MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_000963	TAC	2	6	948342	948347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604592
19003	NC_000963	ATAA	2	8	948360	948367	75 %	25 %	0 %	0 %	15604592
19004	NC_000963	AAGAA	2	10	948430	948439	80 %	0 %	20 %	0 %	15604592
19005	NC_000963	AATA	2	8	948457	948464	75 %	25 %	0 %	0 %	15604592
19006	NC_000963	TCA	2	6	948480	948485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604592
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19008	NC_000963	TA	4	8	948690	948697	50 %	50 %	0 %	0 %	15604592
19009	NC_000963	AT	3	6	948719	948724	50 %	50 %	0 %	0 %	15604592
19010	NC_000963	T	6	6	948742	948747	0 %	100 %	0 %	0 %	15604592
19011	NC_000963	TCAA	2	8	948761	948768	50 %	25 %	0 %	25 %	15604592
19012	NC_000963	TTTAC	2	10	948797	948806	20 %	60 %	0 %	20 %	15604592
19013	NC_000963	TAT	2	6	948811	948816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604592
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19015	NC_000963	CTT	2	6	948879	948884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604592
19016	NC_000963	TCAAAA	2	12	948935	948946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15604592
19017	NC_000963	TAA	2	6	948952	948957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604592
19018	NC_000963	TA	3	6	949078	949083	50 %	50 %	0 %	0 %	15604592
19019	NC_000963	TGT	2	6	949088	949093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604592
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19021	NC_000963	ATC	2	6	949144	949149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604592
19022	NC_000963	AT	3	6	949213	949218	50 %	50 %	0 %	0 %	15604592
19023	NC_000963	T	6	6	949218	949223	0 %	100 %	0 %	0 %	15604592
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19031	NC_000963	TA	4	8	949531	949538	50 %	50 %	0 %	0 %	15604592
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19033	NC_000963	TAT	2	6	949853	949858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604593
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19043	NC_000963	TAT	2	6	950128	950133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604593
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19106	NC_000963	CAAG	2	8	954571	954578	50 %	0 %	25 %	25 %	15604595
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19493	NC_000963	AGC	2	6	973661	973666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604610
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