MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 chromosome

Total Repeats: 91473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_003295	GCA	2	6	510343	510348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545194
13002	NC_003295	ATC	2	6	510386	510391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545194
13003	NC_003295	CG	3	6	510462	510467	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13004	NC_003295	CTCG	2	8	510475	510482	0 %	25 %	25 %	50 %	17545194
13005	NC_003295	GC	3	6	510499	510504	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13006	NC_003295	CAA	2	6	510514	510519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17545194
13007	NC_003295	CGGC	2	8	510531	510538	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13008	NC_003295	GC	3	6	510567	510572	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13009	NC_003295	CGC	2	6	510615	510620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545194
13010	NC_003295	GC	3	6	510623	510628	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13011	NC_003295	GCG	2	6	510648	510653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545194
13012	NC_003295	GCC	2	6	510655	510660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545194
13013	NC_003295	GAAG	2	8	510682	510689	50 %	0 %	50 %	0 %	17545194
13014	NC_003295	GCC	2	6	510710	510715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545194
13015	NC_003295	CGC	2	6	510763	510768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545194
13016	NC_003295	GCG	2	6	510828	510833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545194
13017	NC_003295	CG	3	6	510875	510880	0 %	0 %	50 %	50 %	17545194
13018	NC_003295	GCC	2	6	510903	510908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545194
13019	NC_003295	GCG	2	6	510959	510964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545194
13020	NC_003295	AAG	2	6	511153	511158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17545195
13021	NC_003295	CCG	2	6	511169	511174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545195
13022	NC_003295	TGG	2	6	511202	511207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545195
13023	NC_003295	CCG	2	6	511208	511213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545195
13024	NC_003295	CCG	2	6	511223	511228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545195
13025	NC_003295	CGGC	2	8	511268	511275	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
13026	NC_003295	GCG	2	6	511354	511359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545195
13027	NC_003295	GCG	2	6	511385	511390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545195
13028	NC_003295	CAC	2	6	511407	511412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545195
13029	NC_003295	TGC	3	9	511415	511423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13030	NC_003295	CTG	3	9	511510	511518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13031	NC_003295	ACC	2	6	511535	511540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545195
13032	NC_003295	CTG	2	6	511555	511560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13033	NC_003295	GC	3	6	511588	511593	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
13034	NC_003295	TGC	2	6	511616	511621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13035	NC_003295	GC	3	6	511647	511652	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
13036	NC_003295	GC	3	6	511657	511662	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
13037	NC_003295	GCT	2	6	511671	511676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13038	NC_003295	GCC	2	6	511677	511682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545195
13039	NC_003295	GTC	2	6	511683	511688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13040	NC_003295	TGCG	2	8	511691	511698	0 %	25 %	50 %	25 %	17545195
13041	NC_003295	TGA	2	6	511709	511714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545195
13042	NC_003295	AGG	2	6	511715	511720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545195
13043	NC_003295	CGC	2	6	511727	511732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545195
13044	NC_003295	GC	3	6	511741	511746	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
13045	NC_003295	TGC	2	6	511778	511783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545195
13046	NC_003295	GC	4	8	511782	511789	0 %	0 %	50 %	50 %	17545195
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13050	NC_003295	GC	4	8	511942	511949	0 %	0 %	50 %	50 %	17545196
13051	NC_003295	GGC	2	6	512014	512019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545196
13052	NC_003295	TGC	2	6	512023	512028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545196
13053	NC_003295	TGCGC	2	10	512032	512041	0 %	20 %	40 %	40 %	17545196
13054	NC_003295	GCT	2	6	512128	512133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545196
13055	NC_003295	ACGA	2	8	512139	512146	50 %	0 %	25 %	25 %	17545196
13056	NC_003295	GC	3	6	512178	512183	0 %	0 %	50 %	50 %	17545196
13057	NC_003295	ACC	2	6	512184	512189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545196
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13060	NC_003295	CGG	2	6	512287	512292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545196
13061	NC_003295	GCT	2	6	512293	512298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545196
13062	NC_003295	CGG	2	6	512302	512307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545196
13063	NC_003295	CGG	2	6	512323	512328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545196
13064	NC_003295	GCG	2	6	512506	512511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545197
13065	NC_003295	CTG	2	6	512532	512537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
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13067	NC_003295	CGC	2	6	512591	512596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545197
13068	NC_003295	TGA	2	6	512626	512631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545197
