MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_022545	ATG	2	6	1426370	1426375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729434
31003	NC_022545	TGC	2	6	1426417	1426422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729434
31004	NC_022545	CTG	2	6	1426481	1426486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729434
31005	NC_022545	GGC	2	6	1426490	1426495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729434
31006	NC_022545	GAT	2	6	1426619	1426624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729434
31007	NC_022545	CGG	3	9	1426629	1426637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729434
31008	NC_022545	CGC	2	6	1426681	1426686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729434
31009	NC_022545	GGA	2	6	1426783	1426788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729434
31010	NC_022545	GC	3	6	1426870	1426875	0 %	0 %	50 %	50 %	549729434
31011	NC_022545	GCC	2	6	1427021	1427026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729434
31012	NC_022545	TCG	2	6	1427039	1427044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729434
31013	NC_022545	CCG	2	6	1427098	1427103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729434
31014	NC_022545	CTG	2	6	1427105	1427110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729434
31015	NC_022545	GGC	2	6	1427185	1427190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729434
31016	NC_022545	GGA	3	9	1427227	1427235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_022545	GAA	2	6	1427254	1427259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729435
31018	NC_022545	CCG	2	6	1427280	1427285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729435
31019	NC_022545	TGA	2	6	1427289	1427294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729435
31020	NC_022545	TGG	2	6	1427378	1427383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729435
31021	NC_022545	CGC	2	6	1427395	1427400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729435
31022	NC_022545	AGC	2	6	1427409	1427414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729435
31023	NC_022545	GCC	2	6	1427497	1427502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729435
31024	NC_022545	GGCT	2	8	1427552	1427559	0 %	25 %	50 %	25 %	549729435
31025	NC_022545	AAG	2	6	1427582	1427587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729435
31026	NC_022545	CAG	2	6	1427618	1427623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729435
31027	NC_022545	GT	3	6	1427648	1427653	0 %	50 %	50 %	0 %	549729435
31028	NC_022545	ACT	2	6	1427664	1427669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729435
31029	NC_022545	AAG	2	6	1427693	1427698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729435
31030	NC_022545	GGCG	2	8	1427710	1427717	0 %	0 %	75 %	25 %	549729435
31031	NC_022545	GGC	2	6	1427749	1427754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729435
31032	NC_022545	CCA	3	9	1427763	1427771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729435
31033	NC_022545	ATC	2	6	1427792	1427797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729435
31034	NC_022545	CGC	2	6	1427922	1427927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729435
31035	NC_022545	TGG	2	6	1427931	1427936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729435
31036	NC_022545	TGA	2	6	1427961	1427966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729435
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31038	NC_022545	CCG	2	6	1428125	1428130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729435
31039	NC_022545	GCCG	2	8	1428160	1428167	0 %	0 %	50 %	50 %	549729435
31040	NC_022545	CGA	2	6	1428175	1428180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729435
31041	NC_022545	TCA	2	6	1428204	1428209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729435
31042	NC_022545	GGC	2	6	1428254	1428259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729435
31043	NC_022545	GAA	2	6	1428422	1428427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729435
31044	NC_022545	GAT	2	6	1428436	1428441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729435
31045	NC_022545	CATCCG	2	12	1428551	1428562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31046	NC_022545	AGG	2	6	1428565	1428570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31047	NC_022545	CCAT	2	8	1428572	1428579	25 %	25 %	0 %	50 %	549729436
31048	NC_022545	CGGGC	2	10	1428593	1428602	0 %	0 %	60 %	40 %	549729436
31049	NC_022545	GCC	2	6	1428686	1428691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729436
31050	NC_022545	ATC	2	6	1428692	1428697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729436
31051	NC_022545	CAG	2	6	1428734	1428739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729436
31052	NC_022545	GCCG	2	8	1428768	1428775	0 %	0 %	50 %	50 %	549729436
31053	NC_022545	CTG	2	6	1428829	1428834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729436
31054	NC_022545	GTC	3	9	1428854	1428862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729436
31055	NC_022545	ATC	2	6	1428974	1428979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729436
