MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022545	AAC	2	6	267369	267374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728347
6002	NC_022545	GCC	2	6	267450	267455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728347
6003	NC_022545	AT	3	6	267461	267466	50 %	50 %	0 %	0 %	549728347
6004	NC_022545	CTT	2	6	267485	267490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728347
6005	NC_022545	CGA	2	6	267530	267535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728347
6006	NC_022545	CAG	2	6	267554	267559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728347
6007	NC_022545	GGC	2	6	267578	267583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728347
6008	NC_022545	GGCAA	2	10	267644	267653	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6009	NC_022545	CCAC	2	8	267747	267754	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6010	NC_022545	AT	3	6	267758	267763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_022545	TTG	2	6	267773	267778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_022545	CGC	2	6	267831	267836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6013	NC_022545	CAA	2	6	267915	267920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728348
6014	NC_022545	GCC	2	6	267924	267929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6015	NC_022545	CAC	2	6	268023	268028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728348
6016	NC_022545	CGG	2	6	268086	268091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728348
6017	NC_022545	CAC	2	6	268126	268131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728348
6018	NC_022545	TGG	2	6	268163	268168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728348
6019	NC_022545	GCC	2	6	268195	268200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6020	NC_022545	CTG	2	6	268213	268218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728348
6021	NC_022545	TCT	2	6	268229	268234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728348
6022	NC_022545	CAT	2	6	268245	268250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728348
6023	NC_022545	CCG	2	6	268253	268258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6024	NC_022545	TCG	2	6	268289	268294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728348
6025	NC_022545	TGC	2	6	268319	268324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728348
6026	NC_022545	CGC	2	6	268334	268339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6027	NC_022545	CCA	2	6	268364	268369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728348
6028	NC_022545	TGA	3	9	268394	268402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728348
6029	NC_022545	GCC	2	6	268462	268467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728348
6030	NC_022545	TGG	2	6	268484	268489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728348
6031	NC_022545	GC	3	6	268507	268512	0 %	0 %	50 %	50 %	549728348
6032	NC_022545	AACA	2	8	268528	268535	75 %	0 %	0 %	25 %	549728348
6033	NC_022545	GCA	2	6	268574	268579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_022545	GGC	2	6	268721	268726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728349
6035	NC_022545	CAT	2	6	268732	268737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728349
6036	NC_022545	GGCG	2	8	268738	268745	0 %	0 %	75 %	25 %	549728349
6037	NC_022545	GGGC	2	8	268777	268784	0 %	0 %	75 %	25 %	549728349
6038	NC_022545	GCG	2	6	268800	268805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728349
6039	NC_022545	CG	3	6	268846	268851	0 %	0 %	50 %	50 %	549728349
6040	NC_022545	AACGGC	2	12	268885	268896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728349
6041	NC_022545	GGA	2	6	268942	268947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728349
6042	NC_022545	GACA	2	8	268993	269000	50 %	0 %	25 %	25 %	549728349
6043	NC_022545	TCG	2	6	269004	269009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728349
6044	NC_022545	T	6	6	269045	269050	0 %	100 %	0 %	0 %	549728349
6045	NC_022545	AATGA	2	10	269055	269064	60 %	20 %	20 %	0 %	549728349
6046	NC_022545	CCCGC	2	10	269086	269095	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6047	NC_022545	TGA	2	6	269104	269109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_022545	A	7	7	269123	269129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_022545	GAC	2	6	269176	269181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6050	NC_022545	TCG	2	6	269199	269204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6051	NC_022545	ATG	2	6	269216	269221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728350
6052	NC_022545	CGT	2	6	269254	269259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6053	NC_022545	GC	3	6	269268	269273	0 %	0 %	50 %	50 %	549728350
6054	NC_022545	TGG	2	6	269277	269282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728350
6055	NC_022545	CGT	2	6	269296	269301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6056	NC_022545	GAT	2	6	269333	269338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728350
6057	NC_022545	TCA	2	6	269343	269348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728350
6058	NC_022545	TCG	2	6	269349	269354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6059	NC_022545	GC	3	6	269358	269363	0 %	0 %	50 %	50 %	549728350
6060	NC_022545	CGG	2	6	269376	269381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728350
6061	NC_022545	TCG	2	6	269397	269402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6062	NC_022545	TGA	2	6	269463	269468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728350
6063	NC_022545	TCG	3	9	269469	269477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6064	NC_022545	TCA	2	6	269493	269498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728350
6065	NC_022545	CAT	2	6	269518	269523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728350
6066	NC_022545	GCC	2	6	269597	269602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728350
6067	NC_022545	GGGC	2	8	269608	269615	0 %	0 %	75 %	25 %	549728350
6068	NC_022545	TGA	2	6	269616	269621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728350
6069	NC_022545	TCG	2	6	269646	269651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6070	NC_022545	GAG	2	6	269666	269671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728350
6071	NC_022545	CAT	2	6	269737	269742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728350
6072	NC_022545	TGC	2	6	269766	269771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6073	NC_022545	GGCG	2	8	269974	269981	0 %	0 %	75 %	25 %	549728350
6074	NC_022545	GCT	3	9	270040	270048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
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6077	NC_022545	ATCTC	2	10	270090	270099	20 %	40 %	0 %	40 %	549728350
6078	NC_022545	TCA	2	6	270111	270116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728350
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6080	NC_022545	TGC	2	6	270297	270302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
6081	NC_022545	GCT	2	6	270313	270318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
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6083	NC_022545	CGC	3	9	270385	270393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728350
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6088	NC_022545	CGC	2	6	270529	270534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728350
6089	NC_022545	GCG	2	6	270567	270572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728350
6090	NC_022545	CGC	2	6	270586	270591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728350
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6092	NC_022545	CAA	2	6	270679	270684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728350
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6094	NC_022545	CCGG	2	8	270745	270752	0 %	0 %	50 %	50 %	549728350
6095	NC_022545	TCG	3	9	270897	270905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728350
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6097	NC_022545	AGCC	2	8	270947	270954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_022545	CTTT	2	8	271051	271058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_022545	ATG	2	6	271071	271076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_022545	GC	3	6	271528	271533	0 %	0 %	50 %	50 %	549728351
6105	NC_022545	GCC	2	6	271543	271548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728351
6106	NC_022545	CG	4	8	271594	271601	0 %	0 %	50 %	50 %	549728351
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6122	NC_022545	CGCC	2	8	272307	272314	0 %	0 %	25 %	75 %	549728351
6123	NC_022545	GAA	2	6	272342	272347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728351
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6131	NC_022545	GCT	2	6	272536	272541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728351
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6138	NC_022545	CGGG	2	8	272750	272757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6139	NC_022545	C	6	6	272773	272778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6245	NC_022545	TC	3	6	277827	277832	0 %	50 %	0 %	50 %	549728356
6246	NC_022545	CGG	2	6	277833	277838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728356
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6310	NC_022545	AC	3	6	280581	280586	50 %	0 %	0 %	50 %	549728360
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6337	NC_022545	TGA	2	6	282048	282053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728361
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6340	NC_022545	CGG	2	6	282225	282230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728361
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6343	NC_022545	TGG	2	6	282339	282344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728361
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6347	NC_022545	AATG	2	8	282630	282637	50 %	25 %	25 %	0 %	549728362
6348	NC_022545	GAGAA	2	10	282658	282667	60 %	0 %	40 %	0 %	549728362
6349	NC_022545	GCTGCG	2	12	282697	282708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549728362
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6352	NC_022545	CTG	2	6	282794	282799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728362
6353	NC_022545	GGCC	2	8	282868	282875	0 %	0 %	50 %	50 %	549728362
6354	NC_022545	GGC	2	6	282883	282888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728362
6355	NC_022545	ATC	2	6	282911	282916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728362
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6358	NC_022545	GCT	2	6	283096	283101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728362
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6360	NC_022545	TCG	2	6	283110	283115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728362
6361	NC_022545	GGC	2	6	283149	283154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728362
6362	NC_022545	GC	3	6	283161	283166	0 %	0 %	50 %	50 %	549728362
6363	NC_022545	GCT	2	6	283198	283203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728362
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6365	NC_022545	ATC	2	6	283437	283442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728362
6366	NC_022545	GC	3	6	283453	283458	0 %	0 %	50 %	50 %	549728362
6367	NC_022545	CGAT	2	8	283464	283471	25 %	25 %	25 %	25 %	549728362
6368	NC_022545	CGG	2	6	283513	283518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728362
6369	NC_022545	CGCCAT	2	12	283528	283539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549728362
6370	NC_022545	GGC	3	9	283588	283596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728362
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6373	NC_022545	GAG	2	6	283910	283915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728363
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6379	NC_022545	CGC	2	6	284197	284202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728363
6380	NC_022545	TCGA	2	8	284286	284293	25 %	25 %	25 %	25 %	549728363
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6385	NC_022545	TCT	2	6	284401	284406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728363
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6389	NC_022545	GTG	2	6	284602	284607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_022545	CCAG	2	8	284670	284677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6391	NC_022545	CCG	2	6	284708	284713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6392	NC_022545	CG	3	6	284720	284725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6393	NC_022545	CCG	3	9	284787	284795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728364
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6408	NC_022545	CGCA	2	8	285360	285367	25 %	0 %	25 %	50 %	549728365
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6435	NC_022545	T	7	7	286460	286466	0 %	100 %	0 %	0 %	549728366
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6439	NC_022545	CAGC	2	8	286585	286592	25 %	0 %	25 %	50 %	549728366
6440	NC_022545	ACCG	2	8	286721	286728	25 %	0 %	25 %	50 %	549728366
6441	NC_022545	CGG	2	6	286734	286739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728366
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6443	NC_022545	CT	3	6	286816	286821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6444	NC_022545	ATA	3	9	286935	286943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6446	NC_022545	GGA	2	6	286974	286979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6447	NC_022545	GC	5	10	287033	287042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6452	NC_022545	AGGC	2	8	287118	287125	25 %	0 %	50 %	25 %	549728367
6453	NC_022545	CGA	2	6	287170	287175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728367
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6477	NC_022545	AGCGGC	2	12	287920	287931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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6487	NC_022545	CAG	2	6	288375	288380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728368
6488	NC_022545	CATCG	2	10	288441	288450	20 %	20 %	20 %	40 %	549728368
6489	NC_022545	GC	4	8	288459	288466	0 %	0 %	50 %	50 %	549728368
6490	NC_022545	CGG	2	6	288482	288487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728368
6491	NC_022545	TGA	2	6	288542	288547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728368
6492	NC_022545	GCG	2	6	288572	288577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728368
6493	NC_022545	GCA	2	6	288599	288604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728368
6494	NC_022545	CGCC	2	8	288698	288705	0 %	0 %	25 %	75 %	549728368
6495	NC_022545	GCAT	2	8	288706	288713	25 %	25 %	25 %	25 %	549728368
6496	NC_022545	AGC	2	6	288730	288735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728368
6497	NC_022545	GC	3	6	288734	288739	0 %	0 %	50 %	50 %	549728368
6498	NC_022545	GCCC	2	8	288752	288759	0 %	0 %	25 %	75 %	549728368
6499	NC_022545	CCA	2	6	288761	288766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728368
6500	NC_022545	GGC	2	6	288881	288886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728368

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