MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28503	NC_022545	CTG	2	6	1307057	1307062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28504	NC_022545	GT	3	6	1307089	1307094	0 %	50 %	50 %	0 %	549729330
28505	NC_022545	CGG	2	6	1307148	1307153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28506	NC_022545	CGA	2	6	1307178	1307183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28507	NC_022545	TCG	2	6	1307189	1307194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28508	NC_022545	CGA	2	6	1307229	1307234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28509	NC_022545	GCA	2	6	1307262	1307267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28510	NC_022545	GGC	2	6	1307320	1307325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28511	NC_022545	CT	3	6	1307347	1307352	0 %	50 %	0 %	50 %	549729330
28512	NC_022545	GCG	2	6	1307360	1307365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28513	NC_022545	GC	3	6	1307423	1307428	0 %	0 %	50 %	50 %	549729330
28514	NC_022545	GTC	2	6	1307437	1307442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28515	NC_022545	TCC	2	6	1307507	1307512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729330
28516	NC_022545	GAA	2	6	1307517	1307522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729330
28517	NC_022545	CG	4	8	1307524	1307531	0 %	0 %	50 %	50 %	549729330
28518	NC_022545	ATC	2	6	1307570	1307575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729330
28519	NC_022545	GCG	2	6	1307592	1307597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28520	NC_022545	TGC	3	9	1307634	1307642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729330
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28522	NC_022545	GC	3	6	1307712	1307717	0 %	0 %	50 %	50 %	549729330
28523	NC_022545	TGA	2	6	1307908	1307913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729331
28524	NC_022545	GAA	2	6	1307942	1307947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729331
28525	NC_022545	CG	3	6	1307962	1307967	0 %	0 %	50 %	50 %	549729331
28526	NC_022545	GCC	2	6	1308014	1308019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729331
28527	NC_022545	CTG	2	6	1308023	1308028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729331
28528	NC_022545	ACCTGC	2	12	1308042	1308053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549729331
28529	NC_022545	GCC	2	6	1308054	1308059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729331
28530	NC_022545	GTC	2	6	1308060	1308065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729331
28531	NC_022545	GA	3	6	1308069	1308074	50 %	0 %	50 %	0 %	549729331
28532	NC_022545	CGT	2	6	1308148	1308153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729331
28533	NC_022545	CGA	2	6	1308202	1308207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729331
28534	NC_022545	GT	3	6	1308264	1308269	0 %	50 %	50 %	0 %	549729331
28535	NC_022545	ATG	2	6	1308291	1308296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729331
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28539	NC_022545	CATG	2	8	1308539	1308546	25 %	25 %	25 %	25 %	549729332
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28542	NC_022545	CACC	2	8	1308653	1308660	25 %	0 %	0 %	75 %	549729332
28543	NC_022545	CAT	2	6	1308663	1308668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729332
28544	NC_022545	GCTG	2	8	1308746	1308753	0 %	25 %	50 %	25 %	549729332
28545	NC_022545	CAG	2	6	1308849	1308854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729332
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28549	NC_022545	GCC	2	6	1309001	1309006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729332
28550	NC_022545	TCA	2	6	1309046	1309051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729332
28551	NC_022545	GGGCA	2	10	1309056	1309065	20 %	0 %	60 %	20 %	549729332
28552	NC_022545	CCG	2	6	1309079	1309084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729332
28553	NC_022545	AGGTCG	2	12	1309144	1309155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549729332
28554	NC_022545	GCT	2	6	1309203	1309208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729333
28555	NC_022545	GCC	2	6	1309456	1309461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28556	NC_022545	CCGG	2	8	1309556	1309563	0 %	0 %	50 %	50 %	549729334
28557	NC_022545	A	6	6	1309616	1309621	100 %	0 %	0 %	0 %	549729334
28558	NC_022545	TGG	2	6	1309679	1309684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729334
28559	NC_022545	TGC	2	6	1309833	1309838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729334
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28581	NC_022545	TGTGC	2	10	1310962	1310971	0 %	40 %	40 %	20 %	549729334
28582	NC_022545	TTA	2	6	1310980	1310985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729334
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28584	NC_022545	CTGGC	2	10	1311047	1311056	0 %	20 %	40 %	40 %	549729334
28585	NC_022545	ATC	2	6	1311080	1311085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729334
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28587	NC_022545	CGG	2	6	1311315	1311320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729334
28588	NC_022545	CTG	2	6	1311326	1311331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729334
28589	NC_022545	GCA	2	6	1311370	1311375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729334
