MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

< Previous12...77787980818283848586878889Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_022545	GCC	2	6	2027262	2027267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44002	NC_022545	GCA	2	6	2027353	2027358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44003	NC_022545	CGG	2	6	2027540	2027545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729990
44004	NC_022545	CTGC	2	8	2027546	2027553	0 %	25 %	25 %	50 %	549729990
44005	NC_022545	CGC	2	6	2027579	2027584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729990
44006	NC_022545	CGC	2	6	2027710	2027715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729990
44007	NC_022545	TCG	2	6	2027780	2027785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729990
44008	NC_022545	TG	3	6	2027793	2027798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_022545	GGA	2	6	2027829	2027834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_022545	GCTC	2	8	2027911	2027918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44011	NC_022545	GTC	2	6	2028019	2028024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44012	NC_022545	GGC	2	6	2028062	2028067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729991
44013	NC_022545	GCGT	2	8	2028118	2028125	0 %	25 %	50 %	25 %	549729991
44014	NC_022545	GTG	2	6	2028151	2028156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729991
44015	NC_022545	ACC	2	6	2028175	2028180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729991
44016	NC_022545	GTCCA	2	10	2028182	2028191	20 %	20 %	20 %	40 %	549729991
44017	NC_022545	TTC	2	6	2028339	2028344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729991
44018	NC_022545	GAA	2	6	2028359	2028364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729991
44019	NC_022545	CAT	2	6	2028376	2028381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729991
44020	NC_022545	TTG	2	6	2028396	2028401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729991
44021	NC_022545	CGG	2	6	2028427	2028432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729991
44022	NC_022545	GT	4	8	2028437	2028444	0 %	50 %	50 %	0 %	549729991
44023	NC_022545	CCG	2	6	2028553	2028558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44024	NC_022545	GC	3	6	2028797	2028802	0 %	0 %	50 %	50 %	549729992
44025	NC_022545	CGG	2	6	2028814	2028819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729992
44026	NC_022545	GAT	2	6	2028829	2028834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729992
44027	NC_022545	GAGC	2	8	2028841	2028848	25 %	0 %	50 %	25 %	549729992
44028	NC_022545	TTC	2	6	2028942	2028947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729992
44029	NC_022545	GCTG	2	8	2029039	2029046	0 %	25 %	50 %	25 %	549729993
44030	NC_022545	GC	3	6	2029135	2029140	0 %	0 %	50 %	50 %	549729993
44031	NC_022545	GCA	2	6	2029142	2029147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729993
44032	NC_022545	CGGTGA	2	12	2029184	2029195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44033	NC_022545	TGC	2	6	2029210	2029215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44034	NC_022545	CGA	2	6	2029294	2029299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44035	NC_022545	CGG	2	6	2029300	2029305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44036	NC_022545	CTTA	2	8	2029367	2029374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44037	NC_022545	ATG	2	6	2029385	2029390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44038	NC_022545	CTC	2	6	2029486	2029491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44039	NC_022545	GGC	2	6	2029581	2029586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729994
44040	NC_022545	CCG	2	6	2029656	2029661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729994
44041	NC_022545	GCA	2	6	2029666	2029671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729994
44042	NC_022545	CGG	2	6	2029717	2029722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729994
44043	NC_022545	AATT	2	8	2029729	2029736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44044	NC_022545	GCC	2	6	2029770	2029775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44045	NC_022545	GCT	2	6	2029811	2029816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729995
44046	NC_022545	CAT	2	6	2029817	2029822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729995
44047	NC_022545	GAC	2	6	2029869	2029874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729995
44048	NC_022545	TG	3	6	2029963	2029968	0 %	50 %	50 %	0 %	549729995
44049	NC_022545	GTC	2	6	2029992	2029997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729995
44050	NC_022545	CTGC	2	8	2030122	2030129	0 %	25 %	25 %	50 %	549729995
44051	NC_022545	CTTC	2	8	2030138	2030145	0 %	50 %	0 %	50 %	549729995
44052	NC_022545	TGA	2	6	2030153	2030158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729995
44053	NC_022545	GCC	2	6	2030205	2030210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729995
44054	NC_022545	TCA	2	6	2030291	2030296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729995
44055	NC_022545	GC	3	6	2030353	2030358	0 %	0 %	50 %	50 %	549729996
44056	NC_022545	TG	3	6	2030382	2030387	0 %	50 %	50 %	0 %	549729996
44057	NC_022545	GA	3	6	2030401	2030406	50 %	0 %	50 %	0 %	549729996
