MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_022545	GA	4	8	1632273	1632280	50 %	0 %	50 %	0 %	549729616
35503	NC_022545	TGA	2	6	1632282	1632287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729616
35504	NC_022545	CG	3	6	1632293	1632298	0 %	0 %	50 %	50 %	549729616
35505	NC_022545	CGA	2	6	1632339	1632344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729616
35506	NC_022545	CAG	2	6	1632382	1632387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729616
35507	NC_022545	TCC	2	6	1632467	1632472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729616
35508	NC_022545	GCC	2	6	1632496	1632501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729616
35509	NC_022545	CGG	2	6	1632519	1632524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729616
35510	NC_022545	CAC	2	6	1632535	1632540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729616
35511	NC_022545	CG	3	6	1632561	1632566	0 %	0 %	50 %	50 %	549729616
35512	NC_022545	CGG	2	6	1632597	1632602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729616
35513	NC_022545	GCT	2	6	1632635	1632640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729617
35514	NC_022545	CCG	3	9	1632662	1632670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729617
35515	NC_022545	TGA	2	6	1632680	1632685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729617
35516	NC_022545	GAA	2	6	1632774	1632779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729617
35517	NC_022545	TGA	2	6	1632821	1632826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729617
35518	NC_022545	TGA	2	6	1632857	1632862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729617
35519	NC_022545	CGG	2	6	1632881	1632886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729617
35520	NC_022545	GGC	2	6	1632902	1632907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729617
35521	NC_022545	AAG	2	6	1632979	1632984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729617
35522	NC_022545	CCG	2	6	1633039	1633044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729617
35523	NC_022545	TGA	2	6	1633100	1633105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729617
35524	NC_022545	CAGC	2	8	1633232	1633239	25 %	0 %	25 %	50 %	549729617
35525	NC_022545	ACGGTG	2	12	1633240	1633251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549729617
35526	NC_022545	GCG	2	6	1633256	1633261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729617
35527	NC_022545	CGG	2	6	1633376	1633381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729617
35528	NC_022545	GGA	2	6	1633393	1633398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729617
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35530	NC_022545	CGC	2	6	1633545	1633550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729617
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35533	NC_022545	ATG	2	6	1633579	1633584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729617
35534	NC_022545	GT	3	6	1633617	1633622	0 %	50 %	50 %	0 %	549729618
35535	NC_022545	GCA	3	9	1633678	1633686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729618
35536	NC_022545	ATG	2	6	1633692	1633697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729618
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35538	NC_022545	ATC	2	6	1633755	1633760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729618
35539	NC_022545	GGC	2	6	1633919	1633924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729618
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35541	NC_022545	AGA	2	6	1633984	1633989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729618
35542	NC_022545	TGA	2	6	1633990	1633995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729618
35543	NC_022545	TCA	2	6	1634002	1634007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729618
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35545	NC_022545	GCCG	2	8	1634165	1634172	0 %	0 %	50 %	50 %	549729618
35546	NC_022545	CGGC	2	8	1634257	1634264	0 %	0 %	50 %	50 %	549729618
35547	NC_022545	TGCC	3	12	1634302	1634313	0 %	25 %	25 %	50 %	549729618
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35549	NC_022545	CAGACG	2	12	1634374	1634385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35550	NC_022545	CAT	3	9	1634415	1634423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35551	NC_022545	GAGAA	2	10	1634466	1634475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35552	NC_022545	T	7	7	1634606	1634612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35553	NC_022545	GCTG	2	8	1634614	1634621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35554	NC_022545	GCCG	2	8	1634695	1634702	0 %	0 %	50 %	50 %	549729619
35555	NC_022545	GTG	2	6	1634704	1634709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729619
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35560	NC_022545	GTC	2	6	1634985	1634990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729619
35561	NC_022545	GATC	2	8	1635025	1635032	25 %	25 %	25 %	25 %	549729619
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35585	NC_022545	TAA	2	6	1636140	1636145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729619
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35588	NC_022545	GCCG	2	8	1636240	1636247	0 %	0 %	50 %	50 %	549729619
35589	NC_022545	CGC	3	9	1636273	1636281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729619
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35599	NC_022545	CAG	2	6	1636828	1636833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729620
35600	NC_022545	GC	3	6	1636887	1636892	0 %	0 %	50 %	50 %	549729620
35601	NC_022545	ACG	2	6	1636901	1636906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729620
35602	NC_022545	GC	3	6	1636917	1636922	0 %	0 %	50 %	50 %	549729620
35603	NC_022545	CG	3	6	1636965	1636970	0 %	0 %	50 %	50 %	549729620
35604	NC_022545	GAA	2	6	1636981	1636986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729620
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35607	NC_022545	AGC	2	6	1637228	1637233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729620
35608	NC_022545	CCA	2	6	1637235	1637240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729620
35609	NC_022545	AGA	2	6	1637408	1637413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729620
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35612	NC_022545	CGG	2	6	1637527	1637532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729621
35613	NC_022545	CAT	2	6	1637555	1637560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729621
35614	NC_022545	AGGA	2	8	1637592	1637599	50 %	0 %	50 %	0 %	549729621
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35617	NC_022545	GCC	3	9	1637651	1637659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729621
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35734	NC_022545	CGA	2	6	1643125	1643130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729625
35735	NC_022545	CGC	2	6	1643223	1643228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729625
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35845	NC_022545	GC	3	6	1648556	1648561	0 %	0 %	50 %	50 %	549729628
