MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_022545	GC	3	6	1609597	1609602	0 %	0 %	50 %	50 %	549729598
35003	NC_022545	TCT	2	6	1609607	1609612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729598
35004	NC_022545	GCC	3	9	1609623	1609631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729598
35005	NC_022545	CGG	2	6	1609679	1609684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729598
35006	NC_022545	TATC	2	8	1609693	1609700	25 %	50 %	0 %	25 %	549729598
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35011	NC_022545	CGA	2	6	1610035	1610040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729598
35012	NC_022545	CGA	2	6	1610070	1610075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729598
35013	NC_022545	TCGA	2	8	1610078	1610085	25 %	25 %	25 %	25 %	549729598
35014	NC_022545	TC	3	6	1610126	1610131	0 %	50 %	0 %	50 %	549729598
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35017	NC_022545	TCG	2	6	1610238	1610243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729598
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35020	NC_022545	GCG	2	6	1610384	1610389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729598
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35112	NC_022545	CGT	2	6	1614524	1614529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729600
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35117	NC_022545	GCA	2	6	1614650	1614655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729600
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35119	NC_022545	CGG	2	6	1614734	1614739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729600
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35129	NC_022545	CGGC	2	8	1615140	1615147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35130	NC_022545	GC	3	6	1615207	1615212	0 %	0 %	50 %	50 %	549729601
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35153	NC_022545	TGC	2	6	1616349	1616354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35229	NC_022545	ATC	2	6	1619920	1619925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729604
35230	NC_022545	ATGA	2	8	1619926	1619933	50 %	25 %	25 %	0 %	549729604
35231	NC_022545	CGGAT	2	10	1619968	1619977	20 %	20 %	40 %	20 %	549729604
35232	NC_022545	CG	3	6	1620078	1620083	0 %	0 %	50 %	50 %	549729604
35233	NC_022545	ATC	2	6	1620104	1620109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729604
35234	NC_022545	TCAT	2	8	1620134	1620141	25 %	50 %	0 %	25 %	549729604
35235	NC_022545	CG	3	6	1620146	1620151	0 %	0 %	50 %	50 %	549729604
35236	NC_022545	GC	3	6	1620167	1620172	0 %	0 %	50 %	50 %	549729604
35237	NC_022545	ACG	2	6	1620211	1620216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729604
35238	NC_022545	CGC	3	9	1620225	1620233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729604
35239	NC_022545	GAG	3	9	1620238	1620246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729604
35240	NC_022545	CCG	2	6	1620289	1620294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729604
35241	NC_022545	ATT	2	6	1620298	1620303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729604
35242	NC_022545	GCC	2	6	1620364	1620369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729604
35243	NC_022545	GCCG	2	8	1620395	1620402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35244	NC_022545	ACCGC	2	10	1620440	1620449	20 %	0 %	20 %	60 %	549729605
35245	NC_022545	ACG	2	6	1620461	1620466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729605
35246	NC_022545	GAC	2	6	1620529	1620534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729605
35247	NC_022545	GCG	2	6	1620563	1620568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729605
35248	NC_022545	TGG	2	6	1620660	1620665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729605
35249	NC_022545	GCT	2	6	1620669	1620674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729605
35250	NC_022545	GCC	2	6	1620806	1620811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729605
35251	NC_022545	GCAG	2	8	1621014	1621021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35252	NC_022545	TTC	2	6	1621096	1621101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729606
35253	NC_022545	CTGGTC	2	12	1621126	1621137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35254	NC_022545	CGA	3	9	1621158	1621166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35255	NC_022545	TGG	2	6	1621167	1621172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729606
35256	NC_022545	CGA	2	6	1621185	1621190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35257	NC_022545	GC	3	6	1621200	1621205	0 %	0 %	50 %	50 %	549729606
35258	NC_022545	ACG	2	6	1621271	1621276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35259	NC_022545	TGA	2	6	1621296	1621301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729606
35260	NC_022545	CGG	2	6	1621320	1621325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729606
35261	NC_022545	GGA	2	6	1621333	1621338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729606
35262	NC_022545	CGA	2	6	1621347	1621352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35263	NC_022545	GCA	3	9	1621353	1621361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35264	NC_022545	CGA	2	6	1621482	1621487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35265	NC_022545	TCA	2	6	1621521	1621526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729606
35266	NC_022545	GGC	2	6	1621537	1621542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729606
