MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022545	CTT	2	6	445981	445986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728510
10002	NC_022545	CCTGC	2	10	446045	446054	0 %	20 %	20 %	60 %	549728510
10003	NC_022545	GCG	2	6	446200	446205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728510
10004	NC_022545	CAT	2	6	446317	446322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728510
10005	NC_022545	TGA	2	6	446347	446352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728510
10006	NC_022545	TCG	2	6	446364	446369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728510
10007	NC_022545	GAT	2	6	446398	446403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728510
10008	NC_022545	TTC	2	6	446415	446420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728510
10009	NC_022545	GTC	2	6	446439	446444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728510
10010	NC_022545	GGCG	2	8	446497	446504	0 %	0 %	75 %	25 %	549728510
10011	NC_022545	AGG	2	6	446524	446529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728510
10012	NC_022545	GCC	2	6	446676	446681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728510
10013	NC_022545	TTC	2	6	446697	446702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728510
10014	NC_022545	GCC	2	6	446749	446754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728510
10015	NC_022545	CCG	2	6	446769	446774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728510
10016	NC_022545	ATG	2	6	446787	446792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728510
10017	NC_022545	GTCAT	2	10	446814	446823	20 %	40 %	20 %	20 %	549728510
10018	NC_022545	CTC	2	6	446824	446829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_022545	CGC	2	6	446845	446850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728511
10020	NC_022545	TCGA	2	8	446879	446886	25 %	25 %	25 %	25 %	549728511
10021	NC_022545	GCG	2	6	446913	446918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728511
10022	NC_022545	GAT	2	6	446923	446928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728511
10023	NC_022545	GC	3	6	446958	446963	0 %	0 %	50 %	50 %	549728511
10024	NC_022545	TCC	2	6	446981	446986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728511
10025	NC_022545	CTC	2	6	447016	447021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728511
10026	NC_022545	TCC	2	6	447059	447064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728511
10027	NC_022545	CG	3	6	447143	447148	0 %	0 %	50 %	50 %	549728511
10028	NC_022545	TCGC	2	8	447161	447168	0 %	25 %	25 %	50 %	549728511
10029	NC_022545	CCG	2	6	447203	447208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728511
10030	NC_022545	TTC	2	6	447211	447216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728511
10031	NC_022545	GCG	2	6	447235	447240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728511
10032	NC_022545	CGG	2	6	447355	447360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728511
10033	NC_022545	GCG	2	6	447399	447404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728511
10034	NC_022545	CTG	2	6	447478	447483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728511
10035	NC_022545	GCCC	2	8	447507	447514	0 %	0 %	25 %	75 %	549728511
10036	NC_022545	GCGA	2	8	447551	447558	25 %	0 %	50 %	25 %	549728511
10037	NC_022545	TGC	2	6	447602	447607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728511
10038	NC_022545	CGG	2	6	447728	447733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728511
10039	NC_022545	CGC	2	6	447787	447792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728511
10040	NC_022545	CAT	2	6	447841	447846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728511
10041	NC_022545	TA	3	6	447887	447892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_022545	TAA	2	6	447894	447899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728512
10043	NC_022545	GAT	2	6	447902	447907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728512
10044	NC_022545	GA	3	6	447929	447934	50 %	0 %	50 %	0 %	549728512
10045	NC_022545	GTG	2	6	447949	447954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728512
10046	NC_022545	ACT	2	6	448080	448085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_022545	AAT	2	6	448098	448103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_022545	TC	3	6	448130	448135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_022545	A	6	6	448159	448164	100 %	0 %	0 %	0 %	549728513
10050	NC_022545	AAC	2	6	448249	448254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728513
10051	NC_022545	A	6	6	448261	448266	100 %	0 %	0 %	0 %	549728513
10052	NC_022545	TTC	2	6	448280	448285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728513
10053	NC_022545	AAG	2	6	448318	448323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728513
10054	NC_022545	GAC	2	6	448450	448455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728513
10055	NC_022545	GAT	2	6	448459	448464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728513
10056	NC_022545	GTCAG	2	10	448475	448484	20 %	20 %	40 %	20 %	549728513
10057	NC_022545	GACG	2	8	448494	448501	25 %	0 %	50 %	25 %	549728513
10058	NC_022545	CCGG	2	8	448585	448592	0 %	0 %	50 %	50 %	549728513
10059	NC_022545	CGGT	2	8	448608	448615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_022545	TCC	2	6	448649	448654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728514
10061	NC_022545	AGCGA	2	10	448655	448664	40 %	0 %	40 %	20 %	549728514
10062	NC_022545	GC	3	6	448702	448707	0 %	0 %	50 %	50 %	549728514
10063	NC_022545	TTG	2	6	448733	448738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728514
10064	NC_022545	CAG	2	6	448891	448896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728514
10065	NC_022545	ACG	2	6	449025	449030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728514
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10069	NC_022545	GCT	2	6	449253	449258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728514
10070	NC_022545	TGA	2	6	449277	449282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728514
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10072	NC_022545	GCT	2	6	449333	449338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728514
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10076	NC_022545	CGG	2	6	449610	449615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_022545	CGC	2	6	449755	449760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728515
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10083	NC_022545	CGAC	2	8	449976	449983	25 %	0 %	25 %	50 %	549728515
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10087	NC_022545	TGA	2	6	450129	450134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728515
10088	NC_022545	TTG	2	6	450136	450141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728515