31056	NC_022545	GTC	2	6	1428983	1428988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729436
31057	NC_022545	TGGC	2	8	1429031	1429038	0 %	25 %	50 %	25 %	549729436
31058	NC_022545	GAT	2	6	1429063	1429068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729436
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31061	NC_022545	CAT	2	6	1429318	1429323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729436
31062	NC_022545	GCCGC	2	10	1429413	1429422	0 %	0 %	40 %	60 %	549729436
31063	NC_022545	TCG	2	6	1429455	1429460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729436
31064	NC_022545	CGGC	2	8	1429477	1429484	0 %	0 %	50 %	50 %	549729436
31065	NC_022545	GAG	2	6	1429503	1429508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729436
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31067	NC_022545	TGA	2	6	1429573	1429578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729437
31068	NC_022545	CCA	2	6	1429618	1429623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729437
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31072	NC_022545	GCG	2	6	1429819	1429824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729437
31073	NC_022545	GCT	2	6	1429871	1429876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729437
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31082	NC_022545	GC	3	6	1430699	1430704	0 %	0 %	50 %	50 %	549729438
31083	NC_022545	TC	3	6	1430746	1430751	0 %	50 %	0 %	50 %	549729438
31084	NC_022545	GACAGC	2	12	1430757	1430768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729438
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31087	NC_022545	CAT	2	6	1430977	1430982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729438
31088	NC_022545	CAG	2	6	1430984	1430989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729438
31089	NC_022545	CAA	2	6	1431013	1431018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729438
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31097	NC_022545	GTG	2	6	1431536	1431541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729439
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31099	NC_022545	TCG	2	6	1431548	1431553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729439
31100	NC_022545	GGA	2	6	1431561	1431566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729439
31101	NC_022545	GGA	2	6	1431642	1431647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729439
31102	NC_022545	TCT	2	6	1431690	1431695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729439
31103	NC_022545	GCCGCA	2	12	1431703	1431714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729439
31104	NC_022545	ATC	2	6	1431794	1431799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729439
31105	NC_022545	GCA	2	6	1431875	1431880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729439
31106	NC_022545	GCT	2	6	1431927	1431932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729439
31107	NC_022545	CTT	2	6	1431945	1431950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729439
31108	NC_022545	T	6	6	1431963	1431968	0 %	100 %	0 %	0 %	549729439
31109	NC_022545	CAG	3	9	1431988	1431996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729439
31110	NC_022545	AT	3	6	1432058	1432063	50 %	50 %	0 %	0 %	549729439
31111	NC_022545	GC	3	6	1432066	1432071	0 %	0 %	50 %	50 %	549729439
31112	NC_022545	CGGC	2	8	1432080	1432087	0 %	0 %	50 %	50 %	549729439
31113	NC_022545	TGG	2	6	1432121	1432126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729439
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31115	NC_022545	TTA	2	6	1432281	1432286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729439
31116	NC_022545	GGC	2	6	1432362	1432367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729439
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31143	NC_022545	TCG	2	6	1433692	1433697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729440
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31170	NC_022545	CCGT	2	8	1434916	1434923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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31205	NC_022545	CA	4	8	1436201	1436208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31206	NC_022545	TGAA	2	8	1436222	1436229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31207	NC_022545	GCT	2	6	1436336	1436341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729443
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31223	NC_022545	AGC	2	6	1436956	1436961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729444
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31228	NC_022545	GGC	2	6	1437207	1437212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729444
31229	NC_022545	GGAT	2	8	1437236	1437243	25 %	25 %	50 %	0 %	549729444
31230	NC_022545	ATC	3	9	1437282	1437290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729444
31231	NC_022545	TGGA	2	8	1437381	1437388	25 %	25 %	50 %	0 %	549729444
31232	NC_022545	GCT	2	6	1437392	1437397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729444
31233	NC_022545	TGC	2	6	1437416	1437421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729444
