MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_022545	CCGG	2	8	814137	814144	0 %	0 %	50 %	50 %	549728865
18003	NC_022545	GCAGG	2	10	814157	814166	20 %	0 %	60 %	20 %	549728865
18004	NC_022545	TGG	2	6	814209	814214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728865
18005	NC_022545	GTC	2	6	814232	814237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728865
18006	NC_022545	GGT	2	6	814268	814273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728865
18007	NC_022545	GCC	2	6	814292	814297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728865
18008	NC_022545	CGG	2	6	814323	814328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728865
18009	NC_022545	TGG	2	6	814330	814335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728865
18010	NC_022545	GCG	2	6	814337	814342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728865
18011	NC_022545	GCAG	2	8	814420	814427	25 %	0 %	50 %	25 %	549728865
18012	NC_022545	ATT	2	6	814482	814487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728865
18013	NC_022545	CGC	2	6	814527	814532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728865
18014	NC_022545	CTG	2	6	814589	814594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728865
18015	NC_022545	ACGG	2	8	814720	814727	25 %	0 %	50 %	25 %	549728865
18016	NC_022545	GCA	2	6	814732	814737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728865
18017	NC_022545	CGA	2	6	814765	814770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728865
18018	NC_022545	GCAG	2	8	814780	814787	25 %	0 %	50 %	25 %	549728865
18019	NC_022545	GGA	2	6	814798	814803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728865
18020	NC_022545	AGGC	2	8	814811	814818	25 %	0 %	50 %	25 %	549728865
18021	NC_022545	GCA	2	6	814898	814903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728865
18022	NC_022545	GGT	2	6	814925	814930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728865
18023	NC_022545	GAAG	2	8	814943	814950	50 %	0 %	50 %	0 %	549728865
18024	NC_022545	CCCG	2	8	815004	815011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18025	NC_022545	CGGG	2	8	815015	815022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18026	NC_022545	CGC	2	6	815063	815068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728866
18027	NC_022545	ATC	2	6	815075	815080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728866
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18029	NC_022545	C	6	6	815222	815227	0 %	0 %	0 %	100 %	549728866
18030	NC_022545	CTC	2	6	815231	815236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728866
18031	NC_022545	CA	3	6	815238	815243	50 %	0 %	0 %	50 %	549728866
18032	NC_022545	GCC	2	6	815297	815302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728866
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18036	NC_022545	CTG	2	6	815526	815531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728866
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18038	NC_022545	GAT	2	6	815623	815628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728866
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18040	NC_022545	GCC	2	6	815764	815769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728866
18041	NC_022545	CGA	2	6	815778	815783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728866
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18043	NC_022545	ACCG	2	8	815880	815887	25 %	0 %	25 %	50 %	549728866
18044	NC_022545	CGA	2	6	815890	815895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728866
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18051	NC_022545	GAG	2	6	816311	816316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728866
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18053	NC_022545	CT	3	6	816387	816392	0 %	50 %	0 %	50 %	549728866
18054	NC_022545	TCGTT	2	10	816424	816433	0 %	60 %	20 %	20 %	549728866
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18059	NC_022545	GTTC	2	8	816613	816620	0 %	50 %	25 %	25 %	549728866
18060	NC_022545	CGGG	2	8	816630	816637	0 %	0 %	75 %	25 %	549728866
18061	NC_022545	TTG	2	6	816660	816665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728866
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18066	NC_022545	GAG	2	6	816830	816835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728866
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18070	NC_022545	AT	3	6	817029	817034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18074	NC_022545	CGTCA	2	10	817199	817208	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18075	NC_022545	TAAA	2	8	817229	817236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18091	NC_022545	GA	3	6	817868	817873	50 %	0 %	50 %	0 %	549728868
18092	NC_022545	GCT	2	6	818002	818007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18095	NC_022545	GAATG	2	10	818050	818059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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18101	NC_022545	GCC	2	6	818377	818382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728869
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18109	NC_022545	TGCC	2	8	818840	818847	0 %	25 %	25 %	50 %	549728870
18110	NC_022545	TGA	2	6	818856	818861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728870
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18112	NC_022545	TCA	2	6	818897	818902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728870
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18119	NC_022545	GAT	2	6	819202	819207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728870
18120	NC_022545	ATGG	2	8	819239	819246	25 %	25 %	50 %	0 %	549728870
18121	NC_022545	CCT	2	6	819247	819252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18122	NC_022545	GCCA	2	8	819288	819295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18123	NC_022545	GT	3	6	819397	819402	0 %	50 %	50 %	0 %	549728871
