MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_022545	GAT	3	9	536946	536954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728600
12003	NC_022545	CGCC	2	8	536990	536997	0 %	0 %	25 %	75 %	549728600
12004	NC_022545	GCG	3	9	537001	537009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12005	NC_022545	GGCGCG	2	12	537033	537044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12006	NC_022545	CAG	2	6	537045	537050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728600
12007	NC_022545	CGT	2	6	537155	537160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728600
12008	NC_022545	GC	3	6	537204	537209	0 %	0 %	50 %	50 %	549728600
12009	NC_022545	GCG	2	6	537229	537234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12010	NC_022545	CGGG	2	8	537354	537361	0 %	0 %	75 %	25 %	549728600
12011	NC_022545	GCG	2	6	537415	537420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12012	NC_022545	CGA	2	6	537425	537430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728600
12013	NC_022545	TCG	2	6	537445	537450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728600
12014	NC_022545	GCCT	2	8	537469	537476	0 %	25 %	25 %	50 %	549728600
12015	NC_022545	CGG	2	6	537536	537541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12016	NC_022545	CGG	2	6	537563	537568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12017	NC_022545	GGC	2	6	537606	537611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728600
12018	NC_022545	TCC	2	6	537631	537636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_022545	GCC	2	6	537655	537660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728601
12020	NC_022545	ATC	2	6	537702	537707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728601
12021	NC_022545	GCC	2	6	537711	537716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728601
12022	NC_022545	TGC	2	6	537721	537726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728601
12023	NC_022545	TGA	2	6	537731	537736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728601
12024	NC_022545	ATC	2	6	537772	537777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728601
12025	NC_022545	CGT	3	9	537795	537803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728601
12026	NC_022545	CAG	2	6	537840	537845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728601
12027	NC_022545	GC	5	10	537853	537862	0 %	0 %	50 %	50 %	549728601
12028	NC_022545	GCA	2	6	538014	538019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728602
12029	NC_022545	CGCA	2	8	538046	538053	25 %	0 %	25 %	50 %	549728602
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12033	NC_022545	GCA	2	6	538207	538212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728602
12034	NC_022545	GCC	2	6	538239	538244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728602
12035	NC_022545	CGG	2	6	538267	538272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728602
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12039	NC_022545	TGGC	2	8	538449	538456	0 %	25 %	50 %	25 %	549728602
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12042	NC_022545	CGG	2	6	538649	538654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728602
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12044	NC_022545	CCG	2	6	538857	538862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728603
12045	NC_022545	CGA	2	6	538959	538964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728603
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12056	NC_022545	CGG	2	6	539275	539280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728603
12057	NC_022545	GTT	2	6	539352	539357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728603
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12060	NC_022545	GC	3	6	539429	539434	0 %	0 %	50 %	50 %	549728603
12061	NC_022545	CGATT	2	10	539496	539505	20 %	40 %	20 %	20 %	549728603
12062	NC_022545	TGCG	2	8	539525	539532	0 %	25 %	50 %	25 %	549728603
12063	NC_022545	GAC	2	6	539567	539572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728603
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12065	NC_022545	CAG	2	6	539698	539703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728603
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12069	NC_022545	GA	3	6	540035	540040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12089	NC_022545	TGA	2	6	541239	541244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728607
12090	NC_022545	GCG	2	6	541470	541475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728607
12091	NC_022545	CGT	2	6	541483	541488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728607
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12101	NC_022545	GAC	2	6	542002	542007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728608
12102	NC_022545	TCT	2	6	542079	542084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728608
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12104	NC_022545	CCA	2	6	542124	542129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728608
12105	NC_022545	GC	4	8	542134	542141	0 %	0 %	50 %	50 %	549728608
12106	NC_022545	ACGA	2	8	542152	542159	50 %	0 %	25 %	25 %	549728608
12107	NC_022545	GCAAG	2	10	542163	542172	40 %	0 %	40 %	20 %	549728608
12108	NC_022545	AGA	2	6	542180	542185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728608
12109	NC_022545	CAGCG	2	10	542191	542200	20 %	0 %	40 %	40 %	549728608
12110	NC_022545	TCA	2	6	542219	542224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728608
12111	NC_022545	GGAGGT	2	12	542293	542304	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	549728608
12112	NC_022545	GCCG	2	8	542344	542351	0 %	0 %	50 %	50 %	549728608
12113	NC_022545	ACA	2	6	542352	542357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728608
12114	NC_022545	TCG	2	6	542412	542417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728608
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12116	NC_022545	GTCG	2	8	542518	542525	0 %	25 %	50 %	25 %	549728608
12117	NC_022545	GGC	2	6	542539	542544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728608
