MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022545	GTC	2	6	584332	584337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728647
13002	NC_022545	TCG	2	6	584349	584354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728647
13003	NC_022545	CAC	2	6	584386	584391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728647
13004	NC_022545	GCA	2	6	584480	584485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728647
13005	NC_022545	GGC	2	6	584573	584578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728647
13006	NC_022545	CGT	2	6	584581	584586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728647
13007	NC_022545	CGA	2	6	584734	584739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728647
13008	NC_022545	CGC	2	6	584746	584751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728647
13009	NC_022545	CGG	2	6	584856	584861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728648
13010	NC_022545	GTTTG	2	10	584916	584925	0 %	60 %	40 %	0 %	549728648
13011	NC_022545	CG	3	6	584941	584946	0 %	0 %	50 %	50 %	549728648
13012	NC_022545	CT	3	6	584994	584999	0 %	50 %	0 %	50 %	549728648
13013	NC_022545	AC	3	6	585047	585052	50 %	0 %	0 %	50 %	549728648
13014	NC_022545	CG	3	6	585159	585164	0 %	0 %	50 %	50 %	549728648
13015	NC_022545	TCG	2	6	585185	585190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13016	NC_022545	GCA	2	6	585191	585196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13017	NC_022545	CGT	2	6	585314	585319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13018	NC_022545	ACG	2	6	585349	585354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13019	NC_022545	CAT	2	6	585430	585435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728648
13020	NC_022545	GCC	2	6	585473	585478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728648
13021	NC_022545	CTT	2	6	585482	585487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728648
13022	NC_022545	TGACA	2	10	585488	585497	40 %	20 %	20 %	20 %	549728648
13023	NC_022545	GGT	2	6	585515	585520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728648
13024	NC_022545	GGC	2	6	585584	585589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728648
13025	NC_022545	ACG	2	6	585607	585612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13026	NC_022545	GTG	2	6	585664	585669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728648
13027	NC_022545	CGA	2	6	585674	585679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13028	NC_022545	TC	3	6	585680	585685	0 %	50 %	0 %	50 %	549728648
13029	NC_022545	GCC	2	6	585797	585802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728648
13030	NC_022545	CGA	2	6	585842	585847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13031	NC_022545	CGT	2	6	585890	585895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13032	NC_022545	AACG	2	8	585952	585959	50 %	0 %	25 %	25 %	549728648
13033	NC_022545	GAC	2	6	585986	585991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728648
13034	NC_022545	GGT	2	6	586000	586005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728649
13035	NC_022545	CATC	2	8	586017	586024	25 %	25 %	0 %	50 %	549728649
13036	NC_022545	CGG	2	6	586068	586073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728649
13037	NC_022545	GCG	2	6	586077	586082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728649
13038	NC_022545	GCC	2	6	586151	586156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728649
13039	NC_022545	GCC	2	6	586211	586216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728649
13040	NC_022545	GC	3	6	586224	586229	0 %	0 %	50 %	50 %	549728649
13041	NC_022545	GC	3	6	586231	586236	0 %	0 %	50 %	50 %	549728649
13042	NC_022545	GCC	2	6	586247	586252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728649
13043	NC_022545	CCGATG	2	12	586311	586322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728649
13044	NC_022545	AG	3	6	586343	586348	50 %	0 %	50 %	0 %	549728649
13045	NC_022545	CCT	2	6	586413	586418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728649
13046	NC_022545	CTG	2	6	586442	586447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728649
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13049	NC_022545	CAC	2	6	586495	586500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728649
13050	NC_022545	CGAAGC	2	12	586513	586524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728649
13051	NC_022545	TCT	2	6	586531	586536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728649
13052	NC_022545	CGC	2	6	586537	586542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728649
13053	NC_022545	AAACG	2	10	586559	586568	60 %	0 %	20 %	20 %	549728649
13054	NC_022545	CGC	2	6	586570	586575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728649
13055	NC_022545	CCGCCA	2	12	586616	586627	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549728649
13056	NC_022545	CT	3	6	586647	586652	0 %	50 %	0 %	50 %	549728649
13057	NC_022545	CGGA	2	8	586672	586679	25 %	0 %	50 %	25 %	549728649
13058	NC_022545	TGG	2	6	586736	586741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728650
13059	NC_022545	CGC	2	6	586772	586777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728650
13060	NC_022545	TTC	2	6	586867	586872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728650
13061	NC_022545	CG	3	6	586901	586906	0 %	0 %	50 %	50 %	549728650
13062	NC_022545	TGA	2	6	586958	586963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728650
13063	NC_022545	GC	3	6	587015	587020	0 %	0 %	50 %	50 %	549728650
13064	NC_022545	CGG	2	6	587126	587131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728650
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13068	NC_022545	GC	3	6	587206	587211	0 %	0 %	50 %	50 %	549728650
13069	NC_022545	CGT	2	6	587226	587231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728650
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13073	NC_022545	TCG	2	6	587437	587442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728650
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13077	NC_022545	CCA	2	6	587572	587577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728650
13078	NC_022545	CAA	2	6	587585	587590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728650
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13080	NC_022545	ACA	2	6	587608	587613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728650
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13085	NC_022545	ATC	2	6	587936	587941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_022545	GGA	2	6	587960	587965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_022545	CGAT	2	8	587995	588002	25 %	25 %	25 %	25 %	549728651
13088	NC_022545	GC	3	6	588013	588018	0 %	0 %	50 %	50 %	549728651