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10090	NC_022545	AAT	2	6	450264	450269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_022545	GAA	3	9	450318	450326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_022545	GCCT	2	8	450329	450336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_022545	GCC	2	6	450376	450381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728516
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10103	NC_022545	GGC	3	9	450856	450864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728516
10104	NC_022545	T	6	6	450882	450887	0 %	100 %	0 %	0 %	549728516
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10110	NC_022545	C	6	6	451058	451063	0 %	0 %	0 %	100 %	549728516
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10115	NC_022545	GCC	2	6	451171	451176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728516
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10118	NC_022545	GACGC	2	10	451253	451262	20 %	0 %	40 %	40 %	549728516
10119	NC_022545	CGGA	2	8	451264	451271	25 %	0 %	50 %	25 %	549728516
10120	NC_022545	CG	3	6	451430	451435	0 %	0 %	50 %	50 %	549728516
10121	NC_022545	TCG	2	6	451439	451444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728516
10122	NC_022545	CGA	2	6	451468	451473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728516
10123	NC_022545	TGA	2	6	451559	451564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_022545	TC	3	6	451633	451638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_022545	GCGAA	2	10	451655	451664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10126	NC_022545	AGA	2	6	451689	451694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_022545	T	6	6	451761	451766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_022545	CCT	2	6	451890	451895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728517
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10132	NC_022545	GCG	2	6	452002	452007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_022545	A	6	6	452014	452019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_022545	CTCTT	2	10	452065	452074	0 %	60 %	0 %	40 %	549728518
10135	NC_022545	GT	3	6	452103	452108	0 %	50 %	50 %	0 %	549728518
10136	NC_022545	GAGCA	2	10	452164	452173	40 %	0 %	40 %	20 %	549728518
10137	NC_022545	TGA	2	6	452235	452240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728518
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10141	NC_022545	GGC	2	6	452434	452439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728518
10142	NC_022545	CCA	2	6	452463	452468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728518
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10147	NC_022545	TG	3	6	452692	452697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_022545	T	6	6	452858	452863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10149	NC_022545	ACA	2	6	452920	452925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728519
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10152	NC_022545	CGC	2	6	452955	452960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728519
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10159	NC_022545	ACC	2	6	453283	453288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728519
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10226	NC_022545	CGAC	2	8	456073	456080	25 %	0 %	25 %	50 %	549728521
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10231	NC_022545	GCG	2	6	456449	456454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10232	NC_022545	CGC	2	6	456484	456489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10233	NC_022545	GCG	2	6	456524	456529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728522
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10236	NC_022545	CGA	2	6	456648	456653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728522
10237	NC_022545	CTG	2	6	456658	456663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728522
10238	NC_022545	GATC	2	8	456696	456703	25 %	25 %	25 %	25 %	549728522
10239	NC_022545	GGC	2	6	456709	456714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728522
10240	NC_022545	AAG	2	6	456721	456726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728522
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10242	NC_022545	TGCG	2	8	456908	456915	0 %	25 %	50 %	25 %	549728522
10243	NC_022545	CG	3	6	456969	456974	0 %	0 %	50 %	50 %	549728522
10244	NC_022545	AGC	2	6	457058	457063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728522
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10364	NC_022545	TCG	2	6	462021	462026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728526
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10366	NC_022545	CG	3	6	462077	462082	0 %	0 %	50 %	50 %	549728526
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10480	NC_022545	GCG	2	6	467073	467078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10482	NC_022545	CCG	2	6	467118	467123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728531
10483	NC_022545	CGA	2	6	467167	467172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728531
10484	NC_022545	CGA	2	6	467188	467193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728531
10485	NC_022545	TGA	2	6	467197	467202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728531
10486	NC_022545	GAA	2	6	467240	467245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728531
10487	NC_022545	CCG	3	9	467275	467283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728531
10488	NC_022545	CAG	2	6	467288	467293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728531
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10490	NC_022545	GCCG	2	8	467381	467388	0 %	0 %	50 %	50 %	549728531
10491	NC_022545	ACC	2	6	467448	467453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728531
10492	NC_022545	TGG	2	6	467557	467562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728531
10493	NC_022545	GCC	2	6	467585	467590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728531
10494	NC_022545	GCCT	2	8	467775	467782	0 %	25 %	25 %	50 %	549728531
10495	NC_022545	TGA	2	6	467818	467823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728531
10496	NC_022545	CTG	2	6	467834	467839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728531
10497	NC_022545	GGCATA	2	12	467843	467854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549728531
10498	NC_022545	GCC	2	6	467955	467960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728531
10499	NC_022545	TGA	2	6	467980	467985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728531
10500	NC_022545	GAT	2	6	467990	467995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728531

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