12118	NC_022545	CT	3	6	542653	542658	0 %	50 %	0 %	50 %	549728608
12119	NC_022545	AGC	2	6	542664	542669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728608
12120	NC_022545	GCG	2	6	542681	542686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728608
12121	NC_022545	GGCATT	2	12	542734	542745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549728608
12122	NC_022545	ACC	2	6	542756	542761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728608
12123	NC_022545	GC	4	8	542765	542772	0 %	0 %	50 %	50 %	549728608
12124	NC_022545	CGC	3	9	542775	542783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728608
12125	NC_022545	CGG	3	9	542910	542918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728608
12126	NC_022545	CGC	2	6	542934	542939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728608
12127	NC_022545	AGGAT	2	10	542956	542965	40 %	20 %	40 %	0 %	549728608
12128	NC_022545	GAGC	2	8	542970	542977	25 %	0 %	50 %	25 %	549728608
12129	NC_022545	GGC	2	6	543053	543058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12130	NC_022545	GCC	2	6	543065	543070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12131	NC_022545	CTG	2	6	543089	543094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12132	NC_022545	CTG	2	6	543104	543109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12133	NC_022545	CTT	2	6	543134	543139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12134	NC_022545	TCT	2	6	543163	543168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12135	NC_022545	CGG	3	9	543254	543262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728609
12136	NC_022545	TGA	2	6	543286	543291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728609
12137	NC_022545	GGC	2	6	543353	543358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728609
12138	NC_022545	TTC	2	6	543359	543364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12139	NC_022545	AACC	2	8	543393	543400	50 %	0 %	0 %	50 %	549728609
12140	NC_022545	TTG	2	6	543420	543425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728609
12141	NC_022545	GCT	2	6	543478	543483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12142	NC_022545	TGA	2	6	543484	543489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728609
12143	NC_022545	CGA	2	6	543514	543519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12144	NC_022545	TCT	2	6	543540	543545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12145	NC_022545	TGAA	2	8	543654	543661	50 %	25 %	25 %	0 %	549728609
12146	NC_022545	CTT	2	6	543671	543676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12147	NC_022545	ATCG	2	8	543734	543741	25 %	25 %	25 %	25 %	549728609
12148	NC_022545	CTT	2	6	543761	543766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728609
12149	NC_022545	TCG	2	6	543771	543776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12150	NC_022545	TGG	2	6	543831	543836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728609
12151	NC_022545	CGA	2	6	543859	543864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728609
12152	NC_022545	TAT	2	6	543934	543939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728609
12153	NC_022545	A	6	6	544000	544005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12154	NC_022545	CAT	2	6	544054	544059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12155	NC_022545	C	7	7	544063	544069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12156	NC_022545	CGG	2	6	544203	544208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728610
12157	NC_022545	GTT	2	6	544221	544226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728610
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12159	NC_022545	GAA	2	6	544291	544296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728610
12160	NC_022545	CCA	2	6	544298	544303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728610
12161	NC_022545	CGA	2	6	544314	544319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728610
12162	NC_022545	GGC	2	6	544326	544331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728610
12163	NC_022545	CCG	2	6	544337	544342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728610
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12172	NC_022545	CGC	2	6	544614	544619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728610
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12179	NC_022545	CGC	2	6	544859	544864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728610
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12184	NC_022545	CTG	2	6	545014	545019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728610
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12190	NC_022545	ATG	2	6	545185	545190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728610
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12192	NC_022545	TCC	2	6	545275	545280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728610
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12198	NC_022545	ACG	2	6	545524	545529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728610
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12220	NC_022545	AAC	2	6	546808	546813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728610
12221	NC_022545	CGC	2	6	546911	546916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12222	NC_022545	TTG	3	9	546980	546988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12223	NC_022545	ATC	2	6	547021	547026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12224	NC_022545	TGC	2	6	547037	547042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12225	NC_022545	GCC	2	6	547062	547067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728611
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12227	NC_022545	CCA	2	6	547174	547179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728611
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12230	NC_022545	T	6	6	547351	547356	0 %	100 %	0 %	0 %	549728611
12231	NC_022545	CGG	2	6	547430	547435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728611