13089	NC_022545	GC	3	6	588058	588063	0 %	0 %	50 %	50 %	549728651
13090	NC_022545	CAG	2	6	588090	588095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728651
13091	NC_022545	CATC	2	8	588154	588161	25 %	25 %	0 %	50 %	549728651
13092	NC_022545	CGG	2	6	588206	588211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728651
13093	NC_022545	GCC	2	6	588312	588317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728651
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13099	NC_022545	CCTA	2	8	588577	588584	25 %	25 %	0 %	50 %	549728652
13100	NC_022545	TTG	2	6	588642	588647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728652
13101	NC_022545	TCGC	2	8	588648	588655	0 %	25 %	25 %	50 %	549728652
13102	NC_022545	ATCA	2	8	588663	588670	50 %	25 %	0 %	25 %	549728652
13103	NC_022545	GGT	2	6	588708	588713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728652
13104	NC_022545	GGC	2	6	588741	588746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_022545	T	6	6	588809	588814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_022545	ACC	2	6	588890	588895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_022545	TCA	2	6	588905	588910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_022545	CGGA	2	8	588961	588968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13109	NC_022545	ATC	2	6	589038	589043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728653
13110	NC_022545	CAC	2	6	589088	589093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728653
13111	NC_022545	TCA	2	6	589105	589110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728653
13112	NC_022545	AC	3	6	589114	589119	50 %	0 %	0 %	50 %	549728653
13113	NC_022545	CGT	2	6	589138	589143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728653
13114	NC_022545	TGA	2	6	589156	589161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728653
13115	NC_022545	GATGCC	2	12	589166	589177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728653
13116	NC_022545	GCC	2	6	589236	589241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728653
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13119	NC_022545	CG	3	6	589383	589388	0 %	0 %	50 %	50 %	549728653
13120	NC_022545	TGA	2	6	589561	589566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728653
13121	NC_022545	CGC	2	6	589573	589578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728653
13122	NC_022545	GCC	2	6	589703	589708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728653
13123	NC_022545	GGAAAT	2	12	589712	589723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549728653
13124	NC_022545	GGCGCG	2	12	589787	589798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728654
13125	NC_022545	CGA	2	6	589822	589827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728654
13126	NC_022545	CGA	3	9	589840	589848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728654
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13140	NC_022545	TGA	2	6	590584	590589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728654
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13147	NC_022545	TGACGA	2	12	590842	590853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549728654
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13150	NC_022545	TGA	2	6	591019	591024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728654
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13152	NC_022545	ATTGG	2	10	591071	591080	20 %	40 %	40 %	0 %	549728654
13153	NC_022545	CTC	2	6	591107	591112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13154	NC_022545	GCGCC	2	10	591125	591134	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13155	NC_022545	GGCGC	2	10	591144	591153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13156	NC_022545	CTT	2	6	591225	591230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728655
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13162	NC_022545	GCG	2	6	591469	591474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728655
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13184	NC_022545	CAA	2	6	592346	592351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13185	NC_022545	GCA	2	6	592361	592366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13200	NC_022545	CAG	2	6	592978	592983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728656
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13216	NC_022545	GCTC	2	8	593709	593716	0 %	25 %	25 %	50 %	549728657
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13222	NC_022545	CGC	2	6	593932	593937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728657
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13230	NC_022545	CTC	2	6	594209	594214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728657
13231	NC_022545	CAT	2	6	594262	594267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728657
13232	NC_022545	GGC	2	6	594341	594346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728657
13233	NC_022545	TCT	2	6	594366	594371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728657
13234	NC_022545	GTG	2	6	594417	594422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728657
13235	NC_022545	GAT	2	6	594461	594466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728657
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13237	NC_022545	GC	3	6	594495	594500	0 %	0 %	50 %	50 %	549728657
13238	NC_022545	GCG	2	6	594612	594617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728657
13239	NC_022545	T	6	6	594658	594663	0 %	100 %	0 %	0 %	549728657
13240	NC_022545	CGT	2	6	594699	594704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728657
13241	NC_022545	ATC	2	6	594732	594737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728657
13242	NC_022545	CG	3	6	594757	594762	0 %	0 %	50 %	50 %	549728657
13243	NC_022545	CAT	2	6	594784	594789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728657
13244	NC_022545	TGGC	2	8	594880	594887	0 %	25 %	50 %	25 %	549728657
13245	NC_022545	GCC	2	6	594899	594904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728657
13246	NC_022545	GCC	2	6	595085	595090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728657
13247	NC_022545	TGG	2	6	595102	595107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728657
13248	NC_022545	CGG	2	6	595108	595113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728657
13249	NC_022545	ACG	2	6	595114	595119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728657
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13251	NC_022545	AAAAC	2	10	595310	595319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13252	NC_022545	AAAC	2	8	595333	595340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13253	NC_022545	CCT	2	6	595396	595401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13254	NC_022545	GT	3	6	595422	595427	0 %	50 %	50 %	0 %	549728658