44058	NC_022545	TTG	2	6	2030464	2030469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729996
44059	NC_022545	GC	3	6	2030562	2030567	0 %	0 %	50 %	50 %	549729996
44060	NC_022545	TCG	2	6	2030572	2030577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729996
44061	NC_022545	TTG	2	6	2030579	2030584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729996
44062	NC_022545	GAA	2	6	2030588	2030593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729996
44063	NC_022545	CCT	2	6	2030657	2030662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44064	NC_022545	GTTACC	2	12	2030935	2030946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44065	NC_022545	GCG	2	6	2030950	2030955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44066	NC_022545	TGT	2	6	2030966	2030971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44067	NC_022545	TGT	2	6	2030981	2030986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_022545	TCTT	2	8	2031013	2031020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44069	NC_022545	GCTG	2	8	2031025	2031032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44070	NC_022545	AAC	2	6	2031078	2031083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44071	NC_022545	GAGGCG	2	12	2031094	2031105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44072	NC_022545	CCA	2	6	2031133	2031138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44073	NC_022545	GTG	2	6	2031163	2031168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44074	NC_022545	GAC	2	6	2031176	2031181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44075	NC_022545	TGC	2	6	2031218	2031223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44076	NC_022545	TGA	2	6	2031232	2031237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44077	NC_022545	ATC	2	6	2031242	2031247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44078	NC_022545	TCA	2	6	2031303	2031308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44079	NC_022545	AGC	2	6	2031318	2031323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44080	NC_022545	TGA	2	6	2031340	2031345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44081	NC_022545	TCG	2	6	2031351	2031356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44082	NC_022545	CGA	2	6	2031370	2031375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44083	NC_022545	TGC	2	6	2031444	2031449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44084	NC_022545	GCT	2	6	2031554	2031559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44085	NC_022545	GAC	2	6	2031608	2031613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44086	NC_022545	CCG	2	6	2031614	2031619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44087	NC_022545	GAA	2	6	2031776	2031781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729997
44088	NC_022545	GCCTCG	2	12	2031796	2031807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549729997
44089	NC_022545	GAT	2	6	2031867	2031872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729997
44090	NC_022545	ACG	2	6	2031900	2031905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44091	NC_022545	AGGT	2	8	2031913	2031920	25 %	25 %	50 %	0 %	549729997
44092	NC_022545	ACCTTC	2	12	2031973	2031984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549729997
44093	NC_022545	TCG	2	6	2031985	2031990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44094	NC_022545	GTC	2	6	2032056	2032061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44095	NC_022545	CCT	2	6	2032094	2032099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729997
44096	NC_022545	CCG	2	6	2032106	2032111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729997
44097	NC_022545	TTC	2	6	2032261	2032266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729997
44098	NC_022545	GCA	2	6	2032321	2032326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44099	NC_022545	ATC	2	6	2032333	2032338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729997
44100	NC_022545	GCA	2	6	2032343	2032348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44101	NC_022545	CAA	2	6	2032370	2032375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729997
44102	NC_022545	TCA	2	6	2032388	2032393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729997
44103	NC_022545	GTC	2	6	2032395	2032400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729997
44104	NC_022545	GGT	2	6	2032408	2032413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_022545	ACC	2	6	2032464	2032469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44106	NC_022545	CGG	2	6	2032487	2032492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44107	NC_022545	GAT	2	6	2032511	2032516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44108	NC_022545	ATCG	2	8	2032520	2032527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44109	NC_022545	AGC	2	6	2032536	2032541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44110	NC_022545	GGA	2	6	2032605	2032610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44111	NC_022545	TGCT	2	8	2032620	2032627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44112	NC_022545	GCA	2	6	2032650	2032655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44113	NC_022545	TTA	2	6	2032693	2032698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44114	NC_022545	TTGA	2	8	2032706	2032713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44115	NC_022545	ATG	2	6	2032718	2032723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44116	NC_022545	ATT	2	6	2032757	2032762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44117	NC_022545	GAG	2	6	2032853	2032858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729998