12232	NC_022545	TGC	2	6	547441	547446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728611
12233	NC_022545	CCG	2	6	547459	547464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728611
12234	NC_022545	CGC	2	6	547508	547513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728611
12235	NC_022545	GCA	2	6	547534	547539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728611
12236	NC_022545	TCAT	2	8	547593	547600	25 %	50 %	0 %	25 %	549728611
12237	NC_022545	CAT	2	6	547610	547615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728611
12238	NC_022545	CTG	3	9	547626	547634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728611
12239	NC_022545	CTAT	2	8	547670	547677	25 %	50 %	0 %	25 %	549728611
12240	NC_022545	CAT	2	6	547859	547864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728611
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12242	NC_022545	TCT	2	6	547892	547897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728611
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12341	NC_022545	TC	3	6	552589	552594	0 %	50 %	0 %	50 %	549728615
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12345	NC_022545	CCCGC	2	10	552706	552715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12346	NC_022545	TTA	2	6	552771	552776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_022545	CT	3	6	553024	553029	0 %	50 %	0 %	50 %	549728616
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12352	NC_022545	CGC	2	6	553282	553287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12353	NC_022545	T	6	6	553378	553383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12354	NC_022545	CGCC	2	8	553542	553549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12355	NC_022545	CTT	2	6	553577	553582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12356	NC_022545	CCG	2	6	553621	553626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728617
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12359	NC_022545	GC	3	6	553726	553731	0 %	0 %	50 %	50 %	549728617
12360	NC_022545	CTG	2	6	553737	553742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728617
12361	NC_022545	TAT	2	6	553755	553760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728617
12362	NC_022545	GCT	2	6	553829	553834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728617
12363	NC_022545	GGCC	2	8	553868	553875	0 %	0 %	50 %	50 %	549728617
12364	NC_022545	ATG	2	6	554011	554016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728617
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12368	NC_022545	T	6	6	554309	554314	0 %	100 %	0 %	0 %	549728618
12369	NC_022545	CGC	2	6	554333	554338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728618
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12381	NC_022545	GCT	2	6	554931	554936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12382	NC_022545	ATGAT	2	10	554943	554952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12383	NC_022545	CGA	2	6	554987	554992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12384	NC_022545	CG	3	6	554998	555003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12385	NC_022545	GGA	2	6	555008	555013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12390	NC_022545	GGCG	2	8	555176	555183	0 %	0 %	75 %	25 %	549728620
12391	NC_022545	GCC	2	6	555214	555219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728620
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12393	NC_022545	GCG	2	6	555244	555249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728620
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12420	NC_022545	TGC	2	6	556463	556468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728622
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12432	NC_022545	GA	3	6	557108	557113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12433	NC_022545	GAA	2	6	557131	557136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12434	NC_022545	GCA	2	6	557173	557178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12461	NC_022545	GCG	2	6	558378	558383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728624
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12464	NC_022545	TCCAA	2	10	558529	558538	40 %	20 %	0 %	40 %	549728624
12465	NC_022545	CGAT	2	8	558557	558564	25 %	25 %	25 %	25 %	549728624
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12467	NC_022545	A	6	6	558632	558637	100 %	0 %	0 %	0 %	549728624
12468	NC_022545	GCG	2	6	558706	558711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728624
12469	NC_022545	CGC	2	6	558783	558788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728624
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12472	NC_022545	ACCGA	2	10	559030	559039	40 %	0 %	20 %	40 %	549728624
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12477	NC_022545	A	6	6	559373	559378	100 %	0 %	0 %	0 %	549728624
12478	NC_022545	GCC	2	6	559528	559533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728624
12479	NC_022545	TCT	2	6	559600	559605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728624
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12481	NC_022545	CCG	2	6	559642	559647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728624
12482	NC_022545	CG	4	8	559646	559653	0 %	0 %	50 %	50 %	549728624
12483	NC_022545	TGGCGA	2	12	559682	559693	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549728624
12484	NC_022545	CAG	2	6	559716	559721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728624
12485	NC_022545	CCG	2	6	559771	559776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728624
12486	NC_022545	GACC	2	8	559800	559807	25 %	0 %	25 %	50 %	549728624
12487	NC_022545	CGG	2	6	559911	559916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12488	NC_022545	GCC	2	6	559925	559930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728625
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12498	NC_022545	GGC	2	6	560710	560715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728625
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