35267	NC_022545	CAG	3	9	1621567	1621575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35268	NC_022545	TTC	2	6	1621576	1621581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729606
35269	NC_022545	CGA	2	6	1621602	1621607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729606
35270	NC_022545	CACGAA	2	12	1621645	1621656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	549729606
35271	NC_022545	AGGA	2	8	1621658	1621665	50 %	0 %	50 %	0 %	549729606
35272	NC_022545	GACG	2	8	1621705	1621712	25 %	0 %	50 %	25 %	549729606
35273	NC_022545	TCA	2	6	1621773	1621778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729606
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35285	NC_022545	ATG	2	6	1622300	1622305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729606
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35287	NC_022545	T	6	6	1622387	1622392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35288	NC_022545	CCT	2	6	1622393	1622398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35289	NC_022545	GAG	2	6	1622463	1622468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35290	NC_022545	ATT	2	6	1622496	1622501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35291	NC_022545	T	6	6	1622530	1622535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35292	NC_022545	TG	3	6	1622596	1622601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35293	NC_022545	TGGC	2	8	1622673	1622680	0 %	25 %	50 %	25 %	549729607
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35302	NC_022545	CGT	2	6	1623173	1623178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35303	NC_022545	GTC	2	6	1623243	1623248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35304	NC_022545	TGA	2	6	1623268	1623273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729607
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35306	NC_022545	CGA	2	6	1623324	1623329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35307	NC_022545	TGA	2	6	1623431	1623436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729607
35308	NC_022545	CGA	2	6	1623484	1623489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35309	NC_022545	GCC	2	6	1623537	1623542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729607
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35312	NC_022545	GAAA	2	8	1623632	1623639	75 %	0 %	25 %	0 %	549729607
35313	NC_022545	GAA	3	9	1623642	1623650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729607
35314	NC_022545	GA	3	6	1623687	1623692	50 %	0 %	50 %	0 %	549729607
35315	NC_022545	CG	3	6	1623712	1623717	0 %	0 %	50 %	50 %	549729607
35316	NC_022545	ATC	2	6	1623718	1623723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729607
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35320	NC_022545	CTG	2	6	1623897	1623902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35321	NC_022545	GCC	2	6	1623948	1623953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729607
35322	NC_022545	CG	3	6	1623998	1624003	0 %	0 %	50 %	50 %	549729607
35323	NC_022545	TGC	3	9	1624063	1624071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729607
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35325	NC_022545	TCT	2	6	1624175	1624180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729607
35326	NC_022545	GAA	2	6	1624242	1624247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729607
35327	NC_022545	T	6	6	1624315	1624320	0 %	100 %	0 %	0 %	549729607
35328	NC_022545	AGG	2	6	1624339	1624344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729607
35329	NC_022545	GGCCTT	2	12	1624353	1624364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729607
35330	NC_022545	GGCG	2	8	1624395	1624402	0 %	0 %	75 %	25 %	549729607
35331	NC_022545	AGGC	2	8	1624423	1624430	25 %	0 %	50 %	25 %	549729607
35332	NC_022545	CATGA	2	10	1624459	1624468	40 %	20 %	20 %	20 %	549729607
35333	NC_022545	CGG	2	6	1624469	1624474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729608
35334	NC_022545	GAC	2	6	1624498	1624503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729608
35335	NC_022545	CGAGC	2	10	1624570	1624579	20 %	0 %	40 %	40 %	549729608
35336	NC_022545	CGT	2	6	1624614	1624619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729608
35337	NC_022545	CCG	2	6	1624787	1624792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729608
35338	NC_022545	TGG	2	6	1624799	1624804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729608
35339	NC_022545	CGC	2	6	1624831	1624836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729608
35340	NC_022545	CG	3	6	1624852	1624857	0 %	0 %	50 %	50 %	549729608
35341	NC_022545	GGA	2	6	1624881	1624886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729608
35342	NC_022545	ACG	2	6	1624933	1624938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729608
35343	NC_022545	TGG	2	6	1624973	1624978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729608
35344	NC_022545	GTG	2	6	1625005	1625010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729608
35345	NC_022545	AAG	2	6	1625035	1625040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729608
35346	NC_022545	GAGC	2	8	1625100	1625107	25 %	0 %	50 %	25 %	549729608
35347	NC_022545	A	6	6	1625146	1625151	100 %	0 %	0 %	0 %	549729608
35348	NC_022545	GTG	2	6	1625177	1625182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729608
35349	NC_022545	GTT	2	6	1625187	1625192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729608
35350	NC_022545	TGC	2	6	1625237	1625242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729608