13255	NC_022545	GC	3	6	595502	595507	0 %	0 %	50 %	50 %	549728658
13256	NC_022545	GTC	2	6	595557	595562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728658
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13258	NC_022545	GAT	2	6	595598	595603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728658
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13262	NC_022545	CAC	2	6	595704	595709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728658
13263	NC_022545	GCC	2	6	595834	595839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13264	NC_022545	TTG	2	6	595885	595890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728659
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13271	NC_022545	CCG	2	6	596120	596125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728659
13272	NC_022545	ATG	2	6	596233	596238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728659
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13274	NC_022545	CAC	2	6	596337	596342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728659
13275	NC_022545	CG	3	6	596373	596378	0 %	0 %	50 %	50 %	549728659
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13277	NC_022545	CGA	2	6	596423	596428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728659
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13280	NC_022545	GCG	2	6	596488	596493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728659
13281	NC_022545	CGGCGC	2	12	596512	596523	0 %	0 %	50 %	50 %	549728659
13282	NC_022545	GCG	2	6	596535	596540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728659
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13284	NC_022545	TATCGA	2	12	596567	596578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549728659
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13295	NC_022545	TCA	2	6	596911	596916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728659
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13303	NC_022545	GCC	2	6	597124	597129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728659
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13310	NC_022545	GAT	2	6	597357	597362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728659
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13312	NC_022545	TCC	2	6	597469	597474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728659
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13315	NC_022545	CGCC	2	8	597599	597606	0 %	0 %	25 %	75 %	549728659
13316	NC_022545	CG	3	6	597626	597631	0 %	0 %	50 %	50 %	549728659
13317	NC_022545	CTG	2	6	597687	597692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728659
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13324	NC_022545	TC	3	6	597990	597995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13325	NC_022545	GCCCG	2	10	598046	598055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13326	NC_022545	CCGG	2	8	598083	598090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13327	NC_022545	ACTCGA	2	12	598123	598134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549728660
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13330	NC_022545	TGA	2	6	598297	598302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728660
13331	NC_022545	AGC	2	6	598320	598325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728660
13332	NC_022545	CGG	2	6	598340	598345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728660
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13335	NC_022545	CGCC	2	8	598474	598481	0 %	0 %	25 %	75 %	549728660
13336	NC_022545	AGCC	2	8	598512	598519	25 %	0 %	25 %	50 %	549728660
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13340	NC_022545	TGC	2	6	598730	598735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728660
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13345	NC_022545	GAC	2	6	599062	599067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728660
13346	NC_022545	GAAG	3	12	599073	599084	50 %	0 %	50 %	0 %	549728660
13347	NC_022545	ATC	2	6	599187	599192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728660
13348	NC_022545	CAA	2	6	599290	599295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728660
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13350	NC_022545	ACCG	2	8	599324	599331	25 %	0 %	25 %	50 %	549728660
13351	NC_022545	ACGGCG	2	12	599389	599400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728660
13352	NC_022545	GTC	2	6	599540	599545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728660
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13354	NC_022545	CG	3	6	599590	599595	0 %	0 %	50 %	50 %	549728660
13355	NC_022545	CGT	2	6	599602	599607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728660
13356	NC_022545	GCC	2	6	599630	599635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728660
13357	NC_022545	CCG	2	6	599637	599642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728660
13358	NC_022545	TTC	2	6	599763	599768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728660
13359	NC_022545	GGC	2	6	599855	599860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728660
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13361	NC_022545	GGCATC	2	12	600014	600025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728660
13362	NC_022545	TCT	2	6	600055	600060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728660
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13482	NC_022545	AGA	2	6	605343	605348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_022545	CATC	2	8	605360	605367	25 %	25 %	0 %	50 %	549728666
13484	NC_022545	GGC	2	6	605470	605475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728666
13485	NC_022545	CTG	2	6	605482	605487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728666
13486	NC_022545	CGC	2	6	605519	605524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728666
13487	NC_022545	ATG	2	6	605543	605548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728666
13488	NC_022545	GGCT	2	8	605554	605561	0 %	25 %	50 %	25 %	549728666
13489	NC_022545	CT	3	6	605566	605571	0 %	50 %	0 %	50 %	549728666
13490	NC_022545	GCG	2	6	605586	605591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728666
13491	NC_022545	GAT	2	6	605608	605613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728666
13492	NC_022545	CG	3	6	605729	605734	0 %	0 %	50 %	50 %	549728666
13493	NC_022545	TCCG	2	8	605757	605764	0 %	25 %	25 %	50 %	549728666
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13499	NC_022545	GCG	2	6	605888	605893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728666
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