31234	NC_022545	TGA	2	6	1437527	1437532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729444
31235	NC_022545	TGAC	2	8	1437556	1437563	25 %	25 %	25 %	25 %	549729444
31236	NC_022545	TGG	2	6	1437565	1437570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729444
31237	NC_022545	ATG	2	6	1437580	1437585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729444
31238	NC_022545	CCT	2	6	1437617	1437622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729444
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31243	NC_022545	CCA	2	6	1437757	1437762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729444
31244	NC_022545	GCA	2	6	1437770	1437775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729444
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31248	NC_022545	GCG	2	6	1437864	1437869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729444
31249	NC_022545	GCC	2	6	1437884	1437889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729444
31250	NC_022545	TCAT	2	8	1437916	1437923	25 %	50 %	0 %	25 %	549729444
31251	NC_022545	GC	3	6	1437948	1437953	0 %	0 %	50 %	50 %	549729444
31252	NC_022545	GA	3	6	1437980	1437985	50 %	0 %	50 %	0 %	549729444
31253	NC_022545	AGG	2	6	1438058	1438063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729444
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31256	NC_022545	A	6	6	1438157	1438162	100 %	0 %	0 %	0 %	549729444
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31259	NC_022545	CG	3	6	1438301	1438306	0 %	0 %	50 %	50 %	549729444
31260	NC_022545	CTG	2	6	1438434	1438439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729444
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31294	NC_022545	CCA	2	6	1439786	1439791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31295	NC_022545	TGG	2	6	1439801	1439806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31297	NC_022545	TTC	2	6	1439899	1439904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31299	NC_022545	CAGG	2	8	1439963	1439970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31300	NC_022545	GCG	2	6	1440001	1440006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729446
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31321	NC_022545	AGG	2	6	1441111	1441116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31332	NC_022545	CATG	2	8	1441797	1441804	25 %	25 %	25 %	25 %	549729447
31333	NC_022545	AATC	2	8	1441841	1441848	50 %	25 %	0 %	25 %	549729447
31334	NC_022545	ATC	2	6	1441891	1441896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729447
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31342	NC_022545	GT	3	6	1442379	1442384	0 %	50 %	50 %	0 %	549729448
31343	NC_022545	TTC	2	6	1442432	1442437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729448
31344	NC_022545	CATT	2	8	1442496	1442503	25 %	50 %	0 %	25 %	549729448
31345	NC_022545	GCT	2	6	1442507	1442512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729448
31346	NC_022545	CTGGAC	2	12	1442560	1442571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549729448
31347	NC_022545	GGGGGC	2	12	1442620	1442631	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	549729448
31348	NC_022545	CGT	2	6	1442632	1442637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729448
31349	NC_022545	TCGT	2	8	1442642	1442649	0 %	50 %	25 %	25 %	549729448
31350	NC_022545	CTT	2	6	1442657	1442662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729448
31351	NC_022545	GTG	2	6	1442685	1442690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729448
31352	NC_022545	GTC	2	6	1442711	1442716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729448
31353	NC_022545	TCT	2	6	1442757	1442762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729448
31354	NC_022545	ATTC	2	8	1442827	1442834	25 %	50 %	0 %	25 %	549729448
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31373	NC_022545	CTGG	2	8	1443523	1443530	0 %	25 %	50 %	25 %	549729448
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31418	NC_022545	GTT	2	6	1445733	1445738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31421	NC_022545	CTGA	2	8	1445784	1445791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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31442	NC_022545	GCG	2	6	1446897	1446902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31443	NC_022545	GCCT	2	8	1446930	1446937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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31449	NC_022545	A	6	6	1447096	1447101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31450	NC_022545	GCCC	2	8	1447144	1447151	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31451	NC_022545	CTC	2	6	1447156	1447161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31454	NC_022545	GGA	2	6	1447230	1447235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31495	NC_022545	GTC	2	6	1449097	1449102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729452
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31499	NC_022545	GC	4	8	1449276	1449283	0 %	0 %	50 %	50 %	549729453
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