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56697136
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50142	NC_003911	GGC	2	6	2414255	2414260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56697136
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50145	NC_003911	GC	3	6	2414327	2414332	0 %	0 %	50 %	50 %	56697136
50146	NC_003911	TCA	2	6	2414335	2414340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56697136
50147	NC_003911	GCA	2	6	2414347	2414352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697136
50148	NC_003911	TGG	2	6	2414371	2414376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56697136
50149	NC_003911	CG	3	6	2414440	2414445	0 %	0 %	50 %	50 %	56697136
50150	NC_003911	CGG	2	6	2414491	2414496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56697136
50151	NC_003911	GCC	2	6	2414520	2414525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697136
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50154	NC_003911	GCA	2	6	2414631	2414636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697136
50155	NC_003911	GC	5	10	2414641	2414650	0 %	0 %	50 %	50 %	56697136
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50159	NC_003911	GC	3	6	2415009	2415014	0 %	0 %	50 %	50 %	56697137
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50164	NC_003911	CTTGGC	2	12	2415152	2415163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697137
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50178	NC_003911	TCG	2	6	2415612	2415617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697137
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50182	NC_003911	GGC	2	6	2415904	2415909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56697138
50183	NC_003911	CTG	2	6	2415955	2415960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
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50192	NC_003911	GCT	2	6	2416134	2416139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
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50200	NC_003911	TGC	2	6	2416334	2416339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
50201	NC_003911	CTG	2	6	2416351	2416356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
50202	NC_003911	GCGCTG	2	12	2416369	2416380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56697138
50203	NC_003911	GGCG	2	8	2416386	2416393	0 %	0 %	75 %	25 %	56697138
50204	NC_003911	ACC	2	6	2416403	2416408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697138
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50206	NC_003911	TGC	2	6	2416439	2416444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
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50208	NC_003911	GCT	3	9	2416497	2416505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
50209	NC_003911	GCT	2	6	2416509	2416514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697138
50210	NC_003911	CTGG	2	8	2416518	2416525	0 %	25 %	50 %	25 %	56697138
50211	NC_003911	TGGCGC	2	12	2416533	2416544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56697138
50212	NC_003911	AC	3	6	2416553	2416558	50 %	0 %	0 %	50 %	56697138
50213	NC_003911	CGCA	2	8	2416568	2416575	25 %	0 %	25 %	50 %	56697138
50214	NC_003911	CCG	2	6	2416700	2416705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697138
50215	NC_003911	CG	3	6	2416721	2416726	0 %	0 %	50 %	50 %	56697138
50216	NC_003911	GTCACC	2	12	2416750	2416761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56697138
50217	NC_003911	CT	3	6	2416773	2416778	0 %	50 %	0 %	50 %	56697138
50218	NC_003911	TTC	2	6	2416819	2416824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697138
50219	NC_003911	GCACC	2	10	2416866	2416875	20 %	0 %	20 %	60 %	56697138
50220	NC_003911	GCG	2	6	2416913	2416918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56697138
50221	NC_003911	CCGC	2	8	2416967	2416974	0 %	0 %	25 %	75 %	56697138
50222	NC_003911	CGA	2	6	2417031	2417036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697138
50223	NC_003911	GAT	2	6	2417317	2417322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56697139
50224	NC_003911	GAA	2	6	2417364	2417369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56697139
50225	NC_003911	GTC	2	6	2417465	2417470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697139
50226	NC_003911	TCC	2	6	2417604	2417609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56697139
50227	NC_003911	CAA	2	6	2417713	2417718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56697139
50228	NC_003911	AGT	2	6	2417732	2417737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56697139
50229	NC_003911	TTGA	2	8	2417738	2417745	25 %	50 %	25 %	0 %	56697139
50230	NC_003911	ACG	2	6	2417753	2417758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56697139
50231	NC_003911	CTT	2	6	2417833	2417838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697139
50232	NC_003911	GC	3	6	2417886	2417891	0 %	0 %	50 %	50 %	56697139
50233	NC_003911	TTC	2	6	2417918	2417923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697139
50234	NC_003911	GAG	2	6	2417933	2417938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56697139
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50236	NC_003911	AGCG	2	8	2417962	2417969	25 %	0 %	50 %	25 %	56697139
50237	NC_003911	TTC	2	6	2417996	2418001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697139
50238	NC_003911	AAT	2	6	2418134	2418139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56697139
50239	NC_003911	CTGC	2	8	2418216	2418223	0 %	25 %	25 %	50 %	56697139
50240	NC_003911	CAT	2	6	2418259	2418264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56697139
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50324	NC_003911	GCT	2	6	2422199	2422204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697145
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50334	NC_003911	TGC	2	6	2423300	2423305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56697147
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50341	NC_003911	TGA	2	6	2423671	2423676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56697147
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50349	NC_003911	TGA	2	6	2424394	2424399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56697148
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50469	NC_003911	TCC	2	6	2430822	2430827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56697153
50470	NC_003911	GGCA	2	8	2430886	2430893	25 %	0 %	50 %	25 %	56697153
50471	NC_003911	CCT	2	6	2430895	2430900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56697153
50472	NC_003911	GC	3	6	2430904	2430909	0 %	0 %	50 %	50 %	56697153
50473	NC_003911	GCCCC	2	10	2430934	2430943	0 %	0 %	20 %	80 %	56697153
50474	NC_003911	CG	3	6	2430958	2430963	0 %	0 %	50 %	50 %	56697153
50475	NC_003911	GCC	2	6	2430995	2431000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697153
50476	NC_003911	CGTG	2	8	2431021	2431028	0 %	25 %	50 %	25 %	56697153
50477	NC_003911	CCG	2	6	2431042	2431047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697153
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50479	NC_003911	TTC	2	6	2431156	2431161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697153
50480	NC_003911	GAAG	2	8	2431302	2431309	50 %	0 %	50 %	0 %	56697153
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50482	NC_003911	ACC	2	6	2431335	2431340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697153
50483	NC_003911	TGT	2	6	2431343	2431348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56697153
50484	NC_003911	TCT	2	6	2431360	2431365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56697153
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50486	NC_003911	CTA	2	6	2431423	2431428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56697153
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50491	NC_003911	CCA	2	6	2431632	2431637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697153
50492	NC_003911	TTG	2	6	2431638	2431643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56697153
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50495	NC_003911	ACC	2	6	2431758	2431763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56697153
50496	NC_003911	CGC	2	6	2431817	2431822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56697153
50497	NC_003911	CTGCG	2	10	2431841	2431850	0 %	20 %	40 %	40 %	56697153
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50499	NC_003911	TGCCC	2	10	2431867	2431876	0 %	20 %	20 %	60 %	56697153
50500	NC_003911	GAA	2	6	2432040	2432045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56698713

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