MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_022545	GAT	2	6	1329420	1329425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729353
29003	NC_022545	CGG	2	6	1329437	1329442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
29004	NC_022545	TGA	2	6	1329443	1329448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729353
29005	NC_022545	GC	3	6	1329503	1329508	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
29006	NC_022545	GCAG	2	8	1329548	1329555	25 %	0 %	50 %	25 %	549729353
29007	NC_022545	CGA	2	6	1329617	1329622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729353
29008	NC_022545	CGA	2	6	1329647	1329652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729353
29009	NC_022545	GCC	2	6	1329666	1329671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729353
29010	NC_022545	CGGC	2	8	1329715	1329722	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
29011	NC_022545	GCG	2	6	1329785	1329790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
29012	NC_022545	CGA	2	6	1329794	1329799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729353
29013	NC_022545	TGC	2	6	1329801	1329806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729353
29014	NC_022545	GCG	2	6	1329896	1329901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
29015	NC_022545	CGG	2	6	1329908	1329913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
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29017	NC_022545	GAC	2	6	1330002	1330007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729353
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29019	NC_022545	GCCG	2	8	1330026	1330033	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
29020	NC_022545	GC	3	6	1330044	1330049	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
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29024	NC_022545	GC	3	6	1330198	1330203	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
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29028	NC_022545	TCGGT	2	10	1330274	1330283	0 %	40 %	40 %	20 %	549729353
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29088	NC_022545	A	6	6	1332737	1332742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29089	NC_022545	CGTT	2	8	1332763	1332770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29090	NC_022545	CTC	2	6	1332785	1332790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29091	NC_022545	GC	3	6	1332794	1332799	0 %	0 %	50 %	50 %	549729355
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29099	NC_022545	GTC	2	6	1333241	1333246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729355
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29101	NC_022545	TCTG	2	8	1333332	1333339	0 %	50 %	25 %	25 %	549729355
29102	NC_022545	CAT	2	6	1333355	1333360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729355
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29104	NC_022545	CAT	2	6	1333455	1333460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729356
29105	NC_022545	CCGC	2	8	1333488	1333495	0 %	0 %	25 %	75 %	549729356
29106	NC_022545	G	6	6	1333512	1333517	0 %	0 %	100 %	0 %	549729356
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29108	NC_022545	A	7	7	1333608	1333614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29109	NC_022545	GGT	2	6	1333622	1333627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29110	NC_022545	T	7	7	1333635	1333641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29111	NC_022545	CGCAC	2	10	1333722	1333731	20 %	0 %	20 %	60 %	549729357
29112	NC_022545	CG	3	6	1333752	1333757	0 %	0 %	50 %	50 %	549729357
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29116	NC_022545	GCC	2	6	1333974	1333979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729357
29117	NC_022545	TCC	2	6	1333997	1334002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729357
29118	NC_022545	GAG	2	6	1334014	1334019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729357
29119	NC_022545	CGA	2	6	1334082	1334087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729357
29120	NC_022545	ATC	2	6	1334131	1334136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729357
29121	NC_022545	CGCA	2	8	1334212	1334219	25 %	0 %	25 %	50 %	549729357
29122	NC_022545	GAT	2	6	1334259	1334264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729357
29123	NC_022545	CGATG	2	10	1334304	1334313	20 %	20 %	40 %	20 %	549729357
29124	NC_022545	ACC	2	6	1334332	1334337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729357
29125	NC_022545	TCA	2	6	1334351	1334356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729357
29126	NC_022545	TCA	2	6	1334447	1334452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729357
29127	NC_022545	CG	3	6	1334480	1334485	0 %	0 %	50 %	50 %	549729357
29128	NC_022545	CT	3	6	1334529	1334534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29129	NC_022545	CCTTG	2	10	1334661	1334670	0 %	40 %	20 %	40 %	549729358
29130	NC_022545	TGA	2	6	1334775	1334780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729358
29131	NC_022545	AAGA	2	8	1334824	1334831	75 %	0 %	25 %	0 %	549729358
29132	NC_022545	TGA	2	6	1334936	1334941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729358
29133	NC_022545	ACC	2	6	1334944	1334949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729358
29134	NC_022545	CGG	2	6	1334963	1334968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729358
29135	NC_022545	CGTT	2	8	1334992	1334999	0 %	50 %	25 %	25 %	549729358
29136	NC_022545	AGTC	2	8	1335009	1335016	25 %	25 %	25 %	25 %	549729358
29137	NC_022545	ATC	2	6	1335040	1335045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729358
29138	NC_022545	GAT	2	6	1335088	1335093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729358
29139	NC_022545	TCA	2	6	1335146	1335151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729358
29140	NC_022545	CCGATT	2	12	1335152	1335163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549729358
29141	NC_022545	G	6	6	1335167	1335172	0 %	0 %	100 %	0 %	549729358
29142	NC_022545	GCT	2	6	1335186	1335191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729358
