MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_022545	TCG	2	6	1889898	1889903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41002	NC_022545	AAC	2	6	1889916	1889921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729846
41003	NC_022545	CGG	2	6	1890051	1890056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729846
41004	NC_022545	TCG	2	6	1890060	1890065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41005	NC_022545	GAC	2	6	1890143	1890148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41006	NC_022545	AAG	2	6	1890155	1890160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729846
41007	NC_022545	CGG	2	6	1890244	1890249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729846
41008	NC_022545	GCA	2	6	1890280	1890285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41009	NC_022545	CGG	2	6	1890288	1890293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729846
41010	NC_022545	GAA	2	6	1890332	1890337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729846
41011	NC_022545	A	6	6	1890374	1890379	100 %	0 %	0 %	0 %	549729846
41012	NC_022545	GCT	2	6	1890407	1890412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41013	NC_022545	C	6	6	1890447	1890452	0 %	0 %	0 %	100 %	549729846
41014	NC_022545	GCT	2	6	1890520	1890525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729846
41015	NC_022545	TCA	2	6	1890549	1890554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729846
41016	NC_022545	CAT	2	6	1890580	1890585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729846
41017	NC_022545	GC	3	6	1890586	1890591	0 %	0 %	50 %	50 %	549729846
41018	NC_022545	CT	3	6	1890672	1890677	0 %	50 %	0 %	50 %	549729846
41019	NC_022545	CATG	2	8	1890678	1890685	25 %	25 %	25 %	25 %	549729846
41020	NC_022545	GC	3	6	1890829	1890834	0 %	0 %	50 %	50 %	549729846
41021	NC_022545	GCC	2	6	1890870	1890875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729846
41022	NC_022545	GGC	2	6	1890880	1890885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729846
41023	NC_022545	TTC	2	6	1890934	1890939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729846
41024	NC_022545	CCGC	2	8	1890967	1890974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41025	NC_022545	CG	3	6	1891004	1891009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41026	NC_022545	TCGGG	2	10	1891014	1891023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41027	NC_022545	CGC	2	6	1891027	1891032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41028	NC_022545	CACT	2	8	1891039	1891046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41029	NC_022545	GTT	2	6	1891076	1891081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41030	NC_022545	GCA	2	6	1891110	1891115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41031	NC_022545	TAC	2	6	1891123	1891128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41032	NC_022545	ATT	2	6	1891146	1891151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41033	NC_022545	TAAAT	2	10	1891153	1891162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41034	NC_022545	TGT	2	6	1891225	1891230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41035	NC_022545	TAC	2	6	1891236	1891241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41036	NC_022545	GCGG	2	8	1891337	1891344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41037	NC_022545	GCA	2	6	1891450	1891455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729847
41038	NC_022545	TCG	2	6	1891484	1891489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729847
41039	NC_022545	GAGCCC	2	12	1891495	1891506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729847
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41041	NC_022545	CCTG	2	8	1891571	1891578	0 %	25 %	25 %	50 %	549729847
41042	NC_022545	CGTT	2	8	1891593	1891600	0 %	50 %	25 %	25 %	549729847
41043	NC_022545	CACCGA	2	12	1891683	1891694	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549729847
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41048	NC_022545	CAGCT	2	10	1891852	1891861	20 %	20 %	20 %	40 %	549729847
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41050	NC_022545	GGC	2	6	1891984	1891989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729847
41051	NC_022545	ACGA	2	8	1892005	1892012	50 %	0 %	25 %	25 %	549729847
41052	NC_022545	CAT	2	6	1892028	1892033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729847
41053	NC_022545	CGG	2	6	1892046	1892051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729847
41054	NC_022545	ATC	2	6	1892113	1892118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729847
41055	NC_022545	ACT	3	9	1892177	1892185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729847
41056	NC_022545	TGC	2	6	1892208	1892213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729847
41057	NC_022545	AAC	2	6	1892293	1892298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729847
41058	NC_022545	GC	3	6	1892325	1892330	0 %	0 %	50 %	50 %	549729847
41059	NC_022545	GCT	2	6	1892338	1892343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729847
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41063	NC_022545	TCGT	2	8	1892447	1892454	0 %	50 %	25 %	25 %	549729847
41064	NC_022545	CGTT	2	8	1892461	1892468	0 %	50 %	25 %	25 %	549729847
41065	NC_022545	TTC	2	6	1892524	1892529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41067	NC_022545	AAG	2	6	1892627	1892632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_022545	CGG	2	6	1892706	1892711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729848
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41101	NC_022545	GC	3	6	1893848	1893853	0 %	0 %	50 %	50 %	549729848
41102	NC_022545	AGT	2	6	1893891	1893896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729848
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41111	NC_022545	CT	3	6	1894206	1894211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41112	NC_022545	CAA	2	6	1894260	1894265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41113	NC_022545	TAT	2	6	1894266	1894271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41115	NC_022545	GGC	2	6	1894384	1894389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729849
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41118	NC_022545	GGT	2	6	1894442	1894447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729849
41119	NC_022545	CGGAC	2	10	1894540	1894549	20 %	0 %	40 %	40 %	549729849
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41222	NC_022545	GA	3	6	1899246	1899251	50 %	0 %	50 %	0 %	549729852
41223	NC_022545	TGA	2	6	1899277	1899282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729852
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41225	NC_022545	GATC	2	8	1899500	1899507	25 %	25 %	25 %	25 %	549729853
41226	NC_022545	ACG	2	6	1899531	1899536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729853
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41230	NC_022545	CATCG	2	10	1899701	1899710	20 %	20 %	20 %	40 %	549729853
