MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_022545	GC	3	6	1129596	1129601	0 %	0 %	50 %	50 %	549729157
24502	NC_022545	TAA	2	6	1129646	1129651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729157
24503	NC_022545	AGAA	2	8	1129652	1129659	75 %	0 %	25 %	0 %	549729157
24504	NC_022545	GCG	2	6	1129674	1129679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729157
24505	NC_022545	ACC	2	6	1129697	1129702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729157
24506	NC_022545	ATC	2	6	1129721	1129726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729157
24507	NC_022545	GCG	2	6	1129738	1129743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729157
24508	NC_022545	CAG	2	6	1129744	1129749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729157
24509	NC_022545	CGG	3	9	1129788	1129796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729157
24510	NC_022545	ATG	2	6	1129829	1129834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729157
24511	NC_022545	GGT	2	6	1129864	1129869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729157
24512	NC_022545	CAT	2	6	1129891	1129896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729157
24513	NC_022545	AGC	2	6	1130009	1130014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24514	NC_022545	GAA	2	6	1130108	1130113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729158
24515	NC_022545	CAT	2	6	1130152	1130157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729158
24516	NC_022545	GGA	2	6	1130251	1130256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729158
24517	NC_022545	GC	3	6	1130259	1130264	0 %	0 %	50 %	50 %	549729158
24518	NC_022545	GCC	2	6	1130287	1130292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729158
24519	NC_022545	AGCACC	2	12	1130306	1130317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549729158
24520	NC_022545	CGT	2	6	1130320	1130325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24521	NC_022545	GATCG	2	10	1130326	1130335	20 %	20 %	40 %	20 %	549729158
24522	NC_022545	ATA	2	6	1130362	1130367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729158
24523	NC_022545	CAG	2	6	1130386	1130391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24524	NC_022545	GAA	3	9	1130470	1130478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729158
24525	NC_022545	CGA	2	6	1130493	1130498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24526	NC_022545	TGC	2	6	1130503	1130508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24527	NC_022545	GAC	2	6	1130527	1130532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729158
24528	NC_022545	ATT	2	6	1130634	1130639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729159
24529	NC_022545	CTT	2	6	1130662	1130667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729159
24530	NC_022545	GTC	2	6	1130728	1130733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729159
24531	NC_022545	CGA	2	6	1130748	1130753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729159
24532	NC_022545	ACC	2	6	1130806	1130811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729159
24533	NC_022545	TTC	2	6	1130986	1130991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729159
24534	NC_022545	GC	3	6	1131005	1131010	0 %	0 %	50 %	50 %	549729159
24535	NC_022545	ACG	2	6	1131038	1131043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729159
24536	NC_022545	GGT	2	6	1131082	1131087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729159
24537	NC_022545	CAG	2	6	1131115	1131120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729159
24538	NC_022545	TGTTC	2	10	1131183	1131192	0 %	60 %	20 %	20 %	549729159
24539	NC_022545	CGG	2	6	1131321	1131326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729159
24540	NC_022545	GGC	2	6	1131373	1131378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729159
24541	NC_022545	CTT	2	6	1131402	1131407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729159
24542	NC_022545	GC	3	6	1131417	1131422	0 %	0 %	50 %	50 %	549729159
24543	NC_022545	AGGGCG	2	12	1131446	1131457	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549729159
24544	NC_022545	CTC	2	6	1131494	1131499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24545	NC_022545	GGTTG	2	10	1131501	1131510	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24546	NC_022545	TGG	2	6	1131541	1131546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24547	NC_022545	TGA	2	6	1131597	1131602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729160
24548	NC_022545	GC	3	6	1131616	1131621	0 %	0 %	50 %	50 %	549729160
24549	NC_022545	AGC	2	6	1131626	1131631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729160
24550	NC_022545	CGT	2	6	1131753	1131758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729160
24551	NC_022545	GCA	2	6	1131849	1131854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729160
24552	NC_022545	ATCG	2	8	1131880	1131887	25 %	25 %	25 %	25 %	549729160
