MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_022545	TGG	2	6	1284598	1284603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729308
28004	NC_022545	GTT	2	6	1284604	1284609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729308
28005	NC_022545	CTG	2	6	1284718	1284723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28006	NC_022545	CGCCAC	2	12	1284750	1284761	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549729309
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28008	NC_022545	TCG	2	6	1284824	1284829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28009	NC_022545	CTG	2	6	1284877	1284882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28010	NC_022545	CGA	2	6	1284893	1284898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729309
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28012	NC_022545	CTG	2	6	1284934	1284939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28013	NC_022545	CGC	2	6	1284947	1284952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729309
28014	NC_022545	CGGT	2	8	1285031	1285038	0 %	25 %	50 %	25 %	549729309
28015	NC_022545	GCG	2	6	1285079	1285084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729309
28016	NC_022545	CG	3	6	1285099	1285104	0 %	0 %	50 %	50 %	549729309
28017	NC_022545	CGGG	2	8	1285175	1285182	0 %	0 %	75 %	25 %	549729309
28018	NC_022545	TGA	2	6	1285196	1285201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729309
28019	NC_022545	CGA	2	6	1285242	1285247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28020	NC_022545	CGA	2	6	1285250	1285255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28021	NC_022545	CTG	2	6	1285294	1285299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
28022	NC_022545	GAA	2	6	1285312	1285317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729309
28023	NC_022545	ATGGC	2	10	1285319	1285328	20 %	20 %	40 %	20 %	549729309
28024	NC_022545	TCA	2	6	1285337	1285342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729309
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28033	NC_022545	CAT	2	6	1285721	1285726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729310
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28052	NC_022545	CGTC	2	8	1286898	1286905	0 %	25 %	25 %	50 %	549729311
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28096	NC_022545	GGA	2	6	1288814	1288819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28097	NC_022545	TCC	2	6	1288934	1288939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28098	NC_022545	CCG	2	6	1288984	1288989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729313
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28103	NC_022545	CGAT	2	8	1289299	1289306	25 %	25 %	25 %	25 %	549729313
28104	NC_022545	CT	3	6	1289311	1289316	0 %	50 %	0 %	50 %	549729313
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28116	NC_022545	GAG	2	6	1289658	1289663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729313
28117	NC_022545	GC	3	6	1289703	1289708	0 %	0 %	50 %	50 %	549729313
28118	NC_022545	AGC	2	6	1289737	1289742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729313
28119	NC_022545	CGTTC	2	10	1289758	1289767	0 %	40 %	20 %	40 %	549729313
28120	NC_022545	GGC	2	6	1289820	1289825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729313
28121	NC_022545	AT	3	6	1289834	1289839	50 %	50 %	0 %	0 %	549729313
28122	NC_022545	GCCT	2	8	1289869	1289876	0 %	25 %	25 %	50 %	549729313
28123	NC_022545	GTGCAT	2	12	1289907	1289918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549729313
28124	NC_022545	AT	3	6	1289954	1289959	50 %	50 %	0 %	0 %	549729313
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28128	NC_022545	CG	3	6	1290065	1290070	0 %	0 %	50 %	50 %	549729313
28129	NC_022545	AGC	2	6	1290093	1290098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28130	NC_022545	TCC	2	6	1290134	1290139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28131	NC_022545	GAT	2	6	1290259	1290264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28132	NC_022545	GCCA	2	8	1290285	1290292	25 %	0 %	25 %	50 %	549729314
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28136	NC_022545	GTC	2	6	1290496	1290501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
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28140	NC_022545	CTG	2	6	1290640	1290645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
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28181	NC_022545	GTGGC	2	10	1292250	1292259	0 %	20 %	60 %	20 %	549729315
28182	NC_022545	GGC	2	6	1292276	1292281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729315
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28187	NC_022545	GAG	2	6	1292555	1292560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729316
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28229	NC_022545	CG	3	6	1294545	1294550	0 %	0 %	50 %	50 %	549729318
28230	NC_022545	GGA	2	6	1294573	1294578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729318
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28232	NC_022545	CAT	2	6	1294733	1294738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729319
28233	NC_022545	CAT	2	6	1294742	1294747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729319
28234	NC_022545	CCGCAA	2	12	1294748	1294759	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549729319
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28348	NC_022545	AGG	2	6	1299615	1299620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729323
28349	NC_022545	TGC	3	9	1299655	1299663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729323
28350	NC_022545	GAC	2	6	1299689	1299694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729323