18124	NC_022545	GCA	2	6	819438	819443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728871
18125	NC_022545	AC	3	6	819445	819450	50 %	0 %	0 %	50 %	549728871
18126	NC_022545	ACC	2	6	819528	819533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728871
18127	NC_022545	CGCC	2	8	819697	819704	0 %	0 %	25 %	75 %	549728871
18128	NC_022545	ACCG	2	8	819756	819763	25 %	0 %	25 %	50 %	549728871
18129	NC_022545	AG	3	6	819782	819787	50 %	0 %	50 %	0 %	549728871
18130	NC_022545	CG	3	6	819836	819841	0 %	0 %	50 %	50 %	549728871
18131	NC_022545	AGGC	2	8	819848	819855	25 %	0 %	50 %	25 %	549728871
18132	NC_022545	TCA	2	6	819862	819867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728871
18133	NC_022545	CAGCC	2	10	819875	819884	20 %	0 %	20 %	60 %	549728871
18134	NC_022545	TGT	2	6	820065	820070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728871
18135	NC_022545	ACG	2	6	820105	820110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728871
18136	NC_022545	GCT	2	6	820184	820189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728871
18137	NC_022545	CA	3	6	820195	820200	50 %	0 %	0 %	50 %	549728871
18138	NC_022545	GCA	2	6	820202	820207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728871
18139	NC_022545	TTC	2	6	820282	820287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728871
18140	NC_022545	CAC	2	6	820372	820377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18141	NC_022545	GGC	2	6	820390	820395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18142	NC_022545	ATG	2	6	820440	820445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18143	NC_022545	TCA	2	6	820463	820468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18144	NC_022545	CCGT	2	8	820493	820500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18145	NC_022545	GGA	2	6	820648	820653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18146	NC_022545	CAG	2	6	820728	820733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728872
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18148	NC_022545	GCGG	2	8	820860	820867	0 %	0 %	75 %	25 %	549728872
18149	NC_022545	TGG	2	6	820885	820890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728872
18150	NC_022545	CGG	3	9	820937	820945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728872
18151	NC_022545	TTA	2	6	820958	820963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728872
18152	NC_022545	GAC	2	6	820985	820990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728872
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18155	NC_022545	GGA	2	6	821126	821131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728872
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18158	NC_022545	GAA	2	6	821258	821263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728872
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18161	NC_022545	GAA	2	6	821330	821335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728872
18162	NC_022545	GCC	2	6	821436	821441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728872
18163	NC_022545	GACC	2	8	821465	821472	25 %	0 %	25 %	50 %	549728872
18164	NC_022545	GC	3	6	821495	821500	0 %	0 %	50 %	50 %	549728872
18165	NC_022545	TG	3	6	821531	821536	0 %	50 %	50 %	0 %	549728872
18166	NC_022545	CCG	2	6	821547	821552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728872
18167	NC_022545	GCCGTC	2	12	821562	821573	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549728872
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18177	NC_022545	TGA	2	6	822091	822096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728872
18178	NC_022545	CGG	2	6	822131	822136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728872
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18194	NC_022545	GCC	2	6	822981	822986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728873
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18196	NC_022545	GACG	2	8	823130	823137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18197	NC_022545	CTT	2	6	823192	823197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18198	NC_022545	TGA	2	6	823245	823250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18200	NC_022545	ACG	2	6	823446	823451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728874
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18211	NC_022545	GCTC	2	8	823926	823933	0 %	25 %	25 %	50 %	549728874
18212	NC_022545	ACG	2	6	823974	823979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728874
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18217	NC_022545	GTC	2	6	824326	824331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18219	NC_022545	TCC	2	6	824399	824404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18220	NC_022545	AACGG	2	10	824451	824460	40 %	0 %	40 %	20 %	549728875
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18233	NC_022545	GCG	2	6	825035	825040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728876
18234	NC_022545	GCG	2	6	825051	825056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728876
18235	NC_022545	CTG	2	6	825161	825166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728876
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18238	NC_022545	GC	3	6	825261	825266	0 %	0 %	50 %	50 %	549728876
18239	NC_022545	TCC	2	6	825300	825305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728876
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18243	NC_022545	AC	3	6	825555	825560	50 %	0 %	0 %	50 %	549728876
18244	NC_022545	TCA	2	6	825594	825599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728876
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18246	NC_022545	ACG	2	6	825732	825737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728876
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18249	NC_022545	GCG	2	6	825839	825844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728876