13069	NC_003295	CGATG	2	10	512642	512651	20 %	20 %	40 %	20 %	17545197
13070	NC_003295	CG	4	8	512671	512678	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13071	NC_003295	CTG	2	6	512679	512684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13072	NC_003295	GTG	2	6	512685	512690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545197
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13074	NC_003295	GCT	2	6	512717	512722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13075	NC_003295	GCAC	2	8	512825	512832	25 %	0 %	25 %	50 %	17545197
13076	NC_003295	CGG	2	6	512864	512869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545197
13077	NC_003295	CG	3	6	512896	512901	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13078	NC_003295	TGG	2	6	512950	512955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545197
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13081	NC_003295	ACG	2	6	512992	512997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13082	NC_003295	TCA	2	6	513010	513015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545197
13083	NC_003295	GC	3	6	513022	513027	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13084	NC_003295	GTGACG	2	12	513051	513062	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17545197
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13088	NC_003295	CGAT	2	8	513124	513131	25 %	25 %	25 %	25 %	17545197
13089	NC_003295	GCT	2	6	513134	513139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13090	NC_003295	GAG	2	6	513171	513176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545197
13091	NC_003295	CGC	2	6	513186	513191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545197
13092	NC_003295	ACG	2	6	513193	513198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13093	NC_003295	CGC	3	9	513218	513226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545197
13094	NC_003295	GCA	2	6	513236	513241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13095	NC_003295	TCGCTG	2	12	513243	513254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13096	NC_003295	GCA	2	6	513266	513271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13097	NC_003295	CTGATC	2	12	513291	513302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17545197
13098	NC_003295	TGC	2	6	513376	513381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13099	NC_003295	GCT	2	6	513464	513469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13100	NC_003295	CCGG	2	8	513494	513501	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13101	NC_003295	GC	3	6	513521	513526	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13102	NC_003295	CGGC	2	8	513607	513614	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13103	NC_003295	CGG	2	6	513622	513627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545197
13104	NC_003295	TGG	2	6	513628	513633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545197
13105	NC_003295	CG	3	6	513662	513667	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13106	NC_003295	CTG	2	6	513669	513674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13107	NC_003295	GC	3	6	513752	513757	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13108	NC_003295	CTA	2	6	513806	513811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545197
13109	NC_003295	GCC	2	6	513826	513831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545197
13110	NC_003295	CG	3	6	513841	513846	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13111	NC_003295	AGG	2	6	513847	513852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545197
13112	NC_003295	GCC	2	6	513861	513866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545197
13113	NC_003295	CGCGC	2	10	513867	513876	0 %	0 %	40 %	60 %	17545197
13114	NC_003295	TCG	2	6	513889	513894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13115	NC_003295	GCG	2	6	513952	513957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545197
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13117	NC_003295	GCT	2	6	513986	513991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13118	NC_003295	GCCC	2	8	513997	514004	0 %	0 %	25 %	75 %	17545197
13119	NC_003295	ACCAC	2	10	514090	514099	40 %	0 %	0 %	60 %	17545197
13120	NC_003295	TCG	2	6	514129	514134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545197
13121	NC_003295	GC	3	6	514135	514140	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13122	NC_003295	CAT	2	6	514169	514174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545197
13123	NC_003295	GCAC	2	8	514183	514190	25 %	0 %	25 %	50 %	17545197
13124	NC_003295	GC	3	6	514202	514207	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13125	NC_003295	GC	3	6	514242	514247	0 %	0 %	50 %	50 %	17545197
13126	NC_003295	TCA	2	6	514520	514525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545198
13127	NC_003295	GCG	2	6	514593	514598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545198
13128	NC_003295	CTGG	2	8	514617	514624	0 %	25 %	50 %	25 %	17545198
13129	NC_003295	CGCC	2	8	514667	514674	0 %	0 %	25 %	75 %	17545198
13130	NC_003295	TCT	2	6	514682	514687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17545198
13131	NC_003295	CG	3	6	514727	514732	0 %	0 %	50 %	50 %	17545198
13132	NC_003295	CTT	2	6	514806	514811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17545198
13133	NC_003295	GCTG	2	8	514817	514824	0 %	25 %	50 %	25 %	17545198
13134	NC_003295	GAG	2	6	514834	514839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17545198
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13136	NC_003295	TGA	2	6	514892	514897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545198
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13139	NC_003295	ACC	2	6	514934	514939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545198
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13141	NC_003295	GAT	2	6	514950	514955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545198
