MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_022545	GAC	2	6	1402003	1402008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30503	NC_022545	GCG	2	6	1402050	1402055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729412
30504	NC_022545	CCG	2	6	1402146	1402151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729412
30505	NC_022545	GCC	2	6	1402160	1402165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729412
30506	NC_022545	CAA	2	6	1402189	1402194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729412
30507	NC_022545	GAA	2	6	1402235	1402240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729412
30508	NC_022545	CCG	2	6	1402242	1402247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729412
30509	NC_022545	ATCTCC	2	12	1402311	1402322	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549729412
30510	NC_022545	CG	3	6	1402363	1402368	0 %	0 %	50 %	50 %	549729412
30511	NC_022545	CCGGTG	2	12	1402392	1402403	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549729412
30512	NC_022545	GTA	2	6	1402412	1402417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729412
30513	NC_022545	AG	3	6	1402472	1402477	50 %	0 %	50 %	0 %	549729412
30514	NC_022545	CGG	2	6	1402501	1402506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729412
30515	NC_022545	GAC	2	6	1402517	1402522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30516	NC_022545	GAA	2	6	1402619	1402624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729412
30517	NC_022545	TAT	2	6	1402633	1402638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729412
30518	NC_022545	CGT	2	6	1402678	1402683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30519	NC_022545	AGC	2	6	1402704	1402709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30520	NC_022545	GC	3	6	1402930	1402935	0 %	0 %	50 %	50 %	549729412
30521	NC_022545	GTC	2	6	1402943	1402948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30522	NC_022545	CTGT	2	8	1402971	1402978	0 %	50 %	25 %	25 %	549729412
30523	NC_022545	CG	3	6	1403026	1403031	0 %	0 %	50 %	50 %	549729412
30524	NC_022545	CTT	2	6	1403122	1403127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729412
30525	NC_022545	GGT	2	6	1403299	1403304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729412
30526	NC_022545	CTG	2	6	1403328	1403333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729412
30527	NC_022545	TCG	2	6	1403393	1403398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30528	NC_022545	TCCC	2	8	1403428	1403435	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30529	NC_022545	GAGT	2	8	1403483	1403490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30530	NC_022545	GACA	2	8	1403507	1403514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30531	NC_022545	TCC	2	6	1403642	1403647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729413
30532	NC_022545	GACCG	2	10	1403674	1403683	20 %	0 %	40 %	40 %	549729413
30533	NC_022545	GAC	2	6	1403742	1403747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729413
30534	NC_022545	GC	3	6	1403771	1403776	0 %	0 %	50 %	50 %	549729413
30535	NC_022545	CCA	2	6	1403859	1403864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30536	NC_022545	CGC	2	6	1403881	1403886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30537	NC_022545	TTG	2	6	1403911	1403916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30538	NC_022545	CGG	2	6	1403988	1403993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30539	NC_022545	AGC	2	6	1403995	1404000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30540	NC_022545	GT	3	6	1404005	1404010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30541	NC_022545	ACG	2	6	1404042	1404047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30542	NC_022545	CGG	2	6	1404048	1404053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30543	NC_022545	GAT	2	6	1404093	1404098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_022545	CGG	2	6	1404106	1404111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30545	NC_022545	GGAT	2	8	1404223	1404230	25 %	25 %	50 %	0 %	549729414
30546	NC_022545	GCC	2	6	1404257	1404262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729414
30547	NC_022545	TTCT	2	8	1404317	1404324	0 %	75 %	0 %	25 %	549729414
30548	NC_022545	ACG	2	6	1404346	1404351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729414
30549	NC_022545	GCT	2	6	1404388	1404393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729414
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30551	NC_022545	GCTT	2	8	1404527	1404534	0 %	50 %	25 %	25 %	549729414
30552	NC_022545	GAT	2	6	1404575	1404580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729414
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30555	NC_022545	CG	3	6	1404808	1404813	0 %	0 %	50 %	50 %	549729414
30556	NC_022545	GC	4	8	1404949	1404956	0 %	0 %	50 %	50 %	549729414
30557	NC_022545	GTT	2	6	1404975	1404980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30558	NC_022545	TC	3	6	1405069	1405074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30559	NC_022545	CGA	2	6	1405169	1405174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729415