28351	NC_022545	GGGC	2	8	1299700	1299707	0 %	0 %	75 %	25 %	549729323
28352	NC_022545	TGC	2	6	1299732	1299737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729323
28353	NC_022545	GAGCA	2	10	1299742	1299751	40 %	0 %	40 %	20 %	549729323
28354	NC_022545	GCC	2	6	1299757	1299762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729324
28355	NC_022545	AG	3	6	1299795	1299800	50 %	0 %	50 %	0 %	549729324
28356	NC_022545	GCC	2	6	1299859	1299864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729324
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28358	NC_022545	CTG	2	6	1299880	1299885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729324
28359	NC_022545	TCGA	2	8	1299892	1299899	25 %	25 %	25 %	25 %	549729324
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28362	NC_022545	CGA	2	6	1299983	1299988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729324
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28377	NC_022545	CGGC	2	8	1300785	1300792	0 %	0 %	50 %	50 %	549729324
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28414	NC_022545	ATTTC	2	10	1303014	1303023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28415	NC_022545	TCAT	2	8	1303050	1303057	25 %	50 %	0 %	25 %	549729327
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28450	NC_022545	AGC	2	6	1305235	1305240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729327
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28452	NC_022545	CGG	2	6	1305263	1305268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729327
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28454	NC_022545	GCGG	2	8	1305327	1305334	0 %	0 %	75 %	25 %	549729327
28455	NC_022545	ACG	2	6	1305403	1305408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28456	NC_022545	A	6	6	1305414	1305419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28457	NC_022545	CTT	2	6	1305478	1305483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729328
28458	NC_022545	CGT	2	6	1305528	1305533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729328
28459	NC_022545	AGC	2	6	1305566	1305571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729328
28460	NC_022545	GAGAC	2	10	1305662	1305671	40 %	0 %	40 %	20 %	549729328
28461	NC_022545	GCG	2	6	1305683	1305688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729328
28462	NC_022545	TCC	2	6	1305701	1305706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729328
28463	NC_022545	GC	3	6	1305764	1305769	0 %	0 %	50 %	50 %	549729328
28464	NC_022545	TTC	2	6	1305820	1305825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729328
28465	NC_022545	GTCG	2	8	1305859	1305866	0 %	25 %	50 %	25 %	549729328
28466	NC_022545	CCGC	2	8	1305867	1305874	0 %	0 %	25 %	75 %	549729328
28467	NC_022545	GTA	2	6	1305913	1305918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729328
28468	NC_022545	GTC	2	6	1305946	1305951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729328
28469	NC_022545	TCT	2	6	1305957	1305962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729328
28470	NC_022545	AAAC	2	8	1306022	1306029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28471	NC_022545	GCT	2	6	1306035	1306040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28472	NC_022545	CGGTT	2	10	1306051	1306060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28473	NC_022545	GAG	2	6	1306130	1306135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28474	NC_022545	AGA	2	6	1306161	1306166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729329
28475	NC_022545	TGC	2	6	1306199	1306204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729329
28476	NC_022545	GCC	2	6	1306309	1306314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729329
28477	NC_022545	TCA	2	6	1306328	1306333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729329
28478	NC_022545	CCAT	2	8	1306334	1306341	25 %	25 %	0 %	50 %	549729329
28479	NC_022545	ATG	2	6	1306342	1306347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729329
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28483	NC_022545	GAC	2	6	1306476	1306481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729329
28484	NC_022545	CGG	2	6	1306502	1306507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729329
28485	NC_022545	CGCT	2	8	1306541	1306548	0 %	25 %	25 %	50 %	549729329
28486	NC_022545	CGC	2	6	1306554	1306559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729329
28487	NC_022545	TCG	2	6	1306571	1306576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729329
28488	NC_022545	TAT	2	6	1306577	1306582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729329
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28490	NC_022545	ATGA	2	8	1306622	1306629	50 %	25 %	25 %	0 %	549729329
28491	NC_022545	GGC	3	9	1306684	1306692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28492	NC_022545	CGG	2	6	1306701	1306706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28493	NC_022545	GCC	2	6	1306732	1306737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729330
28494	NC_022545	GTG	2	6	1306799	1306804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729330
28495	NC_022545	CAG	2	6	1306858	1306863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729330
28496	NC_022545	GCG	2	6	1306876	1306881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729330
28497	NC_022545	TGCC	2	8	1306896	1306903	0 %	25 %	25 %	50 %	549729330
28498	NC_022545	TCCTCG	2	12	1306937	1306948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549729330
28499	NC_022545	CCG	2	6	1306949	1306954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729330
28500	NC_022545	CGGT	2	8	1306973	1306980	0 %	25 %	50 %	25 %	549729330

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