MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_022545	CGG	2	6	1979556	1979561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43002	NC_022545	GCCGG	2	10	1979589	1979598	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43003	NC_022545	AGG	2	6	1979643	1979648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_022545	TAA	2	6	1979659	1979664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729940
43005	NC_022545	CAC	2	6	1979689	1979694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729940
43006	NC_022545	GAA	2	6	1979723	1979728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729940
43007	NC_022545	CG	3	6	1979736	1979741	0 %	0 %	50 %	50 %	549729940
43008	NC_022545	A	6	6	1979813	1979818	100 %	0 %	0 %	0 %	549729940
43009	NC_022545	GAC	2	6	1979846	1979851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729940
43010	NC_022545	AGG	2	6	1979861	1979866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43011	NC_022545	GGC	2	6	1979911	1979916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729941
43012	NC_022545	AAG	2	6	1979959	1979964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729941
43013	NC_022545	CCGC	2	8	1979965	1979972	0 %	0 %	25 %	75 %	549729941
43014	NC_022545	GTG	2	6	1980008	1980013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729941
43015	NC_022545	GCG	2	6	1980014	1980019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729941
43016	NC_022545	CCA	2	6	1980030	1980035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729941
43017	NC_022545	AAG	2	6	1980094	1980099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729942
43018	NC_022545	AAG	2	6	1980103	1980108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729942
43019	NC_022545	CGG	2	6	1980209	1980214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729942
43020	NC_022545	GGA	2	6	1980324	1980329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729942
43021	NC_022545	ATA	2	6	1980366	1980371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729942
43022	NC_022545	TGC	2	6	1980401	1980406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43023	NC_022545	ATTC	2	8	1980433	1980440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43024	NC_022545	CGG	2	6	1980455	1980460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43025	NC_022545	AGG	2	6	1980485	1980490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43026	NC_022545	GATGC	2	10	1980493	1980502	20 %	20 %	40 %	20 %	549729943
43027	NC_022545	GAT	2	6	1980507	1980512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729943
43028	NC_022545	GCC	2	6	1980662	1980667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729943
43029	NC_022545	CGC	2	6	1980721	1980726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729943
43030	NC_022545	CGG	2	6	1980775	1980780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729943
43031	NC_022545	ATT	2	6	1980809	1980814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729943
43032	NC_022545	CTT	2	6	1980866	1980871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43033	NC_022545	AGG	2	6	1980979	1980984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43034	NC_022545	CAT	2	6	1980987	1980992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729944
43035	NC_022545	CGC	2	6	1981017	1981022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729944
43036	NC_022545	GCGG	2	8	1981071	1981078	0 %	0 %	75 %	25 %	549729944
43037	NC_022545	CAGC	2	8	1981089	1981096	25 %	0 %	25 %	50 %	549729944
43038	NC_022545	GCC	2	6	1981207	1981212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729944
43039	NC_022545	TCG	3	9	1981247	1981255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729944
43040	NC_022545	GCC	2	6	1981258	1981263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729944
43041	NC_022545	AGG	2	6	1981271	1981276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729944
43042	NC_022545	CAA	2	6	1981296	1981301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729944
43043	NC_022545	GTTC	2	8	1981341	1981348	0 %	50 %	25 %	25 %	549729944
43044	NC_022545	GGC	2	6	1981351	1981356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729944
43045	NC_022545	CGC	2	6	1981380	1981385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729944
43046	NC_022545	GC	3	6	1981428	1981433	0 %	0 %	50 %	50 %	549729944
43047	NC_022545	GAC	2	6	1981486	1981491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729944
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43049	NC_022545	CGGC	3	12	1981542	1981553	0 %	0 %	50 %	50 %	549729944
43050	NC_022545	GGA	2	6	1981662	1981667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729944
43051	NC_022545	CGC	2	6	1981692	1981697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43052	NC_022545	CGG	2	6	1981712	1981717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43053	NC_022545	CTA	2	6	1981740	1981745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43054	NC_022545	GCC	2	6	1981747	1981752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43055	NC_022545	AGG	2	6	1981774	1981779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_022545	CGG	2	6	1981830	1981835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729945
