MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 49225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003296	GCC	2	6	447571	447576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548562
10002	NC_003296	GCG	2	6	447577	447582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548562
10003	NC_003296	CAT	2	6	447606	447611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548562
10004	NC_003296	CTG	2	6	447612	447617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548562
10005	NC_003296	GCCCG	2	10	447625	447634	0 %	0 %	40 %	60 %	17548562
10006	NC_003296	CAG	2	6	447651	447656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548562
10007	NC_003296	CAG	3	9	447672	447680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548562
10008	NC_003296	ACG	3	9	447684	447692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548562
10009	NC_003296	CG	3	6	447691	447696	0 %	0 %	50 %	50 %	17548562
10010	NC_003296	CGG	2	6	447699	447704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548562
10011	NC_003296	CGG	2	6	447746	447751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548562
10012	NC_003296	GGGTC	2	10	447752	447761	0 %	20 %	60 %	20 %	17548562
10013	NC_003296	TGCG	2	8	447770	447777	0 %	25 %	50 %	25 %	17548562
10014	NC_003296	GACA	2	8	448208	448215	50 %	0 %	25 %	25 %	17548563
10015	NC_003296	GCTGCG	2	12	448259	448270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17548563
10016	NC_003296	GCT	2	6	448286	448291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548563
10017	NC_003296	CGATTT	2	12	448337	448348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17548563
10018	NC_003296	GCC	2	6	448368	448373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548563
10019	NC_003296	CAG	2	6	448377	448382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548563
10020	NC_003296	CGGC	2	8	448414	448421	0 %	0 %	50 %	50 %	17548563
10021	NC_003296	CGG	2	6	448429	448434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548563
10022	NC_003296	GC	3	6	448438	448443	0 %	0 %	50 %	50 %	17548563
10023	NC_003296	CGG	2	6	448444	448449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548563
10024	NC_003296	GTG	2	6	448455	448460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548563
10025	NC_003296	GCA	2	6	448532	448537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548563
10026	NC_003296	ACA	2	6	448594	448599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548563
10027	NC_003296	GCTG	2	8	448652	448659	0 %	25 %	50 %	25 %	17548563
10028	NC_003296	AGC	2	6	448668	448673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548563
10029	NC_003296	TGGC	2	8	448863	448870	0 %	25 %	50 %	25 %	17548564
10030	NC_003296	GC	3	6	448872	448877	0 %	0 %	50 %	50 %	17548564
10031	NC_003296	GTG	2	6	448904	448909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548564
10032	NC_003296	GGT	2	6	448975	448980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548564
10033	NC_003296	GTCG	2	8	449023	449030	0 %	25 %	50 %	25 %	17548564
10034	NC_003296	GTG	2	6	449036	449041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548564
10035	NC_003296	ACGTGG	2	12	449124	449135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17548564
10036	NC_003296	CGA	2	6	449137	449142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548564
10037	NC_003296	ACC	2	6	449201	449206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548564
10038	NC_003296	GGC	2	6	449215	449220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548564
10039	NC_003296	ACCC	2	8	449245	449252	25 %	0 %	0 %	75 %	17548564
10040	NC_003296	CCA	3	9	449288	449296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548565
10041	NC_003296	ACCAGC	2	12	449302	449313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17548565
10042	NC_003296	CAG	2	6	449319	449324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10043	NC_003296	CAC	2	6	449334	449339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548565
10044	NC_003296	GAA	2	6	449406	449411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17548565
10045	NC_003296	ACG	2	6	449500	449505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10046	NC_003296	GCC	2	6	449530	449535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548565
10047	NC_003296	TCG	2	6	449545	449550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10048	NC_003296	CGT	2	6	449576	449581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10049	NC_003296	GACGCT	2	12	449583	449594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10050	NC_003296	GTC	2	6	449595	449600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10051	NC_003296	CGA	2	6	449640	449645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10052	NC_003296	GTC	2	6	449650	449655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10053	NC_003296	GAC	2	6	449676	449681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10054	NC_003296	CCG	2	6	449711	449716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548565
10055	NC_003296	GAC	2	6	449746	449751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10056	NC_003296	GCC	2	6	449794	449799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548565
10057	NC_003296	ACC	2	6	449815	449820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548565
10058	NC_003296	GC	3	6	449828	449833	0 %	0 %	50 %	50 %	17548565
10059	NC_003296	GCT	2	6	449880	449885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548565
10060	NC_003296	CAC	2	6	449925	449930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548565
