MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022545	CAT	2	6	158390	158395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728247
3502	NC_022545	GCT	2	6	158405	158410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728247
3503	NC_022545	TGC	2	6	158428	158433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728247
3504	NC_022545	TCG	2	6	158434	158439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728247
3505	NC_022545	T	6	6	158481	158486	0 %	100 %	0 %	0 %	549728247
3506	NC_022545	GCC	2	6	158526	158531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728247
3507	NC_022545	GC	4	8	158542	158549	0 %	0 %	50 %	50 %	549728247
3508	NC_022545	ACC	2	6	158595	158600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728247
3509	NC_022545	TTC	2	6	158601	158606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728247
3510	NC_022545	GTC	2	6	158613	158618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728247
3511	NC_022545	CTT	2	6	158633	158638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728247
3512	NC_022545	CAT	2	6	158651	158656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728247
3513	NC_022545	CGG	3	9	158669	158677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728247
3514	NC_022545	ATG	2	6	158719	158724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728247
3515	NC_022545	CCG	2	6	158752	158757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728247
3516	NC_022545	TCG	2	6	158815	158820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728247
3517	NC_022545	TGA	2	6	158852	158857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728248
3518	NC_022545	CAT	3	9	158910	158918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3519	NC_022545	CTA	2	6	158934	158939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3520	NC_022545	CAT	2	6	158973	158978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3521	NC_022545	GCC	2	6	158982	158987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728248
3522	NC_022545	GCT	2	6	158994	158999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3523	NC_022545	GGC	2	6	159004	159009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728248
3524	NC_022545	GGC	2	6	159043	159048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728248
3525	NC_022545	GTC	2	6	159058	159063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3526	NC_022545	GCT	2	6	159081	159086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3527	NC_022545	TCG	2	6	159098	159103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3528	NC_022545	GCCATC	2	12	159112	159123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549728248
3529	NC_022545	ATC	3	9	159130	159138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3530	NC_022545	TCT	2	6	159164	159169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728248
3531	NC_022545	GAT	2	6	159201	159206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728248
3532	NC_022545	TCA	2	6	159209	159214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3533	NC_022545	TGC	2	6	159221	159226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3534	NC_022545	TCG	2	6	159263	159268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3535	NC_022545	TTCT	2	8	159349	159356	0 %	75 %	0 %	25 %	549728248
3536	NC_022545	TGG	2	6	159374	159379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728248
3537	NC_022545	GCG	2	6	159382	159387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728248
3538	NC_022545	TCCGT	2	10	159405	159414	0 %	40 %	20 %	40 %	549728248
3539	NC_022545	CTG	2	6	159430	159435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3540	NC_022545	GCT	2	6	159510	159515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3541	NC_022545	ACG	2	6	159524	159529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728248
3542	NC_022545	ATC	3	9	159544	159552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3543	NC_022545	TGG	2	6	159566	159571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728248
3544	NC_022545	CAT	2	6	159627	159632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728248
3545	NC_022545	C	6	6	159633	159638	0 %	0 %	0 %	100 %	549728248
3546	NC_022545	TGG	2	6	159683	159688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728248
3547	NC_022545	GGC	2	6	159741	159746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3548	NC_022545	TCG	2	6	159805	159810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3549	NC_022545	CTG	2	6	159837	159842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3550	NC_022545	CGG	2	6	159872	159877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3551	NC_022545	CGT	2	6	159899	159904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3552	NC_022545	GAA	2	6	160004	160009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728249
3553	NC_022545	AGG	2	6	160024	160029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728249
3554	NC_022545	GCG	2	6	160037	160042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3555	NC_022545	GGC	2	6	160052	160057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3556	NC_022545	CGG	2	6	160109	160114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3557	NC_022545	CCAGCG	2	12	160115	160126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728249
3558	NC_022545	CGA	2	6	160175	160180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3559	NC_022545	CCG	2	6	160232	160237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728249
3560	NC_022545	CT	3	6	160247	160252	0 %	50 %	0 %	50 %	549728249
3561	NC_022545	TGG	2	6	160315	160320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728249
3562	NC_022545	GCCG	2	8	160329	160336	0 %	0 %	50 %	50 %	549728249
3563	NC_022545	CCA	2	6	160381	160386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728249
3564	NC_022545	CTG	2	6	160425	160430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3565	NC_022545	GACGGC	2	12	160439	160450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728249
3566	NC_022545	TGC	2	6	160502	160507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728249
3567	NC_022545	TGG	2	6	160603	160608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728249
3568	NC_022545	CAC	2	6	160646	160651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728249
3569	NC_022545	CGC	2	6	160709	160714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728249
3570	NC_022545	CGG	2	6	160744	160749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728249
3571	NC_022545	CGGC	2	8	160855	160862	0 %	0 %	50 %	50 %	549728250
3572	NC_022545	ATC	2	6	160963	160968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728250
3573	NC_022545	CGC	2	6	161001	161006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728250
3574	NC_022545	CGG	2	6	161112	161117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728250
3575	NC_022545	GCG	2	6	161153	161158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728250
3576	NC_022545	CGA	2	6	161333	161338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_022545	GCC	2	6	161450	161455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_022545	GCC	2	6	161555	161560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728251
3579	NC_022545	CCG	2	6	161566	161571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728251
3580	NC_022545	TCT	2	6	161593	161598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728251
3581	NC_022545	C	6	6	161614	161619	0 %	0 %	0 %	100 %	549728251
3582	NC_022545	CGG	2	6	161656	161661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3583	NC_022545	CGG	2	6	161801	161806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3584	NC_022545	CAG	2	6	161807	161812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728251
