MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_022545	GGCGC	2	10	1540084	1540093	0 %	0 %	60 %	40 %	549729531
33503	NC_022545	GCG	2	6	1540164	1540169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729531
33504	NC_022545	CAA	2	6	1540176	1540181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729531
33505	NC_022545	AGA	2	6	1540199	1540204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729531
33506	NC_022545	GCA	2	6	1540244	1540249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729531
33507	NC_022545	CG	3	6	1540292	1540297	0 %	0 %	50 %	50 %	549729531
33508	NC_022545	GAA	2	6	1540315	1540320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729531
33509	NC_022545	GGA	2	6	1540335	1540340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729531
33510	NC_022545	GTTC	2	8	1540354	1540361	0 %	50 %	25 %	25 %	549729531
33511	NC_022545	GCAC	2	8	1540405	1540412	25 %	0 %	25 %	50 %	549729531
33512	NC_022545	TCAG	2	8	1540490	1540497	25 %	25 %	25 %	25 %	549729531
33513	NC_022545	CTG	2	6	1540537	1540542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729531
33514	NC_022545	GCC	2	6	1540564	1540569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729531
33515	NC_022545	CG	3	6	1540570	1540575	0 %	0 %	50 %	50 %	549729531
33516	NC_022545	GTG	2	6	1540600	1540605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729531
33517	NC_022545	AGG	2	6	1540610	1540615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729531
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33519	NC_022545	CAA	2	6	1540671	1540676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729531
33520	NC_022545	CAA	2	6	1540827	1540832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729531
33521	NC_022545	GCC	2	6	1540870	1540875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729531
33522	NC_022545	GCAC	2	8	1540882	1540889	25 %	0 %	25 %	50 %	549729531
33523	NC_022545	CAC	2	6	1540902	1540907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729531
33524	NC_022545	CCG	2	6	1540962	1540967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729531
33525	NC_022545	CTG	2	6	1541015	1541020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729531
33526	NC_022545	AGG	2	6	1541033	1541038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729531
33527	NC_022545	GC	3	6	1541043	1541048	0 %	0 %	50 %	50 %	549729531
33528	NC_022545	AGC	2	6	1541049	1541054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729531
33529	NC_022545	ATC	2	6	1541095	1541100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33530	NC_022545	GC	3	6	1541132	1541137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33531	NC_022545	GGT	2	6	1541172	1541177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729532
33532	NC_022545	CGG	2	6	1541204	1541209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729532
33533	NC_022545	ACC	2	6	1541237	1541242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729532
33534	NC_022545	CTC	2	6	1541254	1541259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729532
33535	NC_022545	GAA	2	6	1541272	1541277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729532
33536	NC_022545	GGC	2	6	1541279	1541284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729532
33537	NC_022545	TGC	2	6	1541324	1541329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729532
33538	NC_022545	TCGC	2	8	1541345	1541352	0 %	25 %	25 %	50 %	549729532
33539	NC_022545	TGG	2	6	1541369	1541374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729532
33540	NC_022545	CGGC	2	8	1541378	1541385	0 %	0 %	50 %	50 %	549729532
33541	NC_022545	TTC	2	6	1541536	1541541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729532
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33544	NC_022545	CCT	2	6	1541604	1541609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729532
33545	NC_022545	GAT	2	6	1541623	1541628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729532
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33547	NC_022545	CGG	2	6	1541754	1541759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729532
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33549	NC_022545	GGA	2	6	1541788	1541793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729532
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33551	NC_022545	TGA	2	6	1541931	1541936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729532
33552	NC_022545	CGT	2	6	1541940	1541945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729532
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33557	NC_022545	GGT	2	6	1542061	1542066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729532
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33572	NC_022545	CGC	2	6	1542900	1542905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729533
33573	NC_022545	CGGG	2	8	1542906	1542913	0 %	0 %	75 %	25 %	549729533
33574	NC_022545	TTC	2	6	1542937	1542942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729533
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33578	NC_022545	GA	3	6	1543070	1543075	50 %	0 %	50 %	0 %	549729533
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33584	NC_022545	CGCGGC	2	12	1543327	1543338	0 %	0 %	50 %	50 %	549729533
33585	NC_022545	GTGGCG	2	12	1543355	1543366	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549729533
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33589	NC_022545	GGTGG	2	10	1543513	1543522	0 %	20 %	80 %	0 %	549729533
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33596	NC_022545	TCAT	2	8	1543845	1543852	25 %	50 %	0 %	25 %	549729534
33597	NC_022545	GC	4	8	1543853	1543860	0 %	0 %	50 %	50 %	549729534
33598	NC_022545	CCG	2	6	1543866	1543871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729534
33599	NC_022545	CGA	2	6	1543942	1543947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729534
33600	NC_022545	TTC	2	6	1543985	1543990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729534
33601	NC_022545	CGT	2	6	1544032	1544037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729534
33602	NC_022545	GC	3	6	1544137	1544142	0 %	0 %	50 %	50 %	549729534
33603	NC_022545	GCT	3	9	1544158	1544166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729534
33604	NC_022545	GCC	2	6	1544168	1544173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729534
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33606	NC_022545	GCC	2	6	1544408	1544413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729534
33607	NC_022545	TGG	2	6	1544467	1544472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729534
33608	NC_022545	GCCGGA	2	12	1544477	1544488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549729534
33609	NC_022545	GAT	2	6	1544495	1544500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729534
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33611	NC_022545	CAA	2	6	1544587	1544592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729534
33612	NC_022545	GATG	2	8	1544612	1544619	25 %	25 %	50 %	0 %	549729534
33613	NC_022545	GAAGC	2	10	1544646	1544655	40 %	0 %	40 %	20 %	549729535