43057	NC_022545	GC	3	6	1981869	1981874	0 %	0 %	50 %	50 %	549729945
43058	NC_022545	TGG	2	6	1981902	1981907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729945
43059	NC_022545	CGGC	2	8	1981917	1981924	0 %	0 %	50 %	50 %	549729945
43060	NC_022545	AGA	2	6	1981959	1981964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729945
43061	NC_022545	CGA	2	6	1981969	1981974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729945
43062	NC_022545	CAG	2	6	1981982	1981987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729945
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43064	NC_022545	GGC	2	6	1982015	1982020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729945
43065	NC_022545	CG	3	6	1982045	1982050	0 %	0 %	50 %	50 %	549729945
43066	NC_022545	TGG	3	9	1982166	1982174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729945
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43070	NC_022545	GCA	2	6	1982341	1982346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729945
43071	NC_022545	CCGGC	2	10	1982364	1982373	0 %	0 %	40 %	60 %	549729945
43072	NC_022545	TCT	2	6	1982383	1982388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729945
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43078	NC_022545	CGA	2	6	1982511	1982516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729945
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43080	NC_022545	GCCG	2	8	1982581	1982588	0 %	0 %	50 %	50 %	549729945
43081	NC_022545	GGT	2	6	1982590	1982595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729945
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43084	NC_022545	TCG	2	6	1982676	1982681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729945
43085	NC_022545	CGT	2	6	1982740	1982745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729945
43086	NC_022545	GGC	2	6	1982749	1982754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729945
43087	NC_022545	GCG	2	6	1982824	1982829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43088	NC_022545	CAT	2	6	1982840	1982845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43089	NC_022545	GGCCG	2	10	1982854	1982863	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43090	NC_022545	GC	3	6	1983086	1983091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43091	NC_022545	GTTTT	2	10	1983102	1983111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43092	NC_022545	CCCG	2	8	1983151	1983158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43093	NC_022545	AAG	2	6	1983234	1983239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729946
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43100	NC_022545	GCG	2	6	1983414	1983419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729946
43101	NC_022545	GC	3	6	1983431	1983436	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
43102	NC_022545	TCA	2	6	1983439	1983444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729946
43103	NC_022545	CGCTG	2	10	1983475	1983484	0 %	20 %	40 %	40 %	549729946
43104	NC_022545	CAT	2	6	1983500	1983505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729946
43105	NC_022545	CG	3	6	1983622	1983627	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
43106	NC_022545	CCT	2	6	1983656	1983661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729946
43107	NC_022545	CCA	2	6	1983703	1983708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729946
43108	NC_022545	TCG	2	6	1983745	1983750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729946
43109	NC_022545	GGC	2	6	1983849	1983854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729946
43110	NC_022545	GC	3	6	1983853	1983858	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
43111	NC_022545	GAA	2	6	1983915	1983920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729946
43112	NC_022545	ATG	2	6	1984011	1984016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729946
43113	NC_022545	TCA	2	6	1984051	1984056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729946
43114	NC_022545	TTC	2	6	1984110	1984115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729946
43115	NC_022545	TGC	2	6	1984117	1984122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729946
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43117	NC_022545	TGC	2	6	1984195	1984200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729946
43118	NC_022545	CCGG	2	8	1984229	1984236	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
43119	NC_022545	GC	3	6	1984300	1984305	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
43120	NC_022545	ACGCC	2	10	1984306	1984315	20 %	0 %	20 %	60 %	549729946
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43123	NC_022545	GCA	2	6	1984511	1984516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729946
43124	NC_022545	GGCC	2	8	1984563	1984570	0 %	0 %	50 %	50 %	549729946
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