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35848	NC_022545	GCA	2	6	1648715	1648720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729628
35849	NC_022545	GCT	2	6	1648801	1648806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729628
35850	NC_022545	GCC	2	6	1648820	1648825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729628
35851	NC_022545	CTG	2	6	1648891	1648896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729629
35852	NC_022545	TCG	2	6	1648898	1648903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729629
35853	NC_022545	GGA	2	6	1649082	1649087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729629
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35855	NC_022545	GTT	2	6	1649269	1649274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729629
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35860	NC_022545	GTC	2	6	1649689	1649694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729630
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35865	NC_022545	CCG	2	6	1649984	1649989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729630
35866	NC_022545	CTG	2	6	1650021	1650026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729630
35867	NC_022545	GCC	2	6	1650034	1650039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729630
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35874	NC_022545	GGC	2	6	1650453	1650458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729630
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35879	NC_022545	CCG	2	6	1650604	1650609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729630
35880	NC_022545	CTG	2	6	1650621	1650626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729630
35881	NC_022545	CTGGC	2	10	1650664	1650673	0 %	20 %	40 %	40 %	549729630
35882	NC_022545	CTC	2	6	1650708	1650713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729630
35883	NC_022545	GTT	2	6	1650744	1650749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729630
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35902	NC_022545	GGT	2	6	1651950	1651955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729630
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35905	NC_022545	GCAA	2	8	1652140	1652147	50 %	0 %	25 %	25 %	549729630
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35910	NC_022545	TGA	2	6	1652418	1652423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729630
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35912	NC_022545	GTG	2	6	1652524	1652529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729630
35913	NC_022545	GGC	2	6	1652594	1652599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729631
35914	NC_022545	TGCC	2	8	1652605	1652612	0 %	25 %	25 %	50 %	549729631
35915	NC_022545	CGA	2	6	1652677	1652682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729631
35916	NC_022545	CG	3	6	1652707	1652712	0 %	0 %	50 %	50 %	549729631
35917	NC_022545	CG	3	6	1652739	1652744	0 %	0 %	50 %	50 %	549729631
35918	NC_022545	ATG	2	6	1652768	1652773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729631
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35923	NC_022545	GA	3	6	1653076	1653081	50 %	0 %	50 %	0 %	549729631
35924	NC_022545	TGGCGC	2	12	1653262	1653273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549729631
35925	NC_022545	CGC	2	6	1653281	1653286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729631
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35929	NC_022545	CCTTGT	2	12	1653400	1653411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549729631
35930	NC_022545	CCG	2	6	1653415	1653420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729631
35931	NC_022545	GGCC	2	8	1653505	1653512	0 %	0 %	50 %	50 %	549729631
35932	NC_022545	GCT	2	6	1653540	1653545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729631
35933	NC_022545	GCC	2	6	1653561	1653566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729631
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35935	NC_022545	GCC	2	6	1653631	1653636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729631
35936	NC_022545	C	6	6	1653639	1653644	0 %	0 %	0 %	100 %	549729631
35937	NC_022545	TGT	2	6	1653657	1653662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729631
35938	NC_022545	CTGG	2	8	1653667	1653674	0 %	25 %	50 %	25 %	549729631
35939	NC_022545	GGA	2	6	1653683	1653688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729631
35940	NC_022545	TGCGGT	2	12	1653716	1653727	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549729631
35941	NC_022545	CGG	2	6	1653811	1653816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729631
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35943	NC_022545	TCC	2	6	1653928	1653933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35944	NC_022545	TTC	2	6	1654066	1654071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35945	NC_022545	GCC	2	6	1654094	1654099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35946	NC_022545	GGC	2	6	1654110	1654115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35947	NC_022545	GCGAT	2	10	1654123	1654132	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35948	NC_022545	TGG	2	6	1654199	1654204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729632
35949	NC_022545	CGA	2	6	1654217	1654222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729632
35950	NC_022545	AAG	2	6	1654309	1654314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729632
35951	NC_022545	GAG	2	6	1654398	1654403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729632
35952	NC_022545	CCGC	2	8	1654465	1654472	0 %	0 %	25 %	75 %	549729632
35953	NC_022545	CTCGAA	2	12	1654509	1654520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549729632
35954	NC_022545	CCA	2	6	1654574	1654579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729632
35955	NC_022545	CAC	2	6	1654596	1654601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729632
35956	NC_022545	CTC	2	6	1654866	1654871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729632
35957	NC_022545	TGA	2	6	1654976	1654981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729632
35958	NC_022545	CTGC	2	8	1654996	1655003	0 %	25 %	25 %	50 %	549729632
35959	NC_022545	GCC	2	6	1655022	1655027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729632
35960	NC_022545	CGC	2	6	1655090	1655095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729632
35961	NC_022545	CCA	2	6	1655101	1655106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729632
35962	NC_022545	GGT	2	6	1655124	1655129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729632
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35964	NC_022545	T	7	7	1655201	1655207	0 %	100 %	0 %	0 %	549729632
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35996	NC_022545	ATA	2	6	1656987	1656992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35997	NC_022545	TGTC	2	8	1657007	1657014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35998	NC_022545	TCCTG	2	10	1657019	1657028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35999	NC_022545	TGGCTG	2	12	1657112	1657123	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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