MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000963	TGT	2	6	144683	144688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603998
3002	NC_000963	A	6	6	144813	144818	100 %	0 %	0 %	0 %	15603999
3003	NC_000963	A	6	6	144833	144838	100 %	0 %	0 %	0 %	15603999
3004	NC_000963	AGA	2	6	144869	144874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603999
3005	NC_000963	AAT	2	6	144953	144958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603999
3006	NC_000963	GAA	2	6	145023	145028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603999
3007	NC_000963	GCA	2	6	145029	145034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603999
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3009	NC_000963	ATA	2	6	145110	145115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603999
3010	NC_000963	GGT	2	6	145182	145187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603999
3011	NC_000963	TGA	2	6	145226	145231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603999
3012	NC_000963	ATTTT	2	10	145285	145294	20 %	80 %	0 %	0 %	15603999
3013	NC_000963	GAA	2	6	145311	145316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603999
3014	NC_000963	TAT	2	6	145381	145386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603999
3015	NC_000963	TGA	2	6	145462	145467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603999
3016	NC_000963	AAAGAA	2	12	145551	145562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15603999
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3018	NC_000963	ATA	3	9	145582	145590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603999
3019	NC_000963	CTG	2	6	145615	145620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603999
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3021	NC_000963	AGA	2	6	145652	145657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603999
3022	NC_000963	AGT	2	6	145757	145762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603999
3023	NC_000963	AGA	2	6	145763	145768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603999
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3028	NC_000963	AT	3	6	145994	145999	50 %	50 %	0 %	0 %	15604000
3029	NC_000963	TA	3	6	146000	146005	50 %	50 %	0 %	0 %	15604000
3030	NC_000963	GTA	2	6	146078	146083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604000
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3033	NC_000963	TTG	2	6	146235	146240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604000
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3035	NC_000963	GTA	2	6	146397	146402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604000
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3041	NC_000963	ATA	2	6	146624	146629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604000
3042	NC_000963	GGTGAT	2	12	146666	146677	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15604000
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3053	NC_000963	GAAT	2	8	146977	146984	50 %	25 %	25 %	0 %	15604001
3054	NC_000963	AGC	2	6	147022	147027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604001
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3058	NC_000963	A	6	6	147306	147311	100 %	0 %	0 %	0 %	15604001
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3061	NC_000963	GAA	2	6	147404	147409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604001
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3070	NC_000963	AGTA	2	8	147760	147767	50 %	25 %	25 %	0 %	15604001
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3097	NC_000963	GCTA	2	8	148638	148645	25 %	25 %	25 %	25 %	15604002
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3100	NC_000963	AG	4	8	148796	148803	50 %	0 %	50 %	0 %	15604002
3101	NC_000963	TA	3	6	148855	148860	50 %	50 %	0 %	0 %	15604002
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3108	NC_000963	TGA	2	6	149199	149204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604002
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3374	NC_000963	AGA	2	6	162282	162287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604016
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3377	NC_000963	AG	3	6	162461	162466	50 %	0 %	50 %	0 %	15604016
3378	NC_000963	AGA	2	6	162474	162479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604016
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3382	NC_000963	GTA	2	6	162681	162686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604016
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3494	NC_000963	TTC	2	6	167753	167758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604017
3495	NC_000963	GTT	2	6	167805	167810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604017
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3497	NC_000963	ATT	3	9	167855	167863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604017
3498	NC_000963	ATA	2	6	167869	167874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604017
3499	NC_000963	TTG	2	6	167923	167928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604017
3500	NC_000963	TATAC	2	10	167979	167988	40 %	40 %	0 %	20 %	15604017

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