35351	NC_022545	CGC	2	6	1625267	1625272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729608
35352	NC_022545	GAG	2	6	1625284	1625289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729608
35353	NC_022545	GCG	2	6	1625314	1625319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729608
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35377	NC_022545	TCCA	2	8	1626469	1626476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35379	NC_022545	CTG	2	6	1626530	1626535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35380	NC_022545	TGAA	2	8	1626545	1626552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35381	NC_022545	CGGAAG	2	12	1626761	1626772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549729610
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35385	NC_022545	CGA	2	6	1626891	1626896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729610
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35447	NC_022545	ATT	2	6	1629909	1629914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35448	NC_022545	GTC	2	6	1629977	1629982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729613
35449	NC_022545	CGAC	2	8	1629991	1629998	25 %	0 %	25 %	50 %	549729613
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35451	NC_022545	GCT	2	6	1630013	1630018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729613
35452	NC_022545	TGC	2	6	1630052	1630057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729613
35453	NC_022545	GCGTC	2	10	1630088	1630097	0 %	20 %	40 %	40 %	549729613
35454	NC_022545	ATC	2	6	1630119	1630124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729613
35455	NC_022545	CGG	2	6	1630157	1630162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729613
35456	NC_022545	GGA	2	6	1630208	1630213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729613
35457	NC_022545	TGCGG	2	10	1630235	1630244	0 %	20 %	60 %	20 %	549729613
35458	NC_022545	CGG	2	6	1630280	1630285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729613
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35460	NC_022545	ATTC	2	8	1630380	1630387	25 %	50 %	0 %	25 %	549729613
35461	NC_022545	CAC	2	6	1630457	1630462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729614
35462	NC_022545	ATG	2	6	1630471	1630476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729614
35463	NC_022545	AAT	2	6	1630536	1630541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729614
35464	NC_022545	CGC	3	9	1630600	1630608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729614
35465	NC_022545	TTC	2	6	1630634	1630639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729614
35466	NC_022545	TGA	2	6	1630728	1630733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729614
35467	NC_022545	CGC	2	6	1630762	1630767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729614
35468	NC_022545	ACG	2	6	1630847	1630852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729614
35469	NC_022545	CGC	2	6	1630874	1630879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729614
35470	NC_022545	TCT	2	6	1630895	1630900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729614
35471	NC_022545	GCA	2	6	1630902	1630907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729614
35472	NC_022545	CAC	2	6	1630945	1630950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729614
35473	NC_022545	GCC	2	6	1630962	1630967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729614
35474	NC_022545	CATC	2	8	1631055	1631062	25 %	25 %	0 %	50 %	549729614
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35476	NC_022545	GGT	2	6	1631074	1631079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729614
35477	NC_022545	TGA	2	6	1631136	1631141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729614
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35481	NC_022545	CG	3	6	1631316	1631321	0 %	0 %	50 %	50 %	549729615
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35483	NC_022545	GA	3	6	1631383	1631388	50 %	0 %	50 %	0 %	549729615
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35485	NC_022545	CAG	2	6	1631436	1631441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729615
35486	NC_022545	CGC	2	6	1631513	1631518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729615
35487	NC_022545	CGG	2	6	1631534	1631539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729615
35488	NC_022545	TCGGCG	2	12	1631557	1631568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549729615
35489	NC_022545	GAT	2	6	1631589	1631594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729615
35490	NC_022545	TCG	2	6	1631638	1631643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729615
35491	NC_022545	TGA	2	6	1631699	1631704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729615
35492	NC_022545	ATC	2	6	1631758	1631763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729615
35493	NC_022545	GCC	2	6	1631821	1631826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729615
35494	NC_022545	AG	3	6	1631840	1631845	50 %	0 %	50 %	0 %	549729615
35495	NC_022545	TGAT	2	8	1631921	1631928	25 %	50 %	25 %	0 %	549729616
35496	NC_022545	CGG	2	6	1632015	1632020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729616
35497	NC_022545	CGC	3	9	1632046	1632054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729616
35498	NC_022545	AGC	2	6	1632085	1632090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729616
35499	NC_022545	C	6	6	1632098	1632103	0 %	0 %	0 %	100 %	549729616
35500	NC_022545	CGCGT	3	15	1632162	1632176	0 %	20 %	40 %	40 %	549729616

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