3585	NC_022545	GGT	2	6	161870	161875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728251
3586	NC_022545	CGG	2	6	161890	161895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3587	NC_022545	GAA	2	6	161909	161914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728251
3588	NC_022545	TGA	2	6	162001	162006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728251
3589	NC_022545	CGCGCA	2	12	162016	162027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728251
3590	NC_022545	GCC	2	6	162042	162047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728251
3591	NC_022545	TCC	2	6	162057	162062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728251
3592	NC_022545	GGC	2	6	162125	162130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728251
3593	NC_022545	GCAA	2	8	162150	162157	50 %	0 %	25 %	25 %	549728251
3594	NC_022545	GTT	2	6	162161	162166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728251
3595	NC_022545	TC	3	6	162189	162194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_022545	TGA	2	6	162234	162239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_022545	CGG	2	6	162240	162245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_022545	CAA	2	6	162383	162388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_022545	GCC	2	6	162390	162395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_022545	GCG	2	6	162473	162478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3601	NC_022545	GCA	3	9	162503	162511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728252
3602	NC_022545	CGG	2	6	162521	162526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3603	NC_022545	A	6	6	162589	162594	100 %	0 %	0 %	0 %	549728252
3604	NC_022545	GGC	2	6	162606	162611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3605	NC_022545	CGG	2	6	162705	162710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3606	NC_022545	AGA	2	6	162737	162742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728252
3607	NC_022545	AGCC	2	8	162859	162866	25 %	0 %	25 %	50 %	549728252
3608	NC_022545	AAG	2	6	162883	162888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728252
3609	NC_022545	CGC	2	6	162918	162923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728252
3610	NC_022545	GT	3	6	162966	162971	0 %	50 %	50 %	0 %	549728252
3611	NC_022545	GCG	2	6	163067	163072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3612	NC_022545	GAG	2	6	163086	163091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728252
3613	NC_022545	CAC	2	6	163119	163124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728252
3614	NC_022545	CGG	2	6	163154	163159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
3615	NC_022545	GGT	2	6	163160	163165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728252
3616	NC_022545	GCCA	2	8	163235	163242	25 %	0 %	25 %	50 %	549728252
3617	NC_022545	GCC	2	6	163258	163263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728252
3618	NC_022545	AGC	2	6	163264	163269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728252
3619	NC_022545	TTGC	2	8	163297	163304	0 %	50 %	25 %	25 %	549728252
3620	NC_022545	TCA	2	6	163307	163312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728252
3621	NC_022545	CAC	2	6	163404	163409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728252
3622	NC_022545	AGC	3	9	163417	163425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728252
3623	NC_022545	GAA	2	6	163446	163451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728252
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3626	NC_022545	GCG	2	6	163528	163533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728252
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3632	NC_022545	CGG	2	6	163774	163779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_022545	TA	3	6	163800	163805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_022545	A	8	8	163838	163845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_022545	TCT	2	6	163881	163886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728253
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3641	NC_022545	TA	3	6	164258	164263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3642	NC_022545	GAA	2	6	164357	164362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728254
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3645	NC_022545	CGG	2	6	164467	164472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728254
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3744	NC_022545	GGC	2	6	169119	169124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3745	NC_022545	AGC	2	6	169305	169310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_022545	CGCC	2	8	169316	169323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3747	NC_022545	CCA	2	6	169489	169494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728258
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3769	NC_022545	TCC	3	9	170340	170348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3770	NC_022545	GCG	2	6	170371	170376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3771	NC_022545	TACCT	2	10	170380	170389	20 %	40 %	0 %	40 %	549728259
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3846	NC_022545	CATGA	2	10	173848	173857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3852	NC_022545	GCC	2	6	174008	174013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728262
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3855	NC_022545	GCGA	2	8	174096	174103	25 %	0 %	50 %	25 %	549728262
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3862	NC_022545	CGA	2	6	174247	174252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
3863	NC_022545	GCA	2	6	174280	174285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728262
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3972	NC_022545	CGGCG	2	10	178613	178622	0 %	0 %	60 %	40 %	549728264
3973	NC_022545	GCCT	2	8	178644	178651	0 %	25 %	25 %	50 %	549728264
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3985	NC_022545	CAC	2	6	179172	179177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728264
3986	NC_022545	TCG	2	6	179245	179250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3987	NC_022545	GCA	2	6	179273	179278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3988	NC_022545	CG	3	6	179316	179321	0 %	0 %	50 %	50 %	549728264
3989	NC_022545	GAT	2	6	179400	179405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728264
3990	NC_022545	CCT	2	6	179420	179425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728264
3991	NC_022545	TCC	2	6	179452	179457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728264
3992	NC_022545	AGC	2	6	179512	179517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3993	NC_022545	GCG	2	6	179523	179528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728264
3994	NC_022545	CCT	2	6	179531	179536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728264
3995	NC_022545	GGT	2	6	179556	179561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728264
3996	NC_022545	AGC	2	6	179566	179571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264
3997	NC_022545	CCGCG	2	10	179603	179612	0 %	0 %	40 %	60 %	549728264
3998	NC_022545	AAT	2	6	179645	179650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728264
3999	NC_022545	CT	3	6	179713	179718	0 %	50 %	0 %	50 %	549728264
4000	NC_022545	CGA	2	6	179753	179758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728264

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