10061	NC_003296	CGC	2	6	450012	450017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548566
10062	NC_003296	GAA	2	6	450021	450026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17548566
10063	NC_003296	GCA	2	6	450041	450046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10064	NC_003296	AAG	2	6	450076	450081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17548566
10065	NC_003296	CGTGAC	2	12	450195	450206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10066	NC_003296	CAT	2	6	450324	450329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548566
10067	NC_003296	CCG	2	6	450389	450394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548566
10068	NC_003296	ACC	2	6	450442	450447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548566
10069	NC_003296	GCC	2	6	450475	450480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548566
10070	NC_003296	ACC	2	6	450493	450498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548566
10071	NC_003296	CCA	2	6	450512	450517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548566
10072	NC_003296	ACG	2	6	450557	450562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10073	NC_003296	GCC	2	6	450607	450612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548566
10074	NC_003296	CGG	2	6	450654	450659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548566
10075	NC_003296	CAG	2	6	450687	450692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10076	NC_003296	TCG	2	6	450706	450711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10077	NC_003296	GGTGGC	2	12	450720	450731	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	17548566
10078	NC_003296	CAC	2	6	450771	450776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548566
10079	NC_003296	CGG	3	9	450783	450791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548566
10080	NC_003296	ACC	2	6	450802	450807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548566
10081	NC_003296	GCC	2	6	450833	450838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548566
10082	NC_003296	TCGG	2	8	450850	450857	0 %	25 %	50 %	25 %	17548566
10083	NC_003296	CGG	2	6	450960	450965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548566
10084	NC_003296	GTGG	2	8	450972	450979	0 %	25 %	75 %	0 %	17548566
10085	NC_003296	GC	3	6	450995	451000	0 %	0 %	50 %	50 %	17548566
10086	NC_003296	CTG	2	6	451036	451041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10087	NC_003296	GTC	2	6	451044	451049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10088	NC_003296	TCG	2	6	451100	451105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548566
10089	NC_003296	TCC	2	6	451157	451162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17548566
10090	NC_003296	CAG	2	6	451250	451255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548567
10091	NC_003296	GCC	2	6	451256	451261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548567
10092	NC_003296	CAA	2	6	451267	451272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548567
10093	NC_003296	CAC	2	6	451288	451293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548567
10094	NC_003296	ACC	2	6	451415	451420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548567
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10096	NC_003296	CCG	2	6	451473	451478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548567
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10099	NC_003296	GCC	2	6	451588	451593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548567
10100	NC_003296	ACC	2	6	451598	451603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548567
10101	NC_003296	CGC	2	6	451656	451661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548567
10102	NC_003296	GGC	2	6	451674	451679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548567
10103	NC_003296	CGG	2	6	451786	451791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548567
10104	NC_003296	GCA	2	6	451803	451808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548567
10105	NC_003296	TGC	2	6	451920	451925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548567
10106	NC_003296	AAC	2	6	452046	452051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548568
10107	NC_003296	ACG	2	6	452067	452072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10108	NC_003296	CG	3	6	452086	452091	0 %	0 %	50 %	50 %	17548568
10109	NC_003296	CTG	2	6	452106	452111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10110	NC_003296	GTC	2	6	452141	452146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10111	NC_003296	GCA	2	6	452147	452152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10112	NC_003296	CGGCAC	2	12	452180	452191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17548568
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10114	NC_003296	GCA	2	6	452234	452239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10115	NC_003296	CGAC	2	8	452251	452258	25 %	0 %	25 %	50 %	17548568
10116	NC_003296	CAACGG	2	12	452267	452278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10117	NC_003296	CTT	2	6	452279	452284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548568
10118	NC_003296	CG	3	6	452320	452325	0 %	0 %	50 %	50 %	17548568
10119	NC_003296	CCA	2	6	452413	452418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548568
10120	NC_003296	ACGGTG	2	12	452442	452453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17548568
10121	NC_003296	ACG	2	6	452454	452459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10122	NC_003296	TCA	2	6	452509	452514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548568