24553	NC_022545	GCC	2	6	1131910	1131915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729160
24554	NC_022545	GGT	2	6	1131922	1131927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729160
24555	NC_022545	GCA	2	6	1132010	1132015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729160
24556	NC_022545	GCC	2	6	1132105	1132110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729160
24557	NC_022545	TCT	2	6	1132173	1132178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729160
24558	NC_022545	ATG	3	9	1132289	1132297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729160
24559	NC_022545	GCC	2	6	1132346	1132351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729160
24560	NC_022545	ATC	2	6	1132433	1132438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729160
24561	NC_022545	TCC	2	6	1132659	1132664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729161
24562	NC_022545	TGA	2	6	1132801	1132806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729161
24563	NC_022545	T	6	6	1132814	1132819	0 %	100 %	0 %	0 %	549729161
24564	NC_022545	A	6	6	1132829	1132834	100 %	0 %	0 %	0 %	549729161
24565	NC_022545	ACG	2	6	1132979	1132984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24566	NC_022545	GAA	2	6	1133003	1133008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729161
24567	NC_022545	GTC	2	6	1133036	1133041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24568	NC_022545	GGAA	2	8	1133075	1133082	50 %	0 %	50 %	0 %	549729161
24569	NC_022545	CGC	2	6	1133107	1133112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729161
24570	NC_022545	ACG	2	6	1133187	1133192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24571	NC_022545	CGA	2	6	1133194	1133199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24572	NC_022545	CGA	2	6	1133218	1133223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24573	NC_022545	TCGG	2	8	1133253	1133260	0 %	25 %	50 %	25 %	549729161
24574	NC_022545	CGG	2	6	1133293	1133298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729161
24575	NC_022545	GCT	2	6	1133346	1133351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24576	NC_022545	ATA	2	6	1133360	1133365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729161
24577	NC_022545	ACCG	2	8	1133381	1133388	25 %	0 %	25 %	50 %	549729161
24578	NC_022545	GAT	2	6	1133414	1133419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729161
24579	NC_022545	ACA	2	6	1133425	1133430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729161
24580	NC_022545	GAT	2	6	1133480	1133485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729161
24581	NC_022545	GGC	2	6	1133565	1133570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729161
24582	NC_022545	CA	3	6	1133576	1133581	50 %	0 %	0 %	50 %	549729161
24583	NC_022545	TGG	2	6	1133583	1133588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729161
24584	NC_022545	GAC	2	6	1133645	1133650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729161
24585	NC_022545	GC	3	6	1133699	1133704	0 %	0 %	50 %	50 %	549729161
24586	NC_022545	CG	3	6	1133716	1133721	0 %	0 %	50 %	50 %	549729161
24587	NC_022545	GAT	2	6	1133773	1133778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729162
24588	NC_022545	CTGC	2	8	1133786	1133793	0 %	25 %	25 %	50 %	549729162
24589	NC_022545	GCCGGT	2	12	1133842	1133853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549729162
24590	NC_022545	TTCG	2	8	1133875	1133882	0 %	50 %	25 %	25 %	549729162
24591	NC_022545	GGC	2	6	1133886	1133891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729162
24592	NC_022545	CTT	2	6	1134096	1134101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729162
24593	NC_022545	CCAG	2	8	1134102	1134109	25 %	0 %	25 %	50 %	549729162
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24595	NC_022545	GAT	2	6	1134151	1134156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729162
24596	NC_022545	GC	3	6	1134161	1134166	0 %	0 %	50 %	50 %	549729162
24597	NC_022545	GCC	2	6	1134173	1134178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729162
24598	NC_022545	CGGA	2	8	1134272	1134279	25 %	0 %	50 %	25 %	549729162
24599	NC_022545	GCCC	2	8	1134331	1134338	0 %	0 %	25 %	75 %	549729162
24600	NC_022545	GACG	2	8	1134352	1134359	25 %	0 %	50 %	25 %	549729162
24601	NC_022545	GCCGC	2	10	1134378	1134387	0 %	0 %	40 %	60 %	549729162
24602	NC_022545	CCA	2	6	1134450	1134455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729162
24603	NC_022545	ATC	2	6	1134479	1134484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729162
24604	NC_022545	GAA	2	6	1134523	1134528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729162
24605	NC_022545	CGC	2	6	1134594	1134599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729162
24606	NC_022545	GGA	2	6	1134621	1134626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729162
24607	NC_022545	CGG	2	6	1134628	1134633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729162
24608	NC_022545	TGG	2	6	1134648	1134653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729162