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13143	NC_003295	CGCC	2	8	515057	515064	0 %	0 %	25 %	75 %	17545198
13144	NC_003295	GC	3	6	515065	515070	0 %	0 %	50 %	50 %	17545198
13145	NC_003295	TGC	2	6	515129	515134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545198
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13151	NC_003295	CGG	2	6	515371	515376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545198
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13155	NC_003295	GC	3	6	515755	515760	0 %	0 %	50 %	50 %	17545199
13156	NC_003295	TCG	2	6	515766	515771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545199
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13158	NC_003295	GCA	2	6	515827	515832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545199
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13160	NC_003295	CCA	2	6	515872	515877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545199
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13218	NC_003295	GCT	2	6	518497	518502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545201
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13224	NC_003295	CG	3	6	518829	518834	0 %	0 %	50 %	50 %	17545201
13225	NC_003295	TGC	2	6	518895	518900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545201
13226	NC_003295	CAT	2	6	518914	518919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545201
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13228	NC_003295	CTG	2	6	518987	518992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545201
13229	NC_003295	TGG	2	6	519018	519023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545201
13230	NC_003295	CGG	2	6	519145	519150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545201
13231	NC_003295	CGTC	2	8	519200	519207	0 %	25 %	25 %	50 %	17545202
13232	NC_003295	CACGGC	2	12	519261	519272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17545202
13233	NC_003295	GCT	2	6	519300	519305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
13234	NC_003295	GAT	2	6	519309	519314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17545202
13235	NC_003295	TGC	2	6	519395	519400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
13236	NC_003295	TTC	2	6	519406	519411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17545202
13237	NC_003295	TGC	2	6	519428	519433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
13238	NC_003295	GGC	2	6	519507	519512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545202
13239	NC_003295	TAC	2	6	519514	519519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545202
13240	NC_003295	ATC	2	6	519526	519531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545202
13241	NC_003295	CG	3	6	519554	519559	0 %	0 %	50 %	50 %	17545202
13242	NC_003295	GGCCA	2	10	519598	519607	20 %	0 %	40 %	40 %	17545202
13243	NC_003295	GCT	3	9	519651	519659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
13244	NC_003295	CAT	2	6	519669	519674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545202
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13246	NC_003295	ACA	2	6	519737	519742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17545202
13247	NC_003295	TCG	2	6	519764	519769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
13248	NC_003295	GCT	3	9	519771	519779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545202
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13343	NC_003295	GACC	2	8	524505	524512	25 %	0 %	25 %	50 %	17545206
13344	NC_003295	CAC	2	6	524613	524618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17545206
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13350	NC_003295	TGG	2	6	524780	524785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545206
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13353	NC_003295	GCT	2	6	524879	524884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545206
13354	NC_003295	CACGCT	2	12	525009	525020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17545206
13355	NC_003295	CCG	2	6	525044	525049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545206
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13359	NC_003295	CGC	2	6	525172	525177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545207
13360	NC_003295	GGC	2	6	525179	525184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17545207
13361	NC_003295	CGGC	2	8	525274	525281	0 %	0 %	50 %	50 %	17545207
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13363	NC_003295	GCC	2	6	525317	525322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545207
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13484	NC_003295	GCC	2	6	531752	531757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17545215
13485	NC_003295	GTG	2	6	531827	531832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545215
13486	NC_003295	CAA	2	6	531835	531840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17545215
13487	NC_003295	CGCC	2	8	531935	531942	0 %	0 %	25 %	75 %	17545215
13488	NC_003295	CG	3	6	531948	531953	0 %	0 %	50 %	50 %	17545215
13489	NC_003295	CTA	2	6	531979	531984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545215
13490	NC_003295	GCCAG	2	10	531987	531996	20 %	0 %	40 %	40 %	17545215
13491	NC_003295	ACA	2	6	532032	532037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17545215
13492	NC_003295	GTG	2	6	532042	532047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17545215
13493	NC_003295	GC	4	8	532059	532066	0 %	0 %	50 %	50 %	17545215
13494	NC_003295	CAT	2	6	532069	532074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17545215
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13497	NC_003295	CGA	2	6	532117	532122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17545215
13498	NC_003295	GGCG	2	8	532141	532148	0 %	0 %	75 %	25 %	17545215
13499	NC_003295	GACC	2	8	532234	532241	25 %	0 %	25 %	50 %	17545215
13500	NC_003295	CTG	2	6	532253	532258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17545215

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