MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_022535	GCTT	2	8	2203250	2203257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48502	NC_022535	GGGC	2	8	2203266	2203273	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48503	NC_022535	TCT	2	6	2203287	2203292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48504	NC_022535	CGG	2	6	2203393	2203398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48505	NC_022535	CGCT	2	8	2203419	2203426	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48506	NC_022535	GGA	2	6	2203522	2203527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48507	NC_022535	GAA	2	6	2203667	2203672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706686
48508	NC_022535	GCC	2	6	2203677	2203682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706686
48509	NC_022535	TGG	2	6	2203693	2203698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706686
48510	NC_022535	CTG	2	6	2203730	2203735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706686
48511	NC_022535	ATG	2	6	2203742	2203747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706686
48512	NC_022535	GAA	2	6	2203810	2203815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706686
48513	NC_022535	AGC	2	6	2203863	2203868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706686
48514	NC_022535	ATT	2	6	2204074	2204079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549706687
48515	NC_022535	TC	3	6	2204202	2204207	0 %	50 %	0 %	50 %	549706687
48516	NC_022535	GA	3	6	2204423	2204428	50 %	0 %	50 %	0 %	549706687
48517	NC_022535	AAT	2	6	2204465	2204470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706687
48518	NC_022535	CGC	2	6	2204507	2204512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48519	NC_022535	CCA	2	6	2204530	2204535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706688
48520	NC_022535	GCC	2	6	2204576	2204581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706688
48521	NC_022535	CCG	2	6	2204667	2204672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706688
48522	NC_022535	CATTTC	2	12	2204732	2204743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549706688
48523	NC_022535	CTT	2	6	2204801	2204806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706688
48524	NC_022535	GCCG	2	8	2204822	2204829	0 %	0 %	50 %	50 %	549706688
48525	NC_022535	CGC	2	6	2204848	2204853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706688
48526	NC_022535	CG	3	6	2204866	2204871	0 %	0 %	50 %	50 %	549706688
48527	NC_022535	CGGCG	2	10	2204932	2204941	0 %	0 %	60 %	40 %	549706688
48528	NC_022535	GTG	2	6	2204967	2204972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706688
48529	NC_022535	GAT	2	6	2204984	2204989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706688
48530	NC_022535	ATGG	2	8	2205080	2205087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48531	NC_022535	CGG	2	6	2205111	2205116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48532	NC_022535	TAA	2	6	2205221	2205226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48533	NC_022535	TTG	2	6	2205291	2205296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706689
48534	NC_022535	ACCATG	2	12	2205351	2205362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549706689
48535	NC_022535	TGCGCT	2	12	2205370	2205381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706689
48536	NC_022535	GGC	2	6	2205416	2205421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
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48538	NC_022535	TCG	2	6	2205462	2205467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706689
48539	NC_022535	CGG	2	6	2205491	2205496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
48540	NC_022535	TG	3	6	2205540	2205545	0 %	50 %	50 %	0 %	549706689
48541	NC_022535	CGG	2	6	2205569	2205574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
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48543	NC_022535	GCC	2	6	2205614	2205619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706689
48544	NC_022535	CCG	2	6	2205630	2205635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706689
48545	NC_022535	GAT	2	6	2205653	2205658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706689
48546	NC_022535	CGC	2	6	2205682	2205687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706689
48547	NC_022535	GC	3	6	2205686	2205691	0 %	0 %	50 %	50 %	549706689
48548	NC_022535	AGC	2	6	2205699	2205704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706689
48549	NC_022535	GCG	2	6	2205720	2205725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
48550	NC_022535	CCA	2	6	2205726	2205731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706689
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48552	NC_022535	AGC	2	6	2205740	2205745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706689
48553	NC_022535	ACGGC	2	10	2205784	2205793	20 %	0 %	40 %	40 %	549706689
48554	NC_022535	GCG	2	6	2205849	2205854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
48555	NC_022535	TCC	2	6	2205888	2205893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706689
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48559	NC_022535	CGC	2	6	2206097	2206102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706689
48560	NC_022535	GGC	2	6	2206130	2206135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706689
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48562	NC_022535	GTC	2	6	2206170	2206175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48563	NC_022535	TCCT	2	8	2206177	2206184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48564	NC_022535	GGC	2	6	2206227	2206232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706690
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48591	NC_022535	GCA	2	6	2207198	2207203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706690
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48600	NC_022535	CCG	2	6	2207884	2207889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706691
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48602	NC_022535	GCG	2	6	2207967	2207972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706691
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48604	NC_022535	GCTC	2	8	2208058	2208065	0 %	25 %	25 %	50 %	549706691
48605	NC_022535	TCC	2	6	2208112	2208117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48606	NC_022535	TG	3	6	2208194	2208199	0 %	50 %	50 %	0 %	549706692
48607	NC_022535	CA	3	6	2208235	2208240	50 %	0 %	0 %	50 %	549706692
48608	NC_022535	T	6	6	2208283	2208288	0 %	100 %	0 %	0 %	549706692
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48617	NC_022535	GCT	2	6	2208664	2208669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706693