41231	NC_022545	G	6	6	1899727	1899732	0 %	0 %	100 %	0 %	549729853
41232	NC_022545	GGC	2	6	1899752	1899757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729853
41233	NC_022545	GCC	2	6	1899765	1899770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729853
41234	NC_022545	GGC	2	6	1899816	1899821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729853
41235	NC_022545	GAA	2	6	1899831	1899836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729853
41236	NC_022545	TGA	2	6	1899860	1899865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729853
41237	NC_022545	GCT	2	6	1900124	1900129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729853
41238	NC_022545	GAA	2	6	1900170	1900175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729853
41239	NC_022545	GGC	2	6	1900239	1900244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729853
41240	NC_022545	TCC	2	6	1900263	1900268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729853
41241	NC_022545	TGA	2	6	1900327	1900332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729853
41242	NC_022545	GGC	2	6	1900422	1900427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729853
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41244	NC_022545	CGA	2	6	1900502	1900507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729853
41245	NC_022545	CGATC	2	10	1900529	1900538	20 %	20 %	20 %	40 %	549729853
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41247	NC_022545	GCG	2	6	1900637	1900642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729853
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41249	NC_022545	CGGT	2	8	1901099	1901106	0 %	25 %	50 %	25 %	549729854
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41252	NC_022545	CGC	2	6	1901283	1901288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729854
41253	NC_022545	TCA	2	6	1901300	1901305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729854
41254	NC_022545	CGA	2	6	1901318	1901323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729854
41255	NC_022545	CTG	2	6	1901362	1901367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729854
41256	NC_022545	CGG	2	6	1901368	1901373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729854
41257	NC_022545	CGG	2	6	1901393	1901398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729854
41258	NC_022545	GCCG	2	8	1901464	1901471	0 %	0 %	50 %	50 %	549729854
41259	NC_022545	TGC	2	6	1901501	1901506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729854
41260	NC_022545	CCCG	2	8	1901619	1901626	0 %	0 %	25 %	75 %	549729854
41261	NC_022545	CGG	2	6	1901671	1901676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729854
41262	NC_022545	GTGC	2	8	1901714	1901721	0 %	25 %	50 %	25 %	549729854
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41267	NC_022545	TCG	2	6	1901929	1901934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729855
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41269	NC_022545	GGC	2	6	1902021	1902026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729855
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41294	NC_022545	TGG	2	6	1903151	1903156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729856
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41298	NC_022545	CGA	2	6	1903415	1903420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729856
41299	NC_022545	CTG	2	6	1903422	1903427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729856
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41301	NC_022545	TGAA	2	8	1903492	1903499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41302	NC_022545	CAA	2	6	1903540	1903545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41303	NC_022545	GA	3	6	1903549	1903554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41304	NC_022545	GC	3	6	1903600	1903605	0 %	0 %	50 %	50 %	549729857
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41307	NC_022545	TCC	2	6	1903739	1903744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729857
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41309	NC_022545	CCG	2	6	1903808	1903813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729857
41310	NC_022545	TCG	2	6	1903825	1903830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729857
41311	NC_022545	GCA	2	6	1903936	1903941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729857
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41317	NC_022545	TGCG	2	8	1904227	1904234	0 %	25 %	50 %	25 %	549729858
41318	NC_022545	GC	3	6	1904296	1904301	0 %	0 %	50 %	50 %	549729858
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41320	NC_022545	CGA	2	6	1904465	1904470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729858
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41326	NC_022545	ATC	2	6	1904601	1904606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729858
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41329	NC_022545	GAG	2	6	1904685	1904690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729858
41330	NC_022545	GCT	2	6	1904711	1904716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729858
41331	NC_022545	GGA	2	6	1904744	1904749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729858
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41333	NC_022545	TCG	2	6	1904941	1904946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729858
41334	NC_022545	CA	3	6	1905019	1905024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41335	NC_022545	GC	3	6	1905037	1905042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41336	NC_022545	G	6	6	1905046	1905051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41337	NC_022545	CATTG	2	10	1905080	1905089	20 %	40 %	20 %	20 %	549729859
41338	NC_022545	GCG	2	6	1905114	1905119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729859
41339	NC_022545	CCCAG	2	10	1905136	1905145	20 %	0 %	20 %	60 %	549729859
41340	NC_022545	CGG	2	6	1905151	1905156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729859
41341	NC_022545	GGA	2	6	1905170	1905175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729859
41342	NC_022545	CGT	2	6	1905185	1905190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729859
41343	NC_022545	GTG	2	6	1905195	1905200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729859
41344	NC_022545	CGT	2	6	1905258	1905263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729859
41345	NC_022545	GC	3	6	1905299	1905304	0 %	0 %	50 %	50 %	549729859
41346	NC_022545	GC	3	6	1905393	1905398	0 %	0 %	50 %	50 %	549729859
41347	NC_022545	ACC	2	6	1905519	1905524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729859
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41349	NC_022545	GAT	2	6	1905722	1905727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729859
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41460	NC_022545	GCCGGT	2	12	1911246	1911257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549729863
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