MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_000963	TCA	2	6	1049088	1049093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604666
21003	NC_000963	TA	3	6	1049096	1049101	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
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21005	NC_000963	AGT	2	6	1049174	1049179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604666
21006	NC_000963	TA	3	6	1049198	1049203	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
21007	NC_000963	TAAT	2	8	1049227	1049234	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
21008	NC_000963	A	6	6	1049261	1049266	100 %	0 %	0 %	0 %	15604666
21009	NC_000963	TTGCA	2	10	1049267	1049276	20 %	40 %	20 %	20 %	15604666
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21011	NC_000963	TCA	3	9	1049287	1049295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604666
21012	NC_000963	TATTT	2	10	1049322	1049331	20 %	80 %	0 %	0 %	15604666
21013	NC_000963	TAT	2	6	1049344	1049349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604666
21014	NC_000963	GATT	2	8	1049589	1049596	25 %	50 %	25 %	0 %	15604666
21015	NC_000963	AT	3	6	1049616	1049621	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
21016	NC_000963	AGC	2	6	1049687	1049692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604666
21017	NC_000963	TA	3	6	1049695	1049700	50 %	50 %	0 %	0 %	15604666
21018	NC_000963	ATC	2	6	1049709	1049714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604666
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21479	NC_000963	ATA	2	6	1073036	1073041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604682
21480	NC_000963	CCA	2	6	1073103	1073108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604682
21481	NC_000963	AGC	2	6	1073114	1073119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604682
21482	NC_000963	GA	3	6	1073236	1073241	50 %	0 %	50 %	0 %	15604682
21483	NC_000963	CGC	2	6	1073334	1073339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604682
21484	NC_000963	ATC	2	6	1073379	1073384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604682
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21487	NC_000963	T	6	6	1073619	1073624	0 %	100 %	0 %	0 %	15604682
21488	NC_000963	AT	3	6	1073628	1073633	50 %	50 %	0 %	0 %	15604682
21489	NC_000963	AATA	2	8	1073648	1073655	75 %	25 %	0 %	0 %	15604682
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21491	NC_000963	CT	3	6	1073794	1073799	0 %	50 %	0 %	50 %	15604682
21492	NC_000963	GCA	2	6	1073808	1073813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604682
21493	NC_000963	TA	3	6	1073822	1073827	50 %	50 %	0 %	0 %	15604682
21494	NC_000963	TAA	2	6	1073878	1073883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604682
21495	NC_000963	AAT	2	6	1073891	1073896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604682
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