33614	NC_022545	GAA	2	6	1544702	1544707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729535
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33850	NC_022545	GAT	2	6	1556048	1556053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729543
33851	NC_022545	AGG	2	6	1556055	1556060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729543
33852	NC_022545	TGC	2	6	1556099	1556104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729544
33853	NC_022545	GC	3	6	1556144	1556149	0 %	0 %	50 %	50 %	549729544
33854	NC_022545	GAGG	2	8	1556286	1556293	25 %	0 %	75 %	0 %	549729544
33855	NC_022545	TGA	2	6	1556340	1556345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729544
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33857	NC_022545	TGG	2	6	1556390	1556395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729545
33858	NC_022545	GGC	2	6	1556402	1556407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729545
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33861	NC_022545	CGGC	2	8	1556563	1556570	0 %	0 %	50 %	50 %	549729545
33862	NC_022545	GAA	2	6	1556576	1556581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729545
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33880	NC_022545	TTC	2	6	1557461	1557466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729545
33881	NC_022545	CGG	2	6	1557480	1557485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729545
33882	NC_022545	CTGA	2	8	1557525	1557532	25 %	25 %	25 %	25 %	549729545
33883	NC_022545	CGC	2	6	1557561	1557566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33884	NC_022545	GCG	2	6	1557622	1557627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33885	NC_022545	AGG	3	9	1557661	1557669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33886	NC_022545	GC	3	6	1557686	1557691	0 %	0 %	50 %	50 %	549729546
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33901	NC_022545	TCA	2	6	1558350	1558355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729546
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33919	NC_022545	TGA	2	6	1559035	1559040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729547
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33928	NC_022545	TGC	2	6	1559486	1559491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729547
33929	NC_022545	ACG	2	6	1559598	1559603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729548
33930	NC_022545	TGC	2	6	1559616	1559621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729548
33931	NC_022545	CCGA	2	8	1559681	1559688	25 %	0 %	25 %	50 %	549729548
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33933	NC_022545	A	7	7	1559796	1559802	100 %	0 %	0 %	0 %	549729548
33934	NC_022545	GCT	2	6	1559893	1559898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729548
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33940	NC_022545	ATCGC	2	10	1560123	1560132	20 %	20 %	20 %	40 %	549729548
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33946	NC_022545	GCG	2	6	1560246	1560251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729548
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33950	NC_022545	CG	3	6	1560347	1560352	0 %	0 %	50 %	50 %	549729548
33951	NC_022545	TCG	2	6	1560399	1560404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729548
33952	NC_022545	GTC	2	6	1560425	1560430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729548
33953	NC_022545	GAG	2	6	1560437	1560442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729548
33954	NC_022545	ATCTG	2	10	1560459	1560468	20 %	40 %	20 %	20 %	549729548
33955	NC_022545	GGC	2	6	1560506	1560511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729548
33956	NC_022545	CA	3	6	1560622	1560627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33957	NC_022545	GGA	2	6	1560650	1560655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33958	NC_022545	GAA	2	6	1560722	1560727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729549
33959	NC_022545	CGG	3	9	1560733	1560741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729549
33960	NC_022545	TCT	2	6	1560866	1560871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729549
33961	NC_022545	A	6	6	1560885	1560890	100 %	0 %	0 %	0 %	549729549
33962	NC_022545	CCTTA	2	10	1560936	1560945	20 %	40 %	0 %	40 %	549729549
33963	NC_022545	GCC	2	6	1560969	1560974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729549
33964	NC_022545	TTGG	2	8	1561042	1561049	0 %	50 %	50 %	0 %	549729549
33965	NC_022545	CGC	2	6	1561093	1561098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729549
33966	NC_022545	CCG	2	6	1561213	1561218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729549
33967	NC_022545	CACGG	2	10	1561284	1561293	20 %	0 %	40 %	40 %	549729549
33968	NC_022545	TCG	2	6	1561309	1561314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729549
33969	NC_022545	ATCG	2	8	1561377	1561384	25 %	25 %	25 %	25 %	549729549
33970	NC_022545	CGT	2	6	1561405	1561410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729549
33971	NC_022545	CTA	2	6	1561418	1561423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729549
33972	NC_022545	TCA	2	6	1561443	1561448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729550
33973	NC_022545	CAT	2	6	1561471	1561476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729550
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33978	NC_022545	GAA	2	6	1561786	1561791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729550
33979	NC_022545	CGG	2	6	1561825	1561830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729550
33980	NC_022545	AT	3	6	1561852	1561857	50 %	50 %	0 %	0 %	549729550
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33982	NC_022545	TGA	2	6	1561902	1561907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729550
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33985	NC_022545	GC	3	6	1562037	1562042	0 %	0 %	50 %	50 %	549729550
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33990	NC_022545	TGT	2	6	1562269	1562274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729550
33991	NC_022545	GCT	2	6	1562433	1562438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729550
33992	NC_022545	TGA	2	6	1562469	1562474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729550
33993	NC_022545	GAC	3	9	1562518	1562526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729550
33994	NC_022545	GCCG	2	8	1562536	1562543	0 %	0 %	50 %	50 %	549729550
33995	NC_022545	GAG	2	6	1562555	1562560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729550
33996	NC_022545	TGC	2	6	1562571	1562576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729550
33997	NC_022545	GCTTT	2	10	1562665	1562674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33998	NC_022545	GCC	2	6	1562678	1562683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33999	NC_022545	CGG	2	6	1562756	1562761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729551
34000	NC_022545	CGC	2	6	1562792	1562797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729551

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