MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_000963	CAC	2	6	652965	652970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604385
13503	NC_000963	TAAT	2	8	652980	652987	50 %	50 %	0 %	0 %	15604385
13504	NC_000963	T	6	6	653010	653015	0 %	100 %	0 %	0 %	15604385
13505	NC_000963	AT	3	6	653047	653052	50 %	50 %	0 %	0 %	15604385
13506	NC_000963	GCT	2	6	653114	653119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604385
13507	NC_000963	TTG	2	6	653161	653166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604385
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13509	NC_000963	A	6	6	653261	653266	100 %	0 %	0 %	0 %	15604385
13510	NC_000963	ATT	2	6	653284	653289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604385
13511	NC_000963	TCT	2	6	653360	653365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604385
13512	NC_000963	TCA	2	6	653549	653554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604386
13513	NC_000963	ACT	2	6	653600	653605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604386
13514	NC_000963	ATCT	2	8	653608	653615	25 %	50 %	0 %	25 %	15604386
13515	NC_000963	ACCT	2	8	653701	653708	25 %	25 %	0 %	50 %	15604386
13516	NC_000963	TCTT	2	8	653728	653735	0 %	75 %	0 %	25 %	15604386
13517	NC_000963	CGT	2	6	653747	653752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604386
13518	NC_000963	TTC	2	6	653755	653760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604386
13519	NC_000963	GAA	2	6	653775	653780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604386
13520	NC_000963	TGCTTT	2	12	653788	653799	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15604386
13521	NC_000963	TGC	2	6	653807	653812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604386
13522	NC_000963	AGT	2	6	653878	653883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604386
13523	NC_000963	TGC	2	6	653891	653896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604386
13524	NC_000963	CCA	2	6	653897	653902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604386
13525	NC_000963	TGC	2	6	653992	653997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604386
13526	NC_000963	GACGCT	2	12	654101	654112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15604386
13527	NC_000963	GCA	2	6	654209	654214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604386
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13530	NC_000963	TAA	2	6	654292	654297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604386
13531	NC_000963	GTA	2	6	654327	654332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604386
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13533	NC_000963	ATCA	2	8	654358	654365	50 %	25 %	0 %	25 %	15604386
13534	NC_000963	ATT	2	6	654406	654411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604386
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13536	NC_000963	TTA	2	6	654437	654442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604386
13537	NC_000963	TAC	2	6	654457	654462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604386
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13539	NC_000963	AGA	2	6	654523	654528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604386
13540	NC_000963	T	6	6	654532	654537	0 %	100 %	0 %	0 %	15604386
13541	NC_000963	ATG	2	6	654812	654817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604387
13542	NC_000963	TTG	2	6	654884	654889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604387
13543	NC_000963	GAT	2	6	654891	654896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604387
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13545	NC_000963	TCC	2	6	655023	655028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604387
13546	NC_000963	TAT	2	6	655055	655060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604387
13547	NC_000963	CTTT	2	8	655067	655074	0 %	75 %	0 %	25 %	15604387
13548	NC_000963	TTTCA	2	10	655083	655092	20 %	60 %	0 %	20 %	15604387
13549	NC_000963	ATT	2	6	655185	655190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604387
13550	NC_000963	TCT	2	6	655207	655212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604387
13551	NC_000963	TAGCAT	2	12	655220	655231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15604387
13552	NC_000963	CTT	2	6	655238	655243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604387
13553	NC_000963	TTA	2	6	655318	655323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604387
13554	NC_000963	TAA	2	6	655341	655346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604387
13555	NC_000963	ACATT	2	10	655354	655363	40 %	40 %	0 %	20 %	15604387
13556	NC_000963	ATAA	2	8	655370	655377	75 %	25 %	0 %	0 %	15604387
13557	NC_000963	TGTT	2	8	655389	655396	0 %	75 %	25 %	0 %	15604387
13558	NC_000963	ATT	3	9	655434	655442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604387
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13563	NC_000963	TAGTGA	2	12	655695	655706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604387
13564	NC_000963	TAT	2	6	655712	655717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604387
13565	NC_000963	TCT	2	6	655750	655755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604387
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13577	NC_000963	CTTAG	2	10	656328	656337	20 %	40 %	20 %	20 %	15604388
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13579	NC_000963	TAC	2	6	656552	656557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604388
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13611	NC_000963	ATA	2	6	658202	658207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604390
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13993	NC_000963	ATT	2	6	677755	677760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604403
13994	NC_000963	TTA	2	6	677761	677766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604403
13995	NC_000963	TGTCA	2	10	677770	677779	20 %	40 %	20 %	20 %	15604403
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