29143	NC_022545	CTG	2	6	1335256	1335261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729358
29144	NC_022545	GC	3	6	1335275	1335280	0 %	0 %	50 %	50 %	549729358
29145	NC_022545	TTG	2	6	1335308	1335313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729358
29146	NC_022545	AGG	2	6	1335377	1335382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729358
29147	NC_022545	TA	3	6	1335391	1335396	50 %	50 %	0 %	0 %	549729358
29148	NC_022545	CGT	2	6	1335465	1335470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729358
29149	NC_022545	GGT	2	6	1335480	1335485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729358
29150	NC_022545	GGA	2	6	1335499	1335504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729358
29151	NC_022545	ACGC	2	8	1335586	1335593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29152	NC_022545	CGGA	2	8	1335597	1335604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29153	NC_022545	GCC	2	6	1335612	1335617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29154	NC_022545	AGA	2	6	1335627	1335632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29155	NC_022545	A	6	6	1335637	1335642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29156	NC_022545	AG	4	8	1335652	1335659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29157	NC_022545	AC	3	6	1335757	1335762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29158	NC_022545	T	6	6	1335794	1335799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29159	NC_022545	TTAG	2	8	1335836	1335843	25 %	50 %	25 %	0 %	549729359
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29182	NC_022545	TGC	2	6	1337176	1337181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729359
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29195	NC_022545	CCG	2	6	1337759	1337764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29196	NC_022545	AAGG	2	8	1337783	1337790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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29211	NC_022545	ACTG	2	8	1338460	1338467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29212	NC_022545	CGA	2	6	1338488	1338493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729361
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29222	NC_022545	CG	3	6	1338805	1338810	0 %	0 %	50 %	50 %	549729361
29223	NC_022545	GCCG	2	8	1338847	1338854	0 %	0 %	50 %	50 %	549729361
29224	NC_022545	GCA	2	6	1338952	1338957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729361
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29229	NC_022545	GTT	2	6	1339172	1339177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729361
29230	NC_022545	GCT	2	6	1339195	1339200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729361
29231	NC_022545	CCGG	2	8	1339249	1339256	0 %	0 %	50 %	50 %	549729361
29232	NC_022545	GA	3	6	1339347	1339352	50 %	0 %	50 %	0 %	549729361
29233	NC_022545	ACG	2	6	1339362	1339367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729361
29234	NC_022545	AG	3	6	1339385	1339390	50 %	0 %	50 %	0 %	549729361
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29236	NC_022545	CGA	2	6	1339429	1339434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729361
29237	NC_022545	TCT	2	6	1339444	1339449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729361
29238	NC_022545	TCA	2	6	1339450	1339455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729361
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29241	NC_022545	A	8	8	1339565	1339572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29242	NC_022545	AAG	2	6	1339619	1339624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29351	NC_022545	GAAT	2	8	1344710	1344717	50 %	25 %	25 %	0 %	549729366
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29470	NC_022545	GTC	2	6	1350556	1350561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729370
29471	NC_022545	TGA	2	6	1350584	1350589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729370
29472	NC_022545	GAG	2	6	1350613	1350618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729370
29473	NC_022545	CGG	2	6	1350654	1350659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729370
29474	NC_022545	GCT	2	6	1350768	1350773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729370
29475	NC_022545	GCCT	2	8	1350774	1350781	0 %	25 %	25 %	50 %	549729370
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29477	NC_022545	CGG	2	6	1350875	1350880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729370
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29480	NC_022545	A	6	6	1350992	1350997	100 %	0 %	0 %	0 %	549729370
29481	NC_022545	TA	3	6	1351036	1351041	50 %	50 %	0 %	0 %	549729370
29482	NC_022545	TCG	2	6	1351052	1351057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729370
29483	NC_022545	TCA	2	6	1351080	1351085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729370
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29488	NC_022545	GAC	2	6	1351314	1351319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29489	NC_022545	T	6	6	1351335	1351340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29490	NC_022545	AAAAG	2	10	1351361	1351370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29491	NC_022545	GCA	2	6	1351544	1351549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29492	NC_022545	GTC	2	6	1351562	1351567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29493	NC_022545	AAC	2	6	1351664	1351669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29494	NC_022545	TGA	2	6	1351705	1351710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729371
29495	NC_022545	ACA	3	9	1351750	1351758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729371
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29497	NC_022545	TGG	2	6	1351766	1351771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729371
29498	NC_022545	AAC	3	9	1351776	1351784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729371
29499	NC_022545	GC	3	6	1351893	1351898	0 %	0 %	50 %	50 %	549729371
29500	NC_022545	GCA	2	6	1351943	1351948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729371

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