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18291	NC_022545	TCTG	2	8	828399	828406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18320	NC_022545	CT	3	6	830486	830491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18343	NC_022545	TTGC	2	8	831804	831811	0 %	50 %	25 %	25 %	549728880
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18350	NC_022545	TCG	2	6	832220	832225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728880
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18354	NC_022545	GTT	2	6	832383	832388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18355	NC_022545	CAATG	2	10	832392	832401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18356	NC_022545	TTC	2	6	832458	832463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728881
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18358	NC_022545	GGC	3	9	832501	832509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728881
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18361	NC_022545	TCA	2	6	832602	832607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728881
18362	NC_022545	TGC	2	6	832637	832642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728881
18363	NC_022545	GGC	2	6	832675	832680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728881
18364	NC_022545	TCG	2	6	832704	832709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728881
18365	NC_022545	GCC	2	6	832739	832744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728881
18366	NC_022545	GCG	2	6	832751	832756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728881
18367	NC_022545	TGAC	2	8	832770	832777	25 %	25 %	25 %	25 %	549728881
18368	NC_022545	GCG	2	6	832786	832791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728881
18369	NC_022545	TTGC	2	8	832889	832896	0 %	50 %	25 %	25 %	549728881
18370	NC_022545	GCAGGC	2	12	833028	833039	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728881
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18372	NC_022545	TCGG	2	8	833154	833161	0 %	25 %	50 %	25 %	549728881
18373	NC_022545	CTC	2	6	833169	833174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728881
18374	NC_022545	GTT	2	6	833175	833180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728881
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18378	NC_022545	C	6	6	833251	833256	0 %	0 %	0 %	100 %	549728881
18379	NC_022545	GCC	2	6	833279	833284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728881
18380	NC_022545	GTCAT	2	10	833395	833404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18381	NC_022545	GAAA	2	8	833487	833494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18382	NC_022545	CAT	2	6	833525	833530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728882
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18385	NC_022545	CGGC	2	8	833617	833624	0 %	0 %	50 %	50 %	549728882
18386	NC_022545	GA	3	6	833653	833658	50 %	0 %	50 %	0 %	549728882
18387	NC_022545	TGG	2	6	833690	833695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728882
18388	NC_022545	TGC	2	6	833746	833751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728882
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18390	NC_022545	GCT	2	6	833798	833803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728882
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18393	NC_022545	CTT	2	6	834035	834040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728882
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18396	NC_022545	TCG	2	6	834193	834198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728882
18397	NC_022545	CA	3	6	834207	834212	50 %	0 %	0 %	50 %	549728882
18398	NC_022545	GCT	3	9	834254	834262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728882
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18400	NC_022545	TCC	2	6	834348	834353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728882
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18402	NC_022545	GCC	2	6	834378	834383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728882
18403	NC_022545	CAA	3	9	834492	834500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18404	NC_022545	TCG	2	6	834539	834544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728883
18405	NC_022545	GGTG	2	8	834560	834567	0 %	25 %	75 %	0 %	549728883
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18428	NC_022545	AT	3	6	835701	835706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18429	NC_022545	CGCTTG	2	12	835707	835718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18430	NC_022545	ACG	2	6	835765	835770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728884
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18464	NC_022545	TCC	2	6	837142	837147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728884
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18468	NC_022545	GGC	2	6	837327	837332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728884
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18470	NC_022545	GA	3	6	837420	837425	50 %	0 %	50 %	0 %	549728884
18471	NC_022545	GC	3	6	837439	837444	0 %	0 %	50 %	50 %	549728884
18472	NC_022545	CAT	2	6	837456	837461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728884
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18475	NC_022545	CTG	2	6	837606	837611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728884
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18477	NC_022545	CAA	2	6	837685	837690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18478	NC_022545	A	6	6	837895	837900	100 %	0 %	0 %	0 %	549728885
18479	NC_022545	TCGC	2	8	837945	837952	0 %	25 %	25 %	50 %	549728885
18480	NC_022545	GAT	2	6	837961	837966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728885
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18482	NC_022545	CCGG	2	8	838171	838178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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