44118	NC_022545	GC	3	6	2032879	2032884	0 %	0 %	50 %	50 %	549729998
44119	NC_022545	TTA	2	6	2032885	2032890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729998
44120	NC_022545	TTGG	2	8	2032903	2032910	0 %	50 %	50 %	0 %	549729998
44121	NC_022545	CG	3	6	2032941	2032946	0 %	0 %	50 %	50 %	549729998
44122	NC_022545	GAACT	2	10	2032949	2032958	40 %	20 %	20 %	20 %	549729998
44123	NC_022545	GCA	2	6	2032960	2032965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729998
44124	NC_022545	GGT	2	6	2032966	2032971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729998
44125	NC_022545	GGC	2	6	2033015	2033020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
44126	NC_022545	CT	3	6	2033057	2033062	0 %	50 %	0 %	50 %	549729998
44127	NC_022545	CCTG	2	8	2033105	2033112	0 %	25 %	25 %	50 %	549729998
44128	NC_022545	GGC	2	6	2033198	2033203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
44129	NC_022545	CGA	2	6	2033317	2033322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729998
44130	NC_022545	TCA	2	6	2033344	2033349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729998
44131	NC_022545	TGC	2	6	2033371	2033376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729998
44132	NC_022545	GGC	2	6	2033391	2033396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
44133	NC_022545	GCT	2	6	2033404	2033409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729998
44134	NC_022545	TCT	3	9	2033445	2033453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729998
44135	NC_022545	GGC	2	6	2033540	2033545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729998
44136	NC_022545	TCA	2	6	2033565	2033570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729998
44137	NC_022545	GCT	2	6	2033624	2033629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729999
44138	NC_022545	TC	3	6	2033720	2033725	0 %	50 %	0 %	50 %	549729999
44139	NC_022545	TGG	2	6	2033776	2033781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729999
44140	NC_022545	GCG	2	6	2033833	2033838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729999
44141	NC_022545	ATG	2	6	2033860	2033865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729999
44142	NC_022545	CTT	2	6	2033880	2033885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729999
44143	NC_022545	TTG	2	6	2034046	2034051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729999
44144	NC_022545	CG	3	6	2034073	2034078	0 %	0 %	50 %	50 %	549729999
44145	NC_022545	ATT	2	6	2034144	2034149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729999
44146	NC_022545	GAAT	2	8	2034212	2034219	50 %	25 %	25 %	0 %	549729999
44147	NC_022545	GAG	2	6	2034246	2034251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729999
44148	NC_022545	AGA	2	6	2034263	2034268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729999
44149	NC_022545	GCA	2	6	2034281	2034286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729999
44150	NC_022545	GGA	2	6	2034309	2034314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729999
44151	NC_022545	ATC	2	6	2034322	2034327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729999
44152	NC_022545	GGC	2	6	2034418	2034423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729999
44153	NC_022545	TGC	2	6	2034475	2034480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729999
44154	NC_022545	CGT	2	6	2034575	2034580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549730000
44155	NC_022545	TCT	2	6	2034712	2034717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549730000
44156	NC_022545	TCAA	2	8	2034726	2034733	50 %	25 %	0 %	25 %	549730000
44157	NC_022545	TGA	2	6	2034751	2034756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549730000
44158	NC_022545	A	6	6	2034760	2034765	100 %	0 %	0 %	0 %	549730000
44159	NC_022545	CGA	2	6	2034776	2034781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549730000
44160	NC_022545	TC	3	6	2034897	2034902	0 %	50 %	0 %	50 %	549730000
44161	NC_022545	CCT	2	6	2034913	2034918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549730001
44162	NC_022545	AGG	2	6	2034947	2034952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549730001
44163	NC_022545	GAT	2	6	2035002	2035007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549730001
44164	NC_022545	TGT	2	6	2035023	2035028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549730001
44165	NC_022545	CGA	2	6	2035035	2035040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549730001
44166	NC_022545	CA	3	6	2035112	2035117	50 %	0 %	0 %	50 %	549730001
44167	NC_022545	AT	4	8	2035221	2035228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44168	NC_022545	AT	3	6	2035240	2035245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44169	NC_022545	TAT	3	9	2035243	2035251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44170	NC_022545	GC	3	6	2035313	2035318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44171	NC_022545	AGGG	2	8	2035417	2035424	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...77787980818283848586878889Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.