30560	NC_022545	TCA	2	6	1405285	1405290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729415
30561	NC_022545	TGC	2	6	1405304	1405309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729415
30562	NC_022545	CGCAA	2	10	1405324	1405333	40 %	0 %	20 %	40 %	549729415
30563	NC_022545	GCA	2	6	1405407	1405412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729415
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30565	NC_022545	CCG	2	6	1405555	1405560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729415
30566	NC_022545	GTC	2	6	1405567	1405572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729415
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30568	NC_022545	CTG	2	6	1405681	1405686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729415
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30579	NC_022545	TGA	2	6	1406297	1406302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729416
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30588	NC_022545	GCC	2	6	1406954	1406959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30589	NC_022545	GGC	2	6	1406972	1406977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729417
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30602	NC_022545	TGTC	2	8	1407537	1407544	0 %	50 %	25 %	25 %	549729417
30603	NC_022545	GAT	2	6	1407565	1407570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729417
30604	NC_022545	GC	3	6	1407623	1407628	0 %	0 %	50 %	50 %	549729417
30605	NC_022545	GAG	2	6	1407731	1407736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729417
30606	NC_022545	CTT	2	6	1407753	1407758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729417
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30610	NC_022545	CCTT	2	8	1407899	1407906	0 %	50 %	0 %	50 %	549729417
30611	NC_022545	CGC	2	6	1408200	1408205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729417
30612	NC_022545	ACC	2	6	1408259	1408264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729417
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30614	NC_022545	GAT	2	6	1408386	1408391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729417
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30616	NC_022545	GCCT	2	8	1408528	1408535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30617	NC_022545	CGA	2	6	1408589	1408594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729418
30618	NC_022545	TGT	2	6	1408704	1408709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729418
30619	NC_022545	TGA	2	6	1408717	1408722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729418
30620	NC_022545	CGG	2	6	1408732	1408737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729418
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30731	NC_022545	CGTT	2	8	1414438	1414445	0 %	50 %	25 %	25 %	549729423
30732	NC_022545	TTG	2	6	1414478	1414483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729423
30733	NC_022545	CTC	2	6	1414517	1414522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729423
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30968	NC_022545	CCT	2	6	1425037	1425042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30970	NC_022545	AT	3	6	1425115	1425120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30971	NC_022545	GAG	2	6	1425134	1425139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30972	NC_022545	TGG	2	6	1425145	1425150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729433
30973	NC_022545	TGGTG	2	10	1425263	1425272	0 %	40 %	60 %	0 %	549729433
30974	NC_022545	TGC	2	6	1425308	1425313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729433
30975	NC_022545	GCGT	2	8	1425317	1425324	0 %	25 %	50 %	25 %	549729433
30976	NC_022545	GCT	2	6	1425326	1425331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729433
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30980	NC_022545	GCCGC	2	10	1425418	1425427	0 %	0 %	40 %	60 %	549729433
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30982	NC_022545	TCGG	2	8	1425471	1425478	0 %	25 %	50 %	25 %	549729433
30983	NC_022545	ATC	2	6	1425543	1425548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729433
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30986	NC_022545	GCCG	2	8	1425653	1425660	0 %	0 %	50 %	50 %	549729433
30987	NC_022545	ATC	2	6	1425678	1425683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729433
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30992	NC_022545	CG	3	6	1425960	1425965	0 %	0 %	50 %	50 %	549729433
30993	NC_022545	GGC	2	6	1425986	1425991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729433
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30999	NC_022545	TCA	2	6	1426290	1426295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729434
31000	NC_022545	CTG	2	6	1426301	1426306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729434

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