MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_000963	ATT	2	6	627174	627179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
13003	NC_000963	TAA	2	6	627187	627192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604369
13004	NC_000963	TAA	2	6	627203	627208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604369
13005	NC_000963	ATC	3	9	627250	627258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604369
13006	NC_000963	CTA	2	6	627265	627270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604369
13007	NC_000963	TTAA	2	8	627291	627298	50 %	50 %	0 %	0 %	15604369
13008	NC_000963	TGATGG	2	12	627338	627349	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15604369
13009	NC_000963	TAT	2	6	627362	627367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
13010	NC_000963	ATT	2	6	627386	627391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
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13012	NC_000963	ATAAA	2	10	627490	627499	80 %	20 %	0 %	0 %	15604369
13013	NC_000963	ATA	2	6	627519	627524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604369
13014	NC_000963	TTA	2	6	627544	627549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
13015	NC_000963	TGA	2	6	627632	627637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604369
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13017	NC_000963	ATT	2	6	627777	627782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
13018	NC_000963	ATT	2	6	627800	627805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
13019	NC_000963	TGGT	2	8	627860	627867	0 %	50 %	50 %	0 %	15604369
13020	NC_000963	TAT	2	6	627896	627901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604369
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13022	NC_000963	ATG	2	6	627954	627959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604369
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13024	NC_000963	ATTA	3	12	627986	627997	50 %	50 %	0 %	0 %	15604369
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13026	NC_000963	ATTAT	2	10	628466	628475	40 %	60 %	0 %	0 %	15604370
13027	NC_000963	TAT	2	6	628582	628587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604370
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13033	NC_000963	GGA	2	6	628745	628750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604370
13034	NC_000963	TA	3	6	628758	628763	50 %	50 %	0 %	0 %	15604370
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13044	NC_000963	TGA	2	6	629074	629079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604370
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13046	NC_000963	TGA	2	6	629113	629118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604370
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13054	NC_000963	T	6	6	630250	630255	0 %	100 %	0 %	0 %	15604371
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13120	NC_000963	T	6	6	632670	632675	0 %	100 %	0 %	0 %	15604371
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13495	NC_000963	AAT	2	6	652749	652754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604385
13496	NC_000963	CTT	2	6	652759	652764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604385
13497	NC_000963	ATA	2	6	652773	652778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604385
13498	NC_000963	CTG	2	6	652809	652814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604385
13499	NC_000963	TCA	2	6	652838	652843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604385
13500	NC_000963	ATG	2	6	652897	652902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604385

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