24609	NC_022545	GC	3	6	1134713	1134718	0 %	0 %	50 %	50 %	549729162
24610	NC_022545	GAT	2	6	1134768	1134773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729163
24611	NC_022545	GAT	2	6	1134813	1134818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729163
24612	NC_022545	GGC	2	6	1134858	1134863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729163
24613	NC_022545	CTG	2	6	1134926	1134931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729163
24614	NC_022545	TCA	2	6	1134961	1134966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729163
24615	NC_022545	CGC	2	6	1135016	1135021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729163
24616	NC_022545	TCC	2	6	1135045	1135050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729163
24617	NC_022545	GCAT	2	8	1135084	1135091	25 %	25 %	25 %	25 %	549729163
24618	NC_022545	CGA	2	6	1135118	1135123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729163
24619	NC_022545	CCGC	2	8	1135165	1135172	0 %	0 %	25 %	75 %	549729163
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24623	NC_022545	GC	3	6	1135379	1135384	0 %	0 %	50 %	50 %	549729163
24624	NC_022545	TTGT	2	8	1135399	1135406	0 %	75 %	25 %	0 %	549729163
24625	NC_022545	TGG	2	6	1135430	1135435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729163
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24634	NC_022545	TCGA	2	8	1135825	1135832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24635	NC_022545	GTT	2	6	1135873	1135878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729164
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24673	NC_022545	CTGG	2	8	1137445	1137452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24674	NC_022545	T	6	6	1137461	1137466	0 %	100 %	0 %	0 %	549729165
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24968	NC_022545	CGA	2	6	1150268	1150273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729177
24969	NC_022545	ACG	2	6	1150351	1150356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729177
24970	NC_022545	TGA	2	6	1150358	1150363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729177
24971	NC_022545	CCT	2	6	1150400	1150405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729177
24972	NC_022545	CGA	2	6	1150451	1150456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729177
24973	NC_022545	CGCTG	2	10	1150523	1150532	0 %	20 %	40 %	40 %	549729177
24974	NC_022545	CGG	3	9	1150553	1150561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729177
24975	NC_022545	T	6	6	1150622	1150627	0 %	100 %	0 %	0 %	549729177
24976	NC_022545	GGC	2	6	1150655	1150660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24977	NC_022545	GA	3	6	1150667	1150672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24978	NC_022545	GGTC	2	8	1150674	1150681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24979	NC_022545	AGCG	2	8	1150790	1150797	25 %	0 %	50 %	25 %	549729178
24980	NC_022545	CTG	2	6	1150818	1150823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729178
24981	NC_022545	ATG	2	6	1150842	1150847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729178
24982	NC_022545	GAG	2	6	1150920	1150925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729178
24983	NC_022545	CCG	2	6	1150945	1150950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729178
24984	NC_022545	GCC	2	6	1150979	1150984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729178
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24986	NC_022545	GTC	2	6	1151162	1151167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729178
24987	NC_022545	TGA	2	6	1151176	1151181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729178
24988	NC_022545	GGC	2	6	1151318	1151323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729178
24989	NC_022545	ACG	2	6	1151339	1151344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729178
24990	NC_022545	GCG	2	6	1151382	1151387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729178
24991	NC_022545	CGGG	2	8	1151397	1151404	0 %	0 %	75 %	25 %	549729178
24992	NC_022545	AGC	2	6	1151460	1151465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729178
24993	NC_022545	GCTTGA	2	12	1151491	1151502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549729178
24994	NC_022545	GTG	2	6	1151520	1151525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729178
24995	NC_022545	CG	3	6	1151540	1151545	0 %	0 %	50 %	50 %	549729178
24996	NC_022545	TGT	2	6	1151628	1151633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24997	NC_022545	ATC	2	6	1151648	1151653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24998	NC_022545	CGAGC	2	10	1151714	1151723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24999	NC_022545	GAA	2	6	1151735	1151740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729179
25000	NC_022545	TTA	2	6	1151750	1151755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729179

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