10123	NC_003296	CGGC	2	8	452518	452525	0 %	0 %	50 %	50 %	17548568
10124	NC_003296	GCA	2	6	452530	452535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548568
10125	NC_003296	AACGTG	2	12	452643	452654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17548568
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10127	NC_003296	C	7	7	452799	452805	0 %	0 %	0 %	100 %	17548569
10128	NC_003296	CGG	2	6	452824	452829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548569
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10130	NC_003296	TGC	2	6	452898	452903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548569
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10132	NC_003296	ACC	2	6	452933	452938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548569
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10134	NC_003296	CCG	2	6	452945	452950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548569
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10140	NC_003296	TGG	2	6	453051	453056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548569
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10144	NC_003296	GCA	2	6	453132	453137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548569
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10232	NC_003296	CAA	2	6	455735	455740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548571
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10235	NC_003296	CAA	2	6	455959	455964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548572
10236	NC_003296	CGGC	2	8	455982	455989	0 %	0 %	50 %	50 %	17548572
10237	NC_003296	GGCT	2	8	456040	456047	0 %	25 %	50 %	25 %	17548572
10238	NC_003296	GCC	2	6	456128	456133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548572
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10240	NC_003296	GCC	2	6	456140	456145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548572
10241	NC_003296	ACCT	2	8	456179	456186	25 %	25 %	0 %	50 %	17548572
10242	NC_003296	CTT	2	6	456226	456231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548572
10243	NC_003296	GCC	2	6	456236	456241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548572
10244	NC_003296	GCG	2	6	456296	456301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548572
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10253	NC_003296	CGA	2	6	456697	456702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548572
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10354	NC_003296	GCCG	2	8	460365	460372	0 %	0 %	50 %	50 %	17548575
10355	NC_003296	CG	3	6	460404	460409	0 %	0 %	50 %	50 %	17548575
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10360	NC_003296	GGC	2	6	460632	460637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548575
10361	NC_003296	GCG	2	6	460696	460701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548575
10362	NC_003296	GC	3	6	460762	460767	0 %	0 %	50 %	50 %	17548575
10363	NC_003296	GCA	2	6	460805	460810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548575
10364	NC_003296	CGAGCA	2	12	460850	460861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548575
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10473	NC_003296	GCGGG	2	10	466029	466038	0 %	0 %	80 %	20 %	17548581
10474	NC_003296	G	8	8	466036	466043	0 %	0 %	100 %	0 %	17548581
10475	NC_003296	GTTCAT	2	12	466056	466067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17548581
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10478	NC_003296	GGC	2	6	466144	466149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548582
10479	NC_003296	CCA	2	6	466159	466164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548582
10480	NC_003296	GCG	2	6	466171	466176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548582
10481	NC_003296	TCA	2	6	466227	466232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548582
10482	NC_003296	TGCA	2	8	466388	466395	25 %	25 %	25 %	25 %	17548582
10483	NC_003296	CGCC	2	8	466516	466523	0 %	0 %	25 %	75 %	17548582
10484	NC_003296	CTC	2	6	466544	466549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17548582
10485	NC_003296	TCA	2	6	466555	466560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548582
10486	NC_003296	ACC	3	9	466695	466703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548582
10487	NC_003296	CAGGCG	2	12	466712	466723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17548582
10488	NC_003296	GCGGCA	2	12	466809	466820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	17548582
10489	NC_003296	TGCG	2	8	466881	466888	0 %	25 %	50 %	25 %	17548582
10490	NC_003296	GCTTCC	2	12	466905	466916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	17548582
10491	NC_003296	ACA	2	6	466944	466949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548582
10492	NC_003296	GTGC	2	8	466990	466997	0 %	25 %	50 %	25 %	17548582
10493	NC_003296	GC	3	6	467011	467016	0 %	0 %	50 %	50 %	17548582
10494	NC_003296	AGC	3	9	467019	467027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548582
10495	NC_003296	GGC	2	6	467064	467069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548582
10496	NC_003296	GC	3	6	467068	467073	0 %	0 %	50 %	50 %	17548582
10497	NC_003296	GACC	2	8	467095	467102	25 %	0 %	25 %	50 %	17548582
10498	NC_003296	CGAT	2	8	467124	467131	25 %	25 %	25 %	25 %	17548582
10499	NC_003296	GC	3	6	467133	467138	0 %	0 %	50 %	50 %	17548582
10500	NC_003296	GTC	2	6	467186	467191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548582

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