28590	NC_022545	CAA	2	6	1311394	1311399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28591	NC_022545	TCG	2	6	1311416	1311421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28592	NC_022545	T	8	8	1311481	1311488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28593	NC_022545	GCGGCC	2	12	1311547	1311558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28594	NC_022545	GGC	2	6	1311561	1311566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28595	NC_022545	CGA	2	6	1311577	1311582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28596	NC_022545	TGAT	2	8	1311599	1311606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28597	NC_022545	A	6	6	1311640	1311645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28598	NC_022545	TAAAA	2	10	1311650	1311659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28599	NC_022545	A	6	6	1311656	1311661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28600	NC_022545	AATT	2	8	1311681	1311688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28601	NC_022545	GAT	2	6	1311818	1311823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729335
28602	NC_022545	CAC	2	6	1311968	1311973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729335
28603	NC_022545	AGA	2	6	1312048	1312053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729335
28604	NC_022545	GCC	2	6	1312062	1312067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729335
28605	NC_022545	GCCA	2	8	1312110	1312117	25 %	0 %	25 %	50 %	549729335
28606	NC_022545	GCT	2	6	1312139	1312144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729335
28607	NC_022545	GTTCG	2	10	1312213	1312222	0 %	40 %	40 %	20 %	549729335
28608	NC_022545	GGT	2	6	1312287	1312292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729335
28609	NC_022545	T	7	7	1312331	1312337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28610	NC_022545	AGC	2	6	1312366	1312371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28611	NC_022545	AGC	2	6	1312410	1312415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28612	NC_022545	GCA	2	6	1312427	1312432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28613	NC_022545	CAT	2	6	1312460	1312465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729336
28614	NC_022545	GGC	2	6	1312581	1312586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729336
28615	NC_022545	CA	3	6	1312594	1312599	50 %	0 %	0 %	50 %	549729336
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28617	NC_022545	AAC	2	6	1312643	1312648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729336
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28968	NC_022545	CGA	2	6	1327803	1327808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729352
28969	NC_022545	ATG	2	6	1327847	1327852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729352
28970	NC_022545	TCT	2	6	1327867	1327872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729352
28971	NC_022545	GGC	2	6	1327933	1327938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729352
28972	NC_022545	CGG	2	6	1328014	1328019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729352
28973	NC_022545	AGC	2	6	1328025	1328030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729352
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28975	NC_022545	ATG	2	6	1328184	1328189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729352
28976	NC_022545	GTC	2	6	1328222	1328227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729352
28977	NC_022545	CGC	2	6	1328279	1328284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729352
28978	NC_022545	CGG	2	6	1328292	1328297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729352
28979	NC_022545	TAA	2	6	1328360	1328365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729352
28980	NC_022545	GCC	2	6	1328393	1328398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28981	NC_022545	TCA	2	6	1328417	1328422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729353
28982	NC_022545	GCC	2	6	1328433	1328438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729353
28983	NC_022545	GCG	2	6	1328440	1328445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
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28985	NC_022545	CCA	2	6	1328474	1328479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729353
28986	NC_022545	GGCT	2	8	1328497	1328504	0 %	25 %	50 %	25 %	549729353
28987	NC_022545	CG	3	6	1328810	1328815	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
28988	NC_022545	TC	3	6	1328835	1328840	0 %	50 %	0 %	50 %	549729353
28989	NC_022545	GCCT	2	8	1328893	1328900	0 %	25 %	25 %	50 %	549729353
28990	NC_022545	CGG	2	6	1328957	1328962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729353
28991	NC_022545	CTG	2	6	1328970	1328975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729353
28992	NC_022545	GCCC	2	8	1329032	1329039	0 %	0 %	25 %	75 %	549729353
28993	NC_022545	CGCC	2	8	1329067	1329074	0 %	0 %	25 %	75 %	549729353
28994	NC_022545	ACC	2	6	1329091	1329096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729353
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28996	NC_022545	CG	3	6	1329140	1329145	0 %	0 %	50 %	50 %	549729353
28997	NC_022545	ATCGT	2	10	1329160	1329169	20 %	40 %	20 %	20 %	549729353
28998	NC_022545	TCG	2	6	1329220	1329225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729353
28999	NC_022545	GCA	2	6	1329266	1329271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729353
29000	NC_022545	GAT	2	6	1329318	1329323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729353

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