48618	NC_022535	CGC	2	6	2208694	2208699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706693
48619	NC_022535	GGCTG	2	10	2208816	2208825	0 %	20 %	60 %	20 %	549706693
48620	NC_022535	CGA	2	6	2208997	2209002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706693
48621	NC_022535	CGA	2	6	2209012	2209017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706693
48622	NC_022535	GCC	2	6	2209121	2209126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706693
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48624	NC_022535	CGA	2	6	2209423	2209428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706694
48625	NC_022535	TCA	2	6	2209578	2209583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706694
48626	NC_022535	GCGCTG	2	12	2209631	2209642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549706694
48627	NC_022535	GCC	2	6	2209643	2209648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706694
48628	NC_022535	TCC	2	6	2209707	2209712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706694
48629	NC_022535	TGA	2	6	2209720	2209725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706694
48630	NC_022535	GTC	2	6	2209727	2209732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706694
48631	NC_022535	CGTCG	2	10	2209743	2209752	0 %	20 %	40 %	40 %	549706694
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48633	NC_022535	TGT	2	6	2209798	2209803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706694
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48635	NC_022535	GCA	3	9	2209936	2209944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706694
48636	NC_022535	CGA	2	6	2209981	2209986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706694
48637	NC_022535	CCCTG	2	10	2210000	2210009	0 %	20 %	20 %	60 %	549706694
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48640	NC_022535	CGA	2	6	2210122	2210127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706694
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48647	NC_022535	CCAGCG	2	12	2210239	2210250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549706694
48648	NC_022535	CACCG	2	10	2210258	2210267	20 %	0 %	20 %	60 %	549706694
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48652	NC_022535	CGT	2	6	2210437	2210442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706694
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48671	NC_022535	CAA	2	6	2210980	2210985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706694
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48674	NC_022535	CCCA	2	8	2211032	2211039	25 %	0 %	0 %	75 %	549706694
48675	NC_022535	GAA	2	6	2211053	2211058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706694
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48677	NC_022535	GA	3	6	2211240	2211245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48678	NC_022535	GCC	2	6	2211371	2211376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706695
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48682	NC_022535	GA	3	6	2211498	2211503	50 %	0 %	50 %	0 %	549706695
48683	NC_022535	GGCGAT	2	12	2211509	2211520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549706695
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48686	NC_022535	CG	3	6	2211637	2211642	0 %	0 %	50 %	50 %	549706695
48687	NC_022535	CGCTGG	2	12	2211654	2211665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549706695
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48702	NC_022535	CGA	2	6	2212144	2212149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706695
48703	NC_022535	TCA	2	6	2212165	2212170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706695
48704	NC_022535	AGCC	2	8	2212285	2212292	25 %	0 %	25 %	50 %	549706695
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48706	NC_022535	TTG	2	6	2212356	2212361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706695
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48708	NC_022535	TC	3	6	2212448	2212453	0 %	50 %	0 %	50 %	549706695
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48716	NC_022535	GCA	2	6	2212804	2212809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706695
48717	NC_022535	GC	3	6	2212829	2212834	0 %	0 %	50 %	50 %	549706695
48718	NC_022535	GCA	2	6	2212900	2212905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706695
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48720	NC_022535	A	6	6	2212955	2212960	100 %	0 %	0 %	0 %	549706695
48721	NC_022535	CGA	2	6	2212990	2212995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706695
48722	NC_022535	AGC	2	6	2213058	2213063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706695
48723	NC_022535	CGG	2	6	2213120	2213125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706695
48724	NC_022535	CGT	2	6	2213210	2213215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48725	NC_022535	ACG	2	6	2213243	2213248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48727	NC_022535	ACT	2	6	2213349	2213354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48728	NC_022535	CCG	2	6	2213535	2213540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48729	NC_022535	TGC	2	6	2213548	2213553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48730	NC_022535	CCG	2	6	2213644	2213649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706696
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48733	NC_022535	CAG	2	6	2213965	2213970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706696
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48744	NC_022535	GT	3	6	2214547	2214552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48745	NC_022535	GTC	2	6	2214612	2214617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48849	NC_022535	CGC	2	6	2218930	2218935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706702
48850	NC_022535	CGA	2	6	2219016	2219021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706702
48851	NC_022535	CAG	2	6	2219253	2219258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706703
48852	NC_022535	GCCG	2	8	2219295	2219302	0 %	0 %	50 %	50 %	549706703
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48855	NC_022535	CG	3	6	2219473	2219478	0 %	0 %	50 %	50 %	549706703
48856	NC_022535	AG	3	6	2219482	2219487	50 %	0 %	50 %	0 %	549706703
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48904	NC_022535	GAG	2	6	2221745	2221750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48905	NC_022535	TGA	2	6	2221764	2221769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706707
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48962	NC_022535	GCG	2	6	2224362	2224367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706709
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