MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_022545	CGGG	2	8	1657136	1657143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36002	NC_022545	TCC	2	6	1657185	1657190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36003	NC_022545	GCA	2	6	1657218	1657223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36004	NC_022545	ATA	2	6	1657253	1657258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36005	NC_022545	AGA	2	6	1657268	1657273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36006	NC_022545	CCG	2	6	1657317	1657322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36007	NC_022545	GTT	2	6	1657324	1657329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729634
36008	NC_022545	TGA	2	6	1657344	1657349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729634
36009	NC_022545	GCG	2	6	1657365	1657370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36010	NC_022545	CCA	2	6	1657383	1657388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729634
36011	NC_022545	GCC	2	6	1657396	1657401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36012	NC_022545	CCG	2	6	1657425	1657430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36013	NC_022545	TCG	2	6	1657434	1657439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36014	NC_022545	CA	3	6	1657447	1657452	50 %	0 %	0 %	50 %	549729634
36015	NC_022545	CGC	2	6	1657500	1657505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36016	NC_022545	CAGG	2	8	1657564	1657571	25 %	0 %	50 %	25 %	549729634
36017	NC_022545	ACG	2	6	1657584	1657589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36018	NC_022545	GTC	2	6	1657613	1657618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36019	NC_022545	CTCG	2	8	1657621	1657628	0 %	25 %	25 %	50 %	549729634
36020	NC_022545	CG	3	6	1657650	1657655	0 %	0 %	50 %	50 %	549729634
36021	NC_022545	GCC	2	6	1657664	1657669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36022	NC_022545	AGC	2	6	1657725	1657730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36023	NC_022545	GCT	2	6	1657750	1657755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36024	NC_022545	CAA	2	6	1657762	1657767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729634
36025	NC_022545	ATC	2	6	1657778	1657783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729634
36026	NC_022545	GCCG	2	8	1657786	1657793	0 %	0 %	50 %	50 %	549729634
36027	NC_022545	CGG	2	6	1657906	1657911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36028	NC_022545	CGG	2	6	1657927	1657932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36029	NC_022545	GC	3	6	1657934	1657939	0 %	0 %	50 %	50 %	549729634
36030	NC_022545	GCC	2	6	1658000	1658005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36031	NC_022545	ATTCC	2	10	1658031	1658040	20 %	40 %	0 %	40 %	549729634
36032	NC_022545	GTC	2	6	1658065	1658070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36033	NC_022545	GTCTTC	2	12	1658114	1658125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549729634
36034	NC_022545	AGG	2	6	1658133	1658138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729634
36035	NC_022545	CGG	2	6	1658205	1658210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36036	NC_022545	GCA	2	6	1658217	1658222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36037	NC_022545	TTA	2	6	1658248	1658253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729634
36038	NC_022545	GCC	3	9	1658321	1658329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36039	NC_022545	GGC	2	6	1658341	1658346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36040	NC_022545	GCC	2	6	1658382	1658387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729634
36041	NC_022545	TGC	2	6	1658419	1658424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729634
36042	NC_022545	GGT	2	6	1658464	1658469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729634
36043	NC_022545	GC	3	6	1658565	1658570	0 %	0 %	50 %	50 %	549729634
36044	NC_022545	TGG	2	6	1658591	1658596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729634
36045	NC_022545	CT	3	6	1658664	1658669	0 %	50 %	0 %	50 %	549729634
36046	NC_022545	AGA	2	6	1658682	1658687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729634
36047	NC_022545	GGC	2	6	1658737	1658742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729634
36048	NC_022545	CAA	2	6	1658749	1658754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729634
36049	NC_022545	CAG	2	6	1658855	1658860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36050	NC_022545	GTG	2	6	1658960	1658965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729635
36051	NC_022545	TCG	2	6	1658973	1658978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36052	NC_022545	GCC	2	6	1659023	1659028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729635
36053	NC_022545	GCCTCG	2	12	1659081	1659092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549729635
36054	NC_022545	CTA	2	6	1659118	1659123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729635
36055	NC_022545	CTG	2	6	1659191	1659196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36056	NC_022545	CTG	2	6	1659236	1659241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36057	NC_022545	TCGT	2	8	1659296	1659303	0 %	50 %	25 %	25 %	549729635
36058	NC_022545	ACG	2	6	1659317	1659322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36059	NC_022545	GGC	2	6	1659334	1659339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729635
36060	NC_022545	CCTCAT	2	12	1659364	1659375	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549729635
36061	NC_022545	TCG	2	6	1659441	1659446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36062	NC_022545	ATC	2	6	1659456	1659461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729635
36063	NC_022545	TCC	2	6	1659494	1659499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729635
36064	NC_022545	GAC	2	6	1659548	1659553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36065	NC_022545	GTG	2	6	1659596	1659601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729635
36066	NC_022545	GAA	2	6	1659616	1659621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729635
36067	NC_022545	CCG	3	9	1659657	1659665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729635
36068	NC_022545	GGT	2	6	1659682	1659687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729635
36069	NC_022545	TCG	2	6	1659726	1659731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36070	NC_022545	CGG	2	6	1659735	1659740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729635
36071	NC_022545	GC	3	6	1659771	1659776	0 %	0 %	50 %	50 %	549729635
36072	NC_022545	TCA	2	6	1659804	1659809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729635
36073	NC_022545	CTG	2	6	1659833	1659838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729635
36074	NC_022545	CGC	2	6	1659945	1659950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729636
36075	NC_022545	TGC	2	6	1659977	1659982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729636
36076	NC_022545	GAT	2	6	1659999	1660004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729636
36077	NC_022545	GCC	2	6	1660050	1660055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729636
36078	NC_022545	GCC	2	6	1660147	1660152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729636
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36082	NC_022545	CGATG	2	10	1660242	1660251	20 %	20 %	40 %	20 %	549729636
36083	NC_022545	CTG	2	6	1660270	1660275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729636
36084	NC_022545	TGG	2	6	1660286	1660291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729636
36085	NC_022545	GAC	2	6	1660311	1660316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729636
36086	NC_022545	TCA	2	6	1660319	1660324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729636
36087	NC_022545	CGT	2	6	1660335	1660340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729636
36088	NC_022545	CGC	2	6	1660346	1660351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729636
36089	NC_022545	GC	3	6	1660368	1660373	0 %	0 %	50 %	50 %	549729636
36090	NC_022545	GGC	2	6	1660410	1660415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729636
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36093	NC_022545	GGCC	2	8	1660530	1660537	0 %	0 %	50 %	50 %	549729636
36094	NC_022545	CCG	2	6	1660595	1660600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729636
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36097	NC_022545	CAT	2	6	1660653	1660658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729636
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36099	NC_022545	CGG	2	6	1660852	1660857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729637
36100	NC_022545	CGG	2	6	1660978	1660983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729637
36101	NC_022545	GCG	2	6	1661025	1661030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729637
36102	NC_022545	TGG	2	6	1661040	1661045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729637
36103	NC_022545	CGG	2	6	1661055	1661060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729637
36104	NC_022545	AT	3	6	1661089	1661094	50 %	50 %	0 %	0 %	549729637
36105	NC_022545	TCA	2	6	1661274	1661279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729637
36106	NC_022545	AAG	2	6	1661315	1661320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729637
36107	NC_022545	GAT	2	6	1661344	1661349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729637
36108	NC_022545	CCGC	2	8	1661366	1661373	0 %	0 %	25 %	75 %	549729637
36109	NC_022545	CAT	2	6	1661452	1661457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729637
36110	NC_022545	GGC	2	6	1661528	1661533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729637
36111	NC_022545	ACC	2	6	1661648	1661653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729637
36112	NC_022545	GCT	2	6	1661662	1661667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729637
36113	NC_022545	CAT	2	6	1661725	1661730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729637
36114	NC_022545	GGTC	2	8	1661758	1661765	0 %	25 %	50 %	25 %	549729637
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36116	NC_022545	GC	3	6	1661918	1661923	0 %	0 %	50 %	50 %	549729637
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36234	NC_022545	TCA	2	6	1666428	1666433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729641
36235	NC_022545	GGT	2	6	1666447	1666452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729641
36236	NC_022545	TCG	2	6	1666497	1666502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729641
36237	NC_022545	GGC	2	6	1666564	1666569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729641
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36245	NC_022545	CGA	2	6	1667180	1667185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729642
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36252	NC_022545	A	6	6	1667744	1667749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36253	NC_022545	GCG	2	6	1667759	1667764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36254	NC_022545	TGA	2	6	1667781	1667786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36256	NC_022545	T	6	6	1667811	1667816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36257	NC_022545	TAG	2	6	1667831	1667836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36258	NC_022545	A	6	6	1667894	1667899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36259	NC_022545	CAA	2	6	1667949	1667954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729644
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36262	NC_022545	CGG	2	6	1668125	1668130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729644
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36337	NC_022545	GCGG	2	8	1671068	1671075	0 %	0 %	75 %	25 %	549729646
36338	NC_022545	GTG	2	6	1671209	1671214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729646
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36340	NC_022545	GC	4	8	1671306	1671313	0 %	0 %	50 %	50 %	549729646
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36347	NC_022545	CTG	2	6	1671536	1671541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729646
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36350	NC_022545	CGT	2	6	1671712	1671717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729646
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36459	NC_022545	CG	3	6	1677297	1677302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36460	NC_022545	CG	3	6	1677309	1677314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36461	NC_022545	TCGG	2	8	1677348	1677355	0 %	25 %	50 %	25 %	549729652
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36466	NC_022545	GCG	2	6	1677496	1677501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729652
36467	NC_022545	GCA	2	6	1677505	1677510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
36468	NC_022545	ATC	2	6	1677516	1677521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729652
36469	NC_022545	TGA	3	9	1677532	1677540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729652
36470	NC_022545	GCA	2	6	1677571	1677576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
36471	NC_022545	AGC	2	6	1677631	1677636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
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36473	NC_022545	CGC	